基因克隆的步骤

基因克隆的步骤

一、RNA的提取

1. 提取RNA前将洗净干燥的瓷研钵放入-70℃预冷10 min；

2. 从液氮罐中取出样品组织放入预冷的研钵中，加液氮淹没后立即研磨，边研磨边加液氮，整个过程都

不要使液氮挥干；

3. 趁冷，将样品粉末50-80 mg加入1.5 mL离心管后再加入1 mL Trizol，样品体积应不超过所使用Trizol

体积的10%，然后按照Trizol试剂盒说明操作；

4. 室温静止5-15 min。对于某些蛋白、多糖或脂含量很高的细胞或组织Trizol裂解后可能会有不溶物或

油脂状漂浮物，需12000g、4℃离心10 min，然后吸取澄清的Trizol裂解产物至一新的离心管中；5. 每mL Trizol中加0.2 mL氯仿。小心盖上离心管，剧烈地涡旋振荡15 sec，室温（24℃）静置3-5 min；

（必需步骤）

6. 12000 g、4℃离心15 min，此时混合物分成三部分：底层为苯酚-氯仿层，中间层，上层水相层，RNA

完全存在水相中；

7. 把小于80%的水相层（每mL Trizol约可吸0.5-0.55 mL）转移至一新的离心管中，并弃去下面的有机

相（小心避免吸到中间层）。往水相中加入异丙醇来沉淀RNA，每使用1 mL Trizol，便加500 uL的异丙醇，颠倒混匀，室温下孵育样品10 min；

8. 4℃、12000 g离心样本10 min弃去上清，每mL Trizol加入1 mL 75%乙醇，涡旋混匀，室温沉淀10 min

后，7500 g、4℃离心5 min，弃上清。再用离心机甩一下（5000rpm，离心1 s）；

9. 小心吸走乙醇，短暂地在室温下置2-5 min，让RNA团风干，不要用离心干燥装置或真空干燥装置，

因为过度干燥会导致很难用水重新溶解RNA，然后在55-60℃温浴10 min，然后-70℃保存。[RNA]（ng/uL）=A260×40×稀释倍数[DNA]（ng/uL）=A260×50×稀释倍数

纯DNA：OD260/OD280≈1.8（＞1.9，表明有RNA污染；＜1.6，表明有蛋白质、酚等污染）

纯RNA：1.7＜OD260/OD280＜2.0（＜1.7时表明有蛋白质或酚污染；＞2.0时表明可能有异硫氰酸残存）

二、M-MLV RT反转录

1. oligo dT 1 uL + dNTP（

2.5 mM）4 uL + 1-5 ug total RNA + 水= 12 uL

Heat mixture to 65℃ for 5 min and quick chill on ice；

2. 上述12 uL液体+ 5×Buffer 4 uL + 0.1 M DTT 2 uL + RNase OUT 1 uL

Mix contents of the tube，incubate at 37℃for 2 min

3. 上述19 uL液体加M-MLV RT 1 uL

Incubate tube at 25℃for 10 min；Incubate 50 min at 37℃；70℃for 15 min。

三、PCR反应

1. 第一轮PCR（25 µL体系）

10×Buffer: 2.5 µL

MgCl2(25 mM): 1.5 µL

dNTP (2.5 mM): 1 µL

rTaq(5 U): 0.25 µL

Primer F(10 µM): 1.0 µL

Primer R(10 µM): 1.0 µL

1st cDNA template: 5.0 µL

Adding ddH2O: 12.75 µL

2. 第二轮PCR（25 µL体系）

10×Buffer: 2.5 µL

MgCl2(25 mM): 1.5 µL

dNTP (2.5 mM): 2.0 µL

rTaq(5 U): 0.25 µL

Primer F(10 µM): 1.0 µL

Primer R(10 µM): 1.0 µL

1st PCR template: 1.0 µL

Adding ddH2O: 15.75 µL

PCR反应条件：94℃初始变性5 min，然后30个循环（94℃ 30 s，58 ℃ 30 s，72℃ 50 s），然后72℃延伸10 min结束，4 ℃保存。（根据所克隆基因片段的大小，一般rTaq酶一分钟合成1000 bp大小）3. 根据第二轮PCR结果，看效果进行4管25 µL体系PCR，然后做胶回收，（小板约45 mL胶即可）。

四、胶回收

100 µL PCR产物在1.5％琼脂糖凝胶上电泳。待目标带分离较好时，用洁净刀片切下目标条带所在胶块，尽量切去多余的胶（紫外灯下30 s内，防止DNA变性），置于灭菌的1.5 mL离心管中。用Agarose Gel DNA Extraction Kit试剂盒回收目标带，具体回收过程如下：

1. 估计胶块体积，按照0.1 g胶块加500 μL溶胶液的比例加入溶胶液，55℃-60℃溶胶约10 min，其间偶尔摇动至胶块完全溶解；

2. 胶块完全溶解后将溶胶液转移至吸附柱中，室温12 000 r/min，离心30 s，去掉废液；（最好等溶胶液温度降至室温后过柱，因为吸附柱在较高温度时结合DNA的能力较弱）

3. 向吸附柱中加入500 μL漂洗液（Wash buffer），室温12 000 r/min，离心30 s，去掉废液；

4. 重复步骤3，倒掉废液后空管室温12 000 r/min，离心2 min以完全去除漂洗液；

5. 将吸附柱转移至一干净的1.5 mL离心管中，向吸附柱膜中央加入30-50 μL的去离子水（一般先在65-70℃水中水浴），室温放置1-2 min，12 000 r/min，离心2 min洗脱DNA。

五、连接反应

在PCR扩增的过程中，TaqDNA聚合酶具有在双链DNA 3’末端加上一个非模板来源的核苷酸A的特性，使扩增产物具有A突出末端。将PCR产物与含有T末端的pMD18-T载体连接，就可以完成PCR 产物的克隆。连接反应体系如下：

pMD18-T V ector 0.5 μL

Ligate Mix 5 μL

胶回收DNA 4.5 μL（看DNA的浓度）

灭菌水up to 10 μL

反应条件：16℃反应16 h以上。

六、感受肽的制备及转化（CaCl2法）

1. 用接种环直接取冻存的TOP10在LB培养基平板上划线，于37℃培养16 h活化菌株；

2. 挑取一个单菌落于20 mL LB培养基中，37℃、250 r/min过夜培养；

3. 吸取1 mL过夜培养液于100 mL LB培养基中，37℃、250 r/min培养2 h，至OD590=0.375；

4. 将培养液转入两个预冷的50 mL灭菌离心管中，在冰上放置15 min，然后4℃、2 000×g离心7 min；

5. 弃上清，加入10 mL预冷的0.1 mol/L的CaCl2溶液悬浮细胞，同时两管合并成一管；

6. 4℃、1 600×g离心5 min，弃上清，用8 mL 0.1 mol/L的CaCl2溶液悬浮细胞，然后转入10 mL 灭菌离心管中（千万不要涡旋，用枪头轻轻地吸吹），冰浴过夜保存。

7. 将保存在10 mL 离心管中的感受态细胞用预冷的1 mL枪头吸掉上清液，剩2 mL时，用预冷的200 μL枪头吸至1 mL时，用枪头混匀，然后吸取100 μL于预冷的1.5 mL离心管中作连接；

8. 再在离心管中加入10 μL连接物，用枪头轻轻吹打混匀，冰上放置30min；

9. 42℃水浴热激90 s，不要摇动管子，然后迅速放于冰上冰浴2 min；

10. 加入800 μL室温LB培养基，轻轻混匀，37℃、150 r/min振荡培养1.5 h；

11. 取培养菌液50 μL涂布于预先已准备的Amp/LB/X-gal/IPTG平板，室温下吸收后，倒转培养皿在37℃培养16～18 h。（100 mL LB固体培养基加100 μL 50 mg/mL 的Amp贮存液，每个平板倒好后涂40 μL的X-gal和4 μL的IPTG）