儿童白血病的分子生物学分型
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儿童急性白血病的分子 生物学分型
背景
☞ 白血病是儿童期最常见的恶性肿瘤 ☞ 我国每年有1.5万左右的儿童发病
─ 约70%为急性淋巴细胞白血病(ALL) ─ ALL可分为B细胞ALL和T细胞ALL ─ 约30%为急性髓细胞白血病(AML)
临床分型
宿主特征 年龄 外周血白细
胞计数
白血病细胞特征
2.02 5.27 1.01 0.11 0.34 4.82 0.34 0.34 17.15 0.22 0.22
31.84
45例Ⅳ期淋巴瘤中检出5种融合基因
染色体畸变
del(1)(p34;p34) t(10;11)(p12;q23) t(9;11)(p22;q23) t(12;21)(p13;q22) t(2;5)(p23;q35)
融合基因 E2A-PBX1 E2A-HLF TEL-AML1 SIL-TAL1
第4组反应:4种融合基因
染色体易位 t(8;21)(q22;q22) t(3;21)(q26;q22) t(16;21)(p11;q22) t(7;10)(q35;q24) t(10;14)(q24;q11)
融合基因 AML1-ETO AML1-MDS1 TLS-ERG Activation of
t(3;5)(q25.1;q35) NPM-MLF1
892例ALL中检出11种融合基因
染色体畸变
del(1)(p34;p34) t(1;19)(q23;p13) t(4;11)(q21;q23) t(6;11)(q27;q23) t(9;11)(p22;q23) t(9;22)(q34;q11) t(10;11)(p12;q23) t(11;19)(q23;p13.3) t(12;21)(p13;q22) t(16;21)(p11;q22) t(17;19)(q22;p13)
总计
融合基因
dupMLL CBFβ-MYH11
MLL-AF10 MLL-ELL MLL-ENL PML-RARA TLS-ERG NPM-MLF1 MLL-AF6 DEK-CAN AML1-ETO MLL-AF9 TEL-ABL
13种
例数
13 12 9 1 1 59 1 1 1 2 75 9 1
185
形态学(M) 免疫学(I) 细胞遗传学(C) 分子生物学(M)
临床分型
儿童白血病的疗效显著提高
Pui CH, et al. N Engl J Med, 2004
分子生物学分型
☞ 利用分子生物学技术,确定白血病细胞是否携带特定染 色体畸变形成的融合基因,为临床分型提供帮助
☞ 常用技术 ─ 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR) ─ 荧光原位杂交(Fluorescence in situ Hybridization, FISH)
多重PCR检测融合基因
第1组反应:4种融合基因
染色体易位 inv(16)(p13;q22) t(X;11)(q13;q23) t(6;11)(q27;q23) t(11;19)(q23;p13.1)
融合基因 CBFβ-MYH11
MLL-AFX MLL-AF6 MLL-ELL
ห้องสมุดไป่ตู้
第2组反应:4种融合基因
百分比(%)
4.58 4.22 3.17 0.35 0.35 20.77 0.35 0.35 0.35 0.70 26.41 3.17 0.35
总计
融合基因
SIL-TAL1 E2A-PBX1 MLL-AF10 MLL-AF6 MLL-AF9 BCR-ABL(e1a2、b2a2、b3a2) MLL-AF4 MLL-ENL TEL-AML1 TLS-ERG E2A-HLF
11种
例数
18 47 9 1 3 43 3 3 153 2 2 284
百分比(%)
染色体易位 t(9;22)(q34;q11) t(9;12)(q34;p13) t(5;12)(q33;p13)
融合基因 BCR-ABL TEL-ABL TEL-PDGFR
多重PCR检测融合基因
第7组反应:3种融合基因
染色体易位 t(6;9)(p23;q34) t(9;9)(q34;q34)
融合基因
HOX11
多重PCR检测融合基因
第5组反应:4种融合基因
染色体易位 t(4;11)(q21;q23) t(11;19)(q23;p13.3) t(9;11)(p22;q23) t(1;11)(q21;q23)
融合基因 MLL-AF4 MLL-ENL MLL-AF9 MLL-AF1q
第6组反应:3种融合基因
DEK-CAN
SET-CAN Activation of
EVI1
第8组反应:5种融合基因
染色体易位
融合基因
t(11;17)(q23;q21) PLZF-RAR
t(15;17)(q21;q22) PML-RARA
t(2;5)(p23;q35) NPM-ALK
t(5;17)(q35;q22) NPM-RAR
总计
融合基因
SIL-TAL1 MLL-AF10 MLL-AF9 TEL-AML1 NPM-ALK
5种
例数
2 3 1 1 2 9
百分比(%)
4.44 6.67 2.22 2.22 4.44 20.0
284例AML中检出13种融合基因
染色体畸变
dup(11q23) inv(16)(p13;q22) t(10;11)(p12;q23) t(11;19)(q23;p13.1) t(11;19)(q23;p13.3) t(15;17)(q21;q22) t(16;21)(p11;q22) t(3;5)(q25.1;q35) t(6;11)(q27;q23) t(6;9)(p23;q34) t(8;21)(q22;q22) t(9;11)(p22;q23) t(9;12)(q34;p13)
染色体易位 t(1;11)(p32;q23) t(11;17)(q23;q21) t(10;11)(p12;q23) dupMLL(11q23)
融合基因 MLL-AF1p MLL-AF17 MLL-AF10 MLL-MLL
多重PCR检测融合基因
第3组反应:4种融合基因
染色体易位 t(1;19)(q23;p13) t(17;19)(q22;p13) t(12;21)(p13;q22) del(1)(p34;p34)
背景
☞ 白血病是儿童期最常见的恶性肿瘤 ☞ 我国每年有1.5万左右的儿童发病
─ 约70%为急性淋巴细胞白血病(ALL) ─ ALL可分为B细胞ALL和T细胞ALL ─ 约30%为急性髓细胞白血病(AML)
临床分型
宿主特征 年龄 外周血白细
胞计数
白血病细胞特征
2.02 5.27 1.01 0.11 0.34 4.82 0.34 0.34 17.15 0.22 0.22
31.84
45例Ⅳ期淋巴瘤中检出5种融合基因
染色体畸变
del(1)(p34;p34) t(10;11)(p12;q23) t(9;11)(p22;q23) t(12;21)(p13;q22) t(2;5)(p23;q35)
融合基因 E2A-PBX1 E2A-HLF TEL-AML1 SIL-TAL1
第4组反应:4种融合基因
染色体易位 t(8;21)(q22;q22) t(3;21)(q26;q22) t(16;21)(p11;q22) t(7;10)(q35;q24) t(10;14)(q24;q11)
融合基因 AML1-ETO AML1-MDS1 TLS-ERG Activation of
t(3;5)(q25.1;q35) NPM-MLF1
892例ALL中检出11种融合基因
染色体畸变
del(1)(p34;p34) t(1;19)(q23;p13) t(4;11)(q21;q23) t(6;11)(q27;q23) t(9;11)(p22;q23) t(9;22)(q34;q11) t(10;11)(p12;q23) t(11;19)(q23;p13.3) t(12;21)(p13;q22) t(16;21)(p11;q22) t(17;19)(q22;p13)
总计
融合基因
dupMLL CBFβ-MYH11
MLL-AF10 MLL-ELL MLL-ENL PML-RARA TLS-ERG NPM-MLF1 MLL-AF6 DEK-CAN AML1-ETO MLL-AF9 TEL-ABL
13种
例数
13 12 9 1 1 59 1 1 1 2 75 9 1
185
形态学(M) 免疫学(I) 细胞遗传学(C) 分子生物学(M)
临床分型
儿童白血病的疗效显著提高
Pui CH, et al. N Engl J Med, 2004
分子生物学分型
☞ 利用分子生物学技术,确定白血病细胞是否携带特定染 色体畸变形成的融合基因,为临床分型提供帮助
☞ 常用技术 ─ 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR) ─ 荧光原位杂交(Fluorescence in situ Hybridization, FISH)
多重PCR检测融合基因
第1组反应:4种融合基因
染色体易位 inv(16)(p13;q22) t(X;11)(q13;q23) t(6;11)(q27;q23) t(11;19)(q23;p13.1)
融合基因 CBFβ-MYH11
MLL-AFX MLL-AF6 MLL-ELL
ห้องสมุดไป่ตู้
第2组反应:4种融合基因
百分比(%)
4.58 4.22 3.17 0.35 0.35 20.77 0.35 0.35 0.35 0.70 26.41 3.17 0.35
总计
融合基因
SIL-TAL1 E2A-PBX1 MLL-AF10 MLL-AF6 MLL-AF9 BCR-ABL(e1a2、b2a2、b3a2) MLL-AF4 MLL-ENL TEL-AML1 TLS-ERG E2A-HLF
11种
例数
18 47 9 1 3 43 3 3 153 2 2 284
百分比(%)
染色体易位 t(9;22)(q34;q11) t(9;12)(q34;p13) t(5;12)(q33;p13)
融合基因 BCR-ABL TEL-ABL TEL-PDGFR
多重PCR检测融合基因
第7组反应:3种融合基因
染色体易位 t(6;9)(p23;q34) t(9;9)(q34;q34)
融合基因
HOX11
多重PCR检测融合基因
第5组反应:4种融合基因
染色体易位 t(4;11)(q21;q23) t(11;19)(q23;p13.3) t(9;11)(p22;q23) t(1;11)(q21;q23)
融合基因 MLL-AF4 MLL-ENL MLL-AF9 MLL-AF1q
第6组反应:3种融合基因
DEK-CAN
SET-CAN Activation of
EVI1
第8组反应:5种融合基因
染色体易位
融合基因
t(11;17)(q23;q21) PLZF-RAR
t(15;17)(q21;q22) PML-RARA
t(2;5)(p23;q35) NPM-ALK
t(5;17)(q35;q22) NPM-RAR
总计
融合基因
SIL-TAL1 MLL-AF10 MLL-AF9 TEL-AML1 NPM-ALK
5种
例数
2 3 1 1 2 9
百分比(%)
4.44 6.67 2.22 2.22 4.44 20.0
284例AML中检出13种融合基因
染色体畸变
dup(11q23) inv(16)(p13;q22) t(10;11)(p12;q23) t(11;19)(q23;p13.1) t(11;19)(q23;p13.3) t(15;17)(q21;q22) t(16;21)(p11;q22) t(3;5)(q25.1;q35) t(6;11)(q27;q23) t(6;9)(p23;q34) t(8;21)(q22;q22) t(9;11)(p22;q23) t(9;12)(q34;p13)
染色体易位 t(1;11)(p32;q23) t(11;17)(q23;q21) t(10;11)(p12;q23) dupMLL(11q23)
融合基因 MLL-AF1p MLL-AF17 MLL-AF10 MLL-MLL
多重PCR检测融合基因
第3组反应:4种融合基因
染色体易位 t(1;19)(q23;p13) t(17;19)(q22;p13) t(12;21)(p13;q22) del(1)(p34;p34)