T7E1酶切法进行基因敲除小鼠的基因型鉴定
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T7E1酶切法进行基因敲除小鼠的基因型鉴定:
下面是举例:
T7E1酶切法检测突变体小鼠实验步骤:
1、PCR扩增target site周围序列(一般设计500bp左右, target site 最
好不位于中央,这样将酶切出两条大小不同的带)。
2、将实验组与对照的PCR产物按如下体系进行退火处理(95℃5min,自然
冷却至室温)
3、
理中,37℃反应30min后跑2%的琼脂糖凝胶电泳检测分析突变效果。
根据TALEN形成的突变位置和PCR引物的位置,PCR产物为642bp, 若发生突变后,用T7E1酶切,将产生约为:520bp和120bp的两条突变型的带。
下面三种情况来判断小鼠或细胞为野生型、杂合子、纯合子
1)纯合子小鼠:样品小鼠的PCR产物自我杂交,经T7E1酶切,只有一种带型(与野生型带大差不多);而样品小鼠的PCR产物与野生型鼠PCR产物杂交,出现两种带型(突变体带+野生型带)。
2)杂合子小鼠:样品小鼠的PCR产物自我杂交,经T7E1酶切,出现两种带型(突变体带+野生型带);而样品小鼠的PCR产物与野生型鼠PCR产物杂交,也出现两种带型(突变体带+野生型带)。
3)野生型小鼠:样品小鼠的PCR产物自我杂交,经T7E1酶切,只有一条带;而样品小鼠的PCR产物与野生型鼠PCR产物杂交也出现一种带。