分离自土壤的裸囊菌科真菌中国及大陆新记录种
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分离自土壤的裸囊菌科真菌中国及大陆新记录种
总结得到一致树,用TreeView(Page 1996)查看。同时在软件MEGA 6中采用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)经1 000 次bootstrap 验证构建系统发育树[22]。
2 结果与分析
2.1 形态描述
2.2 系统发育分析
构建的裸囊菌科三个主要类群的系统发育树(图4)明显表明,采用最大简约法、邻接法和贝叶斯推理法构建的系统发育树具有相似的拓扑结构。该系统树分为I、II、III和IV四支。分支I包含了9种14个小孢子菌菌株,其中本研究菌株布拉尔小孢子菌Microsporum boullardii MH57288(菌株号L19.3,干培养物HMAS 255405)与报道的菌株以82/87/0.89的支持率聚在一起;分支II包含弯奈尼兹皮菌Nannizzia incurvata,本研究菌株MH577289(菌株号K82.3,干培养物HMAS 255403)与其余三个弯奈尼兹皮菌以高支持率99/100/1聚在一起;分支III包含了5种9个小孢子菌Microsporum菌株,这些菌均分离自染病动物上;分支IV 包含了3种6个帕拉癣菌属Paraphyton菌株,其中本研究菌株MH577290(菌株号L6.7,干培养物HMAS 255404)与本种另外三个菌株以较好的支持率90/99/0.99聚在一起。因此,系统发育结果支持了本研究三个菌株的分类地位。
3 结论与讨论
裸囊菌科Arthrodermataceae常见类群主要是小孢子菌属Microsporum及其相关属帕拉癣菌属Paraphyton、奈尼兹皮菌属Nannizzia和毛癣菌属Trichophyton,具有亲土性、亲动物性和亲人性等特点,可引起人和动物发生头癣、体癣等感染病害[16]。有研究表明,
武汉及其周边地区近年来的头癣主要由亲人性的毛癣菌Trichophyton和小孢子菌Microsporum引起[23];昆明和兰州地区的儿童浅部真菌病以皮肤癣菌Dermatophyte病最多,男孩的发病率高于女孩,致病菌种以犬小孢子菌Microsporum canis位居第一[2]。这可能与接触小动物有关。黄梦雅等[24]研究结果表明重庆地区的足癣也是常见病,致病菌种以红色毛癣菌Trichophyton rubrum,可能与该地区温暖潮湿的环境适宜该真菌的生长有关。
Hoog GS等[3]基于ITS,LSU,TUB 和60S L10构建了裸囊菌科相关属的系统发育树,将该科分为9个属[3],其中对小孢子菌属Microsporum采用了3种32条序列进行了研究,结果表明不同来源如人、狗、猴子、兔子等皮肤的同种不同菌株均有一定差异,但三个种的所有菌株都能分别较好地聚在一起。张芝元等[11]在发表该属一新种时,采用了ITS rDNA 进行系统发育分析,结果表明ITS能将本属不同种很好地分类,与Hoog GS等[3]多基因的结果一致。表明ITS可以作为该属的DNA条码标记进行分种鉴定,但对于属级以上阶元的分类采用多基因为好。
本研究从土壤中分离获得的奇妙帕拉癣菌Paraphyton mirabile L6.7菌株能分别与本种其他三个菌株以较好的支持率(90/99/0.99)聚在一起,而且与其模式标本描述基本一致[14];本研究L19.3菌株的描述特征与原始描述基本一致,其在系统发育树上,与GenBank上布拉尔小孢子菌M.boullardii唯一的一条序列仅以82/87/0.89的支持率聚在一起,支持率不高可能由于种内不同菌株的差异引起,正如本系统发育树中的P.mirabile中的两个菌株HQ825144和MH577290的支持率也仅为76/95/0.83,但与同种其他菌株能较好的聚为一支,同样的现象在本研究的N.incurvata三个菌株中也存在,因此,综合系统发育与形态特征,将其鉴定为布拉尔小孢子菌M.boullardii。这两个种在我国未见报道,是中国新记录种。弯奈尼兹皮菌Nannizzia incurvata Stockdale,曾被移入小孢子菌属中命名为
M.incurvatum。早前认为石膏样小孢子菌M.gypseum是N.incurvata的无性型,但基于ITS rDNA聚类分析,虽然这两个无性型形态非常相似,但它们并不聚在一支,因此N.incurvata是独立的一个种[10]。该菌在台湾报道发现,现分离自我国甘肃省土壤,是大陆新记录种。它们在我国还未有病例报道,但这些潜在致病菌的存在和分布也值得重视。
土壤是真菌生活的大本营,这些产孢真菌的孢子可长期潜伏于土壤中,当有适宜的环境条件就会大量繁殖生长,尤其接触到人类和动物毛发更易大量富集。沈鑫等[25]研究表明土壤中加入鸡毛可明显促进人类致病菌如石膏样小孢子菌Microsporum gypseum的生长。近年来随着饲养猫、狗等宠物的增多,亲动物性的癣病发病率有上升趋势。有些癣病治疗时间长,病情易反复,不易根治。这些结果提示我们要做好疾病预防措施,养成讲卫生的良好习惯,对于易出汗的人群,要及时擦干;另外家里尽量不养宠物,在外也避免接触小动物。若发现症状,及时就医,切忌乱用药。
致谢:感谢中国科学院微生物研究所孙炳达老师和杨柳老师在菌株和干模保藏方面提供的帮助。
参考文献:
[1] 王若珺,李若瑜. 皮肤真菌微生态研究进展[J].中国真菌学杂志,2018,13(3):188-192.
[2] 海勒,马越娥,史玉玲. 131例儿童浅部真菌病患者临床和病原菌分析[J].中国真菌学杂志,2018,13(2):87-90.
[3] Hoog GS,Dukik K,Monod M,et al. Toward a novel multilocus phylogenetic taxonomy for the dermatophytes[J].Mycopathologia,2017,182(1-2):5-31. [4] Wijayawardene NN,Hyde KD,Lumbsch HT,et al. Outline of Ascomycota:2017[J].Fungal Diversity,2018,88(1):167-263.