利用不同的方法筛选和鉴定转化子
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利用不同的方法筛选和鉴定转化子
摘要:通过使用不同的方法,从大肠杆菌中筛选和鉴定出转入了GFP基因并表达出GFP的菌株。实验先用蓝白斑筛选得到含有载体的转化子,之后用菌落PCR对其中的重组子进行进一步鉴定,最终通过对表达的产物的检测确证是否能表达出GFP。实验结果表明挑选出来的菌株并没有表达出GFP,需要挑选其他菌落继续实验。
关键词:蓝白斑筛选、菌落PCR、GFP、蛋白质检测
前言
我们采用的是目前应用最广泛、技术最成熟、同时也是最经典的微生物基因重组,作为载体的质粒,我们需要选择或者构建带有多克隆位点和带有抗性基因的质粒,前者有利于基因顺利导入到受体细胞,后者方便我们对转化产物进行筛选;对于受体细胞,我们所选择使用的大肠杆菌,具有遗传背景清楚,结构简单,表达效率高,容易获取等优点,已经建立起一套完善成熟的表达系统,是目前转基因领域最受欢迎、使用最普遍的系统之一。
GFP自从发现以来,已经获得了广泛充足的应用,是生物领域的重要材料绿。绿色荧光蛋白本身无毒,且不需要其他辅酶或者反应底物,在紫外或者蓝光激发下就可以自主发光,而且有较好的稳定性,当其基因与其他蛋白质表达基因相融合时,该蛋白质既能保持原有活性,发光能力也不受影响,这意味着我们可以将GFP与我们想要了解的蛋白质相接合在一起,将GFP作为荧光标签,对蛋白质的位置、运动、活性以及相互作用等机理进行追踪和观察,因为这种特性,绿色荧光蛋白具有其他报告蛋白无法比拟的优点,已经在生物研究中获得广泛的应用。
我们已经通过一系列的实验操作,获取GFP基因,用PCR技术将其扩增并连接到载体质粒pMD19-T Vector上,用CaCl2法将其转入到大肠杆菌中,经过本次实验的筛选和鉴定,构成了完整的转基因操作流程,将我们的课堂学习和实际操作结合起来,从而对转基因技术有一个最直接的认识。尽管在当下中国,转基因技术备受争议,但是每一名生物专业的学生,都应学习了解国际科学社会在转基因领域上所取得的巨大成就,并看到其广泛的应用前景和巨大的市场潜力,同时将所学习到的关于转基因知识科普出去,让每一个公民都能科学、正确地认识转基因,理性、客观地参与到关于转基因的有益讨论中去,推进我国生物科学技术的发展。
一、材料、试剂和器具
1.材料
转化菌液:经过转化操作的E. coli DH5α菌株(R-,M-,Amp-或者含pMD19-T Vector) 2.试剂
含氨苄青霉素(Amp, 100mg/L)的LB固体培养基、LB液体培养基、X-gal(200mg/ml)储存液、IPTG储存液(20mg/ml)、10×PCR buffer 、rTaq 酶、dNTP mixtures(dATP,dTTP,dGTP,dCTP)、无菌蒸馏水、1.5% 琼脂糖凝胶、矿物油、DNA maker、1×10 Loading Buffer 引物溶液(P1、P2各10μM)
P1:GFP-F: 5'-TAGTCGACTATGGTGAGCAAGGGCGAGGAG-3'(Tm=65.5℃)(Sal I)
P2:GFP-R: 5'-GCGTCTAGA TTACTTGTACAGCTCGTCCATG-3'(Tm=61.5℃) (XbaI)
3.器具
超净工作台、涂布器、无菌牙签、PCR管、移液枪、移液管、离心机、PCR仪、天秤;灭菌锅;琼脂凝胶电泳系统;紫外照射摄像系统;恒温振荡培养箱;蓝光手电筒
二、实验步骤
1.蓝白斑筛选
1.1筛选培养基的准备
在制备好的含100 mg/L Amp的LB平板表面中央位置分别加入40μl X-gal储存液和4μl IPTG储存液,用无菌玻棒将溶液涂布均匀,置于超净工作台上,使培养基表面的液体完全被吸收。
1.2菌落筛选培养
取500 μl复壮后的转化菌液涂布于筛选培养基表面,待菌液完全被培养基吸收后,用封口膜封住培养皿边缘,倒置培养皿,37℃培养过夜。
1.3结果观察
观察平板,是否有蓝色和白色菌落,分别计数,白色菌落即为重组子。
2.菌落PCR
2.1挑菌
选择大小合适,最好周围有蓝斑的白色菌落5个,编好号码之后,小心地刮取一半,
分别涂抹于对应的1.5mLPCR管底部。
2.2配制PCR反应体系
先按下列试剂于PCR管中配制50μL的PCR反应体系总液
10 × PCR buffer 5μL
dNTP mixture 4μL
前向引物(P1) 2μL
反向引物(P2) 2μL
rTaq酶0.5μL
灭菌蒸馏水36.5μL
所有试剂按量仔细添加后,轻轻混匀,稍离心后即可,然后取10μL分别分装到涂抹有菌落的PCR管中,稍离心后,加入10μL矿物油,
2.3 PCR反应
PCR仪设置参数如下:
94℃2 min
94 ℃30sec
61 ℃30sec40 cycles
72 ℃45sec
72 ℃ 5 min
2.4琼脂糖凝胶电泳检测
反应结束后,取10μL的PCR产品,加入1μL的1×10 Loading Buffer,混匀后点样,121V电泳15min,紫外照射摄像观察结果,在750bp-1000bp区间有条带产生即为阳性结果。
3.产物表达观察
选择在凝胶电泳中为阳性结果的菌落,将其在蓝白筛选培养基上的剩余部分刮取到LB 液体培养基中,37℃,180 r/min恒温振荡培养过夜,在蓝光照射下观察,培养液有绿色荧光的即为阳性结果。
三、实验注意事项
1、注意无菌操作,接菌的时候应该在超净工作台中进行,培养基需要高压蒸汽灭菌后方可使用,防止杂菌污染;
2、X-gal和IPEG应分别涂抹于LB固体培养基上,由于IPEG存储于有机溶液中,挥发快,应当快速操作,保证分布均匀;
3、配制PCR反应体系时,rTaq酶应该最后加入,减少引物二聚体的形成;
4、加入矿物油是为了防止PCR反应液的挥发,点样时只需抽取下层的PCR反应液,不要吸取到油层。
四、结果和分析
1、蓝白斑筛选结果
图一蓝白斑抗性筛选结果
结果:如图一所示,培养基上有21个白色菌落,2个蓝色菌落
结果分析:使用的E. coli DH5α菌株(Amp-)在含有氨苄青霉素(Amp)的培养基上无法生长,而我们使用的载体pMD19-T Vector上含有氨苄青霉素抗性(Ampr)基因,当载体成功导入到DH5α菌株上形成转化子后,DH5α就能在培养基上正常生长,即长出的菌落的就是含有载体的转化子。
pMD19-T Vector上有具备一个多克隆位点的lacZ基因,能与大肠杆菌发生α-互补,在IPEG诱导下,产生β-半乳糖苷酶,将X-gal分解成蓝色物质,在培养基上生成蓝色菌落;而当我们的GFP基因插入到多克隆位点上时,lacZ基因会被破坏,无法形成α-互补,在培养基上生成正常的白色菌落;即白色菌落就是带有GFP基因的重组子。
X-gal涂抹不均、两个载体连接、lacZ基因的丢失、破坏或者突变都可能导致假阳性结果的产生,因而需要更进一步的鉴定。从中挑选5个白色菌落进行标号,进行菌落PCR。