COX回归分析..
cox回归分析
生存分析之COX回归分析1、生存分析,就是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析得一种统计方法;2、生存时间,就是从规定得观察起点到某一特定终点事件出现得时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间;3、完全数据,观测起点到终点事件所经历得时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡得时间;4、删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定得终点事件以外得原因而终止观察,不能确定具体生存时间得一类数据;5、生存概率,表示某时段开始存活得个体到该时段结束仍存活得概率,p=活满某时段得人数/该时段期初有效人口数;6、生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段得生存概率得累积概率,S(tk)=p1、p2、pk=S(tk-1)、pk;7、生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点得生存率连在一起得曲线图;8、中位生存期,又称半数生存期,表示50%得个体存活得时间;9、PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存得影响不随时间得改变而改变,就是COX回归模型建立得前提条件。
Cox回归分析及其SPSS操作方法概述前面我们已经讲过生存分析及KM法得内容,详细可以回复数字26-28查瞧。
但有对统计不太熟悉得“微粉”还不太明白生存分析与一般统计得区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。
在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局就是否出现,还会关心结局出现得时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4、5后死亡,如果只瞧第5年时得结局,两者就是一样得(均死亡),但就是实际我们认为后者得治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局与结局出现得时间,而一般分析只考虑结局。
另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般得分析中这种病例无法使用,而中间失访得病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例得状态,失访前得资料可以用于分析。
Cox回归分析—非常详细的SPSS操作介绍
患者生存状态的影响因素分析——生存资料的COX回归分析1、问题与数据某研究者拟观察某新药的抗肿瘤效果,将70名肺癌患者随机分为两组,分别采用该新药和常规药物进行治疗,观察两组肺癌患者的生存情况,共随访2年。
研究以死亡为结局,两种治疗方式为主要研究因素,同时考虑调整年龄和性别的影响,比较两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异。
变量的赋值和部分原始数据见表1和表2。
表1. 某恶性肿瘤的影响因素与赋值表2. 两组患者的生存情况group gender age time survival0 1 0 22 10 1 1 10 10 1 1 64 10 1 1 12 10 1 0 17 11 0 0 19 11 1 1 4 11 0 1 12 01 0 0 5 01 1 1 27 02、对数据结构的分析该研究以死亡为结局,治疗方式为主要研究因素,每个研究对象都有生存时间(随访开始到死亡、失访或随访结束的时间),同时考虑调整年龄和性别的影响。
欲了解两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异,可以用Cox比例风险模型(Cox proportional-hazards model,也称为Cox回归)进行分析。
实际上,Cox回归的结局不一定是死亡,也可以是发病、妊娠、再入院等。
其共同特点是,不仅考察结局是否发生,还考察结局发生的时间。
在进行Cox回归分析前,如果样本不多而变量较多,建议先通过单变量分析(KM法绘制生存曲线、Logrank检验等)考察所有自变量与因变量之间的关系,筛掉一些可能无意义的变量,再进行多因素分析,这样可以保证结果更加可靠。
即使样本足够大,也不建议把所有的变量放入方程直接分析,一定要先弄清楚各个变量之间的相互关系,确定自变量进入方程的形式,这样才能有效的进行分析。
单因素分析后,应当考虑应该将哪些自变量纳入Cox回归模型。
一般情况下,建议纳入的变量有:1)单因素分析差异有统计学意义的变量(此时,最好将P值放宽一些,比如0.1或0.15等,避免漏掉一些重要因素);2)单因素分析时,没有发现差异有统计学意义,但是临床上认为与因变量关系密切的自变量。
部分COX回归分析
an1 an2
X3 …. XP
a13 … a1p a23 … a2p a33 … a3p
… ……
an3 … anp
3、COX回归模型 (Cox regression model)
(1)风险率(hazard rate):
患者在t时刻仍存活,在时间t后的瞬间 死亡率,以h(t)表示。
h(t)
死于区间(t,t t)的病人数 在t时刻尚存的病人数 t
The PHREG Procedure
Testing Global Null Hypothesis: BETA=0
Without
With
Criterion Covariates Covariates Model Chi-Square
-2 LOG L
Score
Wald
61.344 . .
Testing Global Null Hypothesis: BETA=0
Without
With
Criterion Covariates Covariates Model Chi-Square
-2 LOG L 61.344 47.906 13.437 with 2 DF(p=0.0012)
Score
4、筛选变量(逐步COX回归分析)
(1)向前法(forward selection)
(2)后退法(backward selection)
(3)逐步回归法 逐步引入-剔除法(stepwise selection)
SLE和SLS的确定同前
调试法:P从大到小取值0.5, 0.1,0.05,一般实际用时,SLE, SLS应多次选取调整。
cox回归模型的基本形式
cox回归模型的基本形式1.引言1.1 概述Cox回归模型是一种常用的生存分析方法,用于研究个体的生存时间与其它因素之间的关系。
生存分析是一种统计学方法,用于分析个体在某个特定时刻或时间段内的生存情况,包括生存时间的长度、生存率以及与其它因素的关联等。
Cox回归模型的基本思想是通过描述危险函数和危险比来研究个体的生存时间。
危险函数描述了在给定时间点个体发生事件(比如死亡)的概率,而危险比则代表了两个不同个体之间的危险程度比较。
通过对危险函数和危险比的建模分析,我们可以得到不同变量对生存时间的影响程度,并且进行生存概率的预测。
Cox回归模型在生物医学、社会科学、经济学等领域中被广泛应用。
在医学研究中,Cox回归模型可以帮助研究者探究特定疾病的生存率以及对生存时间的影响因素,从而为临床治疗和预后评估提供重要的参考依据。
在社会科学领域,Cox回归模型可以用来研究人们的生活方式、社会经济地位等因素对生存时间的影响,从而对社会政策进行科学制定提供支持。
本文首先介绍Cox回归模型的定义和背景,然后详细探讨Cox回归模型的基本形式,包括单变量Cox回归模型和多变量Cox回归模型。
最后,我们将总结Cox回归模型的优势和应用,希望读者对该模型有更全面的了解,并且能够应用于实际的研究工作中。
1.2 文章结构本文将按照以下结构来讨论Cox回归模型的基本形式。
首先,在引言部分1.1中,我们将概述Cox回归模型的背景和定义,并阐明研究的目的。
接下来,在正文部分2中,我们将详细介绍Cox回归模型的基本形式。
2.1节将讨论Cox回归模型的定义和背景,以便读者对其有一个全面的了解。
然后,在2.2节中,我们将重点讨论Cox回归模型的基本形式。
在这一节中,我们将先介绍单变量Cox回归模型的基本形式(2.2.1小节),然后探讨多变量Cox回归模型的基本形式(2.2.2小节)。
通过这些讨论,读者将能够清楚地了解Cox回归模型的具体数学表达和建模方法。
cox回归系数范围
Cox 回归(也称为比例风险回归)是一种生存分析方法,通常用于分析时间到事件发生的数据,如生存时间数据。
Cox 回归的主要目标是评估自变量对事件发生的风险(或概率)的影响。
Cox 回归系数的范围通常是取决于所使用的统计软件和参数化方法。
下面是一些 Cox 回归系数范围的解释:1.系数范围: Cox 回归模型中的系数是自变量对风险的影响的估计值。
这些系数可以为正、负或零,它们表示了自变量对风险的影响程度和方向。
2.指数化系数: Cox 回归系数通常是指数化的。
指数化系数的范围通常是在正实数范围内。
如果系数为1,表示自变量对风险没有影响。
如果系数大于1,表示自变量对风险有正向影响,即增加风险。
如果系数小于1,表示自变量对风险有负向影响,即减小风险。
3.系数的解释: Cox 回归系数的解释通常依赖于所使用的统计软件和模型参数化方法。
在一些软件中,系数可以被解释为相对风险的对数。
这意味着一个单位的系数变化对应于相对风险的对数变化。
在其他软件中,系数可能被解释为相对风险的比例变化。
这些解释方法有助于理解自变量对事件风险的实际影响。
4.信赖区间:与 Cox 回归系数相关的还有信赖区间。
信赖区间提供了系数估计的不确定性范围,通常以95%置信水平表示。
系数估计的信赖区间可以帮助确定系数的显著性以及风险估计的稳定性。
总之,Cox 回归系数的范围通常是指数化的,位于正实数范围内,表示自变量对风险的影响。
系数的解释可能取决于统计软件和参数化方法,通常被解释为相对风险的对数或比例变化。
系数估计的信赖区间可用于确定系数的显著性和稳定性。
cox回归分析
生存分析之COX回归分析1.生存分析,是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析的一种统计方法;2.生存时间,是从规定的观察起点到某一特定终点事件出现的时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间;3.完全数据,观测起点到终点事件所经历的时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡的时间;4.删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定的终点事件以外的原因而终止观察,不能确定具体生存时间的一类数据;5.生存概率,表示某时段开始存活的个体到该时段结束仍存活的概率,p=活满某时段的人数/该时段期初有效人口数;6.生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段的生存概率的累积概率,S(tk)=p1.p2.pk=S(tk-1).pk;7.生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点的生存率连在一起的曲线图;8.中位生存期,又称半数生存期,表示50%的个体存活的时间;9.PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存的影响不随时间的改变而改变,是COX回归模型建立的前提条件。
1.Cox回归分析及其SPSS操作方法概述前面我们已经讲过生存分析及KM法的内容,详细可以回复数字26-28查看。
但有对统计不太熟悉的“微粉”还不太明白生存分析与一般统计的区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。
在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局是否出现,还会关心结局出现的时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4.5后死亡,如果只看第5年时的结局,两者是一样的(均死亡),但是实际我们认为后者的治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局和结局出现的时间,而一般分析只考虑结局。
另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般的分析中这种病例无法使用,而中间失访的病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例的状态,失访前的资料可以用于分析。
cox比例风险回归模型结果解读
COX比例风险回归模型是一种常用的生存分析方法,它能够对生存时间或事件发生时间进行建模,并且能够考虑到不同个体的观测时长不同这一特点。
在研究中,COX比例风险回归模型通常被用来探究某种因素对于生存时间或事件发生时间的影响程度。
本文将以COX比例风险回归模型为主题,深入探讨其原理、应用、结果解读和个人理解。
一、COX比例风险回归模型原理COX比例风险回归模型是由David R. Cox于1972年提出的,它是一种半参数模型,既考虑了危险比的比例关系,又不需要对基本风险函数作出严格的假设。
模型的基本形式为:$$ h(t|x) =h_0(t)exp(\beta_1x_1+\beta_2x_2+...+\beta_px_p) $$ 其中,h(t|x)为在给定协变量x情况下,观测到时间t的瞬时事件发生率;h0(t)为基础风险函数,与协变量无关;β1, β2,…, βp为协变量的回归系数;x1, x2,…, xp为对应的协变量。
二、COX比例风险回归模型应用COX比例风险回归模型主要适用于生存分析领域,例如医学、流行病学和生态学等研究中。
研究者可以利用COX比例风险回归模型来探究不同因素对于生存时间或事件发生时间的影响情况。
这种模型在临床试验中也得到了广泛的应用,可以用来评估治疗效果、预测疾病风险等。
三、COX比例风险回归模型结果解读在进行COX比例风险回归模型分析后,我们通常会得到各个协变量的回归系数、危险比和相应的置信区间。
这些结果对于理解不同因素对生存时间或事件发生时间的影响至关重要。
如果某个协变量的危险比为2.0,且置信区间不包含1.0,就说明该因素对事件发生的影响是显著的。
还需要考虑模型的比例风险假设是否成立,以及是否存在共线性等问题。
个人理解与观点:COX比例风险回归模型是一种非常有用的统计方法,它能够帮助研究者从更深层次理解不同因素对生存能力的影响程度。
然而,在进行模型分析时,我们还需要注意模型的适用性和准确性,避免结果的误导性。
lasso cox regression analysis
Lasso Cox回归分析是一种结合了Lasso回归和Cox回归分析的统计方法。
这种方法在生物信息学、医学和其他领域中被广泛应用,用于研究多个变量对生存时间的影响,尤其是在存在多重共线性和变量个数大于样本量的情况下。
Lasso回归是一种线性模型,通过添加一个惩罚项来压缩模型系数,从而实现变量选择和降低模型复杂度。
这个惩罚项是一个绝对值之和的函数,使得一些系数被压缩为零,从而达到变量选择的目的。
在Lasso回归分析中,通过调整惩罚项的系数λ,可以控制变量选择的严格程度。
Cox回归是一种生存分析方法,用于研究多个变量对生存时间的影响。
Cox回归模型是一种半参数模型,不需要对生存时间分布做出假设,因此在实际应用中比较灵活。
Cox回归模型通过最大化部分似然函数来估计模型系数,从而得到每个变量对生存时间的影响。
将Lasso回归和Cox回归结合起来,可以形成一种新的分析方法——Lasso Cox回归分析。
这种方法首先利用Lasso回归进行变量选择,将不重要的变量压缩为零,然后利用Cox回归模型分析筛选后的变量对生存时间的影响。
这种方法可以克服传统Cox回归在变量个数大于样本量或存在多重共线性时的局限性,提高模型的稳定性和预测能力。
在进行Lasso Cox回归分析时,需要注意选择合适的λ值,以便在变量选择和模型复杂度之间取得平衡。
常用的方法是通过交叉验证等方式来评估不同λ值下模型的性能,选择最优的λ值进行建模。
此外,还需要注意模型的假设条件和适用范围,以确保分析结果的准确性和可靠性。
生存分析-cox回归与sas应用总结x
生存分析的应用场景
01
02
03
医学研究
在临床试验和流行病学研 究中,生存分析用于评估 患者的生存时间,探究疾 病进展和治疗效果。
生物学研究
在生物学和生物医学研究 中,生存分析用于研究生 物体的寿命、疾病发生和 种群动态。
经济学研究
在经济学领域,生存分析 用于研究企业的寿命、市 场退出和产业动态等。
比例风险假设
Cox回归模型要求满足比例风险假设,即风险函数 的比例不随时间变化。
数据完整性
数据需要完整,包括每个观察对象的结局和生存 时间。
独立性
自变量之间需要满足独立性条件,避免多重共线 性问题。
Cox回归模型在生存分析中的重要性
广泛应用
Cox回归模型是生存分析 中最常用的方法之一,适 用于多种生物医学和工程 领域。
• 多模态数据融合:未来的研究可以探索如何将不同来源和类型的数据进行融合 ,以提高生存分析的精度和预测能力。例如,可以将基因组学、影像学等多模 态数据与临床数据相结合,以更全面地了解疾病进展和预后。
• 个性化治疗:随着精准医学的发展,未来的研究可以关注如何利用生存分析的 方法来评估个性化治疗的效果,为患者提供更精准的治疗方案。
PHREG过程用于执行 Cox比例风险回归模型, 用于分析生存时间数据 并评估协变量的影响。
LIFETEST过程可用于估 计生存函数、计算生存 时间的中位数和进行生
存比较等。
使用SAS进行Cox回归的步骤与示例
导入数据
01 使用SAS的数据导入功能将数
据加载到适当的SAS数据集中 。
数据清理和预处理
未来研究方向与展望
• 改进模型:针对Cox回归的限制,未来研究可以探索改进的模型和方法,以提 高生存分析的准确性和适用性。例如,可以考虑使用半参数模型、混合效应模 型等其他方法来处理生存数据。
生存资料的Cox回归分析(3)-结果解读及结论撰写
生存资料的Cox回归分析(3)-结果解读及结论撰写读前提示:本篇文章是“Cox回归分析”的第三部分,如需前情回顾,请返回医咖会主界面,查看 9 月 5 日推送的前两条内容。
结果解读( 1 )CaseProcessingSummary 表格给出了分析数据的基本情况,其中包括事件发生数(Event )、删失数(Censored )和总数(Total )等信息。
(2 )Categorical Variable Codings 表格给出了 Categorical Covariates 选项中设置的变量(本例中为group )所对应的赋值情况和频率(Frequency )。
最后一列给出了变量编码的情况。
脚注b. Indicator Parameter Coding 说明了本研究中group 变量以First 为参照组(Categorical Covariates 选项中的设置)。
(3 )OmnibusTests of Model Coefficients 表格给出了模型中所有变量的回归系数全为0 的检验结果。
对于本例,①Score统计量为5.065, P=0.024 ;②对数似然比检验χ2 =5.399, P=0.020。
说明模型中至少有一个自变量的 HR 值不为1 ,模型整体检验有统计学意义。
( 4 )Variables in the Equation 表格给出了参数估计的结果。
结果显示最后筛选后的模型仅包含group 变量,①P =Sig.=0.029 说明治疗方式为影响肺癌患者预后的独立因素。
②相对危险度 HR=Exp(B)=0.410 ,说明使用新药的患者死亡风险为使用常规药物患者的 0.410 倍,③H R 的 95% 可信区间( 95% CI )为 0.184-0.914。
( 5 )生存曲线。
前述Plots 选项的设置要求输出按照不同药物分组的生存曲线。
新药组(赋值为 1 ,绿色线条)比常规药物组(赋值为0 ,蓝色线条)的生存率高。
COX回归分析
(3)可以用 β1x1+β2x2+…+βpxp(预 后指数)估计疾病的预后。
4、筛选变量(逐步COX回归分析)
(1)向前法(forward
selection)
(2)后退法(backward selection) (3)逐步回归法 逐步引入-剔除法(stepwise selection) SPSS实现方法与Logistic回归相同
其中b0为截距, b1 ,b2 …bp称为偏回归系数.
bi 表示当将其它 p-1 个变量的作用加以固定后 , Xi
改变1个单位时Y将改变bi个单位.
SPSS实现逐步回归方法:
操作过程:Analyze---Regression--Linear---y选入Dependent---x1、x2、 X3选入Independent---Stepwise--options--ok
Options→Correlation of estimate→ Display model→at last step→Entry-removal (0.05,0.10)→Maximum iterations(20)→ Continue→OK
Case Pr ocessing Summary N Cases av ailable in analy sis Cases dro pped Ev enta Censored Total Cases w ith missing v alues Cases w ith non-positiv e time Censored cases before the earliest ev en t in a str atum Total 15 1 16 0 0 0 0 16 Percent 93.8% 6.3% 100.0% .0% .0% .0% .0% 100.0%
生存分析-cox 回归与sas应用总结
2021/10/10
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三. Cox 回归 sas 过程
PHREG过程的语法格式如下: PROC PRREG [过程选项]; MODEL <生存时间变量*截尾指示变量(数值)>=<自变量名> /[模型选项]; STRATA <分层变量名列>; FREQ <变量名列>; BY <分组变量名列>; RUN;
指标
回归系数
P值
相对危险度
----------------------------------------------------------
肿瘤部位中段
-0.7169
0.0469
0.488
肿瘤部位下段
-1.0077
0.0068
0.365
深度
0.3585
0.0007
1.431
TNM分期
0.1603
0.0003
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二. COX回归的应用
COX回归的应用:
(1)因素分析 分析哪些因素(协变量)对生存期的长短有显著作用。 对各偏回归系数作显著性检验,如显著,则说明在排除其它因素的影
响后,该 因素与生存期的长短有显著关系。
(2)求各因素在排除其它因素的影响后,对于死亡的相对危险度(或比 数比)
2.【模型选项】 ENTRYTIME=变量名,规定一个替代左截断时间的变量名。
SELECTION=自变量筛选方法 FORWARD/F: 按规定的P值SLE从无到有依次选择变量进入模型 BACKWARD/B: 按规定的P值SLS从含有全部变量的模型开始,依次剔除变量
STEPWISE/S:按SLE的标准依次选入变量,同时对模型中现有的变量按SLS的标准 剔除不显著的变量 SCORE 采DF (p=0.0010) Wald检验
cox回归分析
cox回归分析Cox回归分析是一种常用的统计学方法,用于分析生存时间数据和生存分析。
它在医学研究、生物学领域以及工程和社会科学等诸多领域得到广泛应用。
本文将介绍Cox回归分析的概念、原理、使用方法以及在实际问题中的应用。
Cox回归分析是由英国统计学家David Cox提出的一种统计方法。
它是基于风险比(Hazard Ratio)的概念,用于估计某个变量对事件发生概率的影响。
所谓“风险比”即某个因素发生后,事件发生概率相对于该因素不发生时的比值。
Cox回归分析的核心思想是通过构建一个风险函数来描述某个因素对事件发生的影响。
具体而言,风险函数是生存时间的密度函数和基准风险函数的乘积。
基准风险函数是指在没有任何因素作用时,事件发生的概率密度函数。
Cox回归分析的目标是估计出各个因素的风险函数,进而计算出它们的风险比。
在进行Cox回归分析时,首先需要收集相关的数据。
数据包括生存时间和事件发生情况,以及可能的影响因素,如年龄、性别、治疗方式等。
然后,通过Cox回归模型,可以估计出每个因素的风险比及其置信区间。
Cox回归分析可以通过不同的方法进行模型拟合和参数估计。
常用的方法包括偏似然估计、梯度下降算法和牛顿-拉夫逊算法等。
根据模型拟合的结果,可以得到每个因素的风险比及其显著性检验结果。
Cox回归分析在实际问题中有广泛的应用。
以医学研究为例,研究者常常希望了解某种治疗方式对患者生存时间的影响。
通过Cox回归分析,可以估计出不同治疗方式的风险比,并判断其是否显著。
这样就可以为临床医生提供有关治疗选择的科学依据。
另外,Cox回归分析也可以用于预测生存时间。
在预测模型中,可以考虑多个因素的影响,并计算出每个因素的权重。
通过对新样本的观测数据进行Cox回归分析,可以基于已知因素的权重预测出其生存时间。
除了医学研究外,Cox回归分析还可以应用于其他领域。
例如,在金融领域,可以使用Cox回归分析来研究某个因素对违约概率的影响;在社会科学中,可以使用Cox回归分析来分析某个因素对离婚率的影响。
cox回归参数估计法
cox回归参数估计法Cox回归是一种常用的生存分析方法,用于研究影响时间至事件发生的因素。
它基于Cox比例风险模型,通过估计风险比例来评估自变量对事件发生时间的影响程度。
Cox回归使用了部分似然估计方法来估计模型的参数。
下面我将从多个角度来解释Cox回归参数估计法。
1. 部分似然估计方法,Cox回归采用了部分似然估计方法来估计模型的参数。
部分似然估计方法是一种在存在右侧截尾数据(即未观察到事件发生的个体)的情况下进行参数估计的方法。
它基于已观察到的事件发生时间和未观察到的事件发生时间之间的比较,通过最大化似然函数来估计模型的参数。
2. 风险比例模型,Cox回归基于Cox比例风险模型,该模型假设自变量对事件发生的风险比例是恒定的。
具体来说,它假设风险比例是一个与时间无关的函数。
通过估计风险比例,我们可以评估自变量对事件发生时间的影响程度。
3. 非参数估计,Cox回归是一种非参数估计方法,它不需要对基础风险函数(即未受自变量影响的风险函数)做出任何假设。
这使得Cox回归具有较强的灵活性,可以适应各种类型的数据。
4. Cox偏似然估计,Cox回归使用了Cox偏似然估计方法来估计模型的参数。
Cox偏似然估计方法是一种基于风险集的方法,它通过比较每个风险集中的个体对事件发生的贡献来估计参数。
这种方法可以有效地处理右侧截尾数据,且不需要对未观察到的事件发生时间做出任何假设。
5. 基于分数函数的估计,Cox回归使用了基于分数函数的估计方法来估计模型的参数。
分数函数是一个基于观测数据的函数,它用于计算每个个体在给定时间点的风险得分。
通过最大化分数函数的似然函数,我们可以估计模型的参数。
总结起来,Cox回归通过部分似然估计方法和Cox偏似然估计方法,基于风险比例模型和分数函数的估计,对模型的参数进行估计。
它是一种非参数估计方法,适用于处理右侧截尾数据,并且具有较强的灵活性。
COX回归分析解析
COX回归分析解析Cox回归分析是一种常用的生存分析方法,用于评估对生存时间有影响的因素。
它可以解决各种因素在时间上对生存时间的影响,并可以考虑协变量的影响。
本文将对Cox回归分析的原理、应用和解读进行详细解析。
1. Cox回归分析原理Cox回归分析基于Cox比例风险模型,该模型假设各个协变量对生存时间的影响是线性的,并且不随时间变化。
其模型的数学表达式如下:h(t,x) = h0(t) * exp(β1x1 + β2x2 + ... + βpxp)其中,h(t,x)表示在给定协变量(x1, x2, ..., xp)条件下,时间t时刻个体的瞬时风险;h0(t)是基准风险函数,表示在所有协变量都为0的情况下,个体的风险函数;β1, β2, ..., βp为协变量x1, x2, ..., xp的回归系数。
2. Cox回归分析应用Cox回归分析广泛应用于生存分析领域,特别是在临床研究中。
它可以研究各种协变量对生存时间的影响,并进行因素筛选和预测。
在临床研究中,Cox回归分析可以用于评估各种因素对疾病生存时间的影响,如性别、年龄、治疗方式等。
同时,它还可以用于预测患者的生存概率,为临床决策提供依据。
除了临床研究外,Cox回归分析还可以用于其他领域的生存分析,如经济学、社会学等。
它可以评估不同因素对个体生存时间的影响,并提供深入的解释和预测。
在进行Cox回归分析后,可以得到每个协变量的回归系数和相应的风险比(HR)。
风险比是比较不同协变量之间风险大小的衡量指标。
当HR大于1时,表示该因素增加了个体生存时间的风险;当HR小于1时,表示该因素减少了个体生存时间的风险。
此外,Cox回归分析还可以得到每个协变量的置信区间(CI),用于对回归系数的显著性进行评估。
当CI不包含1时,表示该因素对生存时间具有显著影响;当CI包含1时,表示该因素对生存时间的影响不显著。
为了更好地解释结果,还可以绘制Kaplan-Meier曲线,用于显示不同组之间的生存差异。
COX回归分析
COX回归分析
接下来,将事件发生时间、事件状态和预测变量作为输入,进行COX
回归分析。
在COX回归分析中,事件发生时间和事件状态被编码为一个对
数似然函数,即
log(λ(t)) = β0 + β1x1 + β2x2 + ... + βpxp
其中,λ(t)表示在时间t事件发生的概率密度函数,β0是一个基
准风险,β1到βp是对应预测变量的系数,x1到xp是对应预测变量的
取值。
模型评估的主要方法是似然比检验和比例风险检验。
似然比检验用于
检测整个模型的有效性,比例风险检验用于检测每个预测变量的有效性。
如果似然比检验的P值小于显著水平,可以认为预测变量对事件风险有显
著影响。
结果解读时,主要关注风险比(HR)和置信区间(CI)。
风险比可以
用来比较两个组之间的事件风险,HR>1表示高风险,HR<1表示低风险,HR=1表示相同风险。
置信区间表示了对风险比的估计的不确定性范围,
通常使用95%置信区间。
总之,COX回归分析可以帮助研究者识别和评估多个预测变量对事件
风险的影响。
通过选择预测变量、建立模型、评估模型和解读结果,可以
得到有关预测变量对事件风险影响的有效信息,为生存分析提供科学依据。
cox回归模型计算得到
在统计学中,Cox回归模型是一种用于生存分析的模型,它可以用于研究在观察期间生存时间与某些变量之间的关系。
这种模型常用于医学研究中,以了解某些因素(如治疗方式、疾病进展等)如何影响病人的生存时间。
假设我们有一个数据集,其中包含了一些病人的信息(如年龄、性别、病情等)和治疗方式(作为因变量),我们可以使用Cox回归模型来进行分析。
Cox回归模型的公式为:S(t) = P = exp(β1*X1 + β2*X2 + ... + βn*Xn)其中,S(t)表示在时间t时的生存概率,P表示概率值,βi表示自变量的系数,Xi表示第i 个自变量。
这个模型的一个主要优点是它可以同时考虑生存时间和多个解释变量。
回归模型的系数可以通过最大似然估计法或矩估计法得到。
在这个例子中,如果年龄、性别和病情这些变量都进入模型,并且我们得到一个有趣的发现,即治疗方式对生存时间的影响与年龄和性别有关。
那么我们可以得出结论,治疗方式可能通过影响病人的年龄和性别来影响生存时间。
在计算得到的结果中,我们通常会看到几个重要的指标:1. 风险比(Hazard Ratio):这是Cox回归模型中最重要的一项结果。
它表示了某一水平(或变化)的自变量对风险的影响程度。
风险比可以用来比较不同组之间的生存概率是否不同。
2. 置信区间(Confidence Interval):这是对风险比的一个估计范围,它可以帮助我们判断自变量是否显著影响生存时间。
3. 统计显著性(Significance):这是基于假设检验的结果,用于判断自变量是否对生存时间有显著影响。
如果p值小于显著性水平(通常为0.05或0.01),则我们可以拒绝零假设,认为自变量对生存时间有显著影响。
以上就是Cox回归模型的基本概念和计算过程。
具体应用时,还需要根据数据和研究问题来选择合适的模型和方法。
Cox回归分析.ppt
病人
处理 性别 生存 结局 组号 (男=1) 天数 (死=1)
风险函数 (因人而异)
Name x1 x2 t
d h(t)=h0(t) e b1x1b2x2
王一 1 1 18 1
e h0(t) b1b2
黄二 0 0 48 1
h0(t)
张三 0 1 70 0
h0(t) eb2
李四 1 0 90 1
h0(t) eb1
风险率 (随时变化)
18 天
48 天
h0(18) eb1b2
90天
h0(18) e 0 h0(18) eb2
h0(18) eb1
h0(48) e 0 h0(48) eb2
Cox模型的 基本形式
利用生存率函数S(t,X)与 风险函数h(t,X)的关系可 导出
St, X exp
t 0
ht,
X
dt
exp
t 0
h0
t exp
X
dt
S0
t exp(
X
)
j
较好地解 决截尾值 的问题
反映了协变量X与生存函数的关系
Cox回归分析
随访资料的特点
① 分布类型不易确定。一般不服从正态分布,少数 情况下近似服从指数分布、Weibull分布、 Gompertz分布等,多数情况下往往是不服从任 何规则的分布类型。
② 影响因素多而复杂且不易控制。 ③ 根据研究对象的结局,生存时间数据可分为两种
类型:
完全数据(complete data) 截尾数据(截尾值、删失数据,censored data)
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2 2
1 0
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SPSS操作步骤:
▪ Analyze-----Regression-----Binary Logistic ▪ -----Dependent框(y)-----Covariates框
(x1,x2,…)------ok
第十九章 Cox回归分析 (Cox regression)
下的最 LLP (H1)
大部分似然函 和 LLP (H1 )
数
的
对
数
▪ 可以证明在H0成立的条件下,统计量
▪ 自χ由2=度-为2[p的LχLP2分(H布1 )。- LLP (H 0 ) ] 服从
二、生存分析的主要内容
第一,描述生存过程 研究生存时间的分布特点,估计生存
率,生存曲线; 第二,比较生存过程(假设检验) 对两组或多组生存率进行比较; 第三,影响生存时间的因素分析 了解影响生存过程的主要因素为改善
预后提供指导。
例在对资料进行描述时: 5名癌症患者存活时间(月) 6 10 14 20 20 n=5 平均生存时间,
“ 生存”的概念
生物生存 仪器始使正常 疾病产生 疾病治愈
阴性
Hale Waihona Puke 与死亡 与出现故障 与治愈 与复发
与阳性
起始事件 随访时间 终点事件
▪ 疾病确诊 治疗开始 治疗开始 接触危险物
死亡 死亡 痊愈 出现反映
截尾数据的处理
▪ 因为不太好处理截尾数据,很多临床 研究工作者常常将失访或中止等原因造 成的截尾数据在分析时抛弃。截尾数据 提供的信息虽然是不完全的,但也很有 价值,不应随便删掉它。
mean=18 ,median=14
7 8+ 25 35 + 50
? 当有截尾数据时,
Kaplanmeier生存率曲线图
三、Cox回归分析(Cox regression)
▪ 影响生存时间的长短不仅与治疗措施有 关, 还可能与病人的体质, 年龄, 病情的轻 重等多种因素有关。如何找出它们之间的关 系呢?对生存资料不能用多元线性回归分析。 1972年英国统计学家Cox DR. 提出了一种能 处理多因素生存分析数据的比例危险模型
▪ 表1 多元线性回归分析的数据结构
实验对象 y
1
y1
2
y2
3
y3
X1
X2
a11 a12
a21 a22
a31 a32
X3 …. XP
a13 … a1p a23 … a2p a33 … a3p
… ……… ………
n
yn an1 an2
an3 … anp
━━━━━━━━━━━━━━━━━━
其中:y取值是服从正态分布
(3)Cox比例风险回归模型
ln(h(t)/ h0(t))=β1x1+β2x2+…+βpxp 参数β 1,β2…,βp称为偏回归系数 , 由于h0(t)是未知的,所以COX模型称为半参 数模型。
COX比例风险函数的另一种形式: h(t)= h0(t)exp(β1x1+β2x2+…+βpxp)
(4) 流行病学意义
供了不完全的信息,称为不完全数据(截尾数据、
删失数据:censor data)。
▪ 始点
终点
▪ 始点
终点
▪ 生 存 分 析 (survival analysis) : 生存时间一般是通过随访收集。不 完全数据提供了部分信息。须要用 专门的方法进行统计处理,这类统 计方法起源于对寿命资料的统计分 析,故称为生存分析。
一、基本概念
▪
生存时间(survival time):疾病治疗的预后
情况,一方面看结局好坏,另一方面还要看出现这
种结局所经历的时间长短。所经历的时间称为生存
时间。
▪ 完全与不完全数据
▪ 一部分研究对象可观察到死亡,从而得到准确的生 存时间,所提供的信息是完全的,称为完全数据;
另一部分病人由于失访、意外事故、或到观察结束 时仍存活等原因,无法知道确切的生存时间,它提
2
y2 a21 a22
3
y3 a31 a32
X3 …. XP
a13 … a1p a23 … a2p a33 … a3p
… ……… ………
n
yn an1 an2
an3 … anp
━━━━━━━━━━━━━━━━━━
其中:y取值是二值或多项分类
定义:
log it( p) ln[ p /(1 p)]
为Logistic变换,即:
(2)COX回归模型的构造
▪ 多元线性回归模型:
yˆi b0 b1x1i b2 x2i bp xpi
▪ Logistic回归模型:
▪
ln[ p /(1 p)] 0 1 X1 p X p
设不存在因素X1、X2 、Xp的影响下, 病人t 时刻死亡的风险率为h0(t), 存在因素X1、 X2 、Xp t的影响下, t时刻死亡的风险率为h(t). 用死亡率的比 h(t)/h0(t) 代替P/(1-P)即得。
( Cox's proportional harzard model)。
1、数据结构
设含有p个变量x1, x2,…,xp及时间T和结局C的 n个观察对象. 其数据结构见表3。
表3 COX模型数据结构
实验对象 t C
1
t1 1
2
t2 0
3
t3 0
… ……
n
tn 1
X1 X2
a11 a12 a21 a22 a31 a32
变量xj暴露水平时的风险率与非暴 露水平时的风险率之比称为风险比hr (hazard ratio)
hr= eβi
hr风险比相对危险度RR
(5)Cox回归模型的检验
▪ 对Cox模型的检验采用似然比检验。
▪ 假设为H0:所有的βi 为0 ,
▪
H1:至少有一个 βi 不为0 。
▪
将值分Ho和别记H1条为件
……
an1 an2
X3 …. XP
a13 … a1p a23 … a2p a33 … a3p
… ……
an3 … anp
3、COX回归模型 (Cox regression model)
(1)风险率(hazard rate):
患者在t时刻仍存活,在时间t后的瞬间 死亡率,以h(t)表示。
h(t)
死于区间(t,t t)的病人数 在t时刻尚存的病人数 t
SPSS实现逐步回归方法:
操作过程:Analyze---Regression--Linear---y选入Dependent---x1、x2、 X3选入Independent---Stepwise--options--ok
▪ 表2 Logistic回归模型的数据结构
实验对象 y
X1
X2
1
y1 a11 a12