基因的克隆与表达PPT课件
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基因的克隆方法ppt课件
1)直接从基因组中扩增过程: (1)提取基因组DNA作模板 (2)根据目的基因序列设计引物 (3)PCR扩增及产物鉴定
31
提取基因组DNA
PCR引物设计
PCR扩增
基因序列分析
此法适合扩增原 核生物基因。
真核生物基因组含有内含子32 !
2)从mRNA中扩增: RT-PCR
(1)提取基因组 total RNA (2)反转录合成总cDNA作模板 (3)根据目的基因序列设计引物 (4)PCR扩增及序列分析
工作量大。 无法定量研究。 扩出的条带往往是3`端比较短的UTR区的一
段序列,提供的信息较少。
19
优点:
简便、灵敏、高效、省时,能快速显示 mRNA的组成。
所需的mRNA量少。 各样本mRNA的差异可同时进加标签的基因克隆 方法野生株构建基因组 基因苗构建基因组文 库基因苗
阳性克隆
获得阳性克隆 目的基因
基因序列分析,24 确定为基因
转座子标签法
转座子又称转座因子或者跳跃因子,实 际上也是DNA片段,它可以在生物的染色 体组中移动,从染色体的一个位点跳到另 一个位点,或从一条染色体跳到另一条染 色体上,引起基因功能的改变。
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
TTTTTTTTTT
G
3`
15
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
TTTTTTTTTT
G
3`
AATTTTTTTT ACTTTTTTTT AGTTTTTTTT TATTTTTTTT
TCTTTTTTTT TGTTTTTTTT CATTTTTTTT CCTTTTTTTT CGTTTTTTTT GATTTTTTTT
31
提取基因组DNA
PCR引物设计
PCR扩增
基因序列分析
此法适合扩增原 核生物基因。
真核生物基因组含有内含子32 !
2)从mRNA中扩增: RT-PCR
(1)提取基因组 total RNA (2)反转录合成总cDNA作模板 (3)根据目的基因序列设计引物 (4)PCR扩增及序列分析
工作量大。 无法定量研究。 扩出的条带往往是3`端比较短的UTR区的一
段序列,提供的信息较少。
19
优点:
简便、灵敏、高效、省时,能快速显示 mRNA的组成。
所需的mRNA量少。 各样本mRNA的差异可同时进加标签的基因克隆 方法野生株构建基因组 基因苗构建基因组文 库基因苗
阳性克隆
获得阳性克隆 目的基因
基因序列分析,24 确定为基因
转座子标签法
转座子又称转座因子或者跳跃因子,实 际上也是DNA片段,它可以在生物的染色 体组中移动,从染色体的一个位点跳到另 一个位点,或从一条染色体跳到另一条染 色体上,引起基因功能的改变。
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
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G
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mRNA
5` RP
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TCTTTTTTTT TGTTTTTTTT CATTTTTTTT CCTTTTTTTT CGTTTTTTTT GATTTTTTTT
分子生物学实验技术ppt课件
质粒转化大肠杆菌的过程
感受态
非定向克隆 +
或
定向克隆
克隆的片段只能按
+ 特定方向连接基因组DNA的构建基因组DNA的类型
质粒(﹤10kb)噬菌体质经双向电泳之后,用蛋白质水解酶裂解成肽段,可 用于质谱分析。通过电离源将蛋白质分子转化为气相离子, 然后用质谱分析仪的电场、磁场将具有特定质量与电荷比 值(M/Z值)的蛋白离子分离开,经过离子检测器收集分离 的离子,确定离子的M/Z值,分析鉴定未知蛋白质。
两种离子发生方法: 基质辅助激光解吸附/离子化(MALDI)、电喷雾离子化 (ESI)
噬菌体展示技术
噬菌体展示技术是将编码目的蛋白的基 因与编码噬菌体表面蛋白的基因融合后, 以融合蛋白的形式表达在噬菌体表面的一 种技术。
将不同蛋白的cDNA插入噬菌体载体进 行表达,得到表达不同蛋白的一定规模的 噬菌体展示库 。
将“诱饵”蛋白固定化,基于“诱饵”蛋白与 “猎物”蛋白之间的相互作用,可将展示库 中与固定化的“诱饵”蛋白有相互作用的“猎 物”蛋白分离纯化出来,再对“猎物”蛋白进 行质谱鉴定。
四、蛋白组学研究
蛋白质分离 蛋白质分析 蛋白质相互作用的研究方法: 酵母双杂交技术,噬菌体展示技术,表
面等离子共振技术,荧光共振能量转移 技术,蛋白质微阵列芯片技术,免疫共 沉淀技术,pull-down技术
蛋白质分离
最常用的蛋白质分离技术是20世纪70年代发明的双 向电泳(2-DE),是根据蛋白质的等电点不同在pH 梯度介质中进行第一次分离,即等点聚焦(IEF),然 后根据蛋白质分子量的不同进行第二次分离,即 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳。
重叠延伸PCR原理
重叠延伸PCR技术由于使用了具有互补末端的引物, 使PCR 产物形成了重叠链,从而在随后的扩增反应中通过 重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼接起来。可 简单迅速的将两个DNA片段连在一起,用于嵌合基因的构 建
克隆基因的表达
实际的启动子中很少具备与上述序列完全一 致的区域,启动子的这两个区域与上述保 守序列的相似程度越高,该启动子的表达 能力也就越强。
(2)-35区与-10区之间的距离
这两个保守区间的距离越是接近于17bp,启 动子的活性就越强。
2.翻译起始序列对表达效率的影响 (1)SD序列
SD序列与16SrRNA分子之间的碱基互补程 度,可明显影响mRNA的翻译速度,当序列 为5‘-GGAGG-3’,可与16SrRNA3’端完 全互补,翻译效率最高;而当该序列发生 单碱基突变时,翻译效率会下降30倍。
特定的时间顺序发生,称之为基因表达的 时间特异性。
• 多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶 段特异性。
(二)空间特异性 • 在个体生长全过程,某种基因产物在个体
按不同组织空间顺序出现,称之为基因表 达的空间特异性
• 基因表达伴随时间顺序所表现出得这种分 布差异,实际上是由细胞在器官的分布决 定的,所以空间特异性又称细胞或组织特 异性
七、原核表达体系
表达体系的建立包括表达载体的构建、受体细胞的 建立及表达产物的分离、纯化等技术 步骤: 获得目的基因-准备表达载体-将目的基因插入表 达载体中(测序验证)-转化表达宿主菌-诱导 靶蛋白的表达-表达蛋白的分析-扩增、纯化、 进一步检测
(一)获得目的基因
1.对外源目的基因的要求
原核生物缺乏真核生物转录后的加工系统; 同时也缺乏真核生物翻译后的加工系统, 所以目的基因不应具有5’端非编码区以及内 含子结构,只编码成熟的蛋白质或多肽
当需要宿主大量生长时,抑制载体质粒的复制。
当宿主大量生长后,再诱导载体质粒的复制,增 加拷贝数。
6.提高表达产物的稳定性
防止被宿主的酶降解 (1)设计成融合蛋白
(2)-35区与-10区之间的距离
这两个保守区间的距离越是接近于17bp,启 动子的活性就越强。
2.翻译起始序列对表达效率的影响 (1)SD序列
SD序列与16SrRNA分子之间的碱基互补程 度,可明显影响mRNA的翻译速度,当序列 为5‘-GGAGG-3’,可与16SrRNA3’端完 全互补,翻译效率最高;而当该序列发生 单碱基突变时,翻译效率会下降30倍。
特定的时间顺序发生,称之为基因表达的 时间特异性。
• 多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶 段特异性。
(二)空间特异性 • 在个体生长全过程,某种基因产物在个体
按不同组织空间顺序出现,称之为基因表 达的空间特异性
• 基因表达伴随时间顺序所表现出得这种分 布差异,实际上是由细胞在器官的分布决 定的,所以空间特异性又称细胞或组织特 异性
七、原核表达体系
表达体系的建立包括表达载体的构建、受体细胞的 建立及表达产物的分离、纯化等技术 步骤: 获得目的基因-准备表达载体-将目的基因插入表 达载体中(测序验证)-转化表达宿主菌-诱导 靶蛋白的表达-表达蛋白的分析-扩增、纯化、 进一步检测
(一)获得目的基因
1.对外源目的基因的要求
原核生物缺乏真核生物转录后的加工系统; 同时也缺乏真核生物翻译后的加工系统, 所以目的基因不应具有5’端非编码区以及内 含子结构,只编码成熟的蛋白质或多肽
当需要宿主大量生长时,抑制载体质粒的复制。
当宿主大量生长后,再诱导载体质粒的复制,增 加拷贝数。
6.提高表达产物的稳定性
防止被宿主的酶降解 (1)设计成融合蛋白
《基因克隆与表达》课件
总结基因克隆与表达的重要性,并鼓励进一步学习和研究。
2 留下问题和展望
引发学生对基因克隆与表达的思考和问题,并展望该领域的未来发展。
什么是基因克隆与表达
解读基因克隆与表达的定义, 了解其在基因研究中的作用。
基因克隆和表达的重要 性
探讨基因克隆与表达在科学 研究和应用中的重要价值。
课程大纲介绍本课程的内容和学习 Nhomakorabea 标,为后续的学习做好准备。
基因克隆
基因克隆是获取目标基因及其背后的DNA片段的过程。PCR、限制性酶切和连接反应是基因克隆中常用的关键 技术。
2 重组蛋白表达
探讨重组蛋白表达的步骤以及在基因工程和生物医药领域中的可行表达体系选择。
3 基因治疗
介绍基因治疗的原理和在疾病治疗中的应用前景。
结论
在基因研究和应用中,基因克隆和表达起着至关重要的作用。通过了解相关技术和应用,我们可 以更好地理解基因的功能和探索其在生物科学中的潜力。
1 基因克隆和表达的重要性再强调
PC R
探讨聚合酶链式反应(PCR)在 基因克隆中的原理、步骤和应 用。
限制性酶切
介绍限制性酶切的原理及其在 基因克隆中的应用。
连接反应
讨论连接反应在基因克隆中的 原理、步骤和应用。
基因表达
基因表达是指利用转化和重组蛋白表达系统来实现基因功能研究和基因治疗的过程。
1 转化
深入解析转化的原理、步骤和转化后的检测方法。
《基因克隆与表达》PPT 课件
这是一份专业的《基因克隆与表达》PPT课件,将带你深入了解基因克隆和表 达的重要性以及相关技术。通过本课件,你将掌握基因克隆和表达的关键步 骤和应用。
简介
基因克隆与表达是研究基因结构和功能的重要方法。本课程将介绍基因克隆与表达的基本概念、原理和技术, 并探讨其在生物科学研究和应用中的重要性。
2 留下问题和展望
引发学生对基因克隆与表达的思考和问题,并展望该领域的未来发展。
什么是基因克隆与表达
解读基因克隆与表达的定义, 了解其在基因研究中的作用。
基因克隆和表达的重要 性
探讨基因克隆与表达在科学 研究和应用中的重要价值。
课程大纲介绍本课程的内容和学习 Nhomakorabea 标,为后续的学习做好准备。
基因克隆
基因克隆是获取目标基因及其背后的DNA片段的过程。PCR、限制性酶切和连接反应是基因克隆中常用的关键 技术。
2 重组蛋白表达
探讨重组蛋白表达的步骤以及在基因工程和生物医药领域中的可行表达体系选择。
3 基因治疗
介绍基因治疗的原理和在疾病治疗中的应用前景。
结论
在基因研究和应用中,基因克隆和表达起着至关重要的作用。通过了解相关技术和应用,我们可 以更好地理解基因的功能和探索其在生物科学中的潜力。
1 基因克隆和表达的重要性再强调
PC R
探讨聚合酶链式反应(PCR)在 基因克隆中的原理、步骤和应 用。
限制性酶切
介绍限制性酶切的原理及其在 基因克隆中的应用。
连接反应
讨论连接反应在基因克隆中的 原理、步骤和应用。
基因表达
基因表达是指利用转化和重组蛋白表达系统来实现基因功能研究和基因治疗的过程。
1 转化
深入解析转化的原理、步骤和转化后的检测方法。
《基因克隆与表达》PPT 课件
这是一份专业的《基因克隆与表达》PPT课件,将带你深入了解基因克隆和表 达的重要性以及相关技术。通过本课件,你将掌握基因克隆和表达的关键步 骤和应用。
简介
基因克隆与表达是研究基因结构和功能的重要方法。本课程将介绍基因克隆与表达的基本概念、原理和技术, 并探讨其在生物科学研究和应用中的重要性。
基因克隆与表达
蛋白原核表达
精选2021版课件
卫文强 2015.112
目的基因-T
表达载体
酶切, 胶回收,连接
转化到克隆用细胞(Top10)
提质粒,酶切验证
转化到表达用细胞(BL21(DE3))
诱导表达
SDS-PAG精E选2021版课件
2
影响限制性内切酶活性的因素
1). DNA的纯度
DNA中的杂质如蛋白质、酚、氯仿、乙醇、 SDS、EDTA等都会影响酶的活性。
• 酶用量不能超过酶切总体积的10%;
• 多种酶进行酶切时,先低盐后高盐缓冲 液;
精选2021版课件
5
1、连接
连接、转化与重组子鉴定
精选2021版课件
6
(2). 连接条件
(1)必须是两条双链DNA。
(2)DNA 3’ 端有游离的-OH, 5’端有一个磷酸基团(P)。
(3)需要能量 动物或噬菌体中:ATP 大肠杆菌中: NAD+
精选2021版课件
7
2)连接温度:
连接效果最好在37 ℃,但形成的互补 不稳定; 最佳连接温度:12-16 ℃,较好的连 接效果,互补又较稳定;
3)反应液中的成分:
ATP:反复冻熔,ATP活性降低,ATP溶解度 不高,连接缓冲液宜分装;
单价离子:150-200mM NaCl,提高连接效果; PEG:5%以下可以提高连接效率
精选2021版课件
15
抽提出的质粒三种构型 电泳结果:
1)开 环 2)线 状 3)超螺旋
-
电 泳 方 向
精选2021版课件
+
16
凝胶电泳技术
电泳目的:对核酸分子进行分离和检测
精选2021版课件
精选2021版课件
卫文强 2015.112
目的基因-T
表达载体
酶切, 胶回收,连接
转化到克隆用细胞(Top10)
提质粒,酶切验证
转化到表达用细胞(BL21(DE3))
诱导表达
SDS-PAG精E选2021版课件
2
影响限制性内切酶活性的因素
1). DNA的纯度
DNA中的杂质如蛋白质、酚、氯仿、乙醇、 SDS、EDTA等都会影响酶的活性。
• 酶用量不能超过酶切总体积的10%;
• 多种酶进行酶切时,先低盐后高盐缓冲 液;
精选2021版课件
5
1、连接
连接、转化与重组子鉴定
精选2021版课件
6
(2). 连接条件
(1)必须是两条双链DNA。
(2)DNA 3’ 端有游离的-OH, 5’端有一个磷酸基团(P)。
(3)需要能量 动物或噬菌体中:ATP 大肠杆菌中: NAD+
精选2021版课件
7
2)连接温度:
连接效果最好在37 ℃,但形成的互补 不稳定; 最佳连接温度:12-16 ℃,较好的连 接效果,互补又较稳定;
3)反应液中的成分:
ATP:反复冻熔,ATP活性降低,ATP溶解度 不高,连接缓冲液宜分装;
单价离子:150-200mM NaCl,提高连接效果; PEG:5%以下可以提高连接效率
精选2021版课件
15
抽提出的质粒三种构型 电泳结果:
1)开 环 2)线 状 3)超螺旋
-
电 泳 方 向
精选2021版课件
+
16
凝胶电泳技术
电泳目的:对核酸分子进行分离和检测
精选2021版课件
分子生物学:基因克隆及克隆基因的表达
Bam HⅠ GGATCC CCTAGG
Bg lⅡ AGATCT TCTAGA
互连后?
GCCTAG+
GATCC G
ATCTAG+GATCTA
Ⅱ型限制性内切酶具有一些共性和特性:
5. 不同的酶可以识别同一个序列 同工异源酶(isoschizomer)或同裂酶 能识别同一序列(切割位点可同或不同)但来源不同的两种酶。
6. 水浴槽
8. 电泳系统
分子克隆常用的有毒试剂
1. 溴化乙锭: (Ethidium bromide,EB)用来染DNA和RNA的染料, 是一种致癌物 质;它是DNA突变的诱变剂,可以嵌入DNA,使DNA发生突变,致癌。 有累积 效应,不要直接接触,但是要注意通过呼吸摄入,故此环境要通风。EB可以被 皮肤吸收。做实验的时候一定要带手套。但是,只要按照标准的操作使不会有问 题的。严禁随便丢弃。因为EB是强致癌性,而且易挥发,挥发至空气中,危害 很大。
2. DEPC:DEPC即二乙基焦碳酸酯(diethylprocarbonate),可灭活各种蛋白质, 是RNA酶的强抑制剂;DEPC是一种潜在的致癌物质,在操作中应尽量在通风的 条件下进行,并避免接触皮肤。DEPC毒性并不是很强,但吸入的毒性是最强的, 使用时戴口罩。不小心占到手上注意立即冲洗。
3.苯酚:苯酚又名酚或石碳酸,为高毒类原浆毒物,对人体危害严重。它的浓溶液 对皮肤有强烈的腐蚀性,苯酚所致的急性中毒常常造成死亡。 4. 氯仿:三氯甲烷,侵入途径:吸入、食入、经皮吸收。健康危害:主要作用 于中枢神经系统,具有麻醉作用,对心、肝、肾有损害。吸入或经皮肤吸收引起 急性中毒,初期有头痛、头晕、恶心、呕吐、兴奋、皮肤粘膜有刺激症状,以后 呈现精神紊乱、呼吸表浅、反向消失、昏迷等,重者发生呼吸麻痹、心室纤维性 颤动、并可有肝、肾损害。误服中毒时,胃有烧灼感、伴恶心、呕吐、腹痛、腹 泻以后出现麻醉症状。慢性中毒:主要引起肝脏损害,此外还有消化不良、乏力、 头痛、失眠等症状,少数有肾损害。 5. 十二烷基硫酸钠(SDS):提取质粒使用的溶液II中含有SDS,对粘膜和上呼 吸道有刺激作用,对眼和皮肤有刺激作用。可引起呼吸系统过敏性反应。。 6. 其它常用的试剂如强酸强碱都有很强的腐蚀性。
基因克隆与表达
基因表达的检测方法
Northern blot:检测mRNA的方法,可用于检测基因的表达水平。
RT-PCR:通过逆转录和PCR技术,检测特定基因的表达水平。
Western blot:检测蛋白质的方法,可用于检测基因的表达产物。 免疫荧光技术:通过抗体与目标蛋白质的结合,利用荧光标记技术进行 检测。
基因克隆与表达的研究流程
同的后代。
克隆技术可以用 于繁殖动物、植 物和微生物,以 及用于生产转基 因生物和基因治
疗。
克隆技术的主要 步骤包括获取供 体细胞的DNA、 将DNA植入受 体细胞、培养产 生的胚胎并使其 发育成新个体。
克隆技术的优点 包括可以快速繁 殖具有优良性状 的动物和植物, 以及可以用于基 因治疗和药物生
产等领域。
生物安全:基因 克隆与表达技术 可用于检测和预 防生物威胁,如 生物武器和病原 体的传播,保障 公共安全。
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克隆技术的应用:克隆技术在医学、农业、生物技术等领域具有广泛的应用价值,例如 用于生产转基因动物、研究动物模型、繁殖濒危物种等。
克隆技术的分类
胚胎干细胞克隆技术 核移植克隆技术 转基因克隆技术 基因克隆技术
克隆技术的应用
添加项标题
克隆动物:通过基因克隆技术可以繁殖出具有相同基因的动物, 用于医学研究、药物筛选和动物模型建立等。
03 基因表达的调控
基因表达的概述
基因表达的定义:基因表达是指基因经过转录和翻译,将遗传信息传递给蛋白质的过程。
基因表达的调控方式:包括转录水平的调控、转录后的调控和翻译水平的调控。
基因表达的调控机制:包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等。
基因表达的生物学意义:基因表达调控对于生物体的生长发育、代谢和环境适应性等方 面具有重要意义。目的基因的获取:通过基因、PCR、基因合成等方法获取目的基因
《克隆技术》课件PPT课件
克隆技术在濒危物种保护中的应用前景
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胚胎细胞克隆
总结词:将供体细胞的细胞核移植到去核的卵母细胞中,经过培养和激活后形成胚胎并进行移植。 详细描述:核移植克隆是一种利用细胞核移植技术进行无性繁殖的方法。首先,从供体动物体内取出细胞核,然后将其移植到去核的卵母细胞中。经过培养和激活后,形成胚胎并进行移植,最终产生遗传上与原个体完全相同的新个体。 科学依据:核移植克隆技术基于细胞核的全能性和卵母细胞的去分化能力,通过精确的操作实现克隆过程。 技术应用:核移植克隆技术已被应用于多种动物克隆,如牛、羊、猪等。同时,该技术也被应用于人类胚胎干细胞的体外培养和生产。
04
克隆技术的未来发展
克隆技术的科研进展
科研进展
科学家们正在不断探索克隆技术的科研进展,包括对克隆技术的原理、技术手段和伦理问题等方面进行深入研究。
科研成果
随着科研的深入,克隆技术已经取得了一些重要的科研成果,例如成功克隆出人类胚胎干细胞、治疗性克隆技术的发展等。
科研挑战
尽管克隆技术取得了一些进展,但仍面临着许多挑战,例如技术难度大、伦理和法律问题等。
克隆技术在农业领域的应用前景
保护优势
克隆技术可以为濒危物种保护提供更为有效和可靠的方式,避免物种灭绝的风险。
保护挑战
然而,克隆技术在濒危物种保护中的应用仍面临着一些挑战,例如技术难度大、伦理和法律问题等。
濒危物种保护
克隆技术也可以应用于濒危物种的保护,例如通过克隆技术繁殖濒危动物,保护其种群数量。
核移植克隆
成年动物体细胞克隆
总结词:利用成年动物的体细胞进行核移植,形成胚胎并进行移植,产生遗传上与原个体完全相同的新个体。
克隆载体表达载体(课件)PPT课件
详细描述
组成型表达载体是将基因整合到宿主细胞的染色体上,使基因在任何生长条件下都能稳定表达。这种 表达载体适用于需要持续稳定表达的基因。
组织特异性表达载体
总结词
在特定的组织或器官中,表达载体才能 启动基因的表达。
VS
详细描述
组织特异性表达载体是将基因与特定的组 织或器官相关的调控序列结合,使基因只 在特定的组织或器官中表达。这种表达载 体适用于需要组织特异性表达的基因。
05
克隆载体和表达载体的未来发展
克隆载体和表达载体的新技术和新方法
基因编辑技术
利用CRISPR-Cas9等基因编辑技术,实现对克隆载体和表达载体的精确修饰,提高基 因治疗的效率和安全性。
人工染色体技术
开发人工染色体技术,实现对大型基因组的克隆和表达,为遗传病研究和治疗提供新的 工具。
克隆载体和表达载体的新应用和新领域
04
克隆载体和表达载体的应用
克隆载体在基因工程中的应用
基因克隆
克隆载体可以将目的基因插入到质粒 或病毒载体中,实现基因的复制和扩 增,为基因工程提供大量目的基因。
基因保存
基因突变
通过将目的基因插入到克隆载体中, 进行定点突变或随机突变,研究基因 功能和蛋白质活性。
克隆载体可以保存和传递目的基因, 为基因工程提供长期稳定的基因来源。
01
02
03
基因治疗
利用克隆载体和表达载体, 开发新型基因治疗策略, 针对遗传性疾病、肿瘤等 进行有效治疗。
生物制药
通过克隆载体和表达载体, 实现高效、大规模的蛋白 质药物生产,推动生物制 药产业的发展。
农业育种
利用克隆载体和表达载体, 培育抗逆、抗病、高产的 农作物新品种,提高农业 生产效益。
组成型表达载体是将基因整合到宿主细胞的染色体上,使基因在任何生长条件下都能稳定表达。这种 表达载体适用于需要持续稳定表达的基因。
组织特异性表达载体
总结词
在特定的组织或器官中,表达载体才能 启动基因的表达。
VS
详细描述
组织特异性表达载体是将基因与特定的组 织或器官相关的调控序列结合,使基因只 在特定的组织或器官中表达。这种表达载 体适用于需要组织特异性表达的基因。
05
克隆载体和表达载体的未来发展
克隆载体和表达载体的新技术和新方法
基因编辑技术
利用CRISPR-Cas9等基因编辑技术,实现对克隆载体和表达载体的精确修饰,提高基 因治疗的效率和安全性。
人工染色体技术
开发人工染色体技术,实现对大型基因组的克隆和表达,为遗传病研究和治疗提供新的 工具。
克隆载体和表达载体的新应用和新领域
04
克隆载体和表达载体的应用
克隆载体在基因工程中的应用
基因克隆
克隆载体可以将目的基因插入到质粒 或病毒载体中,实现基因的复制和扩 增,为基因工程提供大量目的基因。
基因保存
基因突变
通过将目的基因插入到克隆载体中, 进行定点突变或随机突变,研究基因 功能和蛋白质活性。
克隆载体可以保存和传递目的基因, 为基因工程提供长期稳定的基因来源。
01
02
03
基因治疗
利用克隆载体和表达载体, 开发新型基因治疗策略, 针对遗传性疾病、肿瘤等 进行有效治疗。
生物制药
通过克隆载体和表达载体, 实现高效、大规模的蛋白 质药物生产,推动生物制 药产业的发展。
农业育种
利用克隆载体和表达载体, 培育抗逆、抗病、高产的 农作物新品种,提高农业 生产效益。
分子生物学 基因克隆及克隆基因的表达
Bam HⅠ GGATCC CCTAGG
Bg lⅡ AGATCT TCTAGA
互连后?
GCCTAG+
GATCC G
A
+GATCT
TCTAG
ALOGO
Ⅱ型限制性内切酶具有一些共性和特性:
5. 不同的酶可以识别同一个序列 同工异源酶(isoschizomer)或同裂酶 能识别同一序列(切割位点可同或不同)但来源不同的两种酶。
LOGO
聚合酶链式反应
Polymerase Chain Reaction, PCR
体外高效特异性的扩增目的DNA片段
LOGO
LOGO
LOGO
LOGO
LOGO
PCR的基本原理
• PCR反应条件 • PCR过程 • PCR的特点
1
2
3
高温变性 低温退火 适温延伸
94
温
度 72
(℃)
55
22
DNA 2
3’
3’
5’
上游引物、5’ 引物、Sense primer
PCR反应扩增的就是一对引物之间的DNA片段,PCR反应 成功扩增的关键在于引物的正确设计。
引物设计的总原则——提高引物与模板结合的特异性。
LOGO
PCR引物设计的基本原则: 1.引物与模板的序列要紧密互补。 2.引物自身、引物之间不应存在互补序列。 3.引物不能在模板的非目的位点引发PCR。
LOGO
分子生物学关键的技术突破: DNA重组技术
1972年, 世界上第一个重组DNA分子诞生
1980年, 获诺贝尔化学奖
猿猴病毒DNA
噬菌体DNA
限制性内切酶
限制性内切酶
DNA连接酶 重组DNA分子
基因的定位克隆-PPT
体交配,得到3个基因得杂合体ec ct +/+ + cv (ec、ct、cv得排
列不代表它们在X染色体得真实顺序),取其中3杂合体雌蝇再与 3隐性体ec ct cv/Y雄蝇测交,测交后代如下表。
ec ct +/ + + cv× ec ct cv/Y测交后代数据
序号 1 2 3 4 5 6 7 8
合计
构建遗传图谱 构建物理图谱
M1
M2
染色体步移: Chromos未测序得物种可通过染色体步移得方法进行定位,但就是 比较费时费力,而对于水稻、拟南芥等基因组测序工作已经完成得物种, 则不在利用染色体步移得方法进行定位,直接从构建遗传图谱到构建物
图位克隆得特点就是无需预先知道基因得DNA顺序,也无 需预先知道其表达产物得有关信息,但应有以下两方面得 基本情况。
一就是有一个根据目得基因得有无建立起来得遗传分离群 体,即定位群体,如:F2、DH、BC、RI等。
二就是开展以下几项工作:(1)首先找到与目得基因紧密
连锁得分子标记;(2)用遗传作图与物理作图将目标基因 定位在染色体上得特定得重叠群;(6)通过染色体步行、登陆或跳跃 获得带有目得基因得大片段克隆;(7)通过亚克隆获得带 有目得基因得小片段克隆;(8)通过遗传转化与功能互补 验证最终确定目标基因得碱基序列
F2群体构建
引物设计常用软件及网站
设计软件: primer3、0
primer5、0(寻找酶切位点,设计引物)
Webprimer
序列分析软件: DNAstar(分析序列特征,引物质量,编辑序列)
基因得初步定位(BSA法)
筛选亲本间多态性引物 筛选池间多态性引物
小群体验证
初步定位带型分析
列不代表它们在X染色体得真实顺序),取其中3杂合体雌蝇再与 3隐性体ec ct cv/Y雄蝇测交,测交后代如下表。
ec ct +/ + + cv× ec ct cv/Y测交后代数据
序号 1 2 3 4 5 6 7 8
合计
构建遗传图谱 构建物理图谱
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染色体步移: Chromos未测序得物种可通过染色体步移得方法进行定位,但就是 比较费时费力,而对于水稻、拟南芥等基因组测序工作已经完成得物种, 则不在利用染色体步移得方法进行定位,直接从构建遗传图谱到构建物
图位克隆得特点就是无需预先知道基因得DNA顺序,也无 需预先知道其表达产物得有关信息,但应有以下两方面得 基本情况。
一就是有一个根据目得基因得有无建立起来得遗传分离群 体,即定位群体,如:F2、DH、BC、RI等。
二就是开展以下几项工作:(1)首先找到与目得基因紧密
连锁得分子标记;(2)用遗传作图与物理作图将目标基因 定位在染色体上得特定得重叠群;(6)通过染色体步行、登陆或跳跃 获得带有目得基因得大片段克隆;(7)通过亚克隆获得带 有目得基因得小片段克隆;(8)通过遗传转化与功能互补 验证最终确定目标基因得碱基序列
F2群体构建
引物设计常用软件及网站
设计软件: primer3、0
primer5、0(寻找酶切位点,设计引物)
Webprimer
序列分析软件: DNAstar(分析序列特征,引物质量,编辑序列)
基因得初步定位(BSA法)
筛选亲本间多态性引物 筛选池间多态性引物
小群体验证
初步定位带型分析
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2.真核表达系统:使外源基因在真核细 胞中表达的体系。
.
32
二.原核生物基因结构和表达特点
.
33
1. 原核生物染色体DNA是裸露的环形 DNA,其转录和翻译是偶联的连续 进行。
2. 原核生物形成多顺反子mRNA: mRNA在合成过程中和多个核糖体 结合,翻译形成多条肽链。
.
34
3、一般不含内含子(intron),没有转 录及翻译后加工系统
• PCR过程中,普通的Taq酶可在产 物的3’端多加一个A
.
17
五、基因克隆的工作流程
(一)目的基因的获得
1、直接分离3、构建cDNA4、PCR5、人工合成
6、差异显示
.
18
1、直接物的基因组DNA切割成一定大 小的片段,并与合适的载体重组后 导入宿主细胞,进行克隆。这些存 在于所有重组
11
三、受体细胞
1、定义:外源DNA导入的细胞,是 重组体扩增的场所。
2、要求:易于接纳外源DNA
无特异的内源性核酸内切酶
载体复制、扩增不受阻
与载体有互补性
.
12
四、体外重组的策略
1、粘末端连接 1)全同源粘末端连接 • 最方便简单 • 高背景-载体自身环化 • 双向插入
.
13
2)定向克隆:使外源基因定向插入到载体 中的克隆策略
基因的克隆与表达
.
1
➢基因克隆(gene cloning) ➢基因表达(gene expression)
-原核基因表达 -真核基因表达
.
2
基因克 隆 Gene Cloning
.
3
➢概述 ➢克隆载体 ➢受体细胞 ➢体外重组的策略 ➢基因克隆工作流程
.
4
一、概述
• 确定了遗传信息的携带者,即基因的盆 子载体是DNA而不是蛋白质
• 各种启动子启动转录能力不同。
• 启动子强弱取决于-35区和-10区的碱基组成及其间 隔序列
.
40
终止子(terminator,T):位于基因3’
端,给予RNA聚合酶转录终止信号的 DNA序列
.
20
•构建流程
抽提基因组 DNA 鸟枪法制备DNA片 段 DNA片段与载体重组
转化宿主菌
筛选目的基因(核酸探针法、
免疫结合法)
.
21
• 特点及应用: 包含所有遗传信息 构建难度大(单拷贝基因、长片段基因) 筛选难度大 用于研究基因在基因组中的情况
.223、构建cDNA,筛选目的基因• cDNA(complementary DNA library)以组织细胞中的mRNA为模 板,反转录合成双链cDNA ,各 cDNA分子分别插入载体形成重组子, 再导入宿主细胞克隆扩增。这
24
4、PCR扩增目的基因片段
• 适用于克隆序列清楚的基因
• 以基因组DNA为模板,直接进行PCR 扩增较难
• 多采用以mRNA为模板的RT-PCR法
.
25
5、人工合成较短的DNA
6、差异显示法(differential display, DD)—筛选差异表达的基因
• 长度鉴定:酶切、PCR
• 方向鉴定:联合酶切
• 测序
.
28
基因的表达
Gene Expression
.
29
一.表达系统:
基因工程中用来获得有功能的异源蛋白 质的体系,包括克隆载体,表达载体及 受体细胞。
.
30
.
31
据受体细胞的不同可分为:
1.原核表达系统:
将外源基因引入原核细胞,并使其在原 核细胞中以发酵形式快速高效地表达、 合成基因产物的体系。
.
37
5、原核生物中参与转录的基因结 构:
• 8
启动子(promoter, P)是指能被RNA聚合
酶识别、结合并启动基因转录的一段 DNA序列。
• 一般长40-60bp,富含A-T碱基对
• 具有保守序列:
-10区(pribnow box):TATAAT
-35区:
.
39
• RNA聚合酶识别并结合启动子,但并不开始转录
.
26
(二)体外重组 连接体系的建立: • 温度:粘末端连接:12-18℃
平末端连接:室温(低于30℃) • DNA量:载体分子数/目的基因分子数
=1:1-3 • 酶量:平端连接时需加大酶量
.
27
(三)转化—Cacl2法、电击法
(四)重组子的筛选及鉴定
1、筛选:平板法(抗生素、蓝白斑)
原位杂交
2、鉴定:
.
7
基因克隆的核心-----体外重组 (Recombination) : 人工将一段目的DNA 插入一个载体的过程。
.
8
基因克隆的技术路线
目的基因
载体
体外重组
重组子(杂合DNA)
转化
受体细胞
筛选阳性克隆
大量扩增,获得子代DNA
.
9
.
10
二、克隆载体
➢复制基因(replicator) ➢选择性记号 ➢克隆位点
• 揭示了DNA分子的双螺旋结构模型和半 保留复制机理
• 提出了中心法则和操纵子学说,破译了 遗传密码
.
5
1973年Cohen完成第一个基因工程实验
经体外重组获得杂合DNA 杂合子转化入大肠杆菌
➢所需元件: 限制性内切酶 连接酶 载体 受体细胞
.
6
基因克隆(分子克隆molecular cloning)----通过体外重组技术,将一 段目的DNA经切割、连接插入适当载 体,并导入受体细胞,扩增形成大量 子代分子的过程。
• 粘-粘连接:最有效、最快捷
• 粘-平连接:适用于外源基因仅与载体有 一个相同酶切位点,可将另一末端补平
.
14
2、平末端连接:
• 酶切点为平末端或任何两个末端补平 的DNA
• 效率低,酶用量大
.
15
3、人工接头连接
人工接头:人工合成含有酶切位点的寡 核苷酸片段
.
16
4、T-A克隆
• T-vector两条链的5’端含有一个 游离的T
4、原核生物中功能相关的基因串联在 一起,形成操纵子。
.
35
操纵子(operon):是一组功能上相 关,受同一调控区控制的基因组成的 一个遗传单位
.
36
• 原核生物基因表达的基本单位(即一 个转录单位)。
• 共同协调作用,完成某一多肽的表达 调控。
• 包括:调控区(调节基因,启动基因, 操作基因)、 结构基因
.
32
二.原核生物基因结构和表达特点
.
33
1. 原核生物染色体DNA是裸露的环形 DNA,其转录和翻译是偶联的连续 进行。
2. 原核生物形成多顺反子mRNA: mRNA在合成过程中和多个核糖体 结合,翻译形成多条肽链。
.
34
3、一般不含内含子(intron),没有转 录及翻译后加工系统
• PCR过程中,普通的Taq酶可在产 物的3’端多加一个A
.
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五、基因克隆的工作流程
(一)目的基因的获得
1、直接分离3、构建cDNA4、PCR5、人工合成
6、差异显示
.
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1、直接物的基因组DNA切割成一定大 小的片段,并与合适的载体重组后 导入宿主细胞,进行克隆。这些存 在于所有重组
11
三、受体细胞
1、定义:外源DNA导入的细胞,是 重组体扩增的场所。
2、要求:易于接纳外源DNA
无特异的内源性核酸内切酶
载体复制、扩增不受阻
与载体有互补性
.
12
四、体外重组的策略
1、粘末端连接 1)全同源粘末端连接 • 最方便简单 • 高背景-载体自身环化 • 双向插入
.
13
2)定向克隆:使外源基因定向插入到载体 中的克隆策略
基因的克隆与表达
.
1
➢基因克隆(gene cloning) ➢基因表达(gene expression)
-原核基因表达 -真核基因表达
.
2
基因克 隆 Gene Cloning
.
3
➢概述 ➢克隆载体 ➢受体细胞 ➢体外重组的策略 ➢基因克隆工作流程
.
4
一、概述
• 确定了遗传信息的携带者,即基因的盆 子载体是DNA而不是蛋白质
• 各种启动子启动转录能力不同。
• 启动子强弱取决于-35区和-10区的碱基组成及其间 隔序列
.
40
终止子(terminator,T):位于基因3’
端,给予RNA聚合酶转录终止信号的 DNA序列
.
20
•构建流程
抽提基因组 DNA 鸟枪法制备DNA片 段 DNA片段与载体重组
转化宿主菌
筛选目的基因(核酸探针法、
免疫结合法)
.
21
• 特点及应用: 包含所有遗传信息 构建难度大(单拷贝基因、长片段基因) 筛选难度大 用于研究基因在基因组中的情况
.223、构建cDNA,筛选目的基因• cDNA(complementary DNA library)以组织细胞中的mRNA为模 板,反转录合成双链cDNA ,各 cDNA分子分别插入载体形成重组子, 再导入宿主细胞克隆扩增。这
24
4、PCR扩增目的基因片段
• 适用于克隆序列清楚的基因
• 以基因组DNA为模板,直接进行PCR 扩增较难
• 多采用以mRNA为模板的RT-PCR法
.
25
5、人工合成较短的DNA
6、差异显示法(differential display, DD)—筛选差异表达的基因
• 长度鉴定:酶切、PCR
• 方向鉴定:联合酶切
• 测序
.
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基因的表达
Gene Expression
.
29
一.表达系统:
基因工程中用来获得有功能的异源蛋白 质的体系,包括克隆载体,表达载体及 受体细胞。
.
30
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31
据受体细胞的不同可分为:
1.原核表达系统:
将外源基因引入原核细胞,并使其在原 核细胞中以发酵形式快速高效地表达、 合成基因产物的体系。
.
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5、原核生物中参与转录的基因结 构:
• 8
启动子(promoter, P)是指能被RNA聚合
酶识别、结合并启动基因转录的一段 DNA序列。
• 一般长40-60bp,富含A-T碱基对
• 具有保守序列:
-10区(pribnow box):TATAAT
-35区:
.
39
• RNA聚合酶识别并结合启动子,但并不开始转录
.
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(二)体外重组 连接体系的建立: • 温度:粘末端连接:12-18℃
平末端连接:室温(低于30℃) • DNA量:载体分子数/目的基因分子数
=1:1-3 • 酶量:平端连接时需加大酶量
.
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(三)转化—Cacl2法、电击法
(四)重组子的筛选及鉴定
1、筛选:平板法(抗生素、蓝白斑)
原位杂交
2、鉴定:
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基因克隆的核心-----体外重组 (Recombination) : 人工将一段目的DNA 插入一个载体的过程。
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8
基因克隆的技术路线
目的基因
载体
体外重组
重组子(杂合DNA)
转化
受体细胞
筛选阳性克隆
大量扩增,获得子代DNA
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二、克隆载体
➢复制基因(replicator) ➢选择性记号 ➢克隆位点
• 揭示了DNA分子的双螺旋结构模型和半 保留复制机理
• 提出了中心法则和操纵子学说,破译了 遗传密码
.
5
1973年Cohen完成第一个基因工程实验
经体外重组获得杂合DNA 杂合子转化入大肠杆菌
➢所需元件: 限制性内切酶 连接酶 载体 受体细胞
.
6
基因克隆(分子克隆molecular cloning)----通过体外重组技术,将一 段目的DNA经切割、连接插入适当载 体,并导入受体细胞,扩增形成大量 子代分子的过程。
• 粘-粘连接:最有效、最快捷
• 粘-平连接:适用于外源基因仅与载体有 一个相同酶切位点,可将另一末端补平
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14
2、平末端连接:
• 酶切点为平末端或任何两个末端补平 的DNA
• 效率低,酶用量大
.
15
3、人工接头连接
人工接头:人工合成含有酶切位点的寡 核苷酸片段
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4、T-A克隆
• T-vector两条链的5’端含有一个 游离的T
4、原核生物中功能相关的基因串联在 一起,形成操纵子。
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35
操纵子(operon):是一组功能上相 关,受同一调控区控制的基因组成的 一个遗传单位
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36
• 原核生物基因表达的基本单位(即一 个转录单位)。
• 共同协调作用,完成某一多肽的表达 调控。
• 包括:调控区(调节基因,启动基因, 操作基因)、 结构基因