淀粉酶基因的构建及其在大肠杆菌(amp+)中的表达
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淀粉酶基因的构建及其在大肠杆菌(amp+)中的表达
一、相关背景
淀粉酶是较早发现的酶类之一,早在1833年Payen和Persoz已首次从麦芽的水抽提物中用酒精沉淀分离到淀粉酶。1894年高峰让吉从米曲霉(Aspergillus oryzae)中提取出作为消化剂的酶,即高峰淀粉酶。1919年法国Boidin和Effront首次用枯草杆菌生产淀粉酶。
淀粉酶(amylase,AMY,AMS)是作用于可溶性淀粉、直链淀粉、糖元等α-1,4-葡聚糖,水解α-1,4-糖苷键的酶类的总称。现在淀粉酶大致可分为四大类:第一类α-淀粉酶,广泛分布于动物(唾液、胰脏等)、植物(麦芽、山萮菜)及微生物。第二类β-淀粉酶(EC3.2.1.2)从底物非还原性末端顺次水解每隔一个α-1,4糖苷键,切下的是麦芽糖单位。第三类葡萄糖淀粉酶(EC3.2.1.3),习惯上简称糖化酶,从底物的非还原性末端顺次水解α-1,4糖苷键和分支的α-1,6键生成葡萄糖。第四类解枝酶或异淀粉酶(EC3.2.1.9)只水解糖原或支链淀粉分支点α-1,6糖苷键,切下整个侧枝。还有淀粉α-1,6葡萄糖酶是在分支点的葡萄糖单位仅一个时起作用。
淀粉酶是水解淀粉和糖原的酶类总称,通常通过淀粉酶催化水解织物上的淀粉浆料,由于淀粉酶退浆机械作用小,水的用量少,可以在低温条件下达到退浆效果,具有鲜明的环保特色。
除此之外,不同性质的α-淀粉酶还具有许多不同的用途。耐热性α-淀粉酶,由于使用时温度提高,液化完全,用酶量少,操作比较容易,β-淀粉酶在食品工业中主要用于制造麦芽糖浆、啤酒、面包、酱油等。在制醋工业中,常用β-淀粉酶代替部分麸曲节省成本,在白酒和其他工业中也可以用其作糖化剂。在医药工业上,β-淀粉酶的一个重要用途是制造麦芽糖,医学上常用该酶和α-淀粉酶一道作为消化剂使用。
二、目前研究情况
1 .国内外研究机构
由于α-淀粉酶是具有重要应用价值的工业酶,国内外很多课题组对它进行了研究。国内主要研究α-淀粉酶的生产菌株及其培养条件;α-淀粉酶的结构以及应用性能,如耐热性、耐酸性;淀粉酶的变性机理以及环境对α-淀粉酶的影响;淀粉酶的固定化和动力性质;对多种α-淀粉酶生产菌的一淀粉酶基因进行了克隆以及表达研究。
国外有代表性的研究单位有:加拿大的University of British Columbia,他们对人胰腺的α-淀粉酶结构和作用机理进行了深入的研究;丹麦的Carlsberg实验室主要研究大麦α-淀粉酶结构域与结合位点;美国的Westenr Regional Research Center主要研究大麦
的α-淀粉酶与抗菌素的作用以及大麦一淀粉酶的活性位点。
2.国内外α-淀粉酶研究方向
第一利用传统育种技术对生产菌进行改良;第二对不同来源的α-淀粉酶的基因进行克隆.表达及酶学性质研究;第三α-淀粉酶结构与功能关系的研究。
三、实验研究的目标
构建出α-淀粉酶基因,并使其在大肠杆菌(amp+)中进行表达。希望可以通过实验对α-淀粉酶基因的一些功能进行研究。
四、简略研究步骤
DNA提取——>(电泳鉴定)——> PCR扩增(引物设计)——>(电泳鉴定)——>电泳——>目标带回收——>(电泳鉴定)——>连接载体(质粒)——>转化大肠杆菌——>菌体PCR检测
五、相关实验详细介绍
Ⅰ DNA提取
Ⅱ SDS法提取DNA
(一)试剂及器材:
1.母液:
(1)1M Tris-HCl:称Tris-Base 12.1g,双蒸水溶解,定容至100ml,用浓HCl调pH8.0(pH8.0)。
(2)0.25M EDTA:称Na2EDTA〃2H2O9.3g,双蒸水溶解,定容至100ml,用NaOH调pH8.0(pH8.0)。
(3)2M NaCl:称NaCl 11.6g,双蒸水溶解,定容至100ml。2.SDS bulfer:
取母液中1M Tris-HCl 10ml,0.25M EDTA 20ml,2M NaCl 25ml,定容至100ml,加SDS2g混合。
3.5M醋酸钾:称醋酸钾49g,双蒸水溶解,定容至100ml,乙酸调pH4.8。
4.TE:(10m M Tris-HCl,0.1m MEDTA)1M Tris-HCl 1ml,40μlEDTA 99ml双蒸水。
5.3M 醋酸钠(pH5.2):称醋酸钠3H2O 40.8g双蒸水溶解定容,固体NaOH调pH至5.2。
6.Tris-饱和酚。
7.其它:离心机、研钵,7ml离心管,1.5ml离心管,大小枪头,异丙醇,75%乙醇等。
(二)步骤:
1.取湿菌体约400mg(5ml发醇液),8000rpm,离心5min,弃上清
将湿菌体放入研钵中,加液N2(-180℃) 约20ml研磨3~5次,2管1.5ml离心管取粉末约0.5ml,各加700μl预热的SDSbuffer,65℃保温1h,7000rpm 离心6min取上清。
2.加上清2/3体积(约500μl)的5M KAC溶液,4℃,放臵30min,12000rpm,离心10min,取上清
3.加入等体积的异丙醇,-20℃,2小时以上,或过夜,4℃,8000rpm,离心5min,收集DNA沉淀,75%乙醇洗涤2次,离心管口向下晾干,50μl双蒸水(即ddH2O)溶解。
4.Tris-饱和酚,抽提3次。
5.加1/10体积的3M NaAc (pH5.2) ,4℃,放臵10min,10000rpm,离心10min,取上清。
6.2倍酒精沉淀。
7.75%酒精洗2次,凉干,50μl双蒸水溶解。
一般情况下,做前3步即可。
2电泳
(一)试剂及器材:
1.50×TAE Buffer pH8.5 1L(2M Tris-醋酸,100m MEDTA)
称Tris-Base 242g,Na2 EDTA〃2H2O 37.2g加800ml双蒸水,充分混匀搅拌,加57.1ml醋酸,加双蒸水定容到1L,室温保存。
2.1×TAE(取20ml 50×TAE+双蒸水定容至1L)
3.电泳仪、大小枪头、离心管,溴化乙淀,mark(d2000)等。(二)步骤:
1.取20ml(1×TAE)液体,称0.20g琼脂糖,混合,加热溶化,,倒入插有梳子的电泳槽中,冷却、凝固,
2.取出梳子,向槽中倒入TAE溶液至淹没胶块,样品5μl与1μl溴汾兰在塑料皮上混匀后点样入胶孔内(注意不能有泡),加盖,通电,电压100V,电流45mA,40min后,关闭电源。
3.打开盖子,倒去TAE,取出胶块,在EB中染色5min,后用蒸馏水漂洗干净,紫外分析仪中(260nm),观察电泳条带。
3 PCR扩增
(一)试剂及器材:
DNA提取物,Taq酶,Buffer,双蒸无菌水(灭菌过滤),PCR仪,电泳仪,离心机等。
(二)步骤:
1.PCR扩增,先设定程序,94℃,3min。(94℃,30s;55℃,30s;72℃,1min)×30。72℃,5min。及94℃,5min。(93℃,50s;46℃,