StereoChem-NMR-CD-绝对构型测定
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对于相同取代基,J trans 总是大于 J cis
H3C CO2H Cl CH2Cl H3C Cl F F
H
3J HH
Hwenku.baidu.com
H
3J HH
H
F
3J HF
H
H
H
= 11.4 Hz
= 7.2 Hz
3J = 10.8 Hz HF = 20 Hz (3JFF = 19 Hz)
Ha He Ha He
Ha~Ha偶合,a~a=180 0, 3JHH=8~12 Hz Ha~He偶合,a~a=60 0, 3JHH=1~5 Hz He~He偶合,e~e=60 0, 3JHH=0~4 Hz
-0.012 -0.020 H H -0.021 +0.004 -0.010 H -0.208 H H -0.131 -0.004 H +0.012 H +0.014 H +0.011 H H+0.082 +0.020 +0.064 H +0.002 OMPTA
H
H
H H +0.049 +0.111 +0.047
H
Ph COOH
伯胺绝对构型的测定
旋光色谱(ORD)和圆二色谱(CD)方法
纳米纤维的CD谱图
MNCB和MBNC法
在以下两化合物中,其MNCB酯中醇部分的质子(手性碳 上质子除外),均比成酯前醇中相应质子信号位于高场。 将>0的质子置于CB平面的左侧,而<0的质子置于CB 平面的右侧,即可判定仲醇所连手性碳的绝对构型。
-0.19 Me RO -0.21 -0.08 H H H H -0.08 -0.04 -0.06 Me 0.12 Me 0.03 H 0 H -0.01 H -0.02 H -0.01 H 0.04 H 0 H 0.03 H H H 0.01 0.07 Me OR Me -0.03 0 H -0.02 Me
O Ha Ph Hb O
O Ha Hb Ph O
Jab0 (90 degree)
Jab4-9 (45 degree)
NOE H H C H H
H H C
H
H no NOE
当分子中的两个H之间的空间距离较近时(< 5A),如果 我们照射其中的一个H时,另一个H的NMR信号增强。但 是,如果没有观察到NOE时,不能断定两核之间的距离 一定大于5A,因为NOE是个动力学过程。
R
H3COOC HO H CH2OH
R
H3COOC R'O H CH2OH
Saccopetrin A 的绝对构型测定
2.25 2.44
H R H3COOC O MTPA-(s) H CH2OCH3
3.35 5.25 3.48 1.84 1.68
H R H3COOC O MTPA-(R) H CH2OCH3
测定绝对构型的方法
化学相关法 X-ray 衍射法 NMR谱学方法测定构型构象(Mosher 法) ORD 法 CD 法
X-射线衍射法
普通的X射线衍射不能区分对映体。给定的反射幅度取决于原子的散
射力和由这些原子散射的子波的相位差。当衍射涉及轻核(C, H, N, O, F等)时,干涉图象仅有核的距离决定,而相位重合则与这些核的空 间取向无关,因此从衍射图像可能计算各个核间距离和分子的构成, 并推导出在空间的相对位置。 对于氢核,只发生衍射而观察不到显著的吸收,这意味着在实验中射 线的相位变几乎是相同的。重原子的核在其吸收曲线的一定范围吸收 X射线。如果射线波长和重原子的吸收边缘重合,就会产生吸收,并 在实验中可观察到衍射和相位滞后。由于这种相位滞后或非常规的散 射,干涉图像就不仅取决于原子间的距离,还取决于他们在空间的相 对排列,因而可能测定含重原子的绝对构型。
L
3
L
2
MeO O O
R CF3 L
3
L
2
OMe O CF3 O
B
S
H
H
downfield relative to
A
改进的Mosher法
随着超导核磁的出现, H. Kakisawa等改进了Mosher法
Hc Hb Ha C C C C C C H O O (OMe) (Ph)------(R)-MTPA Ph OMe------(S)-MTPA CF3 MTPA plane
ROH2C R1 O H4
R1 H5a H5b CH2N (CH3)3
+
H5a H5b O H4 CH2N+(CH3)3
ROH2C
NMR法测定有机化合物绝对构型
NMR法测定有机化合物绝对构型
NMR法测定有机化合物绝对构型
仲醇绝对构型的测定
Mosher法 :
Mosher法的发展过程
upfield relative to
H
+10
0 0 -15
0
Me
C8H17
H
-10
H0 Me H H
+5
0
-50 H -40 H
APTMO H
0
H
+55
H
+35
H
+10
对无羟基化合物的应用
Li/NH2 H O H OH OH OH
1. O3 2. Me2S H
1. MCPBA O 2. OHH OH
H
H +0.100 +0.047 +0.055 H H H OMTPHA -0.083
3.24 5.20 3.41 1.88 1.77
-0.19
H R H3COOC O R H
+0.05 +0.07 +0.11 -0.04 -0.09 R
OMTPA
S
CH2OCH3
H3COOC
H R
CH2OCH3
H (S -R)
H <0
H >0
应用改进Mosher法应注意的问题
由于非对映异构体的化学位移差值通常较小,所以在 测定这两个非对映异构体的氢谱时,应注意以下几点:
MeO MeO MeO H O
MeO H O
OH
OH
MeO H O
OH
MeO H O
OH
MeO H O
OH
(R)-1
(R)-2
(R)-3
1NMA
(R)-4
2NMA
(R)-5
9AMA
MNCB和MBNC法
Mosher法在测定仲醇的绝对构型中得到广泛应用,但在空 间位阻较大的仲醇绝对构型的测定中难于应用。
Hx Hy Hz
Hx Hy Hz
<0 <0
OMTPA
>0 >0
Hc Hb Ha
H
Mosher法具体操作
将(R)-和(S)-MTPA分别与仲羟基成酯; 尽可能多地归属非对映异构体的质子信号 算出这些质子的=S-R值 将正的值放在模型的右边,负的值放在模型的左边 建立化合物的分子模型,确定所有的正的值都在MTPA 平面的右侧,所有的负的值都在MTPA平面的左侧 值的绝对值与该质子到MTPA平面的距离成反比 值与样品的浓度无关。用C6D6为溶剂时, 的分布与 现有的方法不符。所以这方法到目前只能用CDCl3和 CD3OD为溶剂
R-和S-MTPA酯或酰胺的浓度要相同
在短时间内测定其一维谱
两个溶剂峰的化学位移差值应小于0.002ppm
不能用C6D6、C5D5N等溶剂
Mosher试剂与其它手性试剂的对比
MTPA是个较好的手性试剂,因为它很稳定,不易外消旋化; 由于MTPA中苯环屏蔽作用较弱,其S-R值有时因信号重叠而难以得到准 确的判断(在长链化合物中尤为明显),因此限制了它的应用; 由9ATMA引起的高场位移值一般为MTPA的6至10倍,而由2NMA引起的 高场位移值一般为MTPA的3倍;
化学位移
13C化学位移
取代基的-旁式效应将使-位置的碳原子产生高场位移
H3C H
CH3 H
H3C H
H
H
CH3
H
: 5 ppm
15.1 ppm
23.7 ppm
HOOC
HOOC
HOOC
O
6a
OH OH
7
6a
7
OH OH OH
OH
Prostacyclin
异构体1 异构体2
6a 35.9 41.2
改进Mosher法的应用
0 0 +65 +15 0
H
-15 -15
H H +30 -50 H -40 H OMTPA APTMO H
0
0 -10
Me
C8 H17
0
Me H Me Me
-50
H
-10
H0 Me H
+5
H
H-20 H +20
H H
-10
H H0
+5
H
-155
-60
H
+10
H
+55
H
+35
NOE
NOE最适合应用于刚性分子。在这种情况下,核组 之间具有确定的距离。根据NOE可以得到分子的立 体化学信息。 若样品为柔性分子,相对于核磁共振的时标,这样的 分子在溶液中存在着较快的构象互变,NOE测定的 是个平均的结果,因而无法得到具体的构象信息。
变温实验 加入使溶液变稠的物质,使构象转换的速率变低 将样品分子进行化学修饰,以便测得NOE
H
MPA和FFDNB法
由于MTPA分子中不存在氢,羧基酯化时不会发生 外消旋化作用,因此在仲醇绝对构型的测定中得到广 泛应用。但有时MTPA与手性醇生成的酯存在构象不 稳定的可能性,从而容易引起质子信号的相互干扰。
COOH H OCH3 O2N F
Methoxyphenylacetic acid MPA 1,5-difluoro-2,4-dinitrobeneze FFDNB
NO2 F
L
3L
2
MeO O O
MTPA
CF3
L
3L
2
MeO O O
MPA
H
H
H
MPA和FFDNB法
FFDNB法
伯醇位手性中心绝对构型的测定
伯醇位手性中心绝对构型的测定
需要注意的是,如果手性中心附近有体积较大的官能 团,由于空间位阻的影响,上述规律要慎重处理。
20 25 OH 15 OR OH
7 38.7 32.5
核磁共振方法
偶合常数(邻位偶合)
用偶合常数确定双键构型:
X Y R Y
R
R‘
3J
X
R’
3J
X H H F
Y H F F
cis (Hz) +4 to +12 -4 to +20 +15 to +35
trans (Hz) +12 to +19 +10 to +50 -115 to -134
NOE
为测NOE,需对样品的1H NMR有准确的指认; NOE的测定有一维和二维图谱; (灵敏度差,有假峰) NOE的具体数值除和研究的分子相关外,也和仪器、实 验条件等有关,因而准确性和相互可比性不够好; NOE信息的价值与两个相关的磁核跨越的化学键的数目 有关。当两核越是跨越了多根化学键还显示NOE时,这 越能排除相当多的(构型、构象)可能性,因而提供较重 要的立体化学信息。 在应用NOE时,常有某些预定的分子模型,根据NOE的 结果可以从中作出明确的抉择。
NOE
Nuclear Overhauser Effect, NOE NOE定义为 n=(I-I0)/I0 其中I0为热平衡信号强度,而I则为当用弱的 RF场扰动一个跃迁时另一个强度发生改变的 共振峰的信号强度。
核间奥氏效应(NOE)是指两个质子在空间接近时,对一个 质子做饱和照射,另一个质子的信号也会变化。NOESY 谱是质子NOE信号二维谱,能揭示质子在空间接近时的 关系,帮助把分子中的空间结构建立起来,是研究分子 构型和构象的有效手段,在天然产物和复杂分子的结构 确定中引起了广泛关注
Ethyl 2-(9-anthryl)-2-hydroxyacetate 9-AHA Arylcyclohexanols
H
H2N
Z
Z=NMe2, PGDA Z=OMe, PGME
羧酸绝对构型的测定
伯胺绝对构型的测定
H Ph COOH
CF3 MeO Ph COOH MeO H O OH
Boc
N
H
MeO
OH -0.058
Saccopetrin A 的绝对构型测定
O O H
2 24 25 13 14 21 22
H CH2OH
O O
H
R
CH3I/Ag2O
O O
H
R
1% NaOH 1% HCl
H HOOC HO
R
H CH2OH H
CH2N2
H CH2OCH3 H
(R)- or (S)-MTPA
H CH2OH
HO
OH OH
R=H
R=SO3Na
在化合物的15位有一体积较大的 磺酸基,则26位亚基质子在(R)MTPA ( 4.15, 4.25)和(S)MTPA (4.15, 4.23)酯中的化学位 移差别不大,没有鉴别意义。此 时,若将磺酸基水解掉,即可应 用上述规律。
羧酸绝对构型的测定
H
OH
EtO2C OH
X-射线衍射法
锆的K线在铷的吸收边缘,铀的L 线在溴的吸收边缘。因此 ,含铷的分子的绝对构型可用Zr- K作X射线源来测定,含溴 的分子的绝对构型可用U- L 作X射线源来测定。
对于不含重原子的分子,通过引入另一个已知绝对构型的手 性分子,也可以测定绝对构型。
NMR核磁共振方法
NMR核磁共振方法