聚丙烯酰胺凝胶电泳
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• 聚丙烯酰胺凝胶是由单体丙烯酰胺 (acrylamide, Acr)和交联剂甲叉双丙烯 酰胺(methylene-bisacrylamide, Bis) 在加速剂(TEMED)和催化剂(硫酸铵) 的作用下聚合交联成三维网状结构的凝胶
聚丙烯酰胺凝胶的聚合反应
聚丙烯酰胺凝胶
• 特点:(1)在一定浓度时,凝胶透明、有弹 性、机械性能好 (2)化学性能稳定,与被分 离物不起化学反应 (3)对pH和温度变化较 稳定 (4)几乎无电渗作用 ,只要Acr纯度高, 操作条件一致,则重复性好 (5)样品不易扩 散且用量少 (6)凝胶孔径可调节 (7)分辨率 高
分子量范围与凝胶浓度的关系
PAGE的分类
• 根据具体操作分为:圆柱型,平板型(水 平方向、垂直方向) • 根据凝胶系统的均匀性分为:连续系统, 不连续系统
PAGE圆盘电泳示意图
不连续圆盘电泳示意图
不连续电泳的物理效应
• 样品浓缩效应:凝胶孔径不连续 缓冲液离子成分不连续 pH的不连续性 • 分子筛效应 • 电荷效应 各种蛋白质因所带的净电荷、分子量大小 和形状不同而得以分离
等电聚焦电泳
(isoelectric focusing electrophoresis, IEFE)
• 利用具有线性pH梯度的电泳介质来分离等 电点不同的蛋白质 • 当蛋白质迁移至其pI相同的pH处,则不再 泳动,而浓缩成狭窄的区带 • 蛋白质因其等电点的不同而得以分离
pH梯度的形成
IEFE的聚焦效应
常规PAGE与SDS-PAGE的区别
IEFE优缺点
• 优点:(1)分辨率高,可将pI相差0.01~ 0.02pH单位的蛋白质分开 (2)区带狭窄 (3) 样品不管加到什么部位都可聚焦到其等电 点 • 缺点:(1)需用无盐溶液,而无盐溶液中蛋白 质易沉淀 (2)不适于在pI点不溶解或发生变 性的蛋白质
SDS-蛋白质复合物的形状
琼脂糖凝胶电泳
• 琼脂糖是从琼脂中提取出来的链状多糖 • 优点:(1)含液体量大,达98%~99%,近 似自由电泳,但样品扩散速度小,对蛋白 质吸附极少 (2)分辨率高,重复性好 (3)电泳 速度快 (4)透明,不吸收紫外线,可直接用紫 外检测仪测定 (5)区带可染色,样品易回收 • 缺点:含有较多硫酸根,电渗作用大 • 用途:用于核酸的分离、鉴定
电泳技术 (electrophoresis)
本章主要内容
• • • • • • • 基本原理 醋酸纤维薄膜电泳(CAME) 聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE) SDS-PAGE电泳 琼脂糖凝胶电泳 等电聚焦电泳 双向电泳
概
念
• 带电粒子在直流电场中的作用下,在一定 介质(溶剂)中发生的向异性电极定向移 动的现象称为“电泳” • 利用电泳现象对混合物进行分离分析的技 术称为“电泳技术”
PAGE常见问题
• 凝胶不聚合或聚合时间过长:最常见原因 是硫酸铵失效,需新鲜配制;室温较低时 聚合变慢,可调整硫酸铵和TEMED用量 • 指示剂向相反方向移动:电源连接错误,缓 冲液选择错误 • 指示剂前沿呈“曲线”:“微笑”现象由 凝胶冷却不均匀造成;“皱眉”现象多由 电泳装置不合适、底部气泡或靠近玻片的 凝胶聚合不完全引起
SDS-PAGE
• SDS:十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate),阴离子去垢剂 • SDS带有大量负电荷,大大超过天然蛋白 质原有的电荷量,从而消除或掩盖了不同 种类蛋白质间的电荷差异 • SDS作为变性剂和助溶剂,能断裂分子内 和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋 白质分子的二级和三级结构 • SDS-蛋白质的迁移率取决于分子量的大小
凝胶聚合的影响因素
• 空气中氧能淬灭自由基,使聚合反应终止, 故聚合过程中反应液应与空气隔绝 • 某些材料如有机玻璃等能抑制聚合反应 • 某些化学药物如赤血盐等可减慢反应速度 • 温度升高聚合加快,温度降低聚合减慢
聚丙烯酰胺凝胶的性质
• 总浓度T%:100ml凝胶中含有Acr和Bis的总克数 • T%越大,平均孔径越小,凝胶机械强度增加。 但达15%时胶脆性增大,易断裂;T%过小则凝 胶稀软不易操作 • 交联度C%:交联剂Bis占单体Acr与Bis总量的百 分数 • T%值固定时,C%=5%时孔径最小,高于或低 于5%时孔径相应变大。C%过大胶不透明,缺乏 弹性;过小则凝胶呈糊状
影响电泳的因素
• 样品的性质 • 电场强度 • 缓冲液: (1)pH值 (2) 成分 (3)离子强度 • 支持介质:吸附、电渗,分子筛 • 温度
电
渗
(electro-osmosis)
• 在电场作用下液体相对于固体表面的移 动称“电渗”
醋酸纤维薄膜电泳
(cellulose acetate membrane electrophoresis, CAME)
• 醋酸纤维素是纤维素的羟基乙酰化形成的 纤维素醋酸酯 • 对蛋白质样本吸附少,分离速度快,时间 短,电渗作用虽然高但很均一,不影响分 离效果,经透明化处理后有利于光吸收扫 描测定和膜的长期保存 • 影响因素:膜的性质,缓冲液,电流和电 压,电泳时间和温度,电泳槽的密封性能
聚丙烯酰胺凝胶电泳
(polyacryamide gel electrophoresis, PAGE)
分
类
Байду номын сангаас
• 按有无支持物分为:自由电泳,区带电泳 (其中根据支持物的不同而有不同的名称 如纸电泳,琼脂糖电泳等) • 按电压分:低压电泳,高压电泳 • 按用途分:分析电泳,制备电泳,定量免 疫电泳 • 按支持物形状分:薄层电泳,平板电泳, 圆盘电泳,毛细管电泳 • 按区带形式分:盘状电泳,火箭电泳
特
点
• 凡是带电物质均可应用某一电泳技术分离, 并可进行定性定量分析 • 样品用量少 • 设备简单 • 可在常温进行 • 操作简便省时 • 分辨率高
蛋白质电荷的来源
电泳的基本原理
• • • • 带电粒子在电场中所受的力F=QE 所受阻力F’=6πrηv 电泳平衡时F=F’,则QE= 6πrηv 迁移率(电泳淌度)=Q/ 6πrη,表示粒子在单 位电场强度下的泳动速度 • 不同物质能否利用电泳进行分离,决定于 两者迁移率的差别,有差别才能分离。电 泳后分开的距离与迁移率、电压、时间等 相关