大肠杆菌表达系统

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影响因素包括:
(1)蛋白质的降解作用
在大肠杆菌的细胞中,含有大量的各种类型的蛋白酶, 广泛分布在细胞质、周质、内外膜等部位,参与许多方 面的代谢活动,包括选择性地酶解异常的蛋白质。
已知有许多因素,如不完全多肽、氨基酸取代突变、 多酶复合体亚基的超量合成、氧化作用或游离自由基的 作用而造成的翻译后损伤,以及基因工程技术的效应等, 都可以导致蛋白质分子受损或构型变化,形成异常蛋白 质。
* 使克隆基因表达的外源蛋白质分泌到胞外的 培养基中,是获得蛋白质稳定性的最佳途径。
到目前为止,这方面的技术还很不成熟,外泌率低。
2、外源蛋白质在大肠杆菌细胞中的稳定性
当一种克隆的外源基因在大肠杆菌中不能实 现其功能表达时,我们往往会认为这是由于转 录或翻译过程发生了问题。其实在早期的研究 中就有许多实验表明,克隆的外源基因即便是 在大肠杆菌中得到了表达,也并不一定就意味 着它的多家已经设计并构建了 一系列的以原核启动子取代真核启动子的质粒 表达载体系统。
最常用的:噬菌体的PL启动子,大肠杆 菌的Lac启动子、Trp启动子,以及pBR322 质粒的-内酰胺酶启动子等一批强启动子构 成的。
三、大肠杆菌的转化方法
1、Cohen转化法
第一节 基因的表达系统与表达策略
最佳的基因表达体系:
⑴目的基因的表达产量高; ⑵表达产物稳定; ⑶生物活性高; ⑷表达产物容易分离纯化。
宿主细胞的选择
适合目的基因表达的宿主细胞的要求:
1、容易获得较高浓度的细胞; 2、能利用易得廉价原料; 3、不致病、不产生内毒素; 4、发热量低、需氧低、适当的发酵温度和细胞形态; 5、容易进行代谢调控; 6、容易进行DNA重组技术操作; 7、产物的产量、产率高, 8、产物容易提取纯化。
§ 重组操作时, N-端加一个增加稳定性的氨基酸
(3)表达融合的蛋白质
以形成融合蛋白的形式在大肠杆菌细胞中 表达外源真核基因具有许多方面的优越性。 例如,产物比较稳定,可以免受胞内蛋白酶 的降解作用,可以获得较高的产率。
谷胱甘肽S-转移酶(GST)、麦芽糖结合蛋白 (MBP)以及硫氧还蛋白(Trx)均已经被证实 能非常成功地生产正确折叠、有生物活性的蛋 白质,能明显提高在E.coli细胞质中产生的融合 蛋白的可溶性,并能抑制包涵体的形成。
2、Hanahan转化法
1983年由Hanahan设计。它的特点是在感受态细胞 的诱导方面,除了用CaCl2和MnCl2等二价离子按一定 形式组合方式处理细胞外,还利用二甲亚砜 (DMSO)、二硫苏糖醇(DTT)和氯化六氨合高钴 等进一步处理细胞,其它方面与上法相同。
这种方法的优点是形成高频率的感受态细胞,可使 转化效率提高100-1000倍,而且对大小质粒都能进行 有效的转化。
大肠杆菌表达体系的优越性:
1. 对大肠杆菌的背景知识(完成基因组全测序),特别 是基因表达调控的分子机理有深刻的了解(乳糖操纵 子) ;
2. 是一种安全的基因工程实验体系,拥有各类适用的寄 主菌株和不同类型的载体;
3. 许多克隆的真核基因都可以在大肠杆菌细胞中实有效、 高水平的表达;
4. 大肠杆菌培养方便、操作简单、成本低廉,易用于批 量生产。
1、周质中蛋白质种类较少,纯化简单 2、蛋白质酶解程度不严重 3、促进二硫键的形成及蛋白质的折叠 4、蛋白质N-末端结构真实
缺点
1、蛋白质折叠了可能无法恢复起生物学活性 2、还原的环境不利于二硫键的形成
1、信号肽并非总是有助于蛋白质的转运 2、有可能形成包涵体
1、蛋白质的酶解作用程度很底 2、目标蛋白的纯化容易,由于分泌到胞外的
1、外源蛋白质在大肠杆菌细胞中的表达部位
细胞质;细胞周质;分泌到细胞外
这三种表达部位各有不同的优缺点,而且对 表达量和表达产物的制备有很大关系。
在大肠杆菌细胞不同部位表达外源蛋白质的优缺点
表达部位
细胞质
周质
胞外
优点
1、 形成包涵体 (1)蛋白质易于以高纯度和高浓度方式分离 (2)蛋白质受保护而免受胞内酶的降解 (3)蛋白质没有活性,不会使细胞受伤害 2、表达的质粒载体构建比较简单
此外,转录终止子还能增强mRNA分子的稳定 性,从而大大提高蛋白质产物的水平。(避免产 生多余的二级结构)
(3)翻译起始序列
mRNA转录本5’端的独特的结构特征(核糖 体结合位点),是决定mRNA翻译效率的主要 因素。
至今,仍未鉴定出通用有效的翻译起始序列的保 守结构,但却已经发展出许多种可以用来有效地降 低在mRNA转录本5’-末端形成二级结构的实验方法, 从而提高克隆的外源基因的表达效率。
分子机制不明。
(5)翻译终止密码
对mRNA翻译终止而言,一个必不可少的条 件是必须存在终止密码子。因此,在构建大肠杆 菌表达载体时,通常安置上全部的三个终止密码 子,以便阻止发生核糖体的“跳跃”现象。
已知大肠杆菌格外偏爱使用终止密码UAA,尤其 是当连上一个U而形成UAAU四联核苷酸的情况下, 翻译终止的效率进一步提高。
• 制备用于电转化的感受态细胞相对容易。 当细菌长到对数中期,冷却、离心,然后用
冷却的去离子水反复清洗,最后用10%甘油重 悬细胞,使其浓度为31010细胞/毫升,在干冰 或液氮中速冻后置于-70 ℃贮存。
• 转化必须在0-4 ℃下进行。 如果在室温下操作,转化效率会大大降低。
四、克隆的真核基因在大肠杆菌细胞中的表达
宿主细胞分为两大类:
1、原核细胞:常用有大肠杆菌、枯草芽胞杆菌、链霉菌 等;
2、真核细胞:常用有酵母、丝状真菌、哺乳动物细胞等。
一、真核基因的大肠杆菌表达体系
目前,已被用于表达外源蛋白质的表达系 统有细菌(大肠杆菌和枯草杆菌)、酵母、昆 虫、植物和哺乳动物细胞等。但比较而言,大 肠杆菌表达系统具有明显的优越性。
蛋白种类少 3、增进了蛋白质的折叠作用 4、蛋白质N-末端结构真实
1、在大肠杆菌细胞中表达的外源真核蛋白通 常不会分泌到胞外
2、由于分泌到胞外的蛋白质相当于稀释,因 此目标蛋白的得率较低
* Talmadge和Gilbert(1982)将外源蛋白质在 大肠杆菌细胞中的不同部位表达。结果:
细胞质中表达的大鼠胰岛素原的半衰期仅有 2min左右,而表达在大肠杆菌周质中大鼠胰岛素 原的半衰期延长了10倍以上。(原因:细胞周质 中蛋白酶的含量低)
(2)结构决定因子与蛋白质的稳定性
• 与蛋白质稳定性相关的确切的分子结构特征?
不清楚
• 但已经明确了若干种影响蛋白质稳定性的结 构决定因子。
其中最重要的:N-端氨基酸性质。
N-端氨基酸性质
“N-端法则”: 在生物体内蛋白质新陈代谢的 稳定性,主要取决于N-端氨基酸的性质。
在大肠杆菌细胞质内,若蛋白质N-端为Arg、 Lys、Leu、Phe、Tyr 和Trp等残基,则其稳定 性较差(半衰期 2 min);而同样条件下,若 N-端为除了Pro之外的其它氨基酸残基时,其 稳定性则大大提高(半衰期大于10 h)。
• 启动子 • 终止子 • 核糖体结合位点 • 密码子 • 质粒拷贝数 • 寄主生理状态
转录水平 翻译水平
(1)启动子
要使克隆的外源基因高水平表达的最佳 启动子,必须具备以下几个条件:
1)必须是一个强启动子。
2)这个启动子应能呈现一种低限的基础表达 水平。使用高度抑制型的启动子是一种极为 重要的条件。(外源蛋白可能对细胞有害)
第三章 真核基因在大肠杆菌中的表达
前言
基因表达是指结构基因在生物体中的转录、翻译以 及所有加工过程。 基因工程主要目标之一是生产常规方法难以生产的 大量蛋白质产物—即实现基因的高效表达。 基因高效表达研究是指外源基因在某种细胞中的表 达活动,即剪切下外源基因片段,拼接到另一个基因 表达体系中,使其能获得原生物活性又可高产的表达 产物。
5. 细菌的蛋白酶,能够识别外来的真核基因所表达的蛋白质 分子,并把它们降解掉。
6. 大肠杆菌周质内存在各种内毒素。
克隆基因正确表达的基本条件
能够进行正常的转录和翻译,以及在 正常情况下还与翻译后加工及新生多肽 在细胞中的分布有关。
启动子、终止子以及正确读码框 (ORF)。
二、大肠杆菌的表达载体
为了避免在大肠杆菌中发生外源蛋白质的降解, 或将此降解作用控制在最低水平,已针对性发展出 了许多种不同的技术方案。主要有:
1)让外源蛋白质定位在周质或胞外表达; 2)使用蛋白酶缺陷的大肠杆菌做表达菌株; 3)将转化有克隆基因的寄主菌株放置在低温环境中生长; 4)使目标基因以融合蛋白形式表达; 5)置换多肽链中某些氨基酸,消除蛋白酶切点; 6)对目标蛋白质作疏水性修饰。
例如: 在RBS序列中增加AT含量;诱发特异碱基 发生定点突变;以及使用翻译偶联系统进行克隆基 因的表达。
(4)翻译增强子
大肠杆菌和噬菌体基因中存在一些特殊的序列元 件,能够显著地增强异源基因在大肠杆菌细胞中的 表达效率。这类特殊序列元件特称为翻译增强子。
例如:T7噬菌体基因10的前导序列(g10-L)、 以大肠杆菌atpE基因为代表的一些mRNA分子5’UTR中的富含U的区段,以及直接位于T7基因起 始密码子下游的“下游元件”等。
通过特定的纯化方法,可将融合蛋白与细胞污 染物分开。
通过溴化氰或蛋白酶裂解的方法对融合蛋白进 行位点特异性裂解以获得天然蛋白。
(4)分子伴侣(molecular chaperone)稳定作用
分子伴侣:指一类多功能蛋白质,它能够通过阻 止诸如聚合作用这样的副反应,来促使其它蛋白 质按正确的方式折叠,而其本身却不是最终形成 的功能蛋白质的组成成分。
大肠杆菌中表达体系的不足:
1. 真核基因在结构上同原核基因之间存在着很大的差别。
2.真核基因的转录信号同原核的不同。 细菌的RNA聚合酶不能识别真核的启动子;外源基因可能
含有具大肠杆菌转录终止信号功能的核苷酸序列。
3. 真核基因mRNA的分子结构同细菌的有所差异,影响真核基 因mRNA稳定性。
4. 许多真核基因的蛋白质产物,都要经过转译后的加工修饰 (正确折叠和组装),而大多数的这类修饰作用在细菌细 胞中并不存在;
1、大肠杆菌表达载体的基本成分
RBS
R
P
SD
编码序列
TT
tetr
Ori
-35
-10
TTGACA。。。17。。TATAAT
ATG(91%) GTG(8%) TTG(1%)
TAA TGA TAG
TAAGGAGG(N)8
RBS:ribosome binding site, 核糖体结合位点
外源基因在大肠杆菌中高效表达的原理
值得注意的是:此法要求的条件高,对外界污染 物极其敏感,对各方面的要求很高。因此,只在极 少数情况下才使用此法。
3、电转化法
电转化法的转化效率受电场强度、电脉冲的 时间和DNA浓度等参数的影响。
转化效率:108-109转化体/µg DNA。
• 当电压和电脉冲时间的一定方式组合而导致 50%-70%细菌死亡时,转化效率达到最高。
通过分子伴侣与克隆的外源基因在大肠杆菌 寄主细胞中共表达是增强目标蛋白的稳定性、 实现高水平表达的有效方法。
(5)大肠杆菌突变体菌株与蛋白质的稳定性
通过产生融合蛋白途径增加外源多肽稳定性的 方法,已有许多文献报道,但此法的一个突出缺 点是所产生的融合蛋白并不一定都能够在体外将 天然蛋白质完整无损地切割下来。
3)这种启动子应是诱导型的,能通过简单的 方式使用廉价的诱导物而得以诱导,如物理 (如热)和化学(如IPTG)诱导 。
(2)转录终止子
* 当上游启动子驱动的转录作用通读过下游启动子 时,便会使该启动子的功能受到抑制。—启动子 封堵作用
* 在克隆基因编码区的3’-末端接上一个有效的转 录终止子,便能够阻止转录通读。
1972年Cohen改进而成,是目前最常用的方法。
操作步骤: (1)将处于对数生长期的新鲜培养物(0.5-0.6 OD),于 4℃, 4000转/分钟离心10分钟,回收细菌细胞; (2)将细胞用0℃的0.1mol/L CaCl2溶液重新悬浮细胞沉淀, 以诱导细胞感受态产生; (3)加入适量的DNA后,于42 ℃热处理90秒; (4)将混合物快速转移到冰浴中,使细胞冷却1-2分钟, 加入适当的培养基在37 ℃培养45分钟,使细胞复苏,并表 达质粒所携带的转化基因; (5)选择培养基培养,选择转化体。
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