蛋白质化学1-4-PPT精选文档49页
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25.11.2019
HgNO3Hg(NO3)2 及HNO3混合物 浓HNO3及NH3
乙醛酸试剂及浓 H2SO4 α-萘酚、NaClO
碱性CuSO4及磷 钨酸-钼酸
二硫硝基苯甲酸 DTNB
红色
黄色、橘 色 紫色
红色
蓝色
紫色
—OH
N
胍基 酚基、吲哚基 巯基
有此反应 的氨基酸
Tyr
Tyr、Phe Trp
Arg
或微溶于醇(Pro和Pro oH能溶于乙醇或乙醚中)不溶于丙 酮,稀酸和稀碱中溶解性好。氨基酸的熔点一般都比较
高,一般都大于200℃
2.旋光性:除甘氨酸外的氨基酸均有旋光性。 3.光谱性质: 含苯环氨基酸大π键吸收紫外光
Tyr:275nm;Phe:257nm;Trp280nm
蛋白质的最大光吸收在280nm
Cys 在体内多生成胱氨酸,形成二硫键
25.11.2019
42
Cys侧链上的SH,反应性能高,在微碱条件下可解离成硫醇 阴离子,(-CH2-S-)能与卤化烷剂如碘乙酸、碘乙酸胺、甲 基碘等反应生成稳定的烷基衍生物
可与二硫硝基苯甲酸(dithionitrobenzoic acid DTNB)或Ellman 试剂发生硫醇-二硫化物交换反应
波长475nm 可以用荧光分光光度计进
行定量检测
25.11.2019
35
(7) 形成Schiff碱
25.11.2019
36
2.由α-羧基参加的反应:
(1)与碱反应成盐 (2)与醇反应成酯 (3)与酰化试剂反应成酰氯 (4)脱羧基生成胺
25.11.2019
37
(1)成盐反应
R—CH—COOH + HCl NH2
Tyr
Cys
40
侧链反应:
Tyr的酚基在3,5位易发生亲电取代反应
Tyr的酚基还可以与重氮化合物结合生成桔黄色化合物(Pauly反应)。 His的咪唑基亦可发生相似的反应,生成棕红色化合物。
25.11.2019
41
Arg的侧链胍基在硼酸缓冲液(PH8 ~ 9 25 ~ 35 ℃)与 1,2环已二酮反应生成缩合物,但此反应可逆
3.酶水解
酶水解既不破坏氨基酸,也不引起消旋。但酶水解 时间长,反应不完全
25.11.2019
5
第二节:氨基酸
一、氨基酸的结构与分类 二、氨基酸的性质
25.11.2019
6
(一)基本结构:L-α-氨基酸
结构特点:
1.都是L-α-氨基酸(除脯氨酸外) 2. R侧链不同 3.天然氨基酸都是L-构型的,(与标 准甘油醛的构型参照得出的)。
25.11.2019
33
(5) 与丹磺酰氯(DNS-Cl)的反应:
酸水解生成的DNS- 氨基酸(具有荧光), 用乙酸乙酯抽提,可 得到DNS-氨基酸, 用色谱法分析之,亦 可不用分离,直接用 纸电泳或薄层层析法 鉴定
25.11.2019
34
(6)与荧光胺反应
1ng即可测出。 激发波长:390nm,发射
1.催化功能 2.调节功能 3. 运动功能 4. 运输和跨膜转运功能 5. 保护和防御功能 6. 信息传递与识别功能 7. 贮存功能 8. 结构功能
25.11.2019
3
二、蛋白质的元素组成
含量% : 50~55 6~7 20~23 15~17 0.3~3 微量或无
元素组成 : C H
O
N
S
其它
蛋白质中N是特征元素,且含量恒定,为16%左右 每克样品含氮量×6.25=样品蛋白质含量(克)。 凯氏(Kjedahl)定氮法的理论基础
此法可以作为氨基酸含量测定的依据
25.11.2019
31
(3) 与2,4-二硝基氟苯 (2,4-DNFB)的反 应(Sanger反应):
DNP-氨基酸为黄色, 它溶于乙酸乙酯;可 用之抽提并与标准的 DNP-氨基酸作比较。
ε-NH3、酚羟基也可 以有此反应,但反 应慢,且生成的 DNP-氨基酸不溶于 乙酸乙酯,而是保 留在水相里。
(2)成酯反应
R—CH—COOH NH2·HCl
HCl气
R—CH—COOH + C2H5OH
R—CH—COOC2H5
NH2
NH2
25.11.2019
38
(3)酰氯化反应
Y—NH—CRH—COOH + PCl5
酰化氨基酸
Y—NH—CRH—COCl
酰化氨基酰氯
使氨基酸的羧基活化,易于另一氨基酸的氨基结合, 在合成肽的工作上常用。
25.11.2019
14
总结::二十种氨基酸的结构特点
支链氨基酸:缬氨酸、亮氨酸,异亮氨酸 含羟基的氨基酸:丝氨酸、苏氨酸 含硫的氨基酸:半胱氨酸(含巯基)、
甲硫氨酸(含硫甲基) 含苯环的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸 含胍基的氨基酸:精氨酸 含咪唑基的氨基酸:组氨酸 亚氨基酸:脯氨酸 ຫໍສະໝຸດ Baidu含酰胺的氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺 含吲哚基的氨基酸:色氨酸 含ε-氨基的氨基酸:赖氨酸
25.11.2019
20
25.11.2019
21
(二)酸碱性质
氨基酸的两性电离及等电点:
25.11.2019
22
氨基酸的等电点(isoelectric point PI)可以定义为: 氨基酸所带正负电荷相等时的溶液pH。
25.11.2019
23
25.11.2019
左图是甘氨酸的电离酸碱 滴定曲线, 第一个拐点:pK’1 : 羧基解离50%的状态, 第二个拐点: 等电点, 第三个拐点pK’2 : 氨基解离50%的状态。
15种
芳香族
3种
杂环(亚氨基酸) 2种
25.11.2019
3.根据侧链酸碱性分为3大类 酸性氨基酸 2 种 碱性氨基酸 3种 中性氨基酸15种
硒代Cys 吡咯赖氨 酸 Stuture? 9
25.11.2019
10
25.11.2019
11
25.11.2019
12
25.11.2019
13
加各种氨基酸的功能
25.11.2019
32
(4) 与苯异硫氰酸酯 (PITC)反应 (Edman反应):
分离过程: 这些衍生物是无色的,酸 性条件下极稳定,可溶于 乙酸乙酯,经高压液相即 可分析出其N端的氨基酸 组成。
生成的肽链比原来少一个氨基 酸,可以进行下一轮反应,而 不需要彻底水解掉 ,此法是 自动氨基酸分析仪的基本原理
24
• 中性氨基酸: • PI=
25.11.2019
中性氨基酸 PI=(pK1 + pK2)/2
25
酸性氨基酸:
pI=(pK’1 + pK’2)/2
加电离图
25.11.2019
酸性氨基酸
pI=(pK1 + pK2)/2
26
25.11.2019
碱性氨基酸
pI=(pK’2 + pK’3)/2
27
(三)化学性质
(4)脱羧反应
H2N—CHR—COOH
脱羧酶
CO2 + RCH2NH2
胺
25.11.2019
39
3.蛋白质侧链的反应
反应名称
试剂
颜色
反应有关基团
米伦反应
黄色反应
乙醛酸反应 (Hopking-Cole 反 应) 坂口反应 (Sakaguchi反应)
酚试剂反应 (Folin-Cioculteu 反应) Ellman反应
25.11.2019
15
不 常 见 蛋 白 质 氨 基 酸
25.11.2019
16
非 蛋 白 质 氨 基 酸
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17
25.11.2019
18
二、氨基酸的性质
物理性质 酸碱性质 化学性质
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19
(一)物理性质 1.溶解性:
多为白色晶体,除胱氨酸和Tyr外,一般都溶于水,不溶
25.11.2019
43
胱氨酸中的二硫键在稳定蛋白质的构象上起很大的作用,氧 化剂和还原剂都可以打开二硫键
25.11.2019
44
25.11.2019
45
3.α-氨基与α-羧基共同参加的反应
(2)成肽反应
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46
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47
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48
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29
(1) 与亚硝酸反应:
此法也是VanSlyke法测氨基氮的理论基础。
该反应也用来判断蛋白质的水解程度。
N2一半来自氨基酸 除α-NH3外,ε-NH3亦可以发生反应,但速度 不如α-NH3快 ,前者3-4min即可完成
25.11.2019
30
(2) 与甲醛的反应:
(主要是因为没有合适的指示剂。封闭氨基后 使氨基酸的滴定范围变小,易于判断滴定终点。)
第一章 蛋白质化学
第一节:概论 第二节:氨基酸 第三节:蛋白质一级结构及测序 第四节:蛋白质空间结构 第五节:蛋白质结构与功能的关系 第六节:蛋白质的性质 第七节:蛋白质的分离与纯化
25.11.2019
1
第一节 概述
生物学功能 元素组成 蛋白质的水解
25.11.2019
2
一、蛋白质的生物学功能
25.11.2019
7
(二)氨基酸的分类
1.常见的蛋白质氨基酸 2.不常见蛋白质氨基酸 3.非蛋白质氨基酸
25.11.2019
8
A.组成蛋白质的氨基酸:有22种
1.根据侧链的极性分为2大类 非极性氨基酸 9 种 极性氨基酸
极性不带电荷的 6种 极性带电荷的 5种
2.根据侧链的化学结构分为3大类
脂肪族
25其.11他.201微9 量元素:P、Fe、Cu、Mn、Zn、Co、Mo、I 等。 4
三、蛋白质的水解
1.酸水解
特点:⑴酸水解不引起氨基酸的消旋,
缺点:但Trp完全被破坏,Ser和Thr部分破坏,Asn和 Gln的酰胺基被水解
2.碱水解
特点:⑴碱水解使氨基酸消旋,许多氨基酸被破坏, ⑵但色氨酸不被破坏。Arg可脱氨生成鸟氨酸及尿 素。常用于测定色氨酸含量
1.α-氨基参加的反应 2.α-羧基参加的反应: 3. 侧链参加的反应 4.α-氨基与α-羧基共同参加的反应
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28
1.α-氨基参加的反应: (1) 与亚硝酸反应: (2) 与甲醛的反应: (3) 与2,4-二硝基氟苯(2,4-DNFB)的反应(Sanger反应): (4) 与苯异硫氰酸酯(PITC)反应(Edman反应): (5) 与丹磺酰氯(DNS-Cl)的反应: (6) 与荧光胺反应 (7) 形成Schiff碱
HgNO3Hg(NO3)2 及HNO3混合物 浓HNO3及NH3
乙醛酸试剂及浓 H2SO4 α-萘酚、NaClO
碱性CuSO4及磷 钨酸-钼酸
二硫硝基苯甲酸 DTNB
红色
黄色、橘 色 紫色
红色
蓝色
紫色
—OH
N
胍基 酚基、吲哚基 巯基
有此反应 的氨基酸
Tyr
Tyr、Phe Trp
Arg
或微溶于醇(Pro和Pro oH能溶于乙醇或乙醚中)不溶于丙 酮,稀酸和稀碱中溶解性好。氨基酸的熔点一般都比较
高,一般都大于200℃
2.旋光性:除甘氨酸外的氨基酸均有旋光性。 3.光谱性质: 含苯环氨基酸大π键吸收紫外光
Tyr:275nm;Phe:257nm;Trp280nm
蛋白质的最大光吸收在280nm
Cys 在体内多生成胱氨酸,形成二硫键
25.11.2019
42
Cys侧链上的SH,反应性能高,在微碱条件下可解离成硫醇 阴离子,(-CH2-S-)能与卤化烷剂如碘乙酸、碘乙酸胺、甲 基碘等反应生成稳定的烷基衍生物
可与二硫硝基苯甲酸(dithionitrobenzoic acid DTNB)或Ellman 试剂发生硫醇-二硫化物交换反应
波长475nm 可以用荧光分光光度计进
行定量检测
25.11.2019
35
(7) 形成Schiff碱
25.11.2019
36
2.由α-羧基参加的反应:
(1)与碱反应成盐 (2)与醇反应成酯 (3)与酰化试剂反应成酰氯 (4)脱羧基生成胺
25.11.2019
37
(1)成盐反应
R—CH—COOH + HCl NH2
Tyr
Cys
40
侧链反应:
Tyr的酚基在3,5位易发生亲电取代反应
Tyr的酚基还可以与重氮化合物结合生成桔黄色化合物(Pauly反应)。 His的咪唑基亦可发生相似的反应,生成棕红色化合物。
25.11.2019
41
Arg的侧链胍基在硼酸缓冲液(PH8 ~ 9 25 ~ 35 ℃)与 1,2环已二酮反应生成缩合物,但此反应可逆
3.酶水解
酶水解既不破坏氨基酸,也不引起消旋。但酶水解 时间长,反应不完全
25.11.2019
5
第二节:氨基酸
一、氨基酸的结构与分类 二、氨基酸的性质
25.11.2019
6
(一)基本结构:L-α-氨基酸
结构特点:
1.都是L-α-氨基酸(除脯氨酸外) 2. R侧链不同 3.天然氨基酸都是L-构型的,(与标 准甘油醛的构型参照得出的)。
25.11.2019
33
(5) 与丹磺酰氯(DNS-Cl)的反应:
酸水解生成的DNS- 氨基酸(具有荧光), 用乙酸乙酯抽提,可 得到DNS-氨基酸, 用色谱法分析之,亦 可不用分离,直接用 纸电泳或薄层层析法 鉴定
25.11.2019
34
(6)与荧光胺反应
1ng即可测出。 激发波长:390nm,发射
1.催化功能 2.调节功能 3. 运动功能 4. 运输和跨膜转运功能 5. 保护和防御功能 6. 信息传递与识别功能 7. 贮存功能 8. 结构功能
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3
二、蛋白质的元素组成
含量% : 50~55 6~7 20~23 15~17 0.3~3 微量或无
元素组成 : C H
O
N
S
其它
蛋白质中N是特征元素,且含量恒定,为16%左右 每克样品含氮量×6.25=样品蛋白质含量(克)。 凯氏(Kjedahl)定氮法的理论基础
此法可以作为氨基酸含量测定的依据
25.11.2019
31
(3) 与2,4-二硝基氟苯 (2,4-DNFB)的反 应(Sanger反应):
DNP-氨基酸为黄色, 它溶于乙酸乙酯;可 用之抽提并与标准的 DNP-氨基酸作比较。
ε-NH3、酚羟基也可 以有此反应,但反 应慢,且生成的 DNP-氨基酸不溶于 乙酸乙酯,而是保 留在水相里。
(2)成酯反应
R—CH—COOH NH2·HCl
HCl气
R—CH—COOH + C2H5OH
R—CH—COOC2H5
NH2
NH2
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38
(3)酰氯化反应
Y—NH—CRH—COOH + PCl5
酰化氨基酸
Y—NH—CRH—COCl
酰化氨基酰氯
使氨基酸的羧基活化,易于另一氨基酸的氨基结合, 在合成肽的工作上常用。
25.11.2019
14
总结::二十种氨基酸的结构特点
支链氨基酸:缬氨酸、亮氨酸,异亮氨酸 含羟基的氨基酸:丝氨酸、苏氨酸 含硫的氨基酸:半胱氨酸(含巯基)、
甲硫氨酸(含硫甲基) 含苯环的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸 含胍基的氨基酸:精氨酸 含咪唑基的氨基酸:组氨酸 亚氨基酸:脯氨酸 ຫໍສະໝຸດ Baidu含酰胺的氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺 含吲哚基的氨基酸:色氨酸 含ε-氨基的氨基酸:赖氨酸
25.11.2019
20
25.11.2019
21
(二)酸碱性质
氨基酸的两性电离及等电点:
25.11.2019
22
氨基酸的等电点(isoelectric point PI)可以定义为: 氨基酸所带正负电荷相等时的溶液pH。
25.11.2019
23
25.11.2019
左图是甘氨酸的电离酸碱 滴定曲线, 第一个拐点:pK’1 : 羧基解离50%的状态, 第二个拐点: 等电点, 第三个拐点pK’2 : 氨基解离50%的状态。
15种
芳香族
3种
杂环(亚氨基酸) 2种
25.11.2019
3.根据侧链酸碱性分为3大类 酸性氨基酸 2 种 碱性氨基酸 3种 中性氨基酸15种
硒代Cys 吡咯赖氨 酸 Stuture? 9
25.11.2019
10
25.11.2019
11
25.11.2019
12
25.11.2019
13
加各种氨基酸的功能
25.11.2019
32
(4) 与苯异硫氰酸酯 (PITC)反应 (Edman反应):
分离过程: 这些衍生物是无色的,酸 性条件下极稳定,可溶于 乙酸乙酯,经高压液相即 可分析出其N端的氨基酸 组成。
生成的肽链比原来少一个氨基 酸,可以进行下一轮反应,而 不需要彻底水解掉 ,此法是 自动氨基酸分析仪的基本原理
24
• 中性氨基酸: • PI=
25.11.2019
中性氨基酸 PI=(pK1 + pK2)/2
25
酸性氨基酸:
pI=(pK’1 + pK’2)/2
加电离图
25.11.2019
酸性氨基酸
pI=(pK1 + pK2)/2
26
25.11.2019
碱性氨基酸
pI=(pK’2 + pK’3)/2
27
(三)化学性质
(4)脱羧反应
H2N—CHR—COOH
脱羧酶
CO2 + RCH2NH2
胺
25.11.2019
39
3.蛋白质侧链的反应
反应名称
试剂
颜色
反应有关基团
米伦反应
黄色反应
乙醛酸反应 (Hopking-Cole 反 应) 坂口反应 (Sakaguchi反应)
酚试剂反应 (Folin-Cioculteu 反应) Ellman反应
25.11.2019
15
不 常 见 蛋 白 质 氨 基 酸
25.11.2019
16
非 蛋 白 质 氨 基 酸
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17
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18
二、氨基酸的性质
物理性质 酸碱性质 化学性质
25.11.2019
19
(一)物理性质 1.溶解性:
多为白色晶体,除胱氨酸和Tyr外,一般都溶于水,不溶
25.11.2019
43
胱氨酸中的二硫键在稳定蛋白质的构象上起很大的作用,氧 化剂和还原剂都可以打开二硫键
25.11.2019
44
25.11.2019
45
3.α-氨基与α-羧基共同参加的反应
(2)成肽反应
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46
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47
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48
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(1) 与亚硝酸反应:
此法也是VanSlyke法测氨基氮的理论基础。
该反应也用来判断蛋白质的水解程度。
N2一半来自氨基酸 除α-NH3外,ε-NH3亦可以发生反应,但速度 不如α-NH3快 ,前者3-4min即可完成
25.11.2019
30
(2) 与甲醛的反应:
(主要是因为没有合适的指示剂。封闭氨基后 使氨基酸的滴定范围变小,易于判断滴定终点。)
第一章 蛋白质化学
第一节:概论 第二节:氨基酸 第三节:蛋白质一级结构及测序 第四节:蛋白质空间结构 第五节:蛋白质结构与功能的关系 第六节:蛋白质的性质 第七节:蛋白质的分离与纯化
25.11.2019
1
第一节 概述
生物学功能 元素组成 蛋白质的水解
25.11.2019
2
一、蛋白质的生物学功能
25.11.2019
7
(二)氨基酸的分类
1.常见的蛋白质氨基酸 2.不常见蛋白质氨基酸 3.非蛋白质氨基酸
25.11.2019
8
A.组成蛋白质的氨基酸:有22种
1.根据侧链的极性分为2大类 非极性氨基酸 9 种 极性氨基酸
极性不带电荷的 6种 极性带电荷的 5种
2.根据侧链的化学结构分为3大类
脂肪族
25其.11他.201微9 量元素:P、Fe、Cu、Mn、Zn、Co、Mo、I 等。 4
三、蛋白质的水解
1.酸水解
特点:⑴酸水解不引起氨基酸的消旋,
缺点:但Trp完全被破坏,Ser和Thr部分破坏,Asn和 Gln的酰胺基被水解
2.碱水解
特点:⑴碱水解使氨基酸消旋,许多氨基酸被破坏, ⑵但色氨酸不被破坏。Arg可脱氨生成鸟氨酸及尿 素。常用于测定色氨酸含量
1.α-氨基参加的反应 2.α-羧基参加的反应: 3. 侧链参加的反应 4.α-氨基与α-羧基共同参加的反应
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1.α-氨基参加的反应: (1) 与亚硝酸反应: (2) 与甲醛的反应: (3) 与2,4-二硝基氟苯(2,4-DNFB)的反应(Sanger反应): (4) 与苯异硫氰酸酯(PITC)反应(Edman反应): (5) 与丹磺酰氯(DNS-Cl)的反应: (6) 与荧光胺反应 (7) 形成Schiff碱