系统评价_文献筛选与数据提取
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系统评价文献筛选与数据提取
讲授内容
文献筛选
数据提取
亚组分析
一般文献综述与系统评价的甄别
特征
研究题目 计划书 原始研究文献来源与检索 原始研究文献的筛选 原始研究文献的评价 资料收集与数据提取 结果的综合 结论的形成 更新
一般文献综述(review)
较广泛 常缺乏 常不全面,检索策略常未报告 缺乏具体标准、有潜在偏倚 评价方法不统一或未评价 常不规范、随意性 多采用定性描述方法 较主观,受自身水平、观点制约 未更新
数值变量资料标准表达格式
组别 试验组 样本量 例数nE 均数 XE 标准差 SDE
对照组
例数nC
XC
SDC
效应量:MD, SMD
MD: 均数差值=试验组均数(XE)-对照组均数(XC)
SMD:标准化均数差值
MD
SMD
一致 ++ + 测量尺度 不一致 + ++ 随机对照试验 ++ ++ 队列研究 ++ ++ 设计类型 病例对照研究 + + 横断面研究 + + 注:++强烈推荐;+推荐;-不适用
二分类变量资料的标准表达格式
组 别 例数 阳性数 阴性数 阳性率
试验组 对照组 合 计
n1 n2
a c a+c
b d b+d
p1 p2
效应量:RR, OR, RD, NNT
RD (risk difference)= p1-p2 (试验组和对照组结局事件发生概率绝对差值) NNT (number needed to treat)=1/RD
Index Medicus Journals
Nursing Journals
Abridged Index Medicus
Health Care Administration Journals
Consumer Journals Dental Journals
(四)文献纳入与筛选(关键环节)
根据研究问题(PICOS)来确定纳入与排 除标准,进而选择文献 (Selecting good studies),并非所有文献都可纳入。
合格的全文文献数
排除的全文文献数及原因
排除标准
纳入
纳入的定量综合文献数(Meta分析)
纳入的定性综合文献数
文献纳入与排除标准的制定
PICOS:
similar
similar
patient populations: P
interventions: I
control/comparison: C
选择性偏倚 随访偏倚 测量偏倚
控制偏倚风险的主要手段
RCTs 随机 盲法 观察性研究 混杂控制? 硬性指标测量?
选择性偏倚 实施偏倚
随访偏倚
测量性偏倚 报告偏倚
随访充分
盲法测量 强制注册
随访充分?
盲法测量? 注册?
RCT 风 险 评 估 实 例 演 示
Garbage in, Garbage out
结果测定 其他辅助信息
二、 数据提取表的设计与数据提取
数据提取表的设计原则:
公开透明:应结合系统评价的目的设计数据提取表 完整性:来源信息、文献的外部、内部特征、辅助 信息。 可操作性:初始数据提取表的予试、条目筛选
来 源 数 据 一 览
1、来源信息
2、文献筛选信息
3、方法学信息(重点)
Garbage in, Garbage out
(六)数据提取与收集
二、 数据提取表的设计与数据提取
目的:收集和提取数据资料(collecting of data), 判断收集数据的可靠性。 资料收集与提取内容
一般资料 研究特征
疾病/患者 研究方法 干预措施 设计方案
偏 倚 风 险 评 估
4、研究对象(重点)
必 须 填 写
选 择 填 写
5、干预措施
6、主要结局指标(重点)
7、结果(重点)
必 备 结 果
(1)Meta分析的数据资料类型
数值变量资料:均数差值(或标准化均数差值) 二分类变量资料: RR (相对危险度), OR (比数比), RD, NNT 。 等级变量资料(有序多分类) : 计数或密度资料:(MI、骨折、妊娠、不良事件) 生存分析资料:二分类、hazard ratio
similar
similar
outcomes: O
similar
study design: S
Cochrane SR的 “纳入标准” 基本格 式
S:研究设计类型 (e.g., RCT) P:研究对象或人群 (risk group) I:干预措施 (dosage strength, regimen) O:主要结局指标 (definitions, follow-up period)及次要结局指标
(三)检索文献
系统全面地收集所有相关的文献资料;必 须使用检索工具, 制定检索方法和检索策略 ( Retrieve relevant literature )---查新查全 要求:
检索策略合理可行,检索过程透明、可重复 检索手段多样(机检+手检) 联合选择多种文献检索源(两个以上)
MEDLINE
系统评价(systematic review)
某一具体临床问题 必备 全面,多途径-检索策略明确 纳入、排除标准明确 有严格的评价方法 透明、规范、质控措施 多采用定量方法meta分析 较客观,基于研究证据 定期更新,时效性
一、系统评价-文献纳入与筛选
确定题目(问题提出明确具体) 制定计划书(Protocol): 检索文献(包括检索策略,查全所有相关研究) 文献纳入与筛选(确定纳入与排除原始研究标准) 纳入研究文献的严格评价 ( 逐一严格评价每个研究的方法 与结果) 数据提取与收集(研究结果提取与标准化) Meta分析 (研究结果间的异质性检验,运用合适的统计方 法,进行汇总分析,亚组分析) 结果报告、讨论及结论 ( 评价、解释、报告 Meta 分析结果, 敏感性分析) 系统评价的更新
O
文献筛选阶段的主要偏倚
选择性偏倚:
纳入与排除标准的合理性 多人同步-质量控制
文献筛选阶段的主要偏倚
选择性偏倚: 发表性偏倚:
小样本阴性结果研究,发表比较困难;非英文研 究文献可能遗漏。其产生的后果是:阳性研究结 果可能会被高估 判断识别:漏斗图、Begger与Egger分析、失效安 全数(fail-safe number)等
1 2 3 4 5
组 别 治疗组 对照组 合 计
治疗开始前 治疗后 前后差值 均数标准差 均数标准差 均数标准差
包括两种形式: 1、观察终点的均数之差 2、治疗前后变化值均数间的差值。 根据基线比较的结果而定。
数值变量资料的效应量选择
均数差值(mean difference, MD):首选 均数差值的标准化值(standardized mean difference , SMD):测量标准或度量衡单位 不统一。
发表性偏倚的识别:funnel plot
发表性偏倚的处理
查Biblioteka Baidu未发表文献
与研究者、药企、专家联系
查询临床试验注册库(clinical trial
register,
WHO)
查找灰色文献,包括会议论文摘要等
强化临床试验注册制度
(五)纳入研究文献的严格评价
对入选的文献, 须用临床流行病学评价文献 的原则和方法,进一步分析评价,以防止和减少 偏倚(assessment of study quality) 。 原始研究的主要偏倚:
OR、RR、RD临床(实际)意义
OR、RR>1 (RD>0),表明干预/暴露因素为危险因素, 偏离1越远,表示危险性越强 0<OR、RR<1 (RD<0) ,表明干预/暴露因素为保护 因素,离0越近,表示保护性越强 OR、RR=1 (RD=0) ,表明干预/暴露因素与结果无关
赋值与数据提取注意事项:
筛选分三步进行 :
初筛:相关性(文题+摘要) - procite-剔重 结合纳入与排除标准—精读+泛读 与作者联系:报告不充分或未报告
检索
通过数据库检索的文献数
通过其他途径检索的文献数
相关性 重复性
筛查
去重后的文献数
筛查过的文献数
排除的文献数
纳入标准
合格
文 献 筛 选 纳 入 流 程 图
干预/暴露因素和结果的赋值标准化:
1表示试验组(暴露),0表示对照组(未暴 露);1表示不良事件,0表示良性事件。否则结 论可能刚好相反。
Dan Shen agents for acute ischaemic stroke
S
Dan Shen agents for acute ischaemic stroke
P
Dan Shen agents for acute ischaemic stroke
I
Dan Shen agents for acute ischaemic stroke
合计
1239 1529 626 1682 1216
SR标准数据格式
组 别 例数 n1 n2 阳性数 a c a+c 阴性数 b d b+d 阳性率 p1 p2
治疗组 对照组 合 计
效应量的确定
相对效应量:试验组与对照组的暴露比 的比值(OR)或者两组率的比值(RR); 当发生事件率低于10%时,两者基本等价。 绝对效应量:RD (rate difference), NNT
表2 5个随机对照试验结果一览 阿司匹林组 对照组 研究 死亡 存活 病死率 死亡 存活 病死率 1 49 566 8.0 67 557 10.7 2 44 714 5.8 64 707 8.3 3 27 290 8.5 32 277 10.4 4 102 730 12.3 126 724 14.8 5 85 725 10.5 52 354 12.8
1)计量资料的数据提取
均数(两组) 标准差(有时只能得到标准误,需转化) 样本含量(两组)
例1 某研究者为分析某降血脂药物的疗效, 纳入了5个RCT,结果如下
研究 治疗组 nt xt 13 5.0 30 4.9 35 22.5 20 12.5 8 6.5 对照组 sd1 nc xc 4.7 13 6.5 1.7 50 6.1 3.4 25 24.9 1.47 20 12.3 0.76 8 7.38 sd2 3.8 2.3 10.7 1.66 1.41
ME,changeSDE,change
MC,baselineSDC,baseline
MC,finalSDC,final
MC,changeSDC,change
2)计数资料的数据提取
各纳入研究中试验组与对照组的例数 各纳入研究中各组的阳性(不良)事件数。
例2 纳入5个多中心临床试验研究,用以评价阿司匹 林治疗心肌梗塞的疗效,资料见表2
(一)确定题目
选题遵循五性原则: 立题: 构建可回答的、具体的、前景性问题, 提出立题依据( well formulated question & rationale) 基本格式: Medicine For Disease/symptom
(二)制定计划书-protocol
明确目的、范围和相关标准(objective and scope referral standard)- 5W1H Background: why is this important? Specify the research question (or questions) Provide an overview of your methods, including search strategy, inclusion/exclusion criteria, quality assessment, how you will abstract the data, and analysis plan Specify if you plan on doing subgroup analyses or sensitivity analyses (best if these are a priori)
有缺陷的数值变量资料提取
偏态数据资料,不能处理,联系原作者 只有标准误,无标准差,需转换。 多臂试验中组别的合并与拆分 部分数据缺失或病例失访
基线测量值 干预后测量值 前后变化差值
试验组 (样本量 NE) 对照组 (样本量 NC)
ME,baseline SDE,baseline
ME,finalSDE,final
讲授内容
文献筛选
数据提取
亚组分析
一般文献综述与系统评价的甄别
特征
研究题目 计划书 原始研究文献来源与检索 原始研究文献的筛选 原始研究文献的评价 资料收集与数据提取 结果的综合 结论的形成 更新
一般文献综述(review)
较广泛 常缺乏 常不全面,检索策略常未报告 缺乏具体标准、有潜在偏倚 评价方法不统一或未评价 常不规范、随意性 多采用定性描述方法 较主观,受自身水平、观点制约 未更新
数值变量资料标准表达格式
组别 试验组 样本量 例数nE 均数 XE 标准差 SDE
对照组
例数nC
XC
SDC
效应量:MD, SMD
MD: 均数差值=试验组均数(XE)-对照组均数(XC)
SMD:标准化均数差值
MD
SMD
一致 ++ + 测量尺度 不一致 + ++ 随机对照试验 ++ ++ 队列研究 ++ ++ 设计类型 病例对照研究 + + 横断面研究 + + 注:++强烈推荐;+推荐;-不适用
二分类变量资料的标准表达格式
组 别 例数 阳性数 阴性数 阳性率
试验组 对照组 合 计
n1 n2
a c a+c
b d b+d
p1 p2
效应量:RR, OR, RD, NNT
RD (risk difference)= p1-p2 (试验组和对照组结局事件发生概率绝对差值) NNT (number needed to treat)=1/RD
Index Medicus Journals
Nursing Journals
Abridged Index Medicus
Health Care Administration Journals
Consumer Journals Dental Journals
(四)文献纳入与筛选(关键环节)
根据研究问题(PICOS)来确定纳入与排 除标准,进而选择文献 (Selecting good studies),并非所有文献都可纳入。
合格的全文文献数
排除的全文文献数及原因
排除标准
纳入
纳入的定量综合文献数(Meta分析)
纳入的定性综合文献数
文献纳入与排除标准的制定
PICOS:
similar
similar
patient populations: P
interventions: I
control/comparison: C
选择性偏倚 随访偏倚 测量偏倚
控制偏倚风险的主要手段
RCTs 随机 盲法 观察性研究 混杂控制? 硬性指标测量?
选择性偏倚 实施偏倚
随访偏倚
测量性偏倚 报告偏倚
随访充分
盲法测量 强制注册
随访充分?
盲法测量? 注册?
RCT 风 险 评 估 实 例 演 示
Garbage in, Garbage out
结果测定 其他辅助信息
二、 数据提取表的设计与数据提取
数据提取表的设计原则:
公开透明:应结合系统评价的目的设计数据提取表 完整性:来源信息、文献的外部、内部特征、辅助 信息。 可操作性:初始数据提取表的予试、条目筛选
来 源 数 据 一 览
1、来源信息
2、文献筛选信息
3、方法学信息(重点)
Garbage in, Garbage out
(六)数据提取与收集
二、 数据提取表的设计与数据提取
目的:收集和提取数据资料(collecting of data), 判断收集数据的可靠性。 资料收集与提取内容
一般资料 研究特征
疾病/患者 研究方法 干预措施 设计方案
偏 倚 风 险 评 估
4、研究对象(重点)
必 须 填 写
选 择 填 写
5、干预措施
6、主要结局指标(重点)
7、结果(重点)
必 备 结 果
(1)Meta分析的数据资料类型
数值变量资料:均数差值(或标准化均数差值) 二分类变量资料: RR (相对危险度), OR (比数比), RD, NNT 。 等级变量资料(有序多分类) : 计数或密度资料:(MI、骨折、妊娠、不良事件) 生存分析资料:二分类、hazard ratio
similar
similar
outcomes: O
similar
study design: S
Cochrane SR的 “纳入标准” 基本格 式
S:研究设计类型 (e.g., RCT) P:研究对象或人群 (risk group) I:干预措施 (dosage strength, regimen) O:主要结局指标 (definitions, follow-up period)及次要结局指标
(三)检索文献
系统全面地收集所有相关的文献资料;必 须使用检索工具, 制定检索方法和检索策略 ( Retrieve relevant literature )---查新查全 要求:
检索策略合理可行,检索过程透明、可重复 检索手段多样(机检+手检) 联合选择多种文献检索源(两个以上)
MEDLINE
系统评价(systematic review)
某一具体临床问题 必备 全面,多途径-检索策略明确 纳入、排除标准明确 有严格的评价方法 透明、规范、质控措施 多采用定量方法meta分析 较客观,基于研究证据 定期更新,时效性
一、系统评价-文献纳入与筛选
确定题目(问题提出明确具体) 制定计划书(Protocol): 检索文献(包括检索策略,查全所有相关研究) 文献纳入与筛选(确定纳入与排除原始研究标准) 纳入研究文献的严格评价 ( 逐一严格评价每个研究的方法 与结果) 数据提取与收集(研究结果提取与标准化) Meta分析 (研究结果间的异质性检验,运用合适的统计方 法,进行汇总分析,亚组分析) 结果报告、讨论及结论 ( 评价、解释、报告 Meta 分析结果, 敏感性分析) 系统评价的更新
O
文献筛选阶段的主要偏倚
选择性偏倚:
纳入与排除标准的合理性 多人同步-质量控制
文献筛选阶段的主要偏倚
选择性偏倚: 发表性偏倚:
小样本阴性结果研究,发表比较困难;非英文研 究文献可能遗漏。其产生的后果是:阳性研究结 果可能会被高估 判断识别:漏斗图、Begger与Egger分析、失效安 全数(fail-safe number)等
1 2 3 4 5
组 别 治疗组 对照组 合 计
治疗开始前 治疗后 前后差值 均数标准差 均数标准差 均数标准差
包括两种形式: 1、观察终点的均数之差 2、治疗前后变化值均数间的差值。 根据基线比较的结果而定。
数值变量资料的效应量选择
均数差值(mean difference, MD):首选 均数差值的标准化值(standardized mean difference , SMD):测量标准或度量衡单位 不统一。
发表性偏倚的识别:funnel plot
发表性偏倚的处理
查Biblioteka Baidu未发表文献
与研究者、药企、专家联系
查询临床试验注册库(clinical trial
register,
WHO)
查找灰色文献,包括会议论文摘要等
强化临床试验注册制度
(五)纳入研究文献的严格评价
对入选的文献, 须用临床流行病学评价文献 的原则和方法,进一步分析评价,以防止和减少 偏倚(assessment of study quality) 。 原始研究的主要偏倚:
OR、RR、RD临床(实际)意义
OR、RR>1 (RD>0),表明干预/暴露因素为危险因素, 偏离1越远,表示危险性越强 0<OR、RR<1 (RD<0) ,表明干预/暴露因素为保护 因素,离0越近,表示保护性越强 OR、RR=1 (RD=0) ,表明干预/暴露因素与结果无关
赋值与数据提取注意事项:
筛选分三步进行 :
初筛:相关性(文题+摘要) - procite-剔重 结合纳入与排除标准—精读+泛读 与作者联系:报告不充分或未报告
检索
通过数据库检索的文献数
通过其他途径检索的文献数
相关性 重复性
筛查
去重后的文献数
筛查过的文献数
排除的文献数
纳入标准
合格
文 献 筛 选 纳 入 流 程 图
干预/暴露因素和结果的赋值标准化:
1表示试验组(暴露),0表示对照组(未暴 露);1表示不良事件,0表示良性事件。否则结 论可能刚好相反。
Dan Shen agents for acute ischaemic stroke
S
Dan Shen agents for acute ischaemic stroke
P
Dan Shen agents for acute ischaemic stroke
I
Dan Shen agents for acute ischaemic stroke
合计
1239 1529 626 1682 1216
SR标准数据格式
组 别 例数 n1 n2 阳性数 a c a+c 阴性数 b d b+d 阳性率 p1 p2
治疗组 对照组 合 计
效应量的确定
相对效应量:试验组与对照组的暴露比 的比值(OR)或者两组率的比值(RR); 当发生事件率低于10%时,两者基本等价。 绝对效应量:RD (rate difference), NNT
表2 5个随机对照试验结果一览 阿司匹林组 对照组 研究 死亡 存活 病死率 死亡 存活 病死率 1 49 566 8.0 67 557 10.7 2 44 714 5.8 64 707 8.3 3 27 290 8.5 32 277 10.4 4 102 730 12.3 126 724 14.8 5 85 725 10.5 52 354 12.8
1)计量资料的数据提取
均数(两组) 标准差(有时只能得到标准误,需转化) 样本含量(两组)
例1 某研究者为分析某降血脂药物的疗效, 纳入了5个RCT,结果如下
研究 治疗组 nt xt 13 5.0 30 4.9 35 22.5 20 12.5 8 6.5 对照组 sd1 nc xc 4.7 13 6.5 1.7 50 6.1 3.4 25 24.9 1.47 20 12.3 0.76 8 7.38 sd2 3.8 2.3 10.7 1.66 1.41
ME,changeSDE,change
MC,baselineSDC,baseline
MC,finalSDC,final
MC,changeSDC,change
2)计数资料的数据提取
各纳入研究中试验组与对照组的例数 各纳入研究中各组的阳性(不良)事件数。
例2 纳入5个多中心临床试验研究,用以评价阿司匹 林治疗心肌梗塞的疗效,资料见表2
(一)确定题目
选题遵循五性原则: 立题: 构建可回答的、具体的、前景性问题, 提出立题依据( well formulated question & rationale) 基本格式: Medicine For Disease/symptom
(二)制定计划书-protocol
明确目的、范围和相关标准(objective and scope referral standard)- 5W1H Background: why is this important? Specify the research question (or questions) Provide an overview of your methods, including search strategy, inclusion/exclusion criteria, quality assessment, how you will abstract the data, and analysis plan Specify if you plan on doing subgroup analyses or sensitivity analyses (best if these are a priori)
有缺陷的数值变量资料提取
偏态数据资料,不能处理,联系原作者 只有标准误,无标准差,需转换。 多臂试验中组别的合并与拆分 部分数据缺失或病例失访
基线测量值 干预后测量值 前后变化差值
试验组 (样本量 NE) 对照组 (样本量 NC)
ME,baseline SDE,baseline
ME,finalSDE,final