土壤微生物DNA提取

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原理简介:

独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸梅,然后基因组DNA在高速离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗——离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液讲纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。

注意事项:

1.所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000 rmp的传统台式离心机,如

Eppendorf 5415C 或者类似离心机。

2.开始实验前将需要的水浴先预热到70℃备用。

3.对于革兰氏阳性菌,需要自备lysozyme,或者lysostaphin。

4.结合液CB和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮

肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

操作步骤:

1.取0.5—2毫升培养基菌液(最多不超过2*109个细胞),10,000rmp,离心30秒,弃上

清液,收集菌体,尽可能的洗净上清。

2.加入200μl缓冲液RB重悬洗涤细胞,10,000rmp,离心30秒,弃上清后讲细胞震荡

或者吹打重悬于200μl缓冲液RB中。

3.加入200μl结合液CB,;立刻剧烈颠倒轻摇充分混匀,再加入20μl蛋白酶K(20mg/ml)

溶液,充分混匀,70℃放置10分钟。

4.冷却后加入100μl异丙醇,剧烈颠倒轻摇充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀。

5.讲上一步所得溶液和絮状沉淀都加入到一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)10,

000rmp离心30秒,倒掉收集试管中的废液。

6.加入500μl抑制物去除液IR,12,000rmp离心30秒,弃废液。

7.加入700μl漂洗液WB,12,000rmp离心30秒,弃掉废液。

8.加入500μl漂洗液WB,12,000rmp离心30秒,弃掉废液。

9.将吸附柱AC放回空收集管中,13,000rmp离心2分钟,尽量出去漂洗液,以免漂洗液

中残留乙醇抑制下游反应。

10.取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μl洗脱缓冲液

EB(洗脱缓冲液事先在65—70℃水浴中预热),室温放置3—5分钟,12,000rmp离心1分钟。将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12,000rmp离心1分钟。

11.DNA可以存放在2—8℃,如果要长时间存放,可以放置在—20℃。

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