生物化学复习要点sp
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生物化学复习大纲
第一章蛋白质化学
1.氨基酸的两性解离和等电点。
等电点(pI):在某一pH环境中,氨基酸解离成阳性离子及阴性离子的趋势相等,所带净电荷为零,在电场中不泳动。此时,氨基酸所处环境的pH值称为该种氨基酸的等电点(pI)。
带电状态判定
pI-pH<0 …………….带负电
pI-pH>0 …………….带正电
pI-pH=0 …………….不带电
2.氨基酸与蛋白质的物理性质和化学性质
氨基酸: 1、物理性质:白色晶体、熔点很高(200度以上)、每种氨基酸都有特殊的结晶形状、除胱氨酸和酪氨酸外,都能溶于水。
2、化学性质:茚三酮反应:氨基酸与印三酮水合物共热。可生成蓝紫色化合物,其最大吸收峰在570nm处。(例外:Pro黄色;Asn棕色)
紫外吸收:Trp、Tyr和Phe在280nm波长附近具有最大吸收峰,其中Trp的最大吸收最接近280nm
成肽反应:
蛋白质:1、物理性质:
等电点:当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。
两性解离:蛋白质分子除两端的氨基和羧基可解离外,氨基酸残基侧链中某些基团,在一定的溶液pH条件下都可解离成带负电荷过正电荷的基团。
2、化学性质:
蛋白质胶体稳定的因素:颗粒表面电荷、水化膜(溶剂化层)
蛋白质在溶液中维持稳定的因素:表面电荷、水化层
变性蛋白不一定沉淀,沉淀蛋白也不一定变性。紫外吸收:最大吸收波长=280nm
3.蛋白质二级和三级结构的类型及特点,四级结构的概念及亚基
1、二级结构:稳定力(氢键);类型(螺旋,折叠,转角,无规卷曲)
蛋白质的二级结构是指多肽链骨架中原子的局部空间排列,不涉及侧链的
构象,也就是该肽段主链骨架原子的相对空间位置,主要有α-螺旋、β-折叠、
β-转角和无规则卷曲。维持二级结构的力量为氢键。
а螺旋结构特点:a、右手螺旋(蛋白质中α-螺旋几乎都是右手的):3.6个AA/圈,螺距0.54nm;每个残基绕轴旋
转100度,沿轴上升0.15mm
b、氢键维系:链内氢键(AA1…AA4),平行长轴;
c、侧链伸出螺旋(残基的侧链伸向外侧)
2、三级结构:蛋白质的三级结构是指在一条多肽链中所有原子的整体空间排布,包括主链和侧链。三级结构的形成使得在序列中相隔较远的氨基酸侧链相互靠近。
结构特点:a、多数同时含有α-螺旋和β-折叠
b、氨基酸位置由侧链极性决定:非极性(内)、极性(表面,少数内
部)、带电(表面)
c、次级键维系:疏水键、盐键、氢键、范德华力、二硫键
d、功能区:表面或特定部位
3、四级结构:寡聚蛋白中亚基的立体排布及相互作用。
结构特点:a、亚基之间以非共价键联系,包括疏水键(主要)、盐键、氢键、范德华力
b、亚基可以相同或不同
4.蛋白质的变性作用
蛋白质的变性:在某些物理或化学因素作用下,使蛋白质的空间构象破坏(但不包括肽链的断裂等一级结构的变化),导致蛋白质若干理化性质(如溶解度、粘度、吸收光谱、电泳行为等)和生物学性质(如催化活性、免疫学特性等)的改变,这种现象称为蛋白质的变性。
促使蛋白质变性的物理因素有加热、高压、紫外线、X线和超声波等;化学因素有强酸、强碱、重金属盐、沉淀生物碱的试剂、尿素等。
蛋白质沉淀:改变溶液的pH达到蛋白质的等电点使质点的净电荷为零,蛋白质分子则聚集成大颗粒而沉淀。
5.蛋白质结构与功能的关系
一级结构中的保守序列决定空间结构,一级结构并非影响空间结构的唯一因素。
1、空间结构体现生物特异性
2、空间结构体现生物活性
3、空间结构的灵活性,体现了生物活性的可调节特性
4、空间构象并非生物活性的唯一影响因素
5、蛋白构象疾病:错误构象相互聚集,形成抗蛋白水解酶的淀粉样纤维沉淀,产生毒性而致病。老年痴呆、疯牛病
别构效应(allosteric effect):蛋白质分子的特定部位(调节部位)与小分子化合物(效应物)结合后,引起空间构象发生改变,从而促使生物学活性变化的现象称为变构效应。包括正协同、负协同效应协同效应:P77
重点:氨基酸的两性解离,等电点的计算,氨基酸、蛋白质的结构与性质,
1.构成蛋白质的20种氨基酸的名称(包括3字母名称)?
丙氨酸Ala 谷氨酸Glu 亮氨酸Leu 丝氨酸Ser
精氨酸Arg 谷氨酰胺Gln 赖氨酸Lys 苏氨酸Thr
天冬氨酸Asp 甘氨酸Gly 甲硫氨酸Met 色氨酸Trp
天冬酰胺Asn 组氨酸His 苯丙氨酸Phe 酪氨酸Tyr
半胱氨酸Cys 异亮氨酸He 脯氨酸Pro 缬氨酸Val
2.20种氨基酸的分类?
按R基化学结构分为哪几类?(脂肪族、芳香族、杂环族);
按R基极性性质分为哪几类?每一类包括哪几种氨基酸?p18(上面有)
3.氨基酸等电点?等电点的计算?(看书p22表2-3,一定要搞懂pI的计算)
特别是R基解离的氨基酸pI的计算(三种碱性氨基酸,两种酸性氨基酸,还有半胱氨酸和酪氨酸)
①侧链为非极性基团或虽为极性基团但不解离的氨基酸:pI=½(pK1+pK2)
②酸性氨基酸(Glu、Asp)及Cys:pI=½(pK1+pKR)
③碱性氨基酸(赖、精、组):pI=½(pK2+pKR)
4一级、二级、三级、四级结构的概念?维持一级、二级、三级、四级结构的化学键?(特别维持三级结构的作用力包括哪些?仔细读p57图5-1)(上面的题目中已有答案)
一级结构由共价键连接。二级结构和其他高级结构主要由非共价力如:氢键、离子键、范德华力维系。
一级结构的连接键:肽键(主要)、二硫键
二级结构:氢键
三级结构:氢键,疏水作用、范德华力、二硫键
第二章糖类化学
1. 糖类的概念及功能
概念:糖类是多羟基醛、多羟基酮或其衍生物,或水解时能产生这些化合物的多聚体。
功能:1.可作为生物体的结构物质,如纤维素。
2.可转变为生命所必需的其它物质,如脂类、蛋白质等。
3.是生物体主要的能量来源。
4.可作为细胞识别的信息分子。
2. 重要的单糖、二糖、寡糖和多糖的结构和性质
单糖:葡萄糖C6H12O6+(CH3CO)2O→C6H7O6(COCH3)5
能与Fehling试剂(CuSO4、NaOH、酒石酸钾钠)反应,说明葡萄糖分子内含有醛基。但葡萄糖的醛基不能和NaHSO3反应,也不能和Schiff试剂(品红-亚硫酸)反应,说明葡萄糖的醛基不如一般醛基活泼。
性质:(1)由醛、酮基产生的化学性质:①单糖的氧化(即单糖的还原性),②单糖的还原③形成糖脎(2)由羟基(半缩醛羟基和醇性羟基)产生的性质:①形成糖酯
②形成糖苷:单糖半缩醛羟基与另一个分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羟基、胺基或巯基缩合形成的含糖衍生物。