第三节基因定位与连锁遗传图
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2 饱满 糯性 x 凹陷 非糯 wxwxShSh WxWxshsh WxwxShsh × wxwxshsh 20%
3 非糯 有色 x 糯性 无色 WxWxCC wxwxcc WxwxCc × wxwxcc 23.6%
28.02.2021 9
结果:1C-c和Sh-sh之间的重组值为3.6% 2Wx-wx和Sh-sh 20% 3Wx-wx和C-c 23.6%
在染色体上的位置。 例:玉米籽粒颜色C-c (有色-无),饱满(Sh)
对凹陷(sh)为显性,非糯性(Wx)对糯性 (wx)为显性,为了明确这三对基因是否连锁, 曾有人做过三个两点测验。
28.02.2021 8
1 有色 饱满 × 无色 凹陷 CCShSh ccshsh 有色 饱源自文库 无色 凹陷 CcShsh × ccshsh 3.6%
凹陷非糯性有色 × 饱满糯性无色 shsh + + + + ↓ + +wxwx cc +Sh+Wx+c × shshwxwxcc 测交后代Ft表现型 F1配子类型 粒数 交
换类别
28.02.2021 15
饱满、糯性、无色凹陷、非糯、有色饱 满、非糯、无色凹陷、糯性、有色凹陷、 非糯、无色饱满、糯性、有色饱满、非 糯、有色凹陷、糯性、无色 + wx csh + ++ + csh wx +sh + c+ wx ++ + + sh wx c 2708253862660111311642 亲型} 单交换}单交换}双交换 总 数 6708
(一) 两点测验
两点测验是基因定位的最基本的方法, 它是通过一次杂交和一次测交来确定两 对基因是否连锁以及它们之间的距离。 前面所讲的测交法实际上就是两点测验 法。但是,仅凭一次两点测验结果,不 能确定两对基因在染色体上的顺序(即 方向)。
28.02.2021 6
假如要确定三对基因的位置,要做三个两点测 验才能完成。设有A-a、B-b和C-c三对基因, 其定位的具体步骤是:
1、通过一次杂交和一次测交,求出A-a和B-b 之间的重组值,根据重组值确定它们是否连锁。
2、再通过一次杂交和一次测交,求出B-b和Cc之间的重组率,并根据重组率来确定它们是 否连锁。
28.02.2021 7
3、又通过同样的方法确定A-a和C-c是否连锁。 4、根据三个重组值的大小,确定这三对基因
28.02.2021 16
如何分析上述结果呢?
第一步:判断这三对基因是否连锁。若 这三对基因不连锁,即独立遗传(分别 位于非同源的三对染色体上),测交后 代的八种表现型应该彼此相等,而现在 的比例相差很远。
28.02.2021 17
其次,若是两对基因位于同一对同源染 色体上,另一对独立,应该每四种表现 型的比例一样,总共有两类比例值。现 在的结果也不是如此。试验结果是每两 种表现型的比例一样,共有四类不同的 比例值,这正是三对基因连锁在同一对 同源染色体上的特征。
这样,可以确定三个基因之间的顺 序和距离如下图:
20 3.6 wx ―――――――――Sh―――C
28.02.2021 10
28.02.2021 11
两点测验法有两大缺点:
(1)工作量大。要给三个基因定位须做 三次杂交和三次测交。 (2)如果基因间距离较远,很可能 发生双交换,而影响测定结果的精确性。
28.02.2021 23
三对基因在染色体上的位置和距离可以 图示如下: 18.4 3.5 wx ―――――――――――sh ―――c 21.9cM
上述试验结果表明:基因在染色体上 是呈线性排列的。
28.02.2021 24
(三) 干扰和符合
如果两个单交换的发生是彼此独立的, 双交换的频率就应该是两个单交换频率 的乘积。
28.02.2021 12
(二) 三点测验
三点测验是基因定位最常用的方法。通 过一次杂交和一次测交,能同时确定三 个非等位基因间的排列顺序和遗传距离, 而且结果也比较精确。
28.02.2021 13
仍以上述玉米的三对等位基因为例,介 绍三点测验的具体步骤。 步骤:1杂交 2 测交
28.02.2021 14
28.02.2021 29
玉米的连锁遗传图
28.02.2021 30
基因间的距离与 交换值、遗传距离、连锁强度
28.02.2021 31
连锁图是大量实践资料的简明总结,是 遗传研究工作和育种工作的重要参考资 料。 一种生物连锁群的数目应该等于染色 体的对数,有n对染色体就有n个连锁群。 例如,水稻有12个连锁群,桃有8个,玉 米有10个。连锁群的数目不会多于染色 体的对数,但由于研究资料不足,可能 暂时少于染色体的对数。
28.02.2021 27
符合系数愈大,表示干扰愈小。符合系 数等于1,表示无干扰。符合系数为0, 表示完全干扰,即一点发生交换,其邻 近的另一点就不再发生交换。 干扰=1-符合系数
28.02.2021 28
二、遗传连锁图
基因在染色体上呈线性排列。位于同一 对同源染色体上的基因组成一个连锁群 (linkage group),它们具有连锁遗传的 关系。 把一个连锁群的各个基因之间的顺序 和距离标志出来,就成为连锁图 (linkage map),又称为遗传学图 (genetic map)(图)。
28.02.2021 34
谢谢
28.02.2021 25
上例中,理论双交换值应该是 0.184 × 0.035=0.0064=0.64% 而实际双交换值只有0.09% 可见:一个单交换发生后,在它附近
再发生第二个单交换的机会就会减少一 些。这种现象叫做干扰(干涉) (interference)。
28.02.2021 26
一般用符合系数来表示干扰的大小。 符合系数 = 实际双交换值 理论双交换值 上例中符合系数 =0.09/0.64=0.14
28.02.2021 32
基因在连锁图上有一定的位置,这个位 置叫做座位(locus)。一般以最先端的 基因位置为0,但随着研究工作的不断深 入,发现新的基因位于0座位外侧时,把 0点让给新的基因,其余基因依次类推, 作相应移动。应注意,0点并不是染色体 的端点。
28.02.2021 33
两基因之间的重组值介于0-40%之间,不 会超过50%,但图上的距离常常超过50, 那是多次累加的结果。要从图上数值查 出基因间的重组值只限于邻近的基因座 位间。位于同一染色体上的两个基因也 可以表现为独立遗传,那是因为他们之 间发生了多次交换的缘故。
28.02.2021 22
第三步,计算重组值,以确定三对基因间
的遗传距离。
由于每个双交换是由两个单交换组成的,所以 在估算两个单交换时,必须分别加上双交换值, 才能正确地反映实际发生的单交换频率。 双交换值= (4+2)/6708 ×100% =0.09% wx和sh间的重组率= (601+626)/6708 × 100%+0.09%=18.4% sh和c间的重组值 = (116+113)/6708 × 100%+0.09%=3.5%
28.02.2021 21
只有第二种才能产生+++和wxshc两种双交换配 子,其它两种都不可能。所以可以确定三个基 因间的相对位置,是sh在wx和c之间。 用三点测验法确定三个基因在染色体上的 顺序时,先要在Ft中找出双交换类型,尔后以 亲本类型为对照,在双交换中居于中间的基因 是三个连锁基因中的中间基因。确定了中间基 因,排列顺序也就被确定了。
28.02.2021 18
第二步:确定排列顺序 既然这三对基因是连锁的,在染色体上
就有一个排列顺序的问题。首先在Ft群 体中找出两种亲本表现型和两种双交换 表现型。双交换的可能性肯定是最少的, 而亲本型个体数应该最多。
28.02.2021 19
基因间排列顺序确定
28.02.2021 20
本例中无疑是 + wx c 和sh + + 为亲型 + + + 和sh wx c 为双交换型 三对基因,有三种可能的排列方式: sh + + + sh + sh c + + wx c wx + c + + wx
3 非糯 有色 x 糯性 无色 WxWxCC wxwxcc WxwxCc × wxwxcc 23.6%
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结果:1C-c和Sh-sh之间的重组值为3.6% 2Wx-wx和Sh-sh 20% 3Wx-wx和C-c 23.6%
在染色体上的位置。 例:玉米籽粒颜色C-c (有色-无),饱满(Sh)
对凹陷(sh)为显性,非糯性(Wx)对糯性 (wx)为显性,为了明确这三对基因是否连锁, 曾有人做过三个两点测验。
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1 有色 饱满 × 无色 凹陷 CCShSh ccshsh 有色 饱源自文库 无色 凹陷 CcShsh × ccshsh 3.6%
凹陷非糯性有色 × 饱满糯性无色 shsh + + + + ↓ + +wxwx cc +Sh+Wx+c × shshwxwxcc 测交后代Ft表现型 F1配子类型 粒数 交
换类别
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饱满、糯性、无色凹陷、非糯、有色饱 满、非糯、无色凹陷、糯性、有色凹陷、 非糯、无色饱满、糯性、有色饱满、非 糯、有色凹陷、糯性、无色 + wx csh + ++ + csh wx +sh + c+ wx ++ + + sh wx c 2708253862660111311642 亲型} 单交换}单交换}双交换 总 数 6708
(一) 两点测验
两点测验是基因定位的最基本的方法, 它是通过一次杂交和一次测交来确定两 对基因是否连锁以及它们之间的距离。 前面所讲的测交法实际上就是两点测验 法。但是,仅凭一次两点测验结果,不 能确定两对基因在染色体上的顺序(即 方向)。
28.02.2021 6
假如要确定三对基因的位置,要做三个两点测 验才能完成。设有A-a、B-b和C-c三对基因, 其定位的具体步骤是:
1、通过一次杂交和一次测交,求出A-a和B-b 之间的重组值,根据重组值确定它们是否连锁。
2、再通过一次杂交和一次测交,求出B-b和Cc之间的重组率,并根据重组率来确定它们是 否连锁。
28.02.2021 7
3、又通过同样的方法确定A-a和C-c是否连锁。 4、根据三个重组值的大小,确定这三对基因
28.02.2021 16
如何分析上述结果呢?
第一步:判断这三对基因是否连锁。若 这三对基因不连锁,即独立遗传(分别 位于非同源的三对染色体上),测交后 代的八种表现型应该彼此相等,而现在 的比例相差很远。
28.02.2021 17
其次,若是两对基因位于同一对同源染 色体上,另一对独立,应该每四种表现 型的比例一样,总共有两类比例值。现 在的结果也不是如此。试验结果是每两 种表现型的比例一样,共有四类不同的 比例值,这正是三对基因连锁在同一对 同源染色体上的特征。
这样,可以确定三个基因之间的顺 序和距离如下图:
20 3.6 wx ―――――――――Sh―――C
28.02.2021 10
28.02.2021 11
两点测验法有两大缺点:
(1)工作量大。要给三个基因定位须做 三次杂交和三次测交。 (2)如果基因间距离较远,很可能 发生双交换,而影响测定结果的精确性。
28.02.2021 23
三对基因在染色体上的位置和距离可以 图示如下: 18.4 3.5 wx ―――――――――――sh ―――c 21.9cM
上述试验结果表明:基因在染色体上 是呈线性排列的。
28.02.2021 24
(三) 干扰和符合
如果两个单交换的发生是彼此独立的, 双交换的频率就应该是两个单交换频率 的乘积。
28.02.2021 12
(二) 三点测验
三点测验是基因定位最常用的方法。通 过一次杂交和一次测交,能同时确定三 个非等位基因间的排列顺序和遗传距离, 而且结果也比较精确。
28.02.2021 13
仍以上述玉米的三对等位基因为例,介 绍三点测验的具体步骤。 步骤:1杂交 2 测交
28.02.2021 14
28.02.2021 29
玉米的连锁遗传图
28.02.2021 30
基因间的距离与 交换值、遗传距离、连锁强度
28.02.2021 31
连锁图是大量实践资料的简明总结,是 遗传研究工作和育种工作的重要参考资 料。 一种生物连锁群的数目应该等于染色 体的对数,有n对染色体就有n个连锁群。 例如,水稻有12个连锁群,桃有8个,玉 米有10个。连锁群的数目不会多于染色 体的对数,但由于研究资料不足,可能 暂时少于染色体的对数。
28.02.2021 27
符合系数愈大,表示干扰愈小。符合系 数等于1,表示无干扰。符合系数为0, 表示完全干扰,即一点发生交换,其邻 近的另一点就不再发生交换。 干扰=1-符合系数
28.02.2021 28
二、遗传连锁图
基因在染色体上呈线性排列。位于同一 对同源染色体上的基因组成一个连锁群 (linkage group),它们具有连锁遗传的 关系。 把一个连锁群的各个基因之间的顺序 和距离标志出来,就成为连锁图 (linkage map),又称为遗传学图 (genetic map)(图)。
28.02.2021 34
谢谢
28.02.2021 25
上例中,理论双交换值应该是 0.184 × 0.035=0.0064=0.64% 而实际双交换值只有0.09% 可见:一个单交换发生后,在它附近
再发生第二个单交换的机会就会减少一 些。这种现象叫做干扰(干涉) (interference)。
28.02.2021 26
一般用符合系数来表示干扰的大小。 符合系数 = 实际双交换值 理论双交换值 上例中符合系数 =0.09/0.64=0.14
28.02.2021 32
基因在连锁图上有一定的位置,这个位 置叫做座位(locus)。一般以最先端的 基因位置为0,但随着研究工作的不断深 入,发现新的基因位于0座位外侧时,把 0点让给新的基因,其余基因依次类推, 作相应移动。应注意,0点并不是染色体 的端点。
28.02.2021 33
两基因之间的重组值介于0-40%之间,不 会超过50%,但图上的距离常常超过50, 那是多次累加的结果。要从图上数值查 出基因间的重组值只限于邻近的基因座 位间。位于同一染色体上的两个基因也 可以表现为独立遗传,那是因为他们之 间发生了多次交换的缘故。
28.02.2021 22
第三步,计算重组值,以确定三对基因间
的遗传距离。
由于每个双交换是由两个单交换组成的,所以 在估算两个单交换时,必须分别加上双交换值, 才能正确地反映实际发生的单交换频率。 双交换值= (4+2)/6708 ×100% =0.09% wx和sh间的重组率= (601+626)/6708 × 100%+0.09%=18.4% sh和c间的重组值 = (116+113)/6708 × 100%+0.09%=3.5%
28.02.2021 21
只有第二种才能产生+++和wxshc两种双交换配 子,其它两种都不可能。所以可以确定三个基 因间的相对位置,是sh在wx和c之间。 用三点测验法确定三个基因在染色体上的 顺序时,先要在Ft中找出双交换类型,尔后以 亲本类型为对照,在双交换中居于中间的基因 是三个连锁基因中的中间基因。确定了中间基 因,排列顺序也就被确定了。
28.02.2021 18
第二步:确定排列顺序 既然这三对基因是连锁的,在染色体上
就有一个排列顺序的问题。首先在Ft群 体中找出两种亲本表现型和两种双交换 表现型。双交换的可能性肯定是最少的, 而亲本型个体数应该最多。
28.02.2021 19
基因间排列顺序确定
28.02.2021 20
本例中无疑是 + wx c 和sh + + 为亲型 + + + 和sh wx c 为双交换型 三对基因,有三种可能的排列方式: sh + + + sh + sh c + + wx c wx + c + + wx