2020年病毒的分类与命名.pdf
2020年计算机病毒种类.pptx
4.爱虫 (I love you， 2000 年) 梅丽莎病毒爆发一年后，菲律宾出现了一种新的病毒。与梅丽莎不同的是，这次出现的是 蠕 虫病毒，具有自我复制功能的独立程序。这个病毒的名字叫爱虫 (I love you）。爱虫病毒最 初也是通过邮件传播，而其破坏性要比Melissa 强的多。标题通常会说明，这是一封来自您 的暗恋者的表白信。邮件中的附件则是罪魁祸首。这种蠕虫病毒最初的文件名为 LOVE-LETTER-FOR-YOU.TXT.vbs。后缀名 vbs 表明黑客是使用VB 脚本编写的这段程序。很 多人怀疑是菲律宾的奥尼尔•狄•古兹曼制造了这种病毒。由于当时菲律宾没有制定计算机破 坏的相关法律，当局只得以盗窃罪的名义传讯他。最终由于证据不足,当局被迫释放了古兹 曼。根据媒体估计，爱虫病毒造成大约 100 亿美元的损失。
现在谈到计算机病毒，足以令人谈“毒”色变。硬盘数据被清空，网络连接被掐断，好好的机 器变成了毒源，开始传染其他计算机。中了病毒，噩梦便开始了。虽然现在杀毒软件的功能 也日趋强大，可是道高一尺，魔高一丈，总是会有新的更强大的病毒会出现，并且危害也越 来越大，有报告显示，仅 2008 年，计算机病毒在全球造成的经济损失就高达 85 亿美元。 计算机病毒现身江湖已多年，可以追溯到计算机科学刚刚起步之时，那时已经有人想出破坏 计算机系统的基本原理。1949 年，科学家约翰•冯•诺依曼声称，可以自我复制的程序并非 天方夜谭。不过几十年后，黑客们才开始真正编制病毒。直到计算机开始普及，计算机病毒 才引起人们的注意。下面我们就来盘点一下全球历史上 20 大计算机病毒。 1.Creeper（ 1971 年） 最早的计算机病毒 Creeper（根据老卡通片《史酷比（Scooby Doo ）》中的一个形象命名） 出现在 1971 年，距今以后 42 年之久。当然在那时，Creeper 还尚未被称为病毒，因为计算
第三章 病毒的分类与命名ppt课件
（5）分类阶元只有在病毒代表种的特性得到 了充分了解和在公开出版物上进行过描述， 以致于明确了它们的分类地位，并使其分 类阶元与其他类似的分类阶元相区别时， 才能确定下来。
（6）当病毒有明确的科、而分属未确定时， 这一病毒种在分类学上称为该科的未确定 种（unassigned species）。
植物病毒（Plant Viruses）
植物病毒（plant viruses） 噬藻体(phycophage)
真菌噬菌体或真菌病毒(mycophage) 动物病毒（Animal Viruses）
原生动物病毒(protozoal viruses) 无脊椎动物病毒(inverteble viruses)
昆虫病毒（insect viruses） 脊椎动物病毒(verteble viruses)
第三章 病毒的分类与命名
精品课件ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
病毒分类与命名的意义
病毒分类是将自然界中存在的病毒种群,按照它们的性质相 似性和亲缘关系加以归纳编排,以了解病毒共性与个性的特点. 专门研究病毒分类的学科称为病毒分类学.
由于新病毒的不断发现,且对已知不断性质的了解还不够全 面,所以目前病毒分类学尚处于不成熟阶段.
1. 进行未知病毒的分类和命名。可利用病毒分科、属、种的关系 ，对未知病毒与已经描述过的病毒比较研究和鉴定,若发现新 病毒,可按国际病毒分类命名委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)的规定,提出新描 述的病毒,附有足够的资料,申述理由
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2. 有利于病毒研究工作的交流.病毒分类使病毒研究工作的 交流能够顺利进行。
3. 对寻找新的病毒疫苗株很有意义。利用病毒分类和命名的知 识，有可能寻找新疫苗株。如 Jenner发现牛痘苗能预防人的天 花病，
《病毒的分类与命名》PPT课件
1999年 根据“Virus taxanomy-1999”、病毒分类系统达到了3个目，62个科。另 外亚病毒感染因子（Subviral agent）下设卫星、类病毒和朊病毒，其中 类病毒分类新设立了2个科，7个属。 2000年 ICTV公布第七个国际病毒分类报告，植物病毒的分类有了非常大的进 展，列出15个植物病毒科、73个植物病毒属，其中已归科的属有49个，未归到科 的属有24个。
病毒(bìngdú)属的命名
病毒(bìngdú)属是一群具有某些共同特征的种。其
属名的词尾“virus”；
但在设立一个新的病毒属时必需有一个同时 被承认的代表种(type species) 。
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病毒科的命名(mìng míng)
病毒科是一群具有(jùyǒu)某些共同特征的属。科名
病毒种的命名由几个有实际意义的词组成,但不应该 只是由宿主(sùzhǔ)名加“virus”构成。
已知的细菌病毒种名就是由数字和字母组成的； 植物病毒种的命名,一般是由宿主名加症状(zhèngzhuàng)名和
“virus”构成。
例如：“T4噬菌体属”
(T4-like viruses)
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3. 亚病毒感染因子(yīnzǐ)的规则
类病毒种的词尾是“viroid”，属的词尾为“-
viroid”，亚科的词尾是“-viroinae”（只用于需要这一 分类阶元时），科的词尾是“-viroidae”。
逆转座子（retrotransposons）在分类和命名中被 考虑作为病毒(bìngdú)。
病毒的分类与命名1ppt课件
• 病毒命名筹备委员会(PCNV) 1963
Preparatory Committee for Nomenclature of Virus
• 国际病毒命名委员会(ICNV) 1966
International Committee for Nomenclature of Virus
• 裸露单RN分A病子毒负链RNA病毒目
• 类病毒
• 另增设M亚on病o毒n因eg子a(vsuirbavilreasl agent)
• 1999年第7次分类报告：认可的病毒约4000 种，设3个目
• 不是所有病毒都必须隶属某个目，在没有适当目的情况
下，科可以是最高的病毒分类等级
2、病毒最新分类系统：
一、病毒分类与命名的沿革
3. 1966~1970
➢ Wildy 任ICNV主席,第一次报告——病毒的分类与命名， 描述并划定43个属（或相当于属的组、群）及其他成员； 《病毒学论文集》第5卷
➢ 采用了密码进行分类（每个密码包括4对符号）； ➢ 通过了“国际病毒命名法则”，共18项。
一、病毒分类与命名的• 寄沿生革于一种以上寄主
寄主种类
：
：
：
核酸链类型 核酸含量
核衣壳外形 传播方式/传播介体
R/1 : 2/5 :
E/E : S/O
RNA/SS: 200万Da/5% : 截头杆状/截头杆状: 种子植物/确切介体不
详
R/1 : 2.3/5+ 0.6-1.3/51:977年E终/E止: S/Ne (TRV)
三、病毒分类进展及最新分类系统
• (10)肿瘤病毒群
一、病毒分类与命名的沿革
2. 1962~1966
《病毒的分类与命名》PPT课件
现有的病毒分类名称只要是有用的就应保留,新的命名 不能与已经承认(chéngrèn)的病毒名称重复。人工产生的病毒和 实验室的杂种病毒在分类学上不予考虑。
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一、病毒(bìngdú)的命名与分类系统进展概况
病毒(bìngdú)的分类和命名大事记
1937年 Levaditi和Lepine就曾根据病毒对组织的亲和性进行分类。 1948年 Holmes提出根据病毒所引起的宿主症状的分类方案。 1950年 第五届国际微生物学会提出了有关病毒分类的8项原则。 1963年 国际微生物命名(mìng míng)委员会病毒分会根据安德鲁斯(Andrewes) 提 出的分类建议提出了新的8项分类原则： ① 核酸的类型、结构和分子量； ② 病毒粒子的形状和大小； ③ 病毒粒子的结构； ④ 病毒粒子对乙醚、氯仿等脂溶剂的敏感性； ⑤ 血清学性质和抗原关系； ⑥ 病毒在细胞培养上的繁殖特性； ⑦ 对除脂溶剂以外的理化因子的敏感性； ⑧ 流行病学的特征。
第二章 名
病毒的分类 与命 (fēn lèi)
第1、系统分类
根据病毒间的亲缘关系来进行划分成一定类群→科学 名称→适当描述
2、实用：按照一定的分类系统制成分类表，以便(yǐbiàn)对 未知病毒进行鉴定。
由于在性质上毫不相关的病毒具有相同的形态 特征，且病毒具有特殊的繁殖方式，主要采用复制方式来完
在现今水平，要得到一个既能反映病毒的进 化，又能体现病毒间亲缘关系的自然的分类系统， 难度比较大。
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目前已发现的病毒的种类约4000多种。
最新病毒的分类与命名
病毒的命名过去不够统一，有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名，有些病毒是以地名和人名进行命名，还有些病毒是以字母和数字命名。
病毒的分类系统也不一致，动物病毒分类等级设立科、属、种；而植物病毒分为组、亚组、种。
为了力求分类和命名的统一，1992年Martelli首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则，1993年8月在英国格拉斯哥召开的第9届国际病毒大会上，国际病毒分类委员会(ICTV)采纳了这一分类原则，并且新设立了一些植物病毒的科、属［1］，1995年在ICTV 所公布的病毒分类和命名第六次报告中，植物病毒分类已不再采用组、亚组，而统一使用科、属、种分类系统［2］。
病毒的分类系统也开始逐渐向更高级的分类等级发展，1991年ICTV在病毒分类和命名第五次报告中首次公布了比科更为高级的分类等级，单分子负链RNA病毒目(Mononegavirales)［3］，最近ICTV 又先后增设了套病毒目(Nidovirales)［4］和有尾噬菌体目(Caudovirales)［5］。
除此以外，1996年8月ICTV在第10届国际病毒大会上还对原有的病毒分类和命名规则作了进一步的修订，提出了38条新的病毒命名规则［6］。
最近据Mayo等报道，ICTV又批准了43条新的病毒分类和命名规则，同时对病毒目、科、属和种名的书写也作了专门的规范［7］。
1 病毒命名规则1.1 病毒种的定义和命名病毒“种”是指构成一个复制谱系(replicating lineage)、占据一个特定小生境(ecological niche)、具有多个分类特征的病毒。
这就是说病毒种的分类和命名不是单纯由某一个分类特征、而是由多原则分类特征决定的，包括病毒的基因组组成，病毒颗粒形态结构、生理生化特性和血清学性质等；而病毒种的一个复制谱系则强调了病毒种的系统进化特性，即现今所有的病毒种可能起源于共同的病毒祖先；病毒种所占有的小生境是指某种病毒的特定生物学特性、地理分布、宿主范围、媒介的嗜亲性、致病机理等［8］。
2020年各种传染病的疫情分级
现 5－ 19 例病 例。
流行性脑脊 髓膜炎
流行性感冒
细菌性和阿 米巴性痢疾
流行性出血 热
钩端螺旋体 病
乙型脑炎及 其他病毒性
脑炎
疟疾
登革热
炭疽
本县范围 5 天 内发现 30 例以 上病例。
本县范围内发 生新亚型流 行。
本县范围在五 天内发现 300 例以上病例。
本县范围五天 内发现 10 例以 上病例。 本县范围五天 内发现 30 例以 上病例。 本县范围 5 天 内发现 20 例以 上病例。 本县范围五天 内发现 20 例以 上病例或发现 恶性疟本地续 发病例 5 例以 上。 本县范围五天 内发现 10 例以 上病例。 本县范围内出 现肺炭疽病例 或本县范围 5 天内发现 2 例 及以上炭疽病
本县范围发现 炭疽病例。
本县范围内发 现炭疽疑似病 例。
例。
脊髓灰质炎
麻疹
白喉
急性血吸虫 病
急性出血性 结膜炎
本县范围内发 现脊髓灰质炎 野毒株病例或 疑似病例
本县范围内发 现白喉病例。 全省范围发现 本地病例或本 县范围五天内 发现 2 例以上 外省输入病 例。
本县大部分乡 镇出麻疹的暴 发流行。
本县范围发现 肠出血性大肠 杆菌 O157 ：H7 感染性腹泻疑 似病例。
三 级（较大）
辖区范围内， 对鼠类动物进 行血清学检测 发现鼠疫抗体 阳性。
本县范围 1 周 内发现 5-19 例 病例和带菌 者。
本县范围在五 天内发现 10－ 29 例病例。 本县范围在五 天内发现 10－ 29 例病例。
本县范围在五 天内发现 5－ 9 例病例。 本县范围在五 天内发现 5－ 9 例病例。 本县范围 5 天 内发现 50－99 例病例，且地区 分布较集中；或 一个集体单位 5 天内发现 20 －29 例病 例。 本县范围 5 天内发现 20 －49 例病例， 且地区分布集 中；或一个集体 单位 5 天内发
病毒的命名和分类
2）根据病毒所引起旳病变旳性质 疱疹病毒科、痘病毒科 3）以病毒酶作用旳基质 正粘病毒科、副粘病毒科 4）以病毒旳最初分离部位 腺病毒科
5）感染宿主旳部位 鼻病毒属、肠道病毒属 6）以几种属旳缩拼词作为科名 乳多空病毒科
流感病毒旳命名措施
1.国际上通用旳流感病毒命名措施
型别/分离地点/分离序号/分离时间（年代） （血凝素和神经氨酸酶序号）
3．ICTV不统一要求病毒种下列旳分类和命 名。有关血清型、基因型、病毒株、变异 株等旳命名由公认旳国际教授组决定。
4．对人工产生旳病毒和试验室杂交株不予分 类考虑，这些病毒旳命名也一样由公认旳 国际教授组决定。
5．当代表组员病毒经过充分鉴定并在刊登 旳文件上描述后，才干建立一种类，以便 与相同旳类区别。一样，命名一种病毒时， 该病毒必须经过充分鉴定并在文件上刊登 以明确区别于相同旳病毒
以mRNA为关键：根据病毒旳DNA或RNA是
与mRNA互补(-）和不互补（+) 而将病毒分
为6类。
II类（+DNA）
VI类 +RNA
IV类
I类（±DNA） mRNA
V类（-RNA）
III类（±RNA）
四、动物病毒旳分类现状
➢ 一 DNA病毒
（一）单链DNA病毒 细小病毒科（Parvoviridae)：猪细小病毒（PPV） 圆环病毒科（Circoviridae) ：猪圆环病毒（PCV）
最新旳病毒分类报告：第六次报告（ 1995年） 目前已知旳病毒有3600多种，它们分别属于
71个病毒科; 其中动物病毒（涉及脊椎动物病毒和无椎脊动
物病毒）有2023余种，分属27个病毒科;
（二）分类根据
1．病毒旳形态学特征
2020年病毒分类表.pptx
根据病毒的组成及复制方式，病毒分为如下几类：
• （Viruses） o （DNA Viruses） ▪ 第一组：（Group I: dsDNA Viruses） ▪ 第二组：（Group II: ssDNA Viruses） o （RNA virus） ▪ 第三组：（Group III: dsRNA Viruses） ▪ 第四组：（Group IV: (+)ssRNA Viruses） ▪ 第五组：（Group V: (-)ssRNA Viruses） o （DNA and RNA Reverse Transcribing Viruses） ▪ 第六组：（Group VI: RNA Reverse Transcribing Viruses） ▪ 第七组：（Group VII: DNA Reverse Transcribing Viruses）
学海无 涯
病毒分类表
（International Union of Microbiological Societies，IUMS）病毒学组设立 的（The International Committee on Taxonomy of Viruses，ICTV）制定了《国 际与命名原则》（The International Code of Virus Classification and Nomenclature）。病毒及类病毒的（taxon）的规则简述如下：
病毒的分类和命名
自从1898年贝杰林克（Beijerinck）首次提出“病毒”的概念以来，已经过去100多年时间。
病毒的种类由最初的几十种、几百种，发展到今天的4000多种，为了使如此多的病毒种类能够得到科学的命名和分类，国际病毒分类委员会(International Comittee on Taxonomy of Viruses, ICTV)已提出和多次修订了病毒的命名和分类原则，并且建立了由目、科（亚科）、属和种分类阶元构成的病毒分类系统。
目前病毒分类学这一门重要的基础学科已开始走向完善和逐渐成熟起来。
一、病毒的命名与分类系统进展概况病毒分类学是随着病毒学尤其是分子病毒学的发展而建立起来的，并逐渐走向成熟。
病毒的分类和命名大事记1937年Levaditi和Lepine就曾根据病毒对组织的亲和性进行分类。
1948年Holmes提出根据病毒所引起的宿主症状的分类方案。
1950年第五届国际微生物学会提出了有关病毒分类的8项原则。
1963年国际微生物命名委员会病毒分会根据安德鲁斯(Andrewes)提出的分类建议提出了新的8项分类原则：①核酸的类型、结构和分子量；②病毒粒子的形状和大小；③病毒粒子的结构；④病毒粒子对乙醚、氯仿等脂溶剂的敏感性；⑤血清学性质和抗原关系；⑥病毒在细胞培养上的繁殖特性；⑦对除脂溶剂以外的理化因子的敏感性；⑧流行病学的特征。
1966年在莫斯科举行的第九届国际微生物学会上成立了国际病毒命名委员会（International Committee on Nomenclature of Viruses, ICNV），并通过了上述新的8项分类原则。
1971年ICNV公布了关于病毒分类和命名的第一次报告，将当时了解得比较清楚的500多种病毒分为RNA和DNA病毒两大类，并且分为43个病毒属。
1973年ICNV正式更名为国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)。
病毒的种类PDF.pdf
第二节病毒的种类一.植物种类繁多，绝大多数种子植物都能发生病毒病。
禾本科、葫芦科、豆科、十字花科、蔷薇科植物受害较重，感染病毒的种类较多。
植物病毒的核酸大多数是ssRNA。
粒子形态基本有三种类型：杆状、线条状、近乎球状的多面体，也有些是有的粒子。
植物病毒和其它病毒一样是严格寄生物，但它们的专化性不强，一种病毒往往能于不同科、属、种的栽培、野生植物上。
病毒侵染植物除造成外部症状外，在细胞内部组织或细胞也有不正常表现。
最突出的表现是在感染细胞内形成细胞内含体。
细胞内含体一类是结晶形的，一类是非结晶形的（又称X小体）。
结晶形内含体通常由病毒粒子堆叠而成，在非结晶形的内含体中，有不少是病毒粒子和寄主细胞成分混合而成的。
结晶形内含体：无色透明呈六角形、长条形成不规则形晶体、有纺缍形针状或8字形的长纤维状。
非结晶形是半透明的颗粒状聚积体，呈圆形成椭圆形。
感染病毒的植物，对病毒也有以下的抵抗作用：1.病毒的定域化，不发生全身感染，只发生局部感染。
如产生局部坏死斑点，使病毒局限在病斑内部。
2.病毒相互作用形成的抵抗现象。
一种植物感染二种病毒，会出现加重或减轻症状等。
A.干扰作用：一种病毒影响他种病毒的感染。
B.防御作用：先入的病毒对后入的病毒侵染起防御作用。
3.获得抗性：植物感染某一病毒后，对某一种或其它种病毒具有抗性。
二.人类和动物病毒病毒可进入人和动物细胞生长，引起人和动物多种病毒病。
粒子形态有球状的多面体，也有复杂颗粒，如蝌蚪状，砖形，卵形，也有些是有封套的粒子等。
如脊椎动物病毒的脊椎灰质炎病毒、流感、狂犬病等。
人类80%以上的传染病由病毒引起，肝炎、天花等，家畜、鸡疫、鸭疫等。
动物病毒中，可分两类：杀死细胞病毒和非杀细胞病毒。
1.杀死细胞病毒感染：使细胞受到破坏成死亡，称杀细胞或溶细胞病毒。
如人脊髓灰质病毒。
2.由非杀细胞病毒引起稳定状态感染，叫非杀细胞病毒。
不引起明显的损伤，但持续感染。
病毒对动物引起癌症，称致癌病毒，致癌病毒既引起动物癌症，也引起人的癌症。
病毒分类表PDF.pdf
（International Union of Microbiological Societies，IUMS）病毒学组设立的（The International Committee on Taxonomy of Viruses，ICTV）制定了《国际与命名原则》（The International Code of Virus Classification and Nomenclature）。
病毒及类病毒的（taxon）的规则简述如下：：病毒的目以“-病毒目”（-virales）为词尾；：病毒的科以“-病毒科”（-viridae）为词尾，类病毒的科以“-类病毒科”（-viroidae）为词尾；：病毒的亚科以“-病毒亚科”（-virinae）为词尾；：病毒的属以“-病毒属”（-virus）为词尾，类病毒的属以“-类病毒属”（-viroid）为词尾；：病毒的种病毒分类不使用、、这几个阶层。
根据病毒的组成及复制方式，病毒分为如下几类：•（Viruses）o（DNA Viruses）▪第一组：（Group I: dsDNA Viruses）▪第二组：（Group II: ssDNA Viruses）o（RNA virus）▪第三组：（Group III: dsRNA Viruses）▪第四组：（Group IV: (+)ssRNA Viruses）▪第五组：（Group V: (-)ssRNA Viruses）o（DNA and RNA Reverse Transcribing Viruses）▪第六组：（Group VI: RNA Reverse Transcribing Viruses）▪第七组：（Group VII: DNA Reverse Transcribing Viruses）•（Subviral Agents）o（Satellites）o（Viroids）o（Prions）也可以根据病毒的宿主，分为“病毒”、“病毒”、“病毒”、“病毒”、及“病毒”。
第四章：病毒的命名和分类ppt课件
4.基因组的复制策略、开放阅读框架 的数目和位置、转录特征、翻译特征、 翻译后加工特征。
5．蛋白质
结构蛋白的数目、大小和功能活性，非结构 蛋白的数目、大小和功能活性，蛋白质的特殊 功能活性（转录酶、反转录酶、血凝素、神经 氨酸酶）
6．脂质、糖类含量和特性
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7．在细胞培养中的生长特性
最好使用听起来悦耳的名称。
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10．不使用上标、下标、连字符、斜杠和希腊字 母。
11．新名称不应与已通过的名称有重复，应选用 与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称。
12．如果缩拼词对病毒学家有意义，且得到公认 的国际专家组的推荐，可以接受作为类的名称。
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关于类和病毒的命名原则
2. 通用的病毒分类系统采用目、科、亚科、 属和种的等级制度，在种的命名尚不完善 的情况下，许多病毒可用国际通用的俗名。
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3．ICTV不统一规定病毒种以下的分类和命 名。关于血清型、基因型、病毒株、变异 株等的命名由公认的国际专家组决定。
4．对人工产生的病毒和实验室杂交株不予分 类考虑，这些病毒的命名也同样由公认的 国际专家组决定。
13．由一个类或病毒的名称所隐含的任何意 义都会因在名称中涉及不是所有成员或潜 在成员所具有的特征，以及不是均等地适 用于不同类的特征而排斥该类中的合适成 员病毒，这种情况应当避免。
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14．新名的选用应考虑国家或民族敏感性问题。 应采用那些被病毒学家在科学杂志上发表的工 作中常用的名称及衍生名称作为命名的基础， 此时可不必考虑国家来源；在有一个以上的候 选名称时，相应的研究组或分委员会向ICTV执 行委员会提出建议，由执行委员会决定取哪一 个名称。
第四章病毒分类和命名
P 21~43
第四章 病毒分类和命名
• 病毒是一类比较原始的、有生命特征的、能够 自我复制和严格细胞内寄生的非细胞生物
• 病毒的定义随着分子病毒学的发展而不断延伸 • 类病毒、卫星病毒、朊病毒的发现丰富了病毒
学的内容 • 病毒分类学是随着病毒学尤其是分子病毒学的
发展而建立起来的，并逐渐走向成熟。
三、病毒分类进展及最新分类系统
• 95年以前植物病毒不设目 • 95年采用科、属、种分类系统 • 1991年ICTV第5次报告设1个目：
单分子负链RNA病毒目 Mononegavirales • 1999年第7次分类报告：认可的病毒约4000 种，设3个目
• 不是所有病毒都必须隶属某个目，在没有适当目的情况 下，科可以是最高的病毒分类等级
：
：
：
核酸链类型 核酸含量
核衣壳外形 传播方式/传播介体
R/1 : 2/5 :
E/E : S/O
RNA/SS: 200万Da/5% : 截头杆状/截头杆状: 种子植物/确切介体不详
R/1 : 2.3/5+ 0.6-1.3/5 : E/E : S/Ne (TRV)
1977年终止
三、病毒分类进展及最新分类系统
病毒命名的一般规则：
• 名称的改变、新名称以及分类单元的设立
应正式提交给ICTV常务委员会，在作出决 定之前， ICTV分会委员会和研究小组应进 行充分的协商
• 新名称的选用应考虑国家和地区敏感性问题
病毒的命名
词尾： 属名：-virus 科名 -viridae 亚科名-virinae 目：-virales
• (1)外胚层
一、病毒分类与命名的沿革
• (2)外胚层 • (3)1961以前
第二章病毒的分类与命名
病毒种的定义和命名
病毒“种”是指构成一个复制谱系( replicating lineage) 、占据一个特定小生境(ecological niche) 、具 有多个分类特征的病毒。
④ 病毒蛋白：如结构蛋白和非结构蛋白的数量，大小 以及功能和活性，氨基酸序列等； ⑤ 病毒脂类含量和特性； ⑥ 碳水化合物含量和特性； ⑦ 病毒基因组组成和复制。
病毒抗原性质： 包括病毒血清学性质与其抗原的关系。
病毒生物学特性： 包括病毒天然的宿主范围； 病毒在自然状态下的传播与媒介体的关系； 病毒的地理分布，致病机理，组织嗜亲性； 病毒引起的病理和组织病理学特点。
一、病毒的命名与分类系统进展概况
病毒的分类和命名大事记
1966年 在莫斯科举行的第九届国际微生物学会上成立了国际病毒命名委员 会 （International Committee on Nomenclature of Viruses, ICNV），并 通过了上述 新的8项分类原则。 1971年 ICNV公布了关于病毒分类和命名的第一次报告，将当时了解得比较 清楚的500多种病毒分为RNA和DNA病毒两大类，并且分为43个病毒属。 1973年 ICNV正式更名为国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)。 1976年 ICTV公布了病毒分类和命名的第二次报告，将病毒已建立的属（组） 按宿主分为五大类。 1979年 公布了病毒分类和命名第三次报告，并根据病毒核酸类型，包膜有 无将病毒分为7大类，总共有53个科（组或群）。
但在设立一个新的病毒属时必需有一个 同时被承认的代表种(type species) 。
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病毒的命名过去不够统一，有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名，有些病毒是以地名和人名进行命名，还有些病毒是以字母和数字命名。
病毒的分类系统也不一致，动物病毒分类等级设立科、属、种；而植物病毒分为组、亚组、种。
为了力求分类和命名的统一，1992年Martelli首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则，1993年8月在英国格拉斯哥召开的第9届国际病毒大会上，国际病毒分类委员会(ICTV)采纳了这一分类原则，并且新设立了一些植物病毒的科、属［1］，1995年在ICTV 所公布的病毒分类和命名第六次报告中，植物病毒分类已不再采用组、亚组，而统一使用科、属、种分类系统［2］。
病毒的分类系统也开始逐渐向更高级的分类等级发展，1991年ICTV在病毒分类和命名第五次报告中首次公布了比科更为高级的分类等级，单分子负链RNA病毒目(Mononegavirales)［3］，最近ICTV 又先后增设了套病毒目(Nidovirales)［4］和有尾噬菌体目(Caudovirales)［5］。
除此以外，1996年8月ICTV在第10届国际病毒大会上还对原有的病毒分类和命名规则作了进一步的修订，提出了38条新的病毒命名规则［6］。
最近据Mayo等报道，ICTV又批准了43条新的病毒分类和命名规则，同时对病毒目、科、属和种名的书写也作了专门的规范［7］。
1 病毒命名规则1.1 病毒种的定义和命名病毒“种”是指构成一个复制谱系(replicating lineage)、占据一个特定小生境(ecological niche)、具有多个分类特征的病毒。
这就是说病毒种的分类和命名不是单纯由某一个分类特征、而是由多原则分类特征决定的，包括病毒的基因组组成，病毒颗粒形态结构、生理生化特性和血清学性质等；而病毒种的一个复制谱系则强调了病毒种的系统进化特性，即现今所有的病毒种可能起源于共同的病毒祖先；病毒种所占有的小生境是指某种病毒的特定生物学特性、地理分布、宿主范围、媒介的嗜亲性、致病机理等［8］。
病毒种的命名由几个有实际意义的词组成，但不是单独以宿主名加“virus”构成，当ICTV下属委员会不能肯定一个新的病毒种的分类地位时，新的病毒种可以作为暂定种列在适宜的属和科中；在不考虑病毒属和科的情况下，病毒种名与病毒株一起，均应有明确的含义；如果数字和字母已经用于某一特定病毒种的命名，其数字、字母或其组合可作为病毒种的形容词，现在已知的细菌病毒种名就是由数字和字母组成的，这些细菌病毒通常没有太大的表型上的差异，而且感染相同或相似的宿主；植物病毒种的命名，一般是由宿主名加症状名和“virus”构成。
1.2 病毒属的命名病毒属是一群具有某些共同特征的种。
其属名的词尾为“virus”，但在设立一个新的病毒属时必需有一个同时被承认的代表种(type species)。
1.3 病毒科的命名病毒科是一群具有某些共同特征的属。
科名的词尾为“viridae”，“科”下面可以设立或不设立亚科。
亚科名的词尾为“virinae”。
1.4 病毒目的命名病毒目是一群具有某些共同特征的科，目名的词尾为“virales”。
一般而言，病毒颗粒的形态、基因组组成、复制方式、病毒结构蛋白和非结构蛋白的数量和大小，往往都可以作为病毒科、属命名的依据，而病毒目的命名则与病毒基因组的核酸类型、基因组的单双链、逆转录过程和病毒基因组的极性有关。
此外，病毒颗粒的形态结构和转录策略也可以用作病毒目命名的根据。
2 病毒名称的书写规则在病毒分类系统中所采用的病毒目、科、亚科和属均用斜体字书写或打印，目、科、亚科和属名的第一个字母要大写。
原来规定病毒种名一律不用斜体字书写或打印，种名的第一个字母一般不大写，但在特殊情况下，如病毒种名是来自地名或某个宿主的拉丁科名、属名时，则种名的第一个字母要大写。
但1998年3月ICTV在第27次常务会上，对病毒种名的书写规则又重新作了修订，提出了所有的病毒种名用斜体，第一个词的首字母要大写，其他词除专有名词外首字母一般不大写，同时还规定暂定种(tentative species)不用斜体，第一个字母采用大写［7］。
3 病毒分类系统1995年ICTV在病毒分类和命名第六次报告中共报告了4 000多种病毒，它们分属1个目、49个科、11个亚科、164个属(包括未分科的22个属)［2］。
1996年8月在耶路撒冷第10届国际病毒大会期间，ICTV对第六次报告作了修改和补充，1997年5月ICTV在法国的斯特拉斯堡再次召开常务会议，会上批准的病毒分类系统包括2个目、55个科、189个属(有23个属的分科未定)［9］。
1998年3月ICTV在美国加州San Diego召开了第27次常务会议，又新增添了1个目、6个科、26个属［5］。
最近，根据Pringle惠赠的“Vir us taxonomy-1999”，ICTV已经批准取消乳多空病毒科(Papovaviridae)，同时新设立了乳头瘤病毒科(Papillomaviridae)和多瘤病毒科(Polyomaviridae)，这样病毒分类系统达到了3个目、62个科。
另外亚病毒感染因子(subviral agent)下设卫星、类病毒和朊病毒，其中类病毒分类有2个科、7个属，类病毒科名的词尾为“viroidae”，属名词尾为“viroid”［5，10］。
国际病毒分类系统见表。
在新近公布的国际病毒分类系统中，所设立的科、属、种的中文名除了参考黄祯祥、侯云德、田波、牛宏舜、朱关福、张成良等人的相关文献外，一些新设立的病毒科、属、种的名称均按照国际病毒命名规则和命名的过程给予了适当的中文名，如：Mononegavirales下设4个科，即副粘病毒科(Paramyxoviridae)、弹状病毒科(Rhabdoviridae)、丝状病毒科(Filoviridae)和博尔纳病毒科(Bornaviridae)。
该病毒目是根据这4个病毒科的RNA基因组具有单分子负极性的共同结构特性而命名的，由希腊字“monos”(single)、“nega”(negative)，加上病毒目的拉丁词尾“virales”组成，故称为单分子负链RNA病毒目(Mononegavirales)［11］；Nidovirales是以冠状病毒科(Coronaviridae)和动脉炎病毒科(Arteriviridae)的基因组可转录产生一组长短不等的mRNA，即套(nest)亚基因组mRNA而命名的，它由拉丁字“nidus”(nest)加病毒目的拉丁词尾“virales”构成［12］。
对个别确实无法给出适当中文名的病毒名称，将留给国内的病毒学家和同仁进一步研究确定。
表国际病毒分类系统Table The universal system of virus taxonomy(Caudovirales)肌尾噬菌体科(Myoviridae) 细菌“T4噬菌体属”(T4-like viruses) 肠杆菌T4噬菌体(Enterobacteria phage T4) “P1噬菌体属”(P1-like viruses) 肠杆菌P1噬菌体(Enterobacteria phage P1) “P2噬菌体属”(P2-like viruses) 肠杆菌P2噬菌体(Enterobacteria phage P2) “Mu噬菌体属”(Mu-like viruses) 肠杆菌Mu噬菌体(Enterobacteria phage Mu) “SPOl噬菌体属”(SPOl-like viruses) 芽孢杆菌SPOl噬菌体(Bacillus phage SPO1) “H噬菌体属”(H-like viruses) 盐杆菌H噬菌体(Halobacterium virus H) 长尾噬菌体科(Siphoviridae) 细菌“λ噬菌体属”(λ-like viruses) 肠杆菌λ噬菌体(Enterobacteria phage λ)“T1噬菌体属”(T1-like viruses) 肠杆菌T1噬菌体(Enterobacteria phage T1) “T5噬菌体属”(T5-like viruses) 肠杆菌T5噬菌体(Enterobacteria phage T5) “ψM1噬菌体属”(ψM1-like viruses) 甲烷杆菌ψM1噬菌体(Methanobacterium ψM1)“c2噬菌体属”(c2-like viruses) 乳球菌c2噬菌体(Lactococcus phages c2) “L5噬菌体属”(L5-like viruses) 分枝杆菌L5噬菌体(Mycobacterium phages L5) 短尾噬菌体科(Podoviridae) 细菌“T7噬菌体属”(T7-like viruses) 肠杆菌T7噬菌体(Enterobacteria phage T7) “29噬菌体属”(29-like viruses) 芽孢杆菌29噬菌体(Bacillus phage 29) “P22噬菌体属”(P22-like viruses) 肠杆菌P22噬菌体(Enterobacteria phage P22)—古噬菌体科(Rudiviridae) 古细菌古噬菌体属(Rudivirus) 硫化叶菌噬菌体SIRV1(Sulfolobus virus SIRV1)—复层噬菌体科(Tectiviridae) 细菌复层噬菌体属(Tectivirus) 肠杆菌PRD1噬菌体(Enterobacteria phage PRD1)—覆盖噬菌体科(Corticoviridae) 细菌覆盖噬菌体属(Corticovirus) 交替单胞菌PM2噬菌体(Alteromonas phage PM2)—芽生噬菌体科(Plasmaviridae) 支原体芽生噬菌体属(Plasmavirus) 无胆甾原体L2噬菌体(Acholeplasma phage L2)—脂毛噬菌体科(Lipothrixviridae) 古细菌脂毛噬菌体属(Lipothrixvirus) 热变形菌噬菌体1 (Thermoproteus virus 1)—微小纺锤形噬菌体科(Fuselloviridae) 古细菌微小纺锤形噬菌体属(Fusellovirus) 硫化叶菌噬菌体 SSV1(Sulfolobus virus SSV1)—痘病毒科(Poxviridae) 脊椎动物和无脊椎动物脊椎动物痘病毒亚科(Chordopoxvirinae) 正痘病毒属(Orthopoxvirus) 痘苗病毒(Vaccinia virus) 副痘病毒属(Parapoxvirus) 口疮病毒(Orf virus) 禽痘病毒属(Avipoxvirus) 鸡痘病毒(Fowlpox virus) 山羊痘病毒属(Capripoxvirus) 绵羊痘病毒(Sheeppox virus) 野兔痘病毒属(Leporipoxvirus) 粘液瘤病毒(Myxoma virus) 猪痘病毒属(Suipoxvirus) 猪痘病毒(Swinepox virus) 软疣痘病毒属(Molluscipoxvirus) 人传染性软疣病毒(Molluscum contagiosum virus) 亚塔痘病毒属(Yatapoxvirus) 亚巴猴肿瘤病毒(Yaba monkey tumor virus) 昆虫痘病毒亚科(Entomopoxvirinae) 昆虫痘病毒A属(Entomopoxvirus A) 五月鳃角金龟子昆虫痘病毒(Melolontha melolontha entomopoxvirus) 昆虫痘病毒B属(Entomopoxvirus B) 桑灯蛾昆虫痘病毒(Amsacta moorei entomopoxvirus) 昆虫痘病毒C属(Entomopoxvirus C) 淡黄摇蚊昆虫痘病毒(Chironomus luridus entomopoxvirus)—虹彩病毒科(Iridoviridae) 无脊椎动物、脊椎动物虹彩病毒属(Iridovirus) 无脊椎动物虹彩病毒6型(Invertebrate iridescent virus 6) 绿虹彩病毒属(Chloriridovirus) 无脊椎动物虹彩病毒3型(Invertebrate iridescent virus 3) 蛙病毒属(Ranavirus) 蛙病毒3型(Frog virus 3) 淋巴囊肿病毒属(Lmphocystivirus) 淋巴囊肿病病毒1型(Lymphocystis disease virus 1)—藻类DNA病毒科(Phycodnaviridae) 藻类绿藻病毒属(Chlorovirus) 小球藻病毒1学海无涯(Paramecium bursaria Chlorella virus 1) 寄生藻病毒属(Prasinovirus) 寄生藻病毒SP1(Micromonas pusilla virus SP1) 金藻病毒属(Prymnesiovirus) 金藻病毒PW1(Chrysochromulina brevifilum virus PW1) 褐藻病毒属(Phaeovirus) 褐藻病毒1(Ectocarpus siliculosis virus 1)—杆状病毒科(Baculoviridae) 无脊椎动物核型多角体病毒属(Nucleopolyhedrovirus) 苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒。