遗传性肿瘤科室会v11

临床基因检测方法的差别
如果将人生比作一本自传， 那么不同的基因检测方法，就像 不同的检索方式，以此探索生命 的密码。 • 位点检测是在目录中检索某个关键词 • 基因芯片是在全书中检索某个关键词 • 二代测序是在全书中检索所有关键词
肿瘤有遗传性和散发性之分
与生俱来（胚系突变） VS 与时俱进（体细胞突变）
参考数据库：http://research.nhgri.nih.gov/bic/
遗传性乳腺癌/卵巢癌
乳腺癌筛查有效降低浸润性乳腺癌发病率，
？ 基因检测是否可以降低遗传性乳腺癌发病率
➢ 遗传性乳腺癌发病年龄较散发性乳腺癌发病年龄低 ➢ 随着时间的发展，乳腺癌的死亡率逐渐下降 ➢ 50岁以上的人群，因为乳腺癌筛查技术的完善有效降低浸润性乳腺癌发病率 ➢ 50岁以下人群发病率无明显变化，死亡率下降缓慢
遗传性乳腺癌/卵巢癌基因检测
检测基因
检测周期
遗传性乳腺癌/卵巢 BRCA1、BRCA2、CHEK2、PALB2、BRIP1、 20天 癌（21个基因） TP53、PTEN、STK11、CDH1、ATM、BARD1、
二代测序助力 遗传性肿瘤精准医学
胡元 华大基因肿瘤产品部
Cancer is a genetic disease
— that is, cancer is caused by certain changes to genes that control the way our cells function, especially how they grow and divide. 《NCI-The Genetics of Cancer》
BRCA1
BRCA 2
BRCA1——定位于17q21，约100 kb，含有24个外显子，其中第1、4号外显子不编码氨基酸，另外22 个转录出7.6 kb mRNA，最终可编码含1863个氨基酸的蛋白质。而第11号外显子较大，长3.4 kb。 已报道其突变位点多于1785个 BRCA2——定位在13q12-13，有27个外显子,仅编码区就有11.4K。其中11号外显子几乎含编码序列 的一半，完整的BRCA2编码3418个氨基酸的蛋白质 。已报道其突变位点多于2011个
癌症是一种基因病
·除遗传性肿瘤，所有恶性肿瘤（癌症）的发生都是体细胞基因突变导致 的。
·在人的一生中，肿瘤细胞是通过一系列进行性的改变而逐渐变成恶性的。
人类基因研究史
Genetics, Genomics and Cancer Risk Assessment: State of the art and future directions in the era of personalized medicine
遗传性肿瘤 5-10%
家族性 肿瘤
散发性肿瘤 90-95%
‘第一次打击’ 是胚系突变 所有体细胞均成为杂合BRCA
所有体细胞均为野生型
‘第二次打击’ 是肿瘤细胞的突变导致细胞 失去杂合性
仅病灶处肿瘤细胞突变
由于遗传性原因导致的 染色体和基因异常，特 别是常染色体及其上的 基因，而使患某些肿瘤 的机会大大增加，病理 学上称之为遗传性肿瘤 综合征
肿瘤也会遗传吗？
各类肿瘤中遗传性肿瘤的占比
肿瘤的治疗效果与发现时期有关
AACR cancer progress report 2015
癌症防控：早发现 早诊断 早治疗
世界卫生组织（WHO）“ 抗击癌症 重在预防！”
检测肿瘤易感基因 找出可以预防的肿瘤
1/3的癌症可以预防 1/3的癌症可以根治 1/3的经过治疗可以长期生存
美国癌症学会（www.cancer.org） Brozek I et al. J Appl Genet 2009; 50(4): 379–384
家族性/遗传性肿瘤人群特征
·仅用于初步判断人群是否具有家族性/遗传性肿瘤的特征。
·各种遗传性肿瘤高危筛查人群的判断需综合临床表现和权威指南的标准进行。
遗传性乳腺癌卵巢癌综合征
பைடு நூலகம்
遗传易感基因与乳腺癌/卵巢癌发病风险
BRCA1 突变
BRCA2 突变
乳腺癌44%-78% 卵巢癌18%-54%
乳腺癌(31%-56%) 卵巢癌(2%-19%)
Balmaña J, et al. Ann Oncol 2011;22(suppl. 6);v131-vi34
BRCA1/2基因没有热点突变
CA Cancer J Clin 2014;64:52-62.
测位点还是测基因外显子？
BRCA1基因共5592bp，外显子+内含子共81189 bp，其中2600+位点的变异可导致乳 腺癌/卵巢癌风险上升。
Research Themes of HKU Department of Surgery http://www.surgery.hku.hk/research_div_br.php
Ref：WHO world cancer report
基因科技助力肿瘤精准预防
1 预防
2 早诊
3 诊疗
4 监测
传
疫苗（宫颈癌疫
统
苗，乙肝疫苗）
方
生物制剂（胸腺
法
肽、卡介菌多
糖）
自检 血清学（CEA、CA199） 影像学（X片、B超、CT） 内窥镜（胃肠镜）
病理诊断 手术 放疗 化疗 靶向治疗
血清学（CEA、CA199） 影像学（X片、B超、CT） 内窥镜（胃肠镜）
由于遗传性原因导致
的染色体和基因异常，特 别是常染色体及其上的基 因，而使患某些肿瘤的机 会大大增加，病理学上称 之为遗传性肿瘤综合征。
遗传性乳腺癌/卵巢癌相关基因在乳腺癌人群中的检出情况
遗传风险评估：
基因检测
Nils et al. Dtsch Arztebl 2008; 105(41): 706–14 http://www.breastlink.com/blog/nimmi-s-kapoor-md-gene-tests-asbs/
基
遗传性肿瘤
因
基因检测
科
技
无创 肿瘤早早筛
基于基因 突变的精准 检测及个体 化用药方案
根据肿瘤基因变异 及免疫组库情况， 进行病情监测并 及时调整治疗方案
临床基因检测的方法
聚合酶链式反应(PCR：qPCR，dPCR，ARMS,……) 荧光原位杂交技术(FISH) 一代测序（Sanger sequencing） 二代测序（Next-generation sequencing）