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基因克隆的载体
载体(vector)是由在细胞中能 够自主复制的DNA分子构成的一种 遗传成分,通过实验手段可使其它的 DNA片段连接在它的上面,而进行 复制,作为基因工程的载体,必须具 备以下几个性能:
1、分子较小,可携带比较大的DNA片段。
2、能独立于染色体而进行自主复制并且是高效的复制。
3、要有尽可能多种限制酶的切割位点,但每一种限制
主要基因
非接合型质粒 自主复制基因,长生大肠杆菌素基因
按抗性记号分类 Col质粒
接合型质粒
自主复制基因,抗菌素抗性基因
R质粒(R因子)
自主复制基因,转移基因,细菌染色体区段 F质粒( F因子)
自主复制基因,转移基因,大肠杆菌素基因 自主复制基因,转移基因,抗菌素抗性基因 自主复制基因,转移基因,大肠杆菌素基因
流程:
首先加入溶菌酶或十二烷基硫酸钠 (SDS)来促进大肠杆菌的细胞裂解。
将溴化乙锭的氯化铯溶液加到清亮的 大肠杆菌裂解液中,EB会嵌入到DNA链 的碱基中去。
在EB达到饱和时,进行氯化铯密度 梯度离心。
2.碱变性法:
根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体 DNA片断之间,在拓扑学上的差异而发展出来 的。
酶又要最少的切割位点(多克隆位点 multiple cloning sites ,MCS) 。
4、有适合的标记,易于选择。
5、有时还要求载体要能启动外源基因进行转录及表达, 并且尽可能是高效的表达。
6、从安全角度考虑,要求载体不能随便转移,仅限于 在某些实验室内特殊菌种内才可复制等等。
载体
功能
克隆载体: 克隆一个基因或DNA片断
作为载体的质粒大多是由天然质粒经人工适 当改造而成的,目前已有多种经改造的良好的 质粒载体。
质粒(plasmid)
是存在于细菌染色体外的小型环状双链DNA 分子。大小约为 数千碱基对。常 有1 ~ 3个抗药 性基因,以利于 筛选。
质粒载体
1. 克隆的质粒载体 允许外源的DNA插入,储存。主要 是DNA水平上的操作。
Pel oBAC系列
100 - 2000 kb
PCYPAC1
100 - 2000 kb
〉 1000 kb
SV40 载体,昆虫 杆状病毒载体
pSVK3质粒,PBV, Ti质粒
第一节 质粒(plasmid)载体
质粒是一种独立于染色体外的小分子环状 DNA,一般大小约106~108D,可自身复制和表 达,有的质粒还带有可做为选择性标记的抗药 性基因,所以质粒经过适当改选后便可成为良 好的载体。
在PH值12.0~12.5范围内时,线性的DNA 会被变性而共价闭合环状质粒DNA却不会被变 性。
通过冷却或恢复中性PH值使之复性,线性 染色体形成网状结构,而cccDNA可以准确迅 速复性,通过离心去除线性染色体,获得含有 cccDNA的上清液,最后用乙醇沉淀,获得质 粒DNA
3.碱变性法:
1、取1.5毫升含质粒的大肠杆菌过夜培养物,加在 微量离心管中,离心收集细胞沉淀;
表达载体: 用于一个基因的蛋白表达
整合载体: 把一个基因插入到染色体组中
载体
来源: 质粒载体 噬菌体载体 柯斯质粒载体 真核细胞克隆载体
载体的种类和特征
质粒*
受体细胞 E.coli
λ 噬菌体
E.coli丝状噬菌体及噬菌粒源自E.coli粘粒载体
E.coli
BAC (Bacterial Artificial Chromosome)
2. 基因表达的质粒载体 允许外源DNA的插入、储存和表达。
一、质粒的生物学特性:
1、质粒DNA的构型:
SC型 共价闭合环形DNA(cccDNA) OC型 开环DNA(ocDNA) L 型 线性DNA(cDNA)
2、不同质粒的分子量大小差异相当显著:
106~108D
3、作为载体的质粒都含有三种共同的组分:
Col质粒 R质粒(R因子) Ent质粒
6、质粒DNA的复制类型:
低拷贝的质粒(1~3):严紧型复制控制的质粒
(接合型) 高拷贝的质粒(10~60):松弛型复制控制的质粒 (非接合型)
7、质粒的不亲合性
在同一个大肠杆菌细胞,一般不能同时含有两种不 同的。也称为质粒的不相容性。
是指在没有选择压力的情况下,两种亲源关系密切 的不同质粒,不能够在同一个寄主细胞系中稳定地共 存的现象。
复制基因(replicator)、选择性记号、克隆位点
L OC SC
4、质粒DNA编码着一些重要的非染色体控制的遗传性状。
抗性特征、代谢特征、修饰寄主生活方式的因子都等
5、质粒DNA的类型: 接合型和非接合型;含大肠杆菌素Col质粒和含抗菌 素抗性基因的R质粒;F因子和F`因子等。
按接合转移功能分类
结构 环状 线状 环状 环状 环状 环状 线性染色体
线性染色体 环状 环状
插入片断 〈 8*
9 - 24kb
〈 10 kb 35- 45kb ≈300 kb
举例
pUC18/19 , T-载体 pGEM- 3z等 EMBL系列, Λ gt系列 M13mp系列
pJB8,c2RB, pcoslEMBL, pWE15/16, pCV
质粒的不亲合性分子基础,主要是由于它们在复制 功能之间的相互干扰造成的。
(二 ) 、质粒DNA的分离与纯化
1、氯化铯密度梯度离心法; 2、碱变性法; 3、微量碱变性法。
1.氯化铯密度梯度离心法
1、质粒DNA占总DNA的1%~2%; 2、在细胞裂解及DNA分离过程中,大分子
量的细菌染色体易断裂成线性片断,而质 粒DNA分子量小,结构紧密仍保持完整的 状态; 3、染色剂溴化乙锭(EB)能掺入到DNA 链的碱基中,导致链的解旋;而且形成的 EB- DNA复合物中,EB含量越高,密度会 越低。
PAC (P1-derived Artificial chromosome)
YAC (Yeast Artificial chromosome )
MAC (Mammalian Artificial Chromosome)
E.coli E.coli 酵母细胞 哺乳类细胞
病毒载体
动物细胞
穿梭载体
动物细胞 和细菌
2、加入100微升冰冷的液,(50mM葡萄糖, 25mM Tris-HCl PH=8.0, 10mM EDTA,4~5mg 溶菌酶)静置5分钟;
3、加入200微升微冷的液(0.2NaOH,1.0%SDS) 缓缓混匀置室温5分钟。
载体(vector)是由在细胞中能 够自主复制的DNA分子构成的一种 遗传成分,通过实验手段可使其它的 DNA片段连接在它的上面,而进行 复制,作为基因工程的载体,必须具 备以下几个性能:
1、分子较小,可携带比较大的DNA片段。
2、能独立于染色体而进行自主复制并且是高效的复制。
3、要有尽可能多种限制酶的切割位点,但每一种限制
主要基因
非接合型质粒 自主复制基因,长生大肠杆菌素基因
按抗性记号分类 Col质粒
接合型质粒
自主复制基因,抗菌素抗性基因
R质粒(R因子)
自主复制基因,转移基因,细菌染色体区段 F质粒( F因子)
自主复制基因,转移基因,大肠杆菌素基因 自主复制基因,转移基因,抗菌素抗性基因 自主复制基因,转移基因,大肠杆菌素基因
流程:
首先加入溶菌酶或十二烷基硫酸钠 (SDS)来促进大肠杆菌的细胞裂解。
将溴化乙锭的氯化铯溶液加到清亮的 大肠杆菌裂解液中,EB会嵌入到DNA链 的碱基中去。
在EB达到饱和时,进行氯化铯密度 梯度离心。
2.碱变性法:
根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体 DNA片断之间,在拓扑学上的差异而发展出来 的。
酶又要最少的切割位点(多克隆位点 multiple cloning sites ,MCS) 。
4、有适合的标记,易于选择。
5、有时还要求载体要能启动外源基因进行转录及表达, 并且尽可能是高效的表达。
6、从安全角度考虑,要求载体不能随便转移,仅限于 在某些实验室内特殊菌种内才可复制等等。
载体
功能
克隆载体: 克隆一个基因或DNA片断
作为载体的质粒大多是由天然质粒经人工适 当改造而成的,目前已有多种经改造的良好的 质粒载体。
质粒(plasmid)
是存在于细菌染色体外的小型环状双链DNA 分子。大小约为 数千碱基对。常 有1 ~ 3个抗药 性基因,以利于 筛选。
质粒载体
1. 克隆的质粒载体 允许外源的DNA插入,储存。主要 是DNA水平上的操作。
Pel oBAC系列
100 - 2000 kb
PCYPAC1
100 - 2000 kb
〉 1000 kb
SV40 载体,昆虫 杆状病毒载体
pSVK3质粒,PBV, Ti质粒
第一节 质粒(plasmid)载体
质粒是一种独立于染色体外的小分子环状 DNA,一般大小约106~108D,可自身复制和表 达,有的质粒还带有可做为选择性标记的抗药 性基因,所以质粒经过适当改选后便可成为良 好的载体。
在PH值12.0~12.5范围内时,线性的DNA 会被变性而共价闭合环状质粒DNA却不会被变 性。
通过冷却或恢复中性PH值使之复性,线性 染色体形成网状结构,而cccDNA可以准确迅 速复性,通过离心去除线性染色体,获得含有 cccDNA的上清液,最后用乙醇沉淀,获得质 粒DNA
3.碱变性法:
1、取1.5毫升含质粒的大肠杆菌过夜培养物,加在 微量离心管中,离心收集细胞沉淀;
表达载体: 用于一个基因的蛋白表达
整合载体: 把一个基因插入到染色体组中
载体
来源: 质粒载体 噬菌体载体 柯斯质粒载体 真核细胞克隆载体
载体的种类和特征
质粒*
受体细胞 E.coli
λ 噬菌体
E.coli丝状噬菌体及噬菌粒源自E.coli粘粒载体
E.coli
BAC (Bacterial Artificial Chromosome)
2. 基因表达的质粒载体 允许外源DNA的插入、储存和表达。
一、质粒的生物学特性:
1、质粒DNA的构型:
SC型 共价闭合环形DNA(cccDNA) OC型 开环DNA(ocDNA) L 型 线性DNA(cDNA)
2、不同质粒的分子量大小差异相当显著:
106~108D
3、作为载体的质粒都含有三种共同的组分:
Col质粒 R质粒(R因子) Ent质粒
6、质粒DNA的复制类型:
低拷贝的质粒(1~3):严紧型复制控制的质粒
(接合型) 高拷贝的质粒(10~60):松弛型复制控制的质粒 (非接合型)
7、质粒的不亲合性
在同一个大肠杆菌细胞,一般不能同时含有两种不 同的。也称为质粒的不相容性。
是指在没有选择压力的情况下,两种亲源关系密切 的不同质粒,不能够在同一个寄主细胞系中稳定地共 存的现象。
复制基因(replicator)、选择性记号、克隆位点
L OC SC
4、质粒DNA编码着一些重要的非染色体控制的遗传性状。
抗性特征、代谢特征、修饰寄主生活方式的因子都等
5、质粒DNA的类型: 接合型和非接合型;含大肠杆菌素Col质粒和含抗菌 素抗性基因的R质粒;F因子和F`因子等。
按接合转移功能分类
结构 环状 线状 环状 环状 环状 环状 线性染色体
线性染色体 环状 环状
插入片断 〈 8*
9 - 24kb
〈 10 kb 35- 45kb ≈300 kb
举例
pUC18/19 , T-载体 pGEM- 3z等 EMBL系列, Λ gt系列 M13mp系列
pJB8,c2RB, pcoslEMBL, pWE15/16, pCV
质粒的不亲合性分子基础,主要是由于它们在复制 功能之间的相互干扰造成的。
(二 ) 、质粒DNA的分离与纯化
1、氯化铯密度梯度离心法; 2、碱变性法; 3、微量碱变性法。
1.氯化铯密度梯度离心法
1、质粒DNA占总DNA的1%~2%; 2、在细胞裂解及DNA分离过程中,大分子
量的细菌染色体易断裂成线性片断,而质 粒DNA分子量小,结构紧密仍保持完整的 状态; 3、染色剂溴化乙锭(EB)能掺入到DNA 链的碱基中,导致链的解旋;而且形成的 EB- DNA复合物中,EB含量越高,密度会 越低。
PAC (P1-derived Artificial chromosome)
YAC (Yeast Artificial chromosome )
MAC (Mammalian Artificial Chromosome)
E.coli E.coli 酵母细胞 哺乳类细胞
病毒载体
动物细胞
穿梭载体
动物细胞 和细菌
2、加入100微升冰冷的液,(50mM葡萄糖, 25mM Tris-HCl PH=8.0, 10mM EDTA,4~5mg 溶菌酶)静置5分钟;
3、加入200微升微冷的液(0.2NaOH,1.0%SDS) 缓缓混匀置室温5分钟。