外源性DNA残留量测定法(qPCR法)
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重组抗人表皮生长因子受体人源化单克隆抗体
外源性DNA残留量测定法(qPCR法)
1原理
实时定量PCR(qPCR)扩增分2个阶段,指数增长阶段和之后出现的非指数平台阶段。在指数增长阶段,每个循环PCR产物量大约增加一倍。然而,随着反应的进行,反应体系组成成分的消耗,其中的一种或多种成分限制反应,产物增长速度变慢,反应进入平台期。
反应最初,虽然产物呈指数增长,但是荧光处于背景水平,检测不到荧光增加。但积累了足够的扩增产物,才可检测到的荧光信号,这个循环数叫初始循环数,即C T。C T值主要由扩增反应体系中模板的初始浓度决定的。如果模板初始浓度高,只需要较少的扩增循环就可以积累足够的产物,产生高过背景的荧光信号,因此,反应就有一个小或早出现的C T;相反,如果模板初始浓度低,需要较多的扩增循环才能产生高过背景的荧光信号,反应就有一个大或迟出现的C T。两者之间关系的建立是qPCR用于定量的依据。
2主要仪器
3主要试剂
4溶液配制
4.1 蛋白酶K混合液(新配)
附件13-14重组抗人表皮生长因子受体人源化单克隆抗体外源性DNA残留量测定法
(qPCR)
4.2 裂解混合液(新配)
4.3 DNA标准品稀释
5测定方法
5.1样品处理
5.1.1除蛋白
1)在2ml离心管中加入100μl样品;
2)每100μl的样品中加入70μl的蛋白酶K混合液,混合均匀,56℃水浴30min;
3)每100μl的样品中加入360μl的裂解液,室温裂解2小时以上。
5.1.2 DNA的纯化
1)磁珠使用前于37℃温浴10min,高速涡旋,彻底悬浮磁珠;
2)每100μl的样品加入30μl的磁珠悬浮液;
3)每100μl的样品加入300μl的Binding Solution,涡旋混合5min;
4)12000r/min离心30sec,将离心管放置于磁力架上,静置5min直至溶液清澈,弃上清;
5)从磁力架上取下离心管,加入300μl的Wash Buffer,涡旋混合5 sec;
6)12000r/min离心30sec,将离心管放置于磁力架上,静置2min,弃上清;
7)重复步骤6)1次,打开离心管的盖子,室温下风干;
8)加入50μl的Elution Buffer,高速涡旋10 sec,70℃处理10min,在温浴过程中,涡旋2~3次;
9)12000r/min离心30sec,将离心管放置于磁力架上,静置2min,将含有洗脱DNA的液体转移到新的1.5ml的离心管中,用于进行qPCR反应。
附件13-14重组抗人表皮生长因子受体人源化单克隆抗体外源性DNA残留量测定法
(qPCR)
5.2 PCR反应体系
1)标准品、NTC和样品均做2个复孔;
2)反应母液用量按表4进行计算:
5.3 PCR仪运行程序设置
5.3.1 PCR反应体系
1)标准品、NTC和样品均做2个复孔;
2)反应母液用量按表5进行计算:
5.2.2 PCR仪运行程序设置
1)荧光基团选择FAM;
2)96孔反应模块设置见下表,样品根据实际数量依次设置:
附件13-14重组抗人表皮生长因子受体人源化单克隆抗体外源性DNA残留量测定法
(qPCR)
3)PCR反应条件设置
4)运行上述设置的程序。
6接受标准
1)标准曲线:扩增效率(E):90%~130%;R2≥0.980;斜率(Slope):
-2.7~-3.6。
2)样品数据:2个复孔测定值SQ的CV≤20%。
7结果计算与判断
外源性DNA残留量(pg/ml)=SQ×50,SQ代表测定平均值。
根据检测样品的蛋白质浓度,得出样品中每剂量所残留的外源性DNA量。