DNA酶切及凝胶电泳
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粘性末端：是交错切割，结果形成两条单链末端，这种末 端的核苷酸顺序是互补的，可形成氢键，其断裂的磷酸二 酯键和氢键可通过DNA连接酶连接起来。例如：EcoRI的识 别顺序 5’……G’AA ｜ TT_C……3’ 3’……C_TT ｜ AA’G……5’
Ⅲ型：限制性内切酶有专一的识别顺序，但不 是对称的回文顺序，在识别顺序旁边几个核苷酸对 的固定位置上切割双链，切割后产生的一定长度 DNA 片 段 ， 具 有 各 种 单 链 末 端 。
以琼脂糖凝胶电泳实验为例，待测 DNA 片段与已 知浓度的DNA片段同时进行电泳，根据结合的溴化乙 锭荧光强度，分析其含量：
1. 原理
溴化乙锭(EB)在紫外线照射下能够发射荧光。当 DNA 样品在含有适量 EB 的琼脂糖凝胶中进行电泳时， 其中插入到 DNA 分子中的 EB 与之形成荧光混合物， 使 DNA 发射的荧光增强几十倍。荧光强度与 DNA 含 量成正比关系。为了能够比较出待测样品的浓度，只 需把已知浓度的标准样品作为琼脂糖凝胶电泳的对照。 用肉眼可以检测到0.01~0.1mg DNA，薄层分析扫描仪 可以检测到 5~10ng DNA。
1. 寄主控制的限制与修饰现象
限制与修饰系统是细胞的一种防卫手段。
限制性核酸内切酶是由细菌产生的，其生理意 义是提高自身的防御能力。限制酶限制外源DNA存 在于自身细胞内，但合成这种酶的细胞自身的DNA 不受影响，因为这种细胞还合成了一种修饰酶，对 自身的DNA进行了修饰，限制性酶对修饰过的DNA 不能起作用。这种现象被称为寄主控制的限制与修 饰现象。
2.仪器 紫外投射反射分析仪，电泳槽，电泳仪。
图1 电泳槽
图2 电泳仪电源
3.试剂
(1) 6*上样缓冲液：0.25%溴酚蓝，40%（W/V） 蔗糖水溶液；
(2) 50*TAE电泳缓冲液：Trish 碱 242g，冰乙酸 57.1ml ， 0.5mol/L EDTA100ml ， 加 水 溶 解 后 定 量 1000ml；
(3) 5mg/ml EB（溴化乙锭）：0.5g EB，100ml 双 蒸水。
4.操作步骤 (1) 称取 1g 琼脂糖凝胶干粉，加 100ml 1*TAE 电泳缓冲 液，加热使琼脂糖熔化均匀，取出后室温冷却至 50~60℃； （制作凝胶液）
(2) 将胶倒入制胶槽中，并插入样品梳，待充分凝固后拔 出样品梳；（插梳子）
结论：Ⅱ型限制性内切酶的特性使它在分子克 隆 中 得 到 了 广 泛 应 用 ， 是 重 组 DNA 的 基 础 。
3.同裂酶和同尾酶
同裂酶：有时两种限制性内切酶的识别核苷酸 顺序和切割位置都相同，其差别只在于当识别顺序 中有甲基化的核苷酸时，一种限制性内切酶可以切 割，另一种则不能。这些有相同切点的酶称为同裂 酶。
（2）琼脂糖凝胶，适用于分离大分子核；
（3）聚丙烯酰胺凝胶，普遍用于分离蛋白质及较小分 子的核酸。
凝胶电泳优点
(1) 样品不易扩散 (2) 制备简单，时间短； (3) 将分子筛效应和电荷效应结合在同一方法中，提高分辨能力； (4) 需要合成用的原料纯净，制成的多聚物的再现性高，因此样品 分离的重复性也比较高；
DAN酶切及凝胶电泳
DNA限制性内切酶的酶切分析
限制性核酸内切酶：是一类能识别双链DNA分子 特定的核甘酸序列，并在每条链中特定部位的两个 核苷酸之间的磷酸二酯键进行切割的一类DNA水解酶， 是体外剪切基因片段的重要工具，常常与核酸聚合 酶、连接酶以及末端修饰酶等一起称为工具酶。
限制性核算内切酶的相关知识： 1. 寄主控制的限制与修饰现象 2. 核酸限制性内切酶的类型及基本特性 3. 同裂酶和同尾酶 4. 影响核酸限制性内切酶活性的因素
(6) 取出泳动后的凝胶板，EB 染色 20 分钟后才在紫外分 析仪中观察 DNA 区带。（取出凝胶，分析电泳结果）
一般情况下，实验后分析结果一般用肉眼观察， 通过比较待测 DNA 的条带与已知 DNA 的各条带的 荧光密度，估计待测 DNA 在凝胶中的含量和浓度。
谢谢聆听!
琼脂糖凝胶电泳
琼脂电泳是用琼脂糖或优质琼脂粉作支持物的一 种电泳方法。该法主要用于研究核酸等大分子物质， 是分子生物学中不可缺少的研究手段之一。
用琼脂糖胶分离双链 DNA时，其迁移率大小，主 要与样品的相对分子质量有关，而与核酸的一级结构 一级碱基的组成无关。利用琼脂糖电泳分离和分析蛋 白质和核酸的基本原理是电荷效应及分子筛效应。
(3) 将凝胶板放入电泳槽中，加入 1*TAE 电泳缓冲液，使 液面略高于凝胶 1*TAE电泳缓冲液；（加电泳缓冲液） (4) 5μl DNA 样品加 1μl 6*凝胶加样缓冲液，搅拌均匀后全 部加入凝胶板的样品孔中；在另一加样孔中加 5μl 已知片 段大小的 DNA 标准溶液；（上样） (5) 打开电源开关，电压 100V，电泳约 30~40 分钟； （通电，跑电泳）
分类：按照分离原理的不同，可分为：区带电 泳、移界电泳、等速电泳、等电聚焦电泳
应用：生物学上的可移动大分子，如氨基酸、 多肽、蛋白质及核酸等，具有可以电离的基团，在 具有一定pH值的溶液中，能够形成带电荷的阳离 子和阴离子，通过电泳方法可以将处于同一体系的 不同组分分开。
凝胶电泳技术
凝胶电泳是以各种具有网状多孔结构的凝胶为支 持物的电泳技术。同时，凝胶电泳具有电泳和分子 筛的双重作用，有很高的分辨能力。凝胶电泳的支 持介质一般有以下几种： （1）淀粉凝胶
2.核酸限制性内切酶的类型及基本特性
按限制酶的组成、与修Байду номын сангаас酶活性关系以及切断核 酸的情况不同，分为三类：Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型。
Ⅰ型：限制性内切酶能识别专一的核苷酸顺序， 并在识别点附近的一些核苷酸上切割DNA分子中的双 链，但是切割的核苷酸顺序没有专一性，是随机的。 这类酶如：EcoB 、EcoK等。
Ⅱ型：限制性内切酶能识别专一的核苷酸顺序， 并在该顺序内的固定位置上切割双链。
这类限制酶识别的专一核苷酸顺序常见的是4 至6个核苷酸，其识别顺序是一个回文对称顺序， 即有一个中心对称轴。
Ⅱ型酶的切割有两种方式，分别生成平头末端、 粘性末端。
平头末端：在同一位置上切割双链，产生平头末端，这种末端 可以通过DNA连接酶连接起来。例如EcoRV的识别位置是： 5’……GAT’｜ATC……3’ 3’……CTA’ ｜TAG……5’
(5) 可以随意控制凝胶浓度，按需要可制作不同孔径的凝胶； (6) 一定浓度范围内透明性好，机械轻度好，有弹性； (7) 链上具有不活泼的酰胺基，没有带电的其他离子基，所以电泳 时不会产生电渗；
(8) 用途广泛，可以对核酸、蛋白质等生物高分子进行分离、定量、 定性、分子量的测定；
(9) 需要样品量少，1-100μg 已经足够。
用途
用于DNA基因组物理图谱的组建；基因的定位 和基因分离；DNA分子碱基序列分析；比较相关的 DNA分子和遗传工程。
电泳概述
带电质点在电场中向与其相反的电极进行泳动的 现象，称为电泳或离子泳。
基本原理：交替溶液中的蛋白质、肽都具有可解 离的基团，在溶液中形成带正电荷或带负电荷或咪唑 基的质点。在酸性溶液中，由于 H+浓度较大，它能抑 制蛋白质分子中的羟基解离出 H+，使更多的-NH2接受 H+形成-NH2+，因此，在酸性溶液中，蛋白质带有较多 的正电荷，在外加电场中，向负极移动；反之，在碱 性溶液中，氢氧根离子中和羟基中的氢离子，蛋白质 带有较多的负电荷，在外电场作用下，向正极移动。
同尾酶：有时两种酶切割顺序不完全相同，但 却能产生相同的粘性末端，这类酶被称为同尾酶， 可以通过DNA连接酶将这类末端连接起来，但原来 的酶切位点将被破坏，有时可能会产生一个新的酶 切位点。
4.影响核酸限制性内切酶活性的因素
a. DNA的纯化 b. DNA的甲基化程度 c. 酶切消化反应的温度 d. DNA的分子结构 e. 溶液中离子浓度及种类 f. 缓冲液的PH值
Ⅲ型：限制性内切酶有专一的识别顺序，但不 是对称的回文顺序，在识别顺序旁边几个核苷酸对 的固定位置上切割双链，切割后产生的一定长度 DNA 片 段 ， 具 有 各 种 单 链 末 端 。
以琼脂糖凝胶电泳实验为例，待测 DNA 片段与已 知浓度的DNA片段同时进行电泳，根据结合的溴化乙 锭荧光强度，分析其含量：
1. 原理
溴化乙锭(EB)在紫外线照射下能够发射荧光。当 DNA 样品在含有适量 EB 的琼脂糖凝胶中进行电泳时， 其中插入到 DNA 分子中的 EB 与之形成荧光混合物， 使 DNA 发射的荧光增强几十倍。荧光强度与 DNA 含 量成正比关系。为了能够比较出待测样品的浓度，只 需把已知浓度的标准样品作为琼脂糖凝胶电泳的对照。 用肉眼可以检测到0.01~0.1mg DNA，薄层分析扫描仪 可以检测到 5~10ng DNA。
1. 寄主控制的限制与修饰现象
限制与修饰系统是细胞的一种防卫手段。
限制性核酸内切酶是由细菌产生的，其生理意 义是提高自身的防御能力。限制酶限制外源DNA存 在于自身细胞内，但合成这种酶的细胞自身的DNA 不受影响，因为这种细胞还合成了一种修饰酶，对 自身的DNA进行了修饰，限制性酶对修饰过的DNA 不能起作用。这种现象被称为寄主控制的限制与修 饰现象。
2.仪器 紫外投射反射分析仪，电泳槽，电泳仪。
图1 电泳槽
图2 电泳仪电源
3.试剂
(1) 6*上样缓冲液：0.25%溴酚蓝，40%（W/V） 蔗糖水溶液；
(2) 50*TAE电泳缓冲液：Trish 碱 242g，冰乙酸 57.1ml ， 0.5mol/L EDTA100ml ， 加 水 溶 解 后 定 量 1000ml；
(3) 5mg/ml EB（溴化乙锭）：0.5g EB，100ml 双 蒸水。
4.操作步骤 (1) 称取 1g 琼脂糖凝胶干粉，加 100ml 1*TAE 电泳缓冲 液，加热使琼脂糖熔化均匀，取出后室温冷却至 50~60℃； （制作凝胶液）
(2) 将胶倒入制胶槽中，并插入样品梳，待充分凝固后拔 出样品梳；（插梳子）
结论：Ⅱ型限制性内切酶的特性使它在分子克 隆 中 得 到 了 广 泛 应 用 ， 是 重 组 DNA 的 基 础 。
3.同裂酶和同尾酶
同裂酶：有时两种限制性内切酶的识别核苷酸 顺序和切割位置都相同，其差别只在于当识别顺序 中有甲基化的核苷酸时，一种限制性内切酶可以切 割，另一种则不能。这些有相同切点的酶称为同裂 酶。
（2）琼脂糖凝胶，适用于分离大分子核；
（3）聚丙烯酰胺凝胶，普遍用于分离蛋白质及较小分 子的核酸。
凝胶电泳优点
(1) 样品不易扩散 (2) 制备简单，时间短； (3) 将分子筛效应和电荷效应结合在同一方法中，提高分辨能力； (4) 需要合成用的原料纯净，制成的多聚物的再现性高，因此样品 分离的重复性也比较高；
DAN酶切及凝胶电泳
DNA限制性内切酶的酶切分析
限制性核酸内切酶：是一类能识别双链DNA分子 特定的核甘酸序列，并在每条链中特定部位的两个 核苷酸之间的磷酸二酯键进行切割的一类DNA水解酶， 是体外剪切基因片段的重要工具，常常与核酸聚合 酶、连接酶以及末端修饰酶等一起称为工具酶。
限制性核算内切酶的相关知识： 1. 寄主控制的限制与修饰现象 2. 核酸限制性内切酶的类型及基本特性 3. 同裂酶和同尾酶 4. 影响核酸限制性内切酶活性的因素
(6) 取出泳动后的凝胶板，EB 染色 20 分钟后才在紫外分 析仪中观察 DNA 区带。（取出凝胶，分析电泳结果）
一般情况下，实验后分析结果一般用肉眼观察， 通过比较待测 DNA 的条带与已知 DNA 的各条带的 荧光密度，估计待测 DNA 在凝胶中的含量和浓度。
谢谢聆听!
琼脂糖凝胶电泳
琼脂电泳是用琼脂糖或优质琼脂粉作支持物的一 种电泳方法。该法主要用于研究核酸等大分子物质， 是分子生物学中不可缺少的研究手段之一。
用琼脂糖胶分离双链 DNA时，其迁移率大小，主 要与样品的相对分子质量有关，而与核酸的一级结构 一级碱基的组成无关。利用琼脂糖电泳分离和分析蛋 白质和核酸的基本原理是电荷效应及分子筛效应。
(3) 将凝胶板放入电泳槽中，加入 1*TAE 电泳缓冲液，使 液面略高于凝胶 1*TAE电泳缓冲液；（加电泳缓冲液） (4) 5μl DNA 样品加 1μl 6*凝胶加样缓冲液，搅拌均匀后全 部加入凝胶板的样品孔中；在另一加样孔中加 5μl 已知片 段大小的 DNA 标准溶液；（上样） (5) 打开电源开关，电压 100V，电泳约 30~40 分钟； （通电，跑电泳）
分类：按照分离原理的不同，可分为：区带电 泳、移界电泳、等速电泳、等电聚焦电泳
应用：生物学上的可移动大分子，如氨基酸、 多肽、蛋白质及核酸等，具有可以电离的基团，在 具有一定pH值的溶液中，能够形成带电荷的阳离 子和阴离子，通过电泳方法可以将处于同一体系的 不同组分分开。
凝胶电泳技术
凝胶电泳是以各种具有网状多孔结构的凝胶为支 持物的电泳技术。同时，凝胶电泳具有电泳和分子 筛的双重作用，有很高的分辨能力。凝胶电泳的支 持介质一般有以下几种： （1）淀粉凝胶
2.核酸限制性内切酶的类型及基本特性
按限制酶的组成、与修Байду номын сангаас酶活性关系以及切断核 酸的情况不同，分为三类：Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型。
Ⅰ型：限制性内切酶能识别专一的核苷酸顺序， 并在识别点附近的一些核苷酸上切割DNA分子中的双 链，但是切割的核苷酸顺序没有专一性，是随机的。 这类酶如：EcoB 、EcoK等。
Ⅱ型：限制性内切酶能识别专一的核苷酸顺序， 并在该顺序内的固定位置上切割双链。
这类限制酶识别的专一核苷酸顺序常见的是4 至6个核苷酸，其识别顺序是一个回文对称顺序， 即有一个中心对称轴。
Ⅱ型酶的切割有两种方式，分别生成平头末端、 粘性末端。
平头末端：在同一位置上切割双链，产生平头末端，这种末端 可以通过DNA连接酶连接起来。例如EcoRV的识别位置是： 5’……GAT’｜ATC……3’ 3’……CTA’ ｜TAG……5’
(5) 可以随意控制凝胶浓度，按需要可制作不同孔径的凝胶； (6) 一定浓度范围内透明性好，机械轻度好，有弹性； (7) 链上具有不活泼的酰胺基，没有带电的其他离子基，所以电泳 时不会产生电渗；
(8) 用途广泛，可以对核酸、蛋白质等生物高分子进行分离、定量、 定性、分子量的测定；
(9) 需要样品量少，1-100μg 已经足够。
用途
用于DNA基因组物理图谱的组建；基因的定位 和基因分离；DNA分子碱基序列分析；比较相关的 DNA分子和遗传工程。
电泳概述
带电质点在电场中向与其相反的电极进行泳动的 现象，称为电泳或离子泳。
基本原理：交替溶液中的蛋白质、肽都具有可解 离的基团，在溶液中形成带正电荷或带负电荷或咪唑 基的质点。在酸性溶液中，由于 H+浓度较大，它能抑 制蛋白质分子中的羟基解离出 H+，使更多的-NH2接受 H+形成-NH2+，因此，在酸性溶液中，蛋白质带有较多 的正电荷，在外加电场中，向负极移动；反之，在碱 性溶液中，氢氧根离子中和羟基中的氢离子，蛋白质 带有较多的负电荷，在外电场作用下，向正极移动。
同尾酶：有时两种酶切割顺序不完全相同，但 却能产生相同的粘性末端，这类酶被称为同尾酶， 可以通过DNA连接酶将这类末端连接起来，但原来 的酶切位点将被破坏，有时可能会产生一个新的酶 切位点。
4.影响核酸限制性内切酶活性的因素
a. DNA的纯化 b. DNA的甲基化程度 c. 酶切消化反应的温度 d. DNA的分子结构 e. 溶液中离子浓度及种类 f. 缓冲液的PH值