第七章 外源基因表达系统张幻灯片
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最新第七章外源基因在原核和真核细胞中的表达PPT课件
子
烟草根特异性启动子
lck
在小鼠的胸腺中定向表达基因,供免疫学研究
TobRB7 在转基因植物的根细胞中定向表达克隆基因
调 节 启 小鼠乳房瘤病毒 LTR 增强子/启动 MMTV 在哺乳动物细胞中表达甾类调节基因
动子 子
果蝇热激 70 启动子
hsp
在果蝇细胞中表达热激调节基因
酵母 GAL1-GAL10 启动子区
选择系统
Tk是核苷酸合成代谢途径中的一种酶。 能将T TMP。 几乎所有的真核细胞都能有效地表达tk,
dTTP合成的补偿途径
降 解 T K
D N A
T dT M P
dT D P
D N A
2. 二氢叶酸还原酶选择系统
二氢叶酸还原酶 (dihydrofolate reductase ,DHFR) 催化二氢叶酸还原为四氢叶酸四氢叶酸在胸苷嘧啶 合成中提供甲基。氨基蝶呤(aminopterin),氨基蝶 呤(methotrexate)是叶酸的结构类似物。能与 DHFR发生不可逆结合,阻止胸苷的主要合成途径。
用缺失衰减子的trp操纵子,因缺失 衰减子使它对体内存在的色氨酸不 敏感。此法可增进转录8~10倍。
构建含有2~3个连续的trp启动子, 可提高转录4~5倍。
③PL和PRБайду номын сангаас动子
PL和PR是噬菌体的两个强启动子,比 lac启动子的活性高8~10倍,比trp启动子高 11倍。
它可被CI蛋白所阻遏。所以是强而可调 节的启动子。
在培养细胞和转基因动物中常用的基因启动子
类型 名称
基因
应用
基 本 启 果蝇乙醇脱氢酶启动子
adh
用于构建报导基因的低水平启动子
第七章-外源基因的表达PPT课件
的基因,而不能用基因组DNA。 (3)必须利用原核细胞的强启动子和S-D序列等调控元件控 制外源基的表达。 (4)外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开放阅读 框架。 (5)利用宿主菌的调控系统,调节外源基因的表达,防止外 源基因的表达产物对宿主菌的伤害。
3.原核生物基因表达的调控序列
只有在了解了原核生物基因表达调控序列的基础上, 才能够 构建高效的表达载体,使外源目的基因在原核细胞中得到高效 率、高水平地表达。对于原核细. 胞来讲,基因表达的调控序 4
■-10区(Pribnow框,TATAAT):RN
5
原核表达系统中通常使用的可调控的强启动子有lac(乳糖启 动子)、trp(色氨酸启动子)、PL及PR(λ噬菌体左向和右 向启动子)、tac(乳糖和色氨酸的杂合启动子)等。
(2)终止子
在一个基因或一个操纵子的3’端往往有一个特定的核苷酸序 列 , 它 有 终 止 转 录 的 功 能 , 这 一 段 DNA 序 列 称 为 终 止 子 (terminator)。终止子在结构上有一些共同的特点,即有一 段富含A/T的区域和一段富含G/C的区域,G/C区域具有回文 对称结构,使转录后的RNA具有茎环结构。
这个载体系统是由pBR322为基础构建的。 ➢带有大肠杆菌最强的启动子之一,即Ipp(脂蛋白基因)启 动子。在启动子的下游装有lac UV5的启动子及其操纵基因, 并把lac阻遏子的基因(lac I)也克隆到这个质粒上。这样目 的基因的表达就成为可调节的了。 ➢在转录控制的下游再装上人工合成的高效翻译起始序列(SD序列及ATG)。 ➢信号肽序列取自于大肠杆菌中. 分泌蛋白的基因ompa(外膜9 蛋白基因)。
根据转录终止作用类型,终止子可分为两种:依赖于ρ因子 的转录终止子及不依赖于ρ因子的转录终止子。
《外源基因的表达》PPT课件
2.真核表达系统:使外源基因在真核细 胞中表达的体系。
精选ppt
3
原核生物作为基因表达系统的受体细胞具有如下特点:
(1)大多数为单细胞异养,生长快,代谢易于控制, 可通过发酵迅速获得大量基因表达产物。
(2)基因组结构简单,便于基因操作和分析。
(3)多数原核生物细胞内含有质粒或噬菌体,便于 构建相应的表达载体。
一、启动子
启动子(promoter, P)是指能被RNA聚合
酶识别、结合并启动基因转录的一段 DNA序列。
精选ppt
5
1. 原核生物的启动子
原核生物的启动子一般由四个部分构成:转录 起始位点、两个六联体保守序列区和间隔区。
识别区 Pribnow框 转录起点
16~19bp
5~9bp
5’ TTGACA TATAAT A(G) 3’
RNA … NNAAGCGCCGNNNNCCGGCGCUUUUUUNNN-OH
精选ppt
14
N
N
N
N
C
GC
CG C G RNA结构
GC
CG
GC
AU
AU
……NNNN UUUU-OH3
图: 强终止子模式图
精选ppt
15
三、SD序列:
mRNA的翻译起始效率主要由其5’端的结构序列 所决定,称为核糖体结合位点(RBS),它包括下列 四个特征要素:
精选ppt
7
(3)Sextama框: 在转录启动区的另一个六联体 保守序列位于距转录起始位点上游35bp处,通常称 为-35区,该保守序列为TTGACA,其中前三个碱 基具有较强的保守性,它是RNA聚合酶的识别位点。
(4)间隔区: 原核生物启动子在转录起始位点与 Pribnow框之间、Pribnow框与Sextama框之间存在 长度不等的间隔序列。间隔序列内部无明显的保守 性,其序列的碱基组成对启动子的功能并不十分重 要, 但间隔序列的长度却是影响启动子功能的重要 因素。
精选ppt
3
原核生物作为基因表达系统的受体细胞具有如下特点:
(1)大多数为单细胞异养,生长快,代谢易于控制, 可通过发酵迅速获得大量基因表达产物。
(2)基因组结构简单,便于基因操作和分析。
(3)多数原核生物细胞内含有质粒或噬菌体,便于 构建相应的表达载体。
一、启动子
启动子(promoter, P)是指能被RNA聚合
酶识别、结合并启动基因转录的一段 DNA序列。
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1. 原核生物的启动子
原核生物的启动子一般由四个部分构成:转录 起始位点、两个六联体保守序列区和间隔区。
识别区 Pribnow框 转录起点
16~19bp
5~9bp
5’ TTGACA TATAAT A(G) 3’
RNA … NNAAGCGCCGNNNNCCGGCGCUUUUUUNNN-OH
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N
N
N
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C
GC
CG C G RNA结构
GC
CG
GC
AU
AU
……NNNN UUUU-OH3
图: 强终止子模式图
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三、SD序列:
mRNA的翻译起始效率主要由其5’端的结构序列 所决定,称为核糖体结合位点(RBS),它包括下列 四个特征要素:
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(3)Sextama框: 在转录启动区的另一个六联体 保守序列位于距转录起始位点上游35bp处,通常称 为-35区,该保守序列为TTGACA,其中前三个碱 基具有较强的保守性,它是RNA聚合酶的识别位点。
(4)间隔区: 原核生物启动子在转录起始位点与 Pribnow框之间、Pribnow框与Sextama框之间存在 长度不等的间隔序列。间隔序列内部无明显的保守 性,其序列的碱基组成对启动子的功能并不十分重 要, 但间隔序列的长度却是影响启动子功能的重要 因素。
外源基因在原核细胞中的基因表达 PPT课件
外源基因在原核細胞中的表達
外源基因在原核細胞中的表達
1. Structure elements for gene expression: Gene Organization
外源基因在原核細胞中的表達
Gene Expression and Regulation Levels
Levels at which gene expression is regulated in prokaryotes
外源基因在原核細胞中的表達
• gal: gal基因表達半乳糖代謝所需的各種酶類及調節蛋白, 基因的變異 使細胞不能直接利用半乳糖作為碳源。
• dcm (DNA cytosine methylase)功能:dcm基因表達胞嘧啶甲基化酶 ,它能特異性識別DNA雙鏈上的CCWGG序列,並使第二個C甲基化 ,即CmCWGG,避免DNA受到相關限制酶的切斷。dcm基因的變異 導致胞嘧啶甲基化酶活性缺失,使外源DNA上的C不被甲基化,易於 獲得非甲基化質粒。
外源基因在原核細胞中的表達
Fusional Expression Vector
Factor Xa---Activated form of factor x that participates in both the intrinsic and extrinsic pathways of blood coagulation. It catalyses the conversion of prothrombin to thrombin in conjunction with other cofactors.
Structure of a typical promoter in E.coli
外源基因在原核細胞中的表達
外源基因在原核細胞中的表達
1. Structure elements for gene expression: Gene Organization
外源基因在原核細胞中的表達
Gene Expression and Regulation Levels
Levels at which gene expression is regulated in prokaryotes
外源基因在原核細胞中的表達
• gal: gal基因表達半乳糖代謝所需的各種酶類及調節蛋白, 基因的變異 使細胞不能直接利用半乳糖作為碳源。
• dcm (DNA cytosine methylase)功能:dcm基因表達胞嘧啶甲基化酶 ,它能特異性識別DNA雙鏈上的CCWGG序列,並使第二個C甲基化 ,即CmCWGG,避免DNA受到相關限制酶的切斷。dcm基因的變異 導致胞嘧啶甲基化酶活性缺失,使外源DNA上的C不被甲基化,易於 獲得非甲基化質粒。
外源基因在原核細胞中的表達
Fusional Expression Vector
Factor Xa---Activated form of factor x that participates in both the intrinsic and extrinsic pathways of blood coagulation. It catalyses the conversion of prothrombin to thrombin in conjunction with other cofactors.
Structure of a typical promoter in E.coli
外源基因在原核細胞中的表達
最新外源基因的原核表达PPT课件
mRNA 的翻译才能进行
ATG 与 SD 序列之间的碱基组成为 A,
T 碱基丰富时,mRNA 翻译效率较高。
11.03.2024
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核糖体结合位点本身和附近的序列决定 了目标基因 mRNA 5’ 端的二级结构,研 究表明讨 mRNA 5’端形成的 “茎环” 结 构阻碍了 mRNA 与核糖体 30S 亚基的结 合,从而抑制了翻译的起始。
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大肠杆菌基因表达载体
6、密码子:密码子有简并性,多个 密码子为一个氨基酸进行编码,不 同生物在利用这些密码子时其利用 频率不同,不同的密码子会影响到 大肠杆菌的翻译速度。
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基因表达的机制
基因工程技术的核心是基因表达技术。 迄今为止,已构件建了不同类型的表达 系统,可根据需要合理地选择适当的表 达系统。
外源基因在受体细胞中的表达包括:
1、转录 2、翻译
两个环节
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基因表达的机制
基因工程的核心问题:有效表达 外源基因表达的关键步骤:起始转录 基因表达的限速步骤:转录起始的速率 构建表达系统时首先要考虑的问题是: 1、选择可调控的启动子 2、相关的调控序列
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在进行融合表达时,一般将受体菌 蛋白位于N端,而外源蛋白位于C端。 外源蛋白与菌体自身蛋白以融合蛋 白的方式表达后其稳定性大大增加。 其原因为:外源小分子蛋白上的酶
切位点暴露于分子的表面。当以融 合蛋白的形式表达后,外源蛋白部 分在菌体自身蛋白的引导下正确折 叠,可最大程度上封闭酶切位点。
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常见的大肠杆菌表达系统
外源基因的原核表达PPT精品课程课件讲义
• 目的基因的正确性 测序,酶切,杂交,PCR • 表达产物的鉴定 理化性质,生物学功能
大肠杆菌表达条件的优化
(大肠杆菌系统中,影响外源基因表达的因素)
①选择可调控的强启动子
组成:
-10区(TATA box, pribnow box) -35区 类型: 1. Lac乳糖操纵子的启动子: IPTG 2.PL/P R噬菌体启动子: 42OC 3.trp启动子: -吲哚丙烯酸 4.tac启动子: IPTG( Ptrp, -35; Plac , -10) 5. T7, T3, SP6: IPTG
原核表达的注意事项:
1. 可溶性或分泌性表达:防止包含体 2. 瞬间高效表达:可诱导,防止毒性
3. 易于纯化:Ni, myc, VP5
E.coli表达体系的缺陷
不宜表达真核基因组DNA 不能加工表达的真核蛋白质 表达的蛋白质常形成不溶性包涵体 很难表达大量可溶性蛋白
包含体的形成、变性和复性
PPT内容可自行编辑
外源基因的原核表达
主讲:XX XX
凡大医治病,必当安神
定志,无欲无求,先发大慈恻 隐之心,誓愿普救含灵之苦。
- - 孙思邈
PPT内容可自行编辑
开始上课!
理想的大肠杆菌表达载体所具备的特征:
• 稳定的遗传和复制能力; • 具有显性的转化筛选标记; • 启动子的转录是可以调控的,抑制时本底转录水 平较低; • 转录的mRNA能够在适当的位置终止,转录过程不 影响复制; • 具备适用于外源基因插入的MCS.
宿主
JM101-109, RRI, BL21(DE3)………
• 提供RNA聚合酶: T7 RNA pol(整合染 色体 lacUV5启动子,IPTG)
• 蛋白酶活性低: lon-, rpoH• 高密度培养
大肠杆菌表达条件的优化
(大肠杆菌系统中,影响外源基因表达的因素)
①选择可调控的强启动子
组成:
-10区(TATA box, pribnow box) -35区 类型: 1. Lac乳糖操纵子的启动子: IPTG 2.PL/P R噬菌体启动子: 42OC 3.trp启动子: -吲哚丙烯酸 4.tac启动子: IPTG( Ptrp, -35; Plac , -10) 5. T7, T3, SP6: IPTG
原核表达的注意事项:
1. 可溶性或分泌性表达:防止包含体 2. 瞬间高效表达:可诱导,防止毒性
3. 易于纯化:Ni, myc, VP5
E.coli表达体系的缺陷
不宜表达真核基因组DNA 不能加工表达的真核蛋白质 表达的蛋白质常形成不溶性包涵体 很难表达大量可溶性蛋白
包含体的形成、变性和复性
PPT内容可自行编辑
外源基因的原核表达
主讲:XX XX
凡大医治病,必当安神
定志,无欲无求,先发大慈恻 隐之心,誓愿普救含灵之苦。
- - 孙思邈
PPT内容可自行编辑
开始上课!
理想的大肠杆菌表达载体所具备的特征:
• 稳定的遗传和复制能力; • 具有显性的转化筛选标记; • 启动子的转录是可以调控的,抑制时本底转录水 平较低; • 转录的mRNA能够在适当的位置终止,转录过程不 影响复制; • 具备适用于外源基因插入的MCS.
宿主
JM101-109, RRI, BL21(DE3)………
• 提供RNA聚合酶: T7 RNA pol(整合染 色体 lacUV5启动子,IPTG)
• 蛋白酶活性低: lon-, rpoH• 高密度培养
外源基因表达与基因工程药物ppt课件
➢ 生物技术工程: 基因工程、蛋白质工程、酶 工程、细胞工程等
➢ 基因工程(genetic engineering) —— 实现基因 克隆所用的方法及相关的工作称基因工程, 又称重组DNA工艺学。
➢ 目的: ① 分离获得某一感兴趣的基因或DNA ② 获得感兴趣基因的表达产物(蛋白质)
(二)工具酶
• 粘性质粒(cosmid)
粘性质粒
也称柯斯载体。是带有粘性末端位 点的质粒, 柯斯质粒是人工建造的的含有 λDNA的cos序列和质粒复制子的特殊 类型的质粒载体。
粘性质粒
用于克隆大片段DNA的载体,它是由λ噬菌体 的cos末端及质粒重组而成的载体。cosmid载体带 有质的复制起点、克隆位点、选择性标记以及λ噬 菌体用于包装的cos末端等。
DNA聚合酶Ⅰ
Klenow片段 反转录酶
多聚核苷酸激酶
①合成双链cDNA分子或片段连接 ②缺口平移制作高比活探针 ③DNA序列分析 ④填补3´末端
又名DNA聚合酶I大片段,具有完整DNA聚合酶I的53 聚合、35外切活性,而无53外切活性。常用于 cDNA第二链合成,双链DNA 3末端标记等
①合成cDNA ②替代DNA聚合酶I进行填补,标记或DNA序列分析
Bam HⅠ
GGATCC CCTAGG
GCCTAG+
GATCC G
➢ 分类: Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(基因工程技术中常用Ⅱ型)
➢ 作用: 与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰
系统,限制外源DNA,保护自身DNA。
➢ 命名:
Hin dⅢ
Haemophilus influenzae d株 流感嗜血杆菌d株的第三种酶
催化多聚核苷酸5´羟基末端磷酸化,或标记探针
末端转移酶
相关主题
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②周质中表达 • 周质(periplasm)—大肠杆菌一类格兰氏
阴性细菌中,位于内膜和外膜之间的细胞 结构 • 表达于细胞质中的蛋白,借助信号肽穿过 细胞内膜到达周质
*
Байду номын сангаас
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优点: • 蛋白种类少,易纯化 • 酶解程度低 • 促进二硫键的形成和蛋白质的折叠 • 蛋白质N-端真实性 缺点: • 转运的效率不稳定
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化学诱导与温度诱导在实验室 规模比较容易做到,(发酵罐1~5 升)。但在工业化生产时(发酵罐 数十升~数百升乃至数千升),生 产成本很高。
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为解决此问题,可对工程菌进行改造。
例如:采用双质粒表达系统 将CI 857阻遏
蛋白编码基因置于Ptrp启动子之下,克隆在
一个低表达质粒上,从而保证阻遏蛋白表达
包涵体(inclusion body):细胞质中不溶性 的蛋白质聚集形成的颗粒。
*
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• 优点: 形成包涵体,易于纯化分离,抵抗细菌蛋 白酶的水解;对寄主无毒害
• 蛋白质产量高 • 表达载体构建比较简单
*
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缺点: • 形成包涵体的外源蛋白质,一般没有生物活性
。恢复生物学活性的过程,有时非常困难。活 性蛋白质的终产量低。 • 细胞质还原的环境不利于形成二硫键 • N-末端存在甲硫氨酸,蛋白质真实性受影响 • 蛋白质种类多,纯化工作量比较大。
在真核基因中发现了类似Pribnow框的 共同序列,即位于—25~—30 bp处的 TATAAAAG,也称TATA框(TATAbox)。
*
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常用的大肠杆菌启动子
• Plac 来源于乳糖操纵子 • Ptrp 来源于色氨酸操纵子 • PL 来源于λ噬菌体早期操纵子 • PrecA 来源于recA基因
*
有 Lac 、trp、tac、T7、λPL等。
• 强启动子 外源蛋白质的表达占菌体总蛋
白质的10-30%。
*
5
启动子有关知识
• 大肠杆菌的启动子是控制外源基因转录的 重要元件,基因表达程度与启动子的强弱 密切相关。
• 启动子的强弱主要取决于
启动子本身的序列,尤其是-10区 (TATAA)和-35区(TTGACA)的组成。
*
26
分泌表达形式的缺点:
相对其它生物细胞而言,大肠杆菌的蛋 白分泌机制并不健全。外源真核生物基因很难 在大肠杆菌中进行分泌型表达,少数外源基因 即便能分泌表达,但其表达率通常要比包涵体 方式低很多。
*
2
第一节 大肠杆菌表达系统
一.大肠杆菌表达体系的优点:
•外源基因可以高水平表达 •培养方便、价廉、可大规模生产 •生物学、遗传学背景清楚 • 安全性好 • 寄主菌株及载体较多
*
3
大肠杆菌
*
4
二.大肠杆菌的表达条件
• 克隆的真核基因必须连续,无内含子序列。
• 大肠杆菌不能识别真核启动子,外源基因须 置于原核启动子的控制之下。常用的启动子
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启动子的可控性
目前使用的大肠杆菌启动子,一般含 有与阻遏蛋白特异性结合的序列,因此由 这些启动子介导的外源基因在大肠杆菌细 胞内通常是痕量表达的。例如在不含乳糖 的培养基内, Plac 启动子处于阻遏状态, 外源基因极少表达。
*
8
• 当重组大肠杆菌生长到某一阶段,向培养 物中加入乳糖或IPTG(异丙基硫代半乳糖 苷 isopropylthiogalactoside,IPTG),它 们特异性的与阻遏蛋白结合,使之从操纵 子上脱落下来,启动子打开并启动外源基 因转录。(化学诱导)
*
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③ 表达产物分泌到细胞外 • 诱导大肠杆菌细胞分泌外源蛋白质 • 利用信号肽; • 融合蛋白配体; • 透化剂;
*
20
蛋白质合成后的靶向输送
•蛋白质的靶向输送(protein targeting)
蛋白质合成后需要经过复杂机制,定 向输送到最终发挥生物功能的细胞靶部 位,这一过程称为蛋白质的靶向输送。
*
9
温度诱导
PL启动子 将工程菌先置于300C进行培养, 在此温度范围内,由大肠杆菌合成的CI 857阻遏蛋白与PL 的操纵子区域结合,关 闭外源基因的转录。当工程菌培养到合适 的生长阶段,(一般为对数生长中期)时 ,迅速将培养温度提高到42 0C,此时CI 857失活,从操纵子上脱落下来, PL启动 子遂启动外源基因转录。
第七章 外源基因表达系 统张幻灯片
2020年4月23日星期四
基因工程所用的宿主菌,皆经过人工改造
原因是 野生型细菌具有针对外源DNA的限制和修饰系统, 会切割未经修饰的外源DNA.
经过改造的宿主菌一般具备下列特点 限制系统缺陷型:不切割外源DNA. 重组缺陷型 :避免外源DNA与宿主DNA的重组. 转化亲和型:改变细胞壁的通透性,提高转化效率.
信号假说:分泌型蛋白质的定向输送,就是
靠信号肽与胞浆中的信号肽识别粒子(SRP) 识别并特异结合,然后再通过SRP与膜上的对 接蛋白(DP, 即SRP受体)结合后→开放膜 蛋白通道→分泌性蛋白穿过膜→膜外侧面信 号肽酶切断信号肽加工区。
信号肽的一级结构
优点:
• 酶解作用低 • 纯化方便 • 增进蛋白折叠 • N-端的结构真实
*
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原核表达存在的问题 翻译后的加工修饰 真核细胞的某些蛋白质翻译合成后,还 需要加工和修饰,如糖基化,但大肠杆菌 细胞无此功能。 细菌蛋白酶的存在 细菌蛋白酶对外源蛋白质的切割
*
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真核基因在大肠杆菌 细胞中表达的部位
1.表达产物存在的部位
①细胞质;②细胞周质;③分泌到细胞外
① 细胞质中表达:
较低;第二个重组质粒则含有PL启动子控制 的目的基因。当培养基中缺少色氨酸时,
Ptrp打开, CI 857 阻遏蛋白生成,由PL介导 的目的基因不表达;相反,当色氨酸大量存
在时, Ptrp启动子关闭, CI 阻遏蛋白不再
生成, PL开放。
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此工程菌可用糖蜜和酪蛋白水解物组 成的廉价培养基进行发酵,内含微量的色 氨酸,欲使外源基因表达时,可加入富含 色氨酸的胰蛋白胨进行诱导。
• 信号序列(signal sequence)
所有靶向输送的蛋白质结构中存在分 选信号,主要为N末端特异氨基酸序列, 可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位 ,这一序列称为信号序列 。
常见的信号序列由10~40个氨基酸残基 组成,N端为带正电荷的氨基酸残基,中间为 疏水的核心区,而C端由小分子氨基酸残基组 成(加工区),可被信号肽酶识别并裂解。 •