基因组特征评估

RAD-seq评估相对杂合度

RAD-tag数统计

SNP检测、统计

相对杂合度分析基因组Survey分析基因组大小评估杂合度评估重复比例评估

GC分布评估SSR检测

初步组装

DNA样品总量: ≥3 μg/个体（RAD-seq） ≥10 μg（Survey）

样品要求文库类型测序策略与深度分析内容项目周期

基因组DNA

40天HiSeq PE125/PE1501X（RAD-seq)； 50X（Survey）

RAD文库或小片段文库技术参数

基因组特征评估包括两个产品：

RAD-seq评估相对杂合度：RAD-seq是指利用限制性内切酶对基因组进行酶切，结合一定大小的插入片段文库，对其进行高通量测序；对于无参考基因组的物种，通过构建RAD文库，进行低深度测序，可以用来评估基因组的相对杂合度，为后续基因组项目挑选合适的材料。

基因组Survey分析：对于没有基因组参考序列的物种，在正式启动基因组项目之前，基于小片段文库的低深度测序数据，通过K-mer分析，可以有效地评估基因组大小、GC含量、杂合度高低以及重复序列含量等信息，是全面了解某一物种基因组特征的有效方法，为后续全基因组de novo测序及组装策略的制定

提供依据；此外，通过基因组Survey分析也可对基因组进行初步组装。RAD-seq评估和基因组Survey分析的不同之处在于：RAD-seq仅用于评估相对杂合度，主要用于筛选多个样品中杂合度相对较低的样品进行分析；而基因组Survey分析则可对基因组特征进行全面评估，并对后续组装提供依据。