微生物学_09a微生物与基因工程
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操纵区。它与操纵区结合,转录受阻。
负控诱导系统--诱导物不存在时,阻遏蛋白与操
纵区相结合,结构基因不转录;诱导物存在时,阻
遏蛋白与诱导物相结合,阻遏蛋白与操纵区分离, 结构基因转录。
负控阻遏系统--当阻遏蛋白与效应物结合时,结
构基因不转录。
正转录调控系统 在正转录调控系统中,调节基因的产物是激活蛋 白(activator),激活蛋白结合后, RNA聚合酶与 DNA的启动子结合,转录才会进行。 在正控诱导系统中,诱导物的存在使激活蛋白处 于活性状态,转录进行。 在正控阻遏系统中,效应物分子的存在使激活蛋
操纵子的转录调控实例
㈠、乳糖操纵子-----负控诱导系统; ㈡、色氨酸操纵子----负控阻遏系统
㈠、乳糖操纵子
大肠杆菌能利用乳糖作为碳源,而利用乳糖作为碳
源的酶只有当乳糖成为惟一的碳源时才会被合成。
大肠杆菌乳糖操纵子(lactose operon)包括3个结构
基因:Z、Y和A。这三个结构基因被同一个转录单元 lacZYA所编码,它有一个启动子Plac。
R
LacY
LacA
mRNA
基
阻遏蛋白 (有活性)
因
关
闭
B、乳糖酶的诱导
调节 基因 R
启 动 操纵 子 基因 P O
乳糖结构基因 LacZ LacY LacA
mRNA 异乳糖 阻遏蛋白 (无活性) mRNAZ
mRNAY
mRNAA
基 因 表 达
阻遏蛋白 (有活性)
分解代谢物阻遏调控(葡萄糖效应)
cAMP即环式AMP,其在生物 这是因为ATP是cAMP的
多肽链组成的二聚体。
DNA结合蛋白的模体(motif)
(1)螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix,HTH) HTH的一端是由氨基酸形成的α-螺旋,又称为识别螺旋; “转角”由3个氨基酸组成;第二个螺旋以疏水相互作用稳定
第一个螺旋。
结合蛋白与DNA作用力:氢键、范德华力等非共价作用。 实例:大肠杆菌的Lac、Trp阻遏蛋白。
色氨酸阻抑物
色氨酸操纵子中产生阻遏蛋白的基因是trpR,阻遏蛋白是含
有两个亚基的二聚体, 可与色氨酸操纵子的操纵区特异性相互
作用。
操纵区的部分对称序列与色氨酸启动子在-21和+3碱基之间重
叠。中心结合区是18个碱基的回文结构。
只有当色氨酸结合到阻遏蛋白上时,阻遏蛋白才处于正确的
构象,与色氨酸操纵区相互作用 ,将转录的起始减少了大
前导RNA结构
色氨酸操纵子RNA的前导序列含有4个序列互补区,能
形成不同的碱基配对的RNA结构。它们被称为序列1、2、 3和4。
弱化子发夹结构是序列3和4配对的产物 (3:4结构)。
序列1和2也是互补的,能形成另一个发夹结构1:2。然而
序列2还和序列3互补。
如果序列2和3形成2:3发夹结构,3:4弱化子发夹结构就
构,由操纵区与一个或几个结构基因联合起来,形成一个结 构上、功能上协同作用的整体,受统一调节基因和启动区 的调控。 调节基因:可产生阻遏物或激活物蛋白调节操纵区,从
而控制结构基因的功能。
一、DNA结合蛋白
(1)非专一性结合蛋白:组蛋白与DNA结合,结果有时影响基
因表达。
(2)专一性结合蛋白: 有很多蛋白质可与DNA发生序列特异性 相互作用,这些蛋白质分子的氨基酸侧链通过与DNA的碱 基磷酸或戊糖分子发生作用; 结合部位往往在DNA大沟中,每条多肽链与一条DNA链结 合。 与DNA发生特异性相互作用的蛋白质一般是有两条相同的
CAP 基因
CAP结 合部位
结构基因
P O
R
T
LacZ
LacY
LacA
T 基 因 表 达
mRNA
RNA 聚合酶
mRNAZ
mRNAY
mRNAA
CAP
cAMP - CAP
葡萄糖降解物与cAMP的关系 ATP 腺苷酸 环化酶 cAMP
抑制
葡萄糖 分解代 谢产物
激活
降低cAMP浓度 cAMP 使CAP呈失活状态
中所必需的,因此细胞对它的含量很敏感,它决定
了在mRNA中终止子(3:4)发夹结构是否形成。
在色氨酸操纵子转录进行的过程中,RNA聚合酶在序列2的
末端停滞直到核糖体开始翻译前导肽(即当前导肽开始翻译
时,RNA聚合酶才又继续沿DNA模板链前进合成RNA)。
在色氨酸含量很高的情况下,核糖体迅速在两个色氨酸密码
乳糖操纵子的这三个结构蛋白是作为一个多顺反子
的mRNA一起表达的。
lacZYA转录单元含有一个操纵区Olac,它位于
Plac启动子5’端的-5至+21之间。当阻遏蛋白结合
到操纵区时,便成为转录的强抑制物。
阻遏蛋白被一个独立的调节基因lac I所编码,lac I
也是乳糖操纵子的一部分; lac I位于Plac的上游。
此外,体系还存在分解代谢物阻遏调控:细菌生长系统中若缺
少葡萄糖,使cAMP含量增加,才有足够量的cAMP与分解物
结合蛋白(CRP)结合形成CRP-cAMP复合物结合于Plac上 游。使DNA双螺旋发生构象变化,转录才可以有效地进行。
㈡、色氨酸操纵子
色氨酸操纵子包括色氨酸合成途经中相关的
5个结构基因,编码一个转录单元,即从色 氨酸启动子Ptrp、操纵基因位点Otrp和向下 游转录出7kb的转录物。
不能形成,转录就不会终止。在正常情况下,1:2和3:4
ห้องสมุดไป่ตู้
发夹结构的形成在能量上是有利的。
弱化作用
大肠杆菌中,翻译在mRNA边转录时边进行。色氨
酸前导肽编码序列的3‘端与互补序列1重叠,两个
色氨酸密码子都在序列1内,终止密码子在序列1和
2之间。
由于色氨酸 (色氨酸操纵子的最终产物)是翻译过程
原核生物的基因调控主要发生在转录水平上,根 据调控机制的不同可分为负转录调控(negative transcription regulation)和正转录调控(Positive transcription regulation)。
负转录调控系统
在负转录调控系统中,调节基因的产物是阻遏蛋白
(repressor)--阻止结构基因转录。其作用部位是
cAMP产生。
分解代谢激活蛋白
分解代谢激活蛋白(CAP)是以以二聚体形式存在的。 葡萄糖存在时会降低细胞内cAMP的水平, CRP自身不能
独立与DNA结合;
当葡萄糖缺乏时,大肠杆菌细胞内cAMP水平上升,CRP
结合到cAMP上。CRP-cAMP复合物可结合到紧邻RNA聚 合酶结合位点上游的乳糖操纵子的启动子Plac上游。能使 DNA双螺旋发生弯曲,有利于形成稳定的开放型启动子RNA聚合酶结构,使转录效率提高50倍。
弱化子
如果在操纵基因和trpE基因编码序列之间的一段序列
缺失,会导致基本转录水平和活化 (解阻抑)--转录水
平的上升。该段序列称为弱化子,它位于trpE起始密
码子前面162bp的转录前导序列的123~150位。
弱化子是一个不依赖ρ因子的终止子区域,在一小段
富含GC的回文结构之后是8个连续的U残基。如果这 段序列能在RNA转录物中形成发夹结构,就可以作为 一个高效的转录终止子,因而只有140bp的转录物被 合成。
子处插入色氨酸,这样翻译可直达前肽导末端。核糖体封闭 了序列2,当RNA聚合酶把3区和4区转录出来时,3:4发夹
得以形成,当RNA聚合酶到达终止序列时,由于3:4发夹使
转录可能被终止。这一过程被称为弱化作用。
图9-20 弱化作用模型
如果色氨酸缺乏时,翻译过程中将缺少其氨酰
-tRNA,核糖体将在两个色氨酸密码子上滞留, 封闭了序列1。这使得序列2能自由地与序列3 形成发夹结构(即抗终止子)。终止子 (3:4)发 夹结构不能形成,转录继续到trpE及其下游。
点, RNA聚合酶不能与启动子结合。乳糖阻抑物
阻碍了几乎全部的lacZYA的转录而使之保持很低
的转录水平。
乳糖操纵子诱导表达的机理
将乳糖加入细胞中后,细胞本身所含的低量的透性
酶使它能吸收乳糖,β-半乳糖苷酶则催化一些乳糖
转化为异乳糖。
异乳糖可以作为诱导物结合到阻遏蛋白上。从而引
起阻遏蛋白四聚体构象的变化,从而降低其对乳糖
2、转录后mRNA转译出多少蛋白(酶)的过程。
基因表达调控
基因表达调控在两个水平上体现: (1) 转录水平上的调控(transcriptional regulation); (2) 转录后水平上的调控(post-transcriptional regulation);
9.2 转录水平调控
操纵子:原核生物细胞中,功能相关的基因组成操纵子结
操纵序列的亲和力,阻遏蛋白从操纵序列上脱离下
来,聚合酶 迅速开始lacZYA基因的转录。
因此,加入乳糖或合成诱导物如异丙基-β-D-硫 代半乳糖苷(IPTG)能非常迅速地刺激乳糖操纵 子结构基因的转录。
A、乳糖操纵子的结构
调节 基因 启动子 操纵区 P O LacZ
乳糖结构基因
乳 糖 操 纵 子 的 负 调 控
约70倍。
辅阻遏物(合成产物) 当合成产物积累时,阻遏蛋白被 合成产物激活而与操纵基因结合 阻遏蛋白
当合成产物减少时,合成产物 脱离阻遏蛋白而使阻遏蛋白失 活。转录酶使结构基因转录, 蛋白质酶合成使合成代谢开始 色氨酸操纵子: 色氨酸积累时色氨酸合成减弱 色氨酸缺乏时色氨酸合成加强 色氨酸=合成产物=辅阻遏物
白处于非活性状态,转录不进行。
负调控 Lac O
正调控 Ara O
诱
导 阻遏物 阻遏 诱导物 诱导
失活的阻遏物 失活的活性蛋白 阻遏
活化的激活蛋白 诱导物 诱导
Trp O
阻
遏 失活的活性蛋白 辅-阻遏物 诱导 阻遏 活化的激活蛋白 诱导 辅-阻遏物 阻遏 失活的活性蛋白
图 16-1 原核生物结构基因的 4 种表达调控类型 (仿 B.Lewin:《GENES》Ⅵ,1997, Fig .12.21)
第九章 微生物基因表达调控
9.1 概 述 9.2 转录水平调控
9.3 转录后调控
9.1 概 述
微生物新陈代谢过程中,酶是主要的基因
产物;
微生物在代谢过程中,已经形成了两种主
要的代谢调节方式,即酶活性的调节和酶
量的调节。
酶活性的调节:具体指一定数量的酶通过其分子构 象或分子结构的改变来调节其催化反应的速率,主 要是生化水平的调节(第五章)。 酶量的调节包含: 1、基因(酶的基因)被转录成多少mRNA的转录 水平的调节。
因此终产物色氨酸含量的高低决定了转录是提
早终止 (弱化),还是继续转录完整个操纵子。
CAP:降解物基因活化蛋白(catabolic gene activation protein)
5'-AMP
磷酸二 酯酶
lac 操纵子小结
通常情况(葡萄糖供应正常)阻遏蛋白与操纵序列结合,基因
不转录。
细胞外的乳糖通过透性酶吸收到细胞内;细胞内的β-半乳糖苷
酶将乳糖转变为异乳糖。异乳糖结合到阻遏蛋白上使之从操纵 序列上脱离,聚合酶迅速开始lacZYA基因的转录。这就是负 控诱导。
表达调控过程中起着重要作用。 直接代谢前体,担任这种 转化的酶是腺苷酸环化酶 葡萄糖的降解代谢会抑制一些 (adenylcyclase),此酶受 葡萄糖代谢降解物的直接 操纵子的转录。 抑制,从而造成cAMP不能 cAMP在细胞中的增加对这些 产生。
操纵子的转录是有利的。
葡萄糖降解物能抑制细胞内
(2)锌指(zinc finger)多见于真核 特点: Zn2+连结四个氨基酸(2个组氨酸,2个半胱氨酸)
形成α-helix(螺旋)形式的“指”,在大沟中与 DNA相互作
用。 一般多个锌指串联排列, 但不一定每个都接触DNA,其氮端形 成反向β折 叠,碳端形成α-helix,与DNA大沟特异性接触。
(3)亮氨酸拉扣(leucine zipper)
多肽链上每隔7个氨基酸有一个亮氨酸残基,这些残基形成了
一种二聚体化基序。亮氨酸拉扣不与DNA相互作用,只是保 持另外2 个α螺旋与DNA结合,稳定其空间构象。 三种蛋白的共同特点:以α螺旋作为与DNA识别(作用)的 部位。
二、操纵子的转录调控
乳糖操纵子的编码产物
lacZ编码β-半乳糖苷酶,它可以将乳糖水解为半乳糖
和葡萄糖。 lacY编码半乳糖苷透性酶,它能将乳糖运送透过细菌 的细胞壁。 lacA编码硫代半乳糖苷乙酰转移酶。
阻遏蛋白
操纵序列存在反向重复对称,正好与由四个相同亚
基组成的阻遏蛋白的内部对称相匹配。
当乳糖缺乏时,阻遏蛋白占据了操纵序列的结合位