微生物生态

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(三)简单有机物的无氧分解及甲烷的生成 1.简单有机物的无氧分解 酒精发酵 乳酸发酵
2.甲烷的生成 (1)甲烷产生菌:简单有机物在厌氧条件下可被微生物 转化生成甲烷,此作用称产甲烷作用。产甲烷细菌属 古细菌的一个类群,一般为中温型,少数种类为高温 型。能利用NH4+为氮源,少数可利用N2,它们对碳源 基质的要求含专性。 (2)甲烷生成的基质:大多数产甲烷细菌以CO2为最终 电子受体,H2为电子供体,将CO2还原为CH4。 4H2 + CO2——CH4 +2 H2O (3)甲烷生成的机制:有许多特定的酶参与作用。 由CO2生成CH4的生化途径为4个阶段: CO2 甲酰碳 → 甲基碳 → 甲基辅酶 M → 甲烷碳 产甲烷细菌具有独特辅酶,如辅酶M、CDR因子等。 甲烷杆菌 甲烷八叠球菌 利用H2/ CO2、甲醇 乙酸
七 微生物分解木素及芳香族物质 (一)木素 木素是由苯丙烷单元通过醚键和碳碳键连 接并难以被酸水解的复杂的无定性高聚物。分 解极为缓慢。木材的完全降解是真菌、细菌等 微生物共同作用的结果,其中真菌起着主要作 用。
真菌:白腐霉、褐腐霉和软腐霉、乳酸镰孢霉、 雪腐镰孢霉等类型能分解木素。 放线菌:链霉菌属、小单胞菌属和诺卡氏菌; 细菌: 梭菌属、假单胞菌属、不动杆菌属 芽孢菌。
五、极端环境中的微生物(重点) (一)嗜热微生物: (二)嗜冷微生物,甚至产生细菌毒素。 (三)嗜酸微生物: (四)嗜碱微生物 甲烷嗜盐菌、嗜盐碱杆
(五)嗜盐微生物 (六)嗜压微生物 知道 微生物生活的条件
第二节 微生物间的相互关系(重点)
一、互生关系
两种可以单独生活的生物,当他们生活在 一起时,通过各自的代谢活动而有利于对方, 或偏利于一方的一Baidu Nhomakorabea生活方式。 1.微生物间的相互关系: 固氮菌和纤维分解菌 2.人体肠道的正常菌群 人体肠道有 60-400种微生物可以抑制外来的肠 道致病菌、提供维生素、酶。微量的氮素 3.混菌培养与生产实践。 二、共生关系 两种生物共居在一起,相依为命,合二为一的一 种相互关系。 1.微生物间的共生 ——菌、藻共生 地衣;
第四章 微生物生态
生态圈、生态系统、微生物生态系统 第一节 微生物在环境中的分布 一、微生物在土壤中的分布 (一)土壤是微生物良好的生活环境 1.养分 :土壤中有机质、无机盐和有机物氮素养料 和各种盐类碳源和能源, 2.水分及渗透压 : 3.空气:团粒间、内部充满空气,厌氧微生物生活。 4.pH : 土壤中溶液pH一般在中性左右。 5.温度:大部分地区、大部分时间土壤温度在0- 30之间。热带土壤表层温度高,微生物 活动接近停止。
(二)土壤中微生物的数量与分布
土壤中微生物的数量因土壤类型、季节、土层 深度(根圈)与层次等不同而异。 根土比、垂直分布,水平分布
土壤细菌最多102 — 108/g 土,其中多属异养菌。 专性厌氧菌则以梭状芽孢杆菌属为主,放线菌 103 —105/g土和真菌 104/g土次之,藻类微生物的 1%,原生动物较少。
(二)芳香族化合物 微生物能利用芳香化合物在有氧条件下的 氧化分解比厌氧条件下为快,有氧氧化分解是 这些化合物分解的主要途径,其生化过程:
1.在加氧酶作用下生成双酚化合物 2.在单加氧酶或双加氧酶作用下芳香环开裂 3.上述所得相应的有机酸,转化成乙酸等进 入三羧酸循环,最后氧化成CO2、H2O。 细菌,如假单胞菌、分枝杆菌、不动杆菌、 节杆菌及芽孢杆菌中的很多种,诺卡氏菌也有 重要作用。
盐湖中的细菌: 盐浓度低于 5 %大多数微嗜盐菌、耐盐细菌、 盐浓度为5-20% 中度嗜盐菌
在含硫化氢的盐湖中,大量绿色细菌和紫色 细菌,如绿杆菌属,暗网菌属等细菌都能生长。 海水中的微生物 垂直分布从上108到下104-5 海洋中常见的细菌属是G-、弧菌、光合菌, 沉积物中芽孢杆菌等。 大部分海洋细菌在 12-25 0C 、 pH7.2-7.6 生长最好 , 另外,许多海洋细菌在有氧时能发 光,可监测。
1.微生物种类数量分布的条件? 2.不同环境微生物分布的特点?极端环境微 生物生存的机制? 3.举例说明微生物相互关系的概念,特点?
4.3 微生物在自然界物质循环中的作用
第一节 碳素生物循环
在自然界碳及碳的化合物以多种形式存在,其中周转最快 的是大气中的 CO2。地球上90%CO2是靠微生物分解作用而来。
3 江河水中或多或少常受到城市排放的污水的污染,污水细菌 中值得注意的是肠道细菌,如大肠杆菌、细菌沙门氏菌属、梭菌。
湖泊、池塘中的微生物: 上层 好氧细菌、藻类、霉菌,铁细菌、硫细菌等 中层 紫细菌和绿细菌等厌氧菌 底层 厌氧或兼性厌氧菌
在富营养湖泊的均温层中有丰富的无色硫细菌,如 硫螺细菌、发硫菌属、辫硫菌属,如甲烷假单胞菌;脱 硫脱硫弧菌和一些梭菌。 化能自养型细菌,如欧洲亚硝化单胞菌、维氏硝化 杆菌、硫杆菌、铁杆菌在湖泊中均起着作用。 光能自养型细菌是他们多为绝对厌氧或微好氧的细 菌。绿硫菌科、红硫菌科和红螺菌科。在富营养湖泊中 起着很重要的作用。
一 微生物分解有机物的一般途径 (一)复杂有机物分解为简单有机物 对于复杂有机物,通过其分泌于细胞外的 胞外酶类使基质分解成简单的可溶性有机 物而后吸入体内加以利用。 可概括为氧化和发酵两大类别。 (二)简单有机物的有氧分解
1.完全氧化:在有氧呼吸过程中彻底氧化成 CO2+H2O 2.不完全氧化:生成有机酸类等中间产物,暂时 积累。
二、微生物在水体中的分布
大气水中主要是球菌、杆菌、放线菌霉菌孢子 地下水和泉水大体是无菌的。
产油岩层的地下水有大量分解碳氢化物的细菌。脱硫弧 菌亦常出现。含铁的泉水中常有锈色盖氏铁细菌,纤毛铁细菌, 多孢锈铁细菌。含硫泉水中有无色和紫色硫细菌。
江河水中的细菌
江河中的土著细菌较少。 1 在营养贫乏的小河中,主要是能耐贫营养的无芽孢细菌,如 无色杆菌和黄杆菌等。丝状细菌藻类 2 随着水体的富营养化,而假单孢杆菌科,特别是萤光假单孢 杆菌群,芽孢杆菌科和肠杆菌科的细菌占主要地位。
八 微生物分解烃类 (一)烷烃 微生物对烷烃分解生成相应的醇、醛和酸, 而后经β -氧化进入三羧酸循环,最终分解成 CO2、H2O。有甲基孢囊菌属、甲基单胞菌属、 甲基球菌等不同属。 (二)烯烃 微生物对烯烃的代谢主要是产生具有双键 的加氧氧化物或环氧化物,最终形成饱和或不 饱和的脂肪酸,然后再经β -氧化进入三羧酸 循环而被完全分解。 (三)脂环烃类 在全部烃类中脂环类对微生物作用的抵抗力 最强。但诺卡氏菌可以分解。
(二)β-1,4-葡聚糖酶 又称CX 酶,包括内切酶和外切酶。它不能水解天 然纤维素,只能切割部分降解的多糖。它们广泛分布 于细菌、放线菌、真菌中。
(三)β-葡萄糖苷酶 此酶水解纤维二糖、纤维三糖及低相对分子质量的 寡糖成为葡萄糖。 细菌:好氧噬纤维菌属、生孢噬纤维菌属、纤维 弧菌属等,厌氧菌以梭状芽孢杆菌为主。 真菌:曲霉、青霉、根霉等。 放线菌:有诺卡氏菌、小单孢菌和链霉菌的某些种。
三、微生物在空气中的分布 其中大部分是腐生微生物,也有人及动植 物病原微生物。 真菌:曲霉、青霉、木霉、根霉、毛霉等 是常见的种类。 细菌:则是土壤中来的,最常见的为芽孢杆 菌、如枯草芽孢杆菌、肠膜芽孢杆菌等,球菌 如微菌、八叠球菌等。
空气中微生物数目决定于尘埃的总量。城 市多于农村。
四、微生物在食品上的分布 (一)粮食:以芽孢、革兰氏阴性细菌为主。 粮食常见的有曲霉、青霉等大量的霉菌孢子。 (二)肉类: 1.好氧性芽孢杆菌等 2.好氧性无芽孢杆菌等。 3.球菌:如橙色微球菌、橙色八叠球菌等。 4.厌氧性细菌:如臭气梭菌、溶组织梭菌等。 在肉类上常见曲霉属、毛霉属、青霉属等。 (三)鱼类:鱼类也有许多细菌,如无色杆菌 属、 黄杆菌属和微球菌属类。 (四)乳类:主要是乳链球菌和乳酸乳杆菌等。
三 微生物分解半纤维素 放线菌和真菌的一些种能分泌多种不同的 酶分解半纤维素。例如芽孢杆菌属中的某些种 能分解甘露聚糖、半乳甘露聚糖和木聚糖等。
四 微生物分解果胶类物质 果胶类物质是以半乳糖醛酸为主的高分子 聚合物。 首先,好氧性细菌有芽孢杆菌、软腐欧式 杆菌等分解利用可溶性养分。 其次,厌氧性细菌有费式浸麻梭菌,真菌 有青霉、曲霉、毛霉、根霉等。
四、拮抗关系 拮抗关系是指一种微生物在其生命活动过 程中,产生某种代谢产物或改变其他条件,从 而抑制其他微生物的生长繁殖,甚至杀死其他 微生物的现象。 分为非特异性拮抗关系和特异性拮抗关系。 某种微生物所产生的特异的代谢物,具有 选择性的可抑制他种生物的生长发育甚至杀死 它们,这就是特异性的拮抗关系。 各种微生物能产生这类代谢物的特性各不 相同,统称为抗菌素。 五、捕食关系:原生动物吞食细菌和藻类的现象
(四)微生物分解有机物的总图式
好氧微生物
复杂有机物 —简单有机物

厌氧微生物
CO2+H2O
CO2+H2O+H2+CH4 酸、醇、酮
二 微生物分解纤维素 纤维素是葡萄糖的高分子缩聚物。不溶于水,只 有在产纤维素酶的微生物作用下,才被分解成简单 的糖, 纤维素 纤维二糖 葡萄糖 纤维素酶是一种诱导酶,如绿色木霉只有在纤维 素、纤维二糖、乳糖和葡萄糖做碳源时才能合成纤 维素酶纤维素酶大致分为3群: (一)C1酶 C1 酶水解未经降解的天然纤维素,对部分降解 的多糖或寡糖很少作用或没有作用。一种微生物能 分泌一种以上的C1酶。
第二节 氮素生物循环
一 微生物转换氮素物质的一般途径
自然界的氮素以3种主要形态存在: ①分子氮(N2); ②无机态氮(NH4+-N, NO3 -N等);
③有机态氮(核酸、蛋白质等)。
上述3种形态的氮素物质的转化:
(一)绿色植物和微生物的生命活动过程中,吸收硝态 氮和铵态氮组成蛋白质、核酸等含氮有机物质。
五 微生物分解淀粉 微生物水解淀粉糖苷键的酶总称为淀粉酶: ①α -淀粉酶(内切酶)可以切割直链和支链 中的α - 1,4键。 ②β -淀粉酶;外切酶直连和支连的一端切割 ③糖化淀粉酶;④异淀粉酶。 厌氧条件下主要是梭状芽孢菌,如淀粉梭菌。 六 微生物分解脂质物质 细菌:好氧性种类假单胞菌、而荧光假单胞 菌、铜绿假单胞菌分枝杆菌等等是其 中最活跃的菌种。 放线菌:有的种也具有分解脂质的能力。 真 菌:青霉、曲霉等。
2.微生物和植物共生——根瘤菌和豆科 3 .微生物与动物的共生 —— 白蚁与其消化道中 的某些原生动物和微生物,因为白蚁不能分泌 水解纤微素的酶。 反刍动物与其瘤胃微生物的共生关系——为 微生物提供纤维及生长条件,微生物提供菌体 蛋白。可以说如此庞大的牛和大量的牛奶是靠 微生物喂出来的。 三、寄生关系(寄生关系是一种对抗关系) 1.微生物间的寄生 菜叶豆烧病病原菌与蛭弧菌 2.微生物与植物间的寄生关系 白粉菌,锈菌 3.微生物与动物间的寄生 噬菌体寄生于细菌或放线菌是寄生关系的最 典型例子。
二 生物固氮作用
微生物在常温常压下直接利用分子态氮,将 之还原为氨的过程称为生物固氮作用。 (一)固氮微生物 能进行固氮作用的微生物叫做固氮微生物或固 氮菌。
(二)动植物和微生物遗体中的有机氮化物,经微生物 的分解作用,使无机质化为氨态氮。 (三)氨态氮在有氧条件下,经硝化细菌的作用氧化成 硝态氮。 (四)硝酸盐由于反硝化细菌的作用,还原为分子态氮 ,逸散到大气中。 (五)空气中的分子态氮,通过固氮微生物的作用,还 原为氨,进而合成有机氮化物。
(三)其他含氮有机物的分解 1.尿素是分子结构简单的含氮有机物 微生物产生尿酶直接水解尿素,生成碳酸铵,在碱 性环境分解为氨和CO2。 微生物有脲素芽孢八叠球菌,巴斯德芽孢杆菌等。 2.几丁质的氨基葡萄糖缩聚物 某些微生物如贝内克氏菌属中的一些种,产生几丁质 酶使几丁质水解,生成氨基葡萄糖和乙酸,氨基葡萄 糖再经脱氨基酶作用,生成葡萄糖和氨。 3.卵磷脂是含胆碱的磷酸脂,存在于细胞原生质中 许多芽孢杆菌、假单胞菌和某些霉菌等可产生卵磷脂酶 类,使卵磷脂水解成甘油、脂肪酸、磷酸和胆碱,在 进一步分解成氨、醇、有机酸等。
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