第3章核酸化学

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绿色(苔黑酚法)
D-2-脱氧核糖+
NH
H+
蓝色(二苯胺法)
核苷 核糖和碱基通过糖苷键连接形成核苷。
HOH2C O H OH H H OH base
核苷的结构:含N苷,β-苷
H
核糖的 C1′与嘧啶碱的N1或嘌呤碱的N9之间的通 过C-N糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)。
C-N糖苷键对酸不稳定。
核 苷 核苷中戊糖与碱基的连接方式(C-N糖苷键)
2. RNA参与蛋白质的生物合成
负责遗传信息的表达, 转录DNA所载的遗传信息,并将之翻译给蛋白质,使生命机体的生长、 发育、繁殖和遗传得以继续进行。
3. RNA具有多种功能:
1)控制蛋白质的合成; 2)作用于RNA转录后加工和修饰; 3)基因表达与细胞功能调节; 4)生物催化与其它细胞持家功能; 5)遗传物质信息的加工和进化
功能
DNA
主要的遗传物质,主要存在于细胞核 通过复制传递遗传信息至子代 通常为双链 含D-2-脱氧核糖、胸腺嘧啶特有成分
RNA
遗传信息表达分子,指导合成蛋白质 主要在核内合成,主要分布于细胞质 通常为单链 含D-核糖、尿嘧啶特有成分
mRNA:占全部RNA的5%,可以 作为合成蛋白质的 直 接模板。 tRNA:占全部RNA的15%,在 蛋白质合成中起转运AA的 功能。 rRNA:占全部RNA的80%,是 构成核糖体的成分,原核 细胞中有5S、16S、28S三 种,真核细胞中有5S、 5.8S、18S、28S四种。
——赫尔希和蔡斯
DNA病毒: 噬菌体 • 病毒分类(2): RNA病毒: 如流感病毒,天花病毒, HIV(艾滋)病毒,SARS(非典病毒), 乙肝病毒等。
怎样将 DNA 和蛋白 质区分 开, 单 独观察 他们的 作用?
DNA: C H O N
32P
标记噬菌体的方法: (1)标记细菌。在分 别含有放射性同位素 32P 和35S的培养基中培 养细菌 (2)标记噬菌体。用 上述细菌培养噬菌体, 分别制备含32P 和35S的 噬菌体。
第一节 核酸的组成成分
一.元素组成
C H O N P(9%-9.9%)
RNA:P-9%,
DNA:P-9.9%
通过测定P 的含量来推算核酸的含量(定磷法)。任何核酸 都含磷酸,所以核酸呈酸性。
二. 分子组成及组成单位
腺嘌呤 嘌呤 鸟嘌呤 碱基 尿嘧啶 嘧啶 核苷 核苷酶 胞嘧啶 胸腺嘧啶 核酸酶 核苷酸酶 核苷酸 核酸 核糖 戊糖 磷酸 脱氧核糖
H OC H2 H H
Ade O H H OC H3
OH
2'-O-甲基腺苷(Am)
稀有核苷
(3)由碱基与糖连接 方式特殊的核苷
H OC H2 H H OH OH O H 1' H O HN 5 O NH
糖苷键不是C-N 键,而是C-C键
假尿嘧啶核苷 (pseudouridine)
(ψ)
核苷的性质
稀有核苷
在核酸分子中的5种碱基可被化学修饰形成稀有碱基
稀有碱基在tRNA分子中比例最高,可大于10% 稀有碱基种类很多,但在核酸分子中的比例很低
稀有碱基大多是正常碱基的甲基化产物
核酸分子中的核糖也可能被修饰
修饰核苷(稀有核苷)包括三种情况:
(1)由修饰碱基和糖组成的核苷 (2)由非修饰碱基和2-O-甲基核糖组 成的核苷 (3)由碱基与糖连接方式特殊的核苷
RNA参与蛋白质的生物合成
中 心 法 则
RNA与生命起源
一Байду номын сангаас
生命是自我复制的体系 DNA代替了RNA的遗传信息功能 蛋白质取代了绝大部分RNA酶的功能


成为原始遗传基因的必要条件:
1
具备自我复制功 能;
蛋白质被排除
自身是复制的模
2
板;
3 具备催化复制反
应的功能
DNA被排除
RNA是最早的生命大分子
DNA代替了RNA的遗传信息功能
• DNA双链比RNA单链稳定 • DNA链中胸腺嘧啶代替了RNA链中的尿嘧 啶,使之易于修复。 • 作为遗传载体则有可能储存大量的信息并 能更稳定的遗传
蛋白质取代了绝大部分RNA酶的功能
• 蛋白质化学结构的多样性与构象的多变 性;
• 与RNA相比,蛋白质能更为有效地催化 多种生化反应,并提供更为复杂的细胞 结构成分,逐渐演化成今天的细胞。
放射性很高
放射性 很低
被35S标记 的噬菌体
被35S标记的噬菌 体与细菌混合
搅拌 离心
放射性很低
放射性很高
被32P标记 的噬菌体 被32P标记的噬菌 体与细菌混合
• 赫尔希和蔡斯的实验表明:噬菌体在侵染细菌的时候,蛋白质外 壳留在细菌外面,DNA进入到细菌内部。子代噬菌体的各种性 状,是通过DNA 遗传的,DNA是真正的遗传物质。
RNA
携带遗传信息的能 力
酶的催化功能
唯一同时具备 了作为遗传物 质和功能载体 的能力
RNA
古界
1.核酸为主体的原始生命系统
2.RNA反转录建立了DNA系统
3.蛋白质介入
4.DNA-RNA-蛋白质系统的诞生
生命是自我复制的体系
• 生命起源中最早的生物大分子
• RNA的功能
• 由RNA催化产生了蛋白质
N
NH2
嘧啶(pyrimidine)
5 4 3 2 N
O
NH
6 1 NH
NH2
NH
O
尿嘧啶(uracil, U)
O H3C
N
NH
NH
NH
O
O
胞嘧啶(cytosine, C)
胸腺嘧啶(thymine, T)
• DNA中含有的碱基是:A T C G
RNA中含有的碱基是:A U C G • 紫外吸收的特性(共轭双键) 吸收波长:260nm 用于定量测定
几种稀有(修饰)碱基
主要存在于tRNA中
次黄嘌呤(I)
二氢尿嘧啶(D)
修饰碱基多是4种主要碱基的衍生物
碱基的性质
① 一般的物理性质 ② 互变异构现象
O HN O C N N H
uracil 酮式
OH C
HO
N
uracil 烯醇式
③ 碱基的紫外吸收
最大吸收峰在260nm附近
戊 糖
HO CH2 5´ O OH HO CH2 O OH
一.
1944年,O.T.Avery的肺炎双球菌转化实验
S型细菌
菌体 菌落 毒性 形态 有多糖类的荚膜 光滑 有毒性
R型细菌
没有多糖类的荚膜 粗糙 没有毒性
(一)肺炎双球菌的转化实验
1.将无毒性的R型活细菌注射 到小鼠体内,不死亡。
2.将有毒性的S型活细菌注射到 小鼠体内,患败血症死亡。
3.将加热杀死后的S型细菌注 射到小鼠体内,不死亡。 4.将无毒性R型活细菌与加热杀死 后的S型细菌混合后注射到小 鼠体内,小鼠患败血症死亡。 格里菲斯推论: 已经加热杀死的S型细菌中必然含有某种转化因子,这种转化 因子能将无毒的R型活菌转化为有毒的S型活菌。
• 后来的研究证明,遗传物质除了DNA以外还有 RNA。有些病毒不含DNA,只含有蛋白质和RNA, 如烟草花叶病毒。在这些病毒中,RNA是遗传物 质。
RNA是遗传物质的证据
烟草花叶病毒 感染烟草 提取蛋白质 提取RNA
二、核酸的种类、分布和功能
核酸的种类和分布
核酸分为两大类: 脱氧核糖核酸 Deoxyribonucleic Acid (DNA) 核糖核酸 Ribonucleic Acid(RNA)
蛋白质:C H O N 35S
同位素示踪法:用具有放射性的同位素标记某种物质, 从而跟踪某种物质的方法,也叫同位素示踪法。
实验方法步骤
(1)标记细菌 (2)标记噬菌体(一组用32P 标记DNA,一 组用35S 标记蛋白质) (3)噬菌体侵染细菌 (4)搅拌离心:上清液(培养液) 沉淀物(大肠杆菌) (5)观察放射性分布
基因 转录
翻译
多肽 折叠
活性蛋白
DNA —— 一种类型,一种功能 RNA —— 多种类型,多种功能 编码RNA和非编码 (NcRNA)
DNA和RNA的结构异同
性质 戊糖 碱基 RNA D-核糖 A 、 G、 C 、 U DNA 2′-D-脱氧核糖 A 、 G、 C 、 T
多聚核苷酸链的数目
4´ 3´
OH
1´ 2´
OH OH
H
核糖(ribose) (构成RNA)
脱氧核糖(deoxyribose) (构成DNA)
碱水解
HOH2C RNA OH 水解 H H O P O OH O H H O base
2′-核苷酸 3′-核苷酸 混合物
颜色反应
CH3
D-核糖+浓HCl +
HO OH
FeCl3
双螺旋 种类 功能 碱溶液下的稳定性
多为单链
A型 多种 功能多样 不稳定,很容易水解
多为双链
B型和Z型 只有一种 一种功能:充当遗传物质 稳定
核酸的生物功能
1. DNA是主要的遗传物质
是生命遗传的物质基础, 其基本功能是作为遗传信息的载体,负责遗传信息的贮存 和遗传,并作为基因的复制和转录的模板。(基因是 DNA链上的一段核苷酸片段,是DNA功能的最小单位。)
真核
98%核中(染色体) 线粒体(mtDNA) 核外 质粒(plasmid) 叶绿体(ctDNA) 拟核
DNA 原核
核外:质粒(plasmid) 病毒:DNA病毒
RNA
mRNA (5%) 真核 tRNA (10-15%) rRNA(80%) SnRNA(核内) sRNA SnoRNA(核仁) mRNA ScRNA(胞内) 原核 tRNA rRNA 病毒:RNA病毒
(二)著名的肺炎球菌转化试验
1944年由 Avery等完成的,它证明了生物遗传特性 发生改变的转化因子是DNA,而不是蛋白质。
(三)噬菌体转化试验
核酸的发现及研究简史
1868年 F. Miescher 核酸的发现 早期研究 Watson &Crick DNA双螺旋结构的建立 生物技术 人类基因组计划
(1)物理性质 (2)互变异构现象
NH2 N N HOH2C H OH O 1' H H H OH N 9 N
NH2 N O HOH2C H OH O 1' H H H H 1 N
腺嘌呤核苷 (adenosine)
胞嘧啶脱氧核苷 (deoxycytidne)
核苷:AR, GR, UR, CR 脱氧核苷:dAR, dGR, dTR, dCR
核酸的组成单位:核苷酸 核酸的分子组成:碱基,戊糖,磷酸
基本组成单位:核苷酸
核苷酸 核酸 核苷
磷酸
戊糖
碱基
核苷酸的组成
碱 基(base):又称含氮碱
N
NH2 N
嘌呤(purine)
N 7 8 9 NH
NH N
5 4
6 3 N
1N 2
腺嘌呤(adenine, A)
O N
NH
NH
鸟嘌呤(guanine, G)
结论:DNA才是使R型细菌发生稳定遗传变化的物质, 即DNA是遗传物质。而蛋白质不是遗传物质。
二、噬菌体侵染细菌的实验
——DNA是遗传物质的证据
• 噬菌体:是一种病毒。 • 病 毒: 一类无细胞结构的生物,必须生活在活细胞中。
• 病毒分类(1):
结构简单,化学成分是蛋白质和核酸(DNA或RNA )。 植物病毒: 烟草花叶病毒(TMV) 动物病毒: 细菌病毒: HIV, SARS病毒 噬菌体
稀有核苷
(1)由修饰碱基和糖组成的核苷
O HN O N R
5,6-dihydrouridine (D or hU)
H H H H
H N N N
CH3 N N dR
NH2 N O N dR
5-Methyl-dC
5-甲基脱氧胞苷
CH3
二氢尿嘧啶核苷
N6-Methyl-dA
稀有核苷
(2)由非修饰碱基和2′-O-甲基核糖组成的核苷
1953年
作为遗传物质所必须具备的特点
1. 能够准确地复制自己,传递给下一代.
2.结构比较稳定;
3.能贮存大量的遗传信息; 4. 能够指导蛋白质的合成, 从而控制生物的性状和代谢.
1868年,F. Miescher从细胞核中分离得到一种 酸性物质,即现在被称为核酸的物质。
and
可分离
证明DNA是遗传物质
第3章
核酸
NH2 CH3 N
+
NH2 N N N
+
NH2 N N R CH3 N
+
N N N R
N CH3
+
N O HN H2N N
+
N R
CH3 O N HN N
NH2 CH3 O N
+
N R
CH3
H2N
N R
N R
核酸:是以核苷酸为基本组成单位的生物信息分子
(一)核酸的发现
1868年瑞士科学家F.Miescher从 外科绷带上脓细胞的细胞核中分 离得到。但其生物学作用是在70 年后才得到证明。
噬菌体侵染细菌的过程
噬菌体的结构 噬菌体侵染细菌过程 噬菌体借尾丝吸附在细菌表面 把DNA注入到细菌细胞 利用细菌的化学成分和酶系统合 成出噬菌体的DNA、蛋白质 新合成的DNA、蛋白质组装 成很多噬菌体 细菌解体,释放出噬菌体
吸附 注入
合成 组装 释放
结论:DNA是遗传物质,蛋白质不是遗
传物质。
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