原位杂交的基本方法
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
原位杂交的基本方法
一、组织的取材
注意事项:刀要锋利、不能用力向下挤压组织;组织块不宜过大、及时固定。
二、固定
(一)原则:及时固定、避免RNA酶的污染
4%多聚甲醛(0.1M PBS PH7.4,可加1/1000的DEPC),动物实验标本最好先灌流固定。(二)固定液的浓度、固定时间及温度要适宜
1 浓度越高组织结构保存的越好,但mRNA的保存越差;
2 固定时间越长,mRNA破坏的越多;做原位杂交组织固定时间不宜过长,一般24h,不能高温固定(微波可使组织内温度升高),低温可保护RNA不降解(4 ℃冰箱内固定)。mRNA杂交:最好用冰冻切片
a. 4%多聚甲醛中固定1-2h,浸入15%蔗糖溶液中
4℃冰箱过夜,次日切片或保存在液氮中。
b. 取材后直接液氮冷冻,切片后4%多聚甲醛固定
10min,空气干燥后-70 ℃低温冰箱保存。
注意:a. 多聚甲醛与戊二醛混合固定的组织可同时用作光、
电镜检查,但不能用于原位杂交实验。
b. 石蜡切片蛋白质交联影响探针穿透,包埋降低
mRNA含量
三、玻片和组织切片的处理
玻片的处理:
洗涤:洗涤剂→水洗→洗液(24h)→水洗→双蒸水洗→60 ℃烤干→250 ℃烘烤4h,锡箔纸包裹无尘存放。
玻片硅化:将烘烤过的载玻片用2%APES丙酮液浸泡3min →用丙酮洗两次→用DEPC处理过的蒸馏水洗1~2次→40 ℃烘干→防尘保存待用。(整个过程要戴消毒手套进行)
未经硅化的玻片可以涂粘附剂(多聚赖氨酸)
2.增强组织的通透性和核酸探针的穿透性:稀释的酸洗涤、去垢剂Triton X-100或消化酶(蛋白酶k、胃蛋白酶),用量及孵育时间视组织的种类、固定剂的种类及切片的厚薄而定。为保持组织结构,可用4%多聚甲醛再固定。
3.降低背景染色:杂交后的酶处理和杂交后的洗涤。
预杂交:预杂交液不含探针和硫酸葡聚糖,可封闭非特异性杂交点。
杂交后用低浓度RNA酶溶液洗涤一次,以减少残留的内源性RNA。
4.防止RNA酶污染:整个杂交前处理过程都需戴消毒手套,所有实验用玻璃器皿和镊子于实验前一日200 ℃烘烤。
四、杂交
将杂交液滴于切片的组织上,加盖硅化的盖玻片以防止杂交液蒸发。(放在湿盒中,37 ℃孵育)
五、杂交后处理
用不同浓度、不同温度的盐溶液漂洗,可有效地减低背景染色,RNA酶液的洗涤可将组织中非碱基配对的RNA除去。
原则:盐溶液的浓度由高到低,温度由低到高。
注:切勿使切片干燥。
六、显示
根据核酸探针标记物的种类可进行不同显色处理,原位杂交探针一般是用半抗原地高辛标记的,借助于间接加入的酶(酶标的抗地高辛抗体)使底物显色,常用的酶有辣根过氧化物酶(HRP)、碱性磷酸酶(AP)。
1.AP显色系统:-AP+BCIP→BCL-OH+Pi
BCL-OH+NBT →蓝紫色↓
2. HRP显色系统:-HRP+H2O2 →HRP.H2O2
HRP.H2O2 +ODA-NH2 →棕色↓
细胞或组织的原位杂交切片显色后可进行半定量检测,但
要注意严格控制实验条件的同一性,包括切片的厚度、核酸的
保存量等。
七、对照实验和结果的判断
对照实验的设计须根据核酸探针和靶核苷酸的种类以及
现有可能的条件选定:
1.将cDNA或cRNA探针进行预杂交(吸收实验)。
2.与非特异性序列和不相关探针杂交(置换实验)。
3.将切片用RNA酶或DNA酶进行预处理后杂交,应用同义RNA探针进行杂交。
4.以不加核酸探针杂交液进行杂交(空白实验)。
5.组织对照应用已确定为阳性或阴性的组织进行杂交对照。
6.应用未标记探针做杂交进行对照。
八、阳性信号的评定
1.阳性信号定位于胞浆,蓝色细颗粒状,信号越强颜色越深,阴性对照片中无阳性信号检出。
2.阳性细胞数:阳性细胞数≤10%、≤30%、≤70%和>70%分别计为1、2、3和4分。
3.阳性着色强度:可分为弱、中、强三级,分别计1、2、3分,上述两种计分相加,1~3分为阴性,4~5分为阳性,6~7分为强阳性。