细胞图象自动分割与计数
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细胞图像自动分割与计数软件简介
(第一版)
2010-03-10
1. 细胞图像分割的现状与意义
应用背景:对切片图像处理,自动分割出单个细胞,统计细胞个数、形状、分布等特征参数。
实际意义:
降低科研人员工作强度;
提高细胞分割精度;
从根本上提高统计分析工作的效率;
智能化医学图像分析仪器的核心部分。
2. 细胞图像分割原理
原始图像光照平衡处理, 检测并去除背景影响, 灰度化, 灰度图像光照平衡处理, 基于高阶累积量的图像下采样, 噪声处理, 目标区域识别, 图像轮廓提取。
2.1原始图像光照平衡处理
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图1 原始细胞图像
图2 横向与纵向拟合曲线
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图3 光度平衡处理结果
2.2检测并去除背景影响
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图4 背景处理结果
2.3灰度化
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图5 灰度化结果
2.4灰度图像光照平衡处理
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图6 灰度图像光照平衡处理结果
2.5基于高阶累积量的图像下采样
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图7 一阶累计量结果
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图8 二阶累计量结果
2.6噪声处理
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图9 一阶累噪声剔除结果
2.7目标区域识别
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图10 目标区域识别结果(灰色为核,白色为间质)
2.8细胞轮廓提取细 2.8.1 中心亮色细胞
图11 边界探测序列及拟合结果(左-探测结果,右-拟合结果
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图12 提取的全部细胞轮廓
2.8.2 中心暗色细胞
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图13 原始图,亮色为间质
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图14 边缘扩展处理结果
5. 分割结果细化
图15 原始分割图像的细化效果对比(d-m=0,3)
3. 软件使用说明
3.1 图像读取
单击”文件”菜单,点击“读取分割图像”,则出现文件选择界面。可读入JPG,BMP,TIF格式的图像。
图16 图像选择菜单
3.2 分割
单击”分割”按钮,即可完成对读入图像的分割。单幅图像处理时间大致在1-1.5秒间。
图17 图像分割按钮
3.3 中间结果浏览
单击“中间结果”栏中各按钮,即观察光度平衡、一阶统计、二阶统计等中间结果。
图18 中间结果浏览
3.4 JPG图片保存
单击”文件”菜单,点击“另存分割结果图像”,则出现文件保存界面。可存入JPG格式的图像。保存的JPG图像为无损灰度图。
图19 分割结果保存界面4. 开发者联系方式
blog: /signalthu
Email: imagethu@
qq: 1913440946