蛋白表达纯化实验步骤
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
蛋白表达纯化实验步骤
蛋白表达纯化实验步骤(待改进)
1、取适当相应蛋白高表达的动物组织提total-RNA。
2、设计蛋白表达引物。引物要去除信号肽,要加上适当的酶切位点和保护碱基。
3、RT-PCR,KOD酶扩增获取目的基因 c DNA.
4、双酶切,将cDNA.克隆入PET28/32等表达载体。
5、转化到DH5α感受态细菌中扩增,提质粒。
6、将质粒转化入表达菌株,挑菌检测并保种。表达菌株如Bl21(DE3)、Rosetta gami(DE3)、Bl21 codon(DE3)等。
7、蛋白的诱导表达。
1)将表达菌株在3ml LB培养基中摇至
OD=0.6左右,加入IPTG,浓度梯度从25
μM到1m M。37度诱导过夜(一般3h以上
即有大量表达)。
2)SDS-PAGE电泳检测目的蛋白的表达。
注:目的蛋白包涵体表达量一般会达到菌体
蛋白的50%以上,在胶上可以看到明显的
粗大的条带。
动等原因,要及时调整。溶液由浑浊变清透,由粘稠变不粘稠表明裂解完成(后面3000
转离心时,如果沉淀少说明裂解的好)。5.
超声波破碎仪工作30分min要休息5min
(即关闭总电源开关)。
注意:1.如果纯化的蛋白较易被蛋白酶降
解,在超声裂解之前要加蛋白酶抑制剂
(PMSF),PMSF工作浓度为1%。2.如不
能判断是否裂解完全,就按上述条件裂解
60分钟,60分钟足够裂解。
8、取得上清
1)将破碎好的溶液收集到50ml离心管中。
10000rpm,15min,4°离心。沉淀为
包涵体、细胞碎片和未破碎的细胞。轻
轻的将上清倒出,尽量不要倒出沉淀。
(此时可以测量一下pH值,pH值最
好在7.5左右。平衡buffer的pH是7.8
左右,裂解后上清就会在7.5左右。)9、纯化上清---摸洗脱条件。
1)镍柱处理。将1ml镍柱吸入空层析管中,待其中的液体流完后加入平衡缓冲液3ml。2)将10ml上清加到已经平衡过的NI柱上,
并将过柱的样品重复上样3次。(若是流速慢可以在柱子下面加一个针头,或者用1ml 的枪将胶体吹散。)取20μl过柱后的样品,以备跑胶。
3)分别加20mM、40mM、60mM、80 mM 的咪唑梯度来洗脱杂蛋白。每个梯度分别的上样量为4ml、2ml、2ml、2ml。每个次上样的液体分前面1ml和后面1ml分别收集入EP管中,以备跑胶。
注意:理论上是要将收集的溶液测量280nm 处的吸光度,直到吸光度为零时再进行下一个梯度的洗脱。实际上测不到零,怎么都会有一点的,上面说的量已经做够洗脱了。4)加Elution Buffer 将目的蛋白洗脱。上样量为4.5ml(将前面的0.5ml单独接入EP 管,再将后面的4ml接入另外两个EP管),留跑胶样品。
5)加MES将NI柱重生。MES加10ml,流完后再加10ml Miliq H2O。流完后保存于2倍体积的20%乙醇中,镍柱至少能重复利用6次。(尿素可能对NI柱有损伤。)
注意:所有溶液使用前都要确定其pH是否正
确,pH对挂柱及洗脱影响较大。镍柱所用溶液MES的ph=5.0,其余Equilibration Buffer pH=7.8 ,上清pH=7.5 ,Wash Buffer pH=7.0 ,Elution Buffer pH=7.2。
10、跑胶验证。
1)跑2块0.75mm的PAGE胶,把所有的样品都加上去,注意两块胶的浓分离比要相同两块胶才会比较一致。
2)跑胶顺序:负对照、正对照、上清、过柱样品、W1、W2、W3、W4、W5、W6、W7、W8、W9、E1、E2、MES
3)300V快速压胶5min左右,160V分离样品50min左右。(也可以300V,30min,只是图没有160V好看。)
4)考马斯亮蓝染色。一般染色2h即可。5)脱色。先用脱色剂1脱15min,再用脱色剂2脱过夜。
11、纯化上清---收集目的蛋白
1)将重生的镍柱再次平衡(即加Equilibration
Buffer 3ml)。
2)重复步骤12中的操作,只是wash时只用步
骤12中摸好的咪唑浓度洗。
12、跑胶验证。同步骤13这次胶图要跑的漂亮一点(用160V),保存好。
13、透析。
1)配制2L透析液(配方见附件1),并放于-20度冰箱预冷但不要结冰。
2)透析袋(剪10cm即可)用透析袋处理液煮沸10min,用MILIQ H2O充分洗净。3)用透析夹将透析袋夹住(将透析袋折叠一下会夹的更牢),将洗脱的蛋白样品加入其中,置入提前预冷的500ml透析液(20mM PBS+50 mM NaCl)中。冰浴下轻微磁力搅拌20min后置入4°冰箱1.5h后换液。透析3次即可。
注意:用广口瓶装透析液,将广口瓶置于装有冰的2L大烧杯中。冰浴以防活性降低。
14、浓缩。
1)将透析好的样品连同透析袋一起放在白色盒子中,用预冷的聚乙二醇2000固体包埋。
2)30min后将吸水后呈浆糊状的聚乙二醇去除,加入新的固体聚乙二醇。
3)每隔10min观察一次,一旦出现浑浊立
即停止浓缩。
4)透析袋用完后,洗净,保存于20%乙醇中4°存放。
注意:浓缩过度后会有白色小颗粒或絮状晶体出现,由于透析袋使溶液成薄层状,透明度较高,不易发现小颗粒或絮状沉淀,要看仔细。如果看不到,可根据自己估计的蛋白量留1-2ml体积。用透析液将透析袋表面的聚乙二醇洗掉,吸取其中的溶液分装后-20度保存。
15、超滤法浓缩、透析蛋白。使用超滤法就可省去16、17两步。
1)将4ml Elution 得到的蛋白溶液加入超滤管中。
2)配平。
3)7400g,30min,4°离心,结束时4ml变为1ml左右。浓缩4倍。可根据需要选择不同的离心时间,以达到不同的浓缩倍数。可以几次的Elution液一起浓缩。
4)加入需要的蛋白储存液至4ml,离心。重复操作可以使Elution液逐渐换为所需的蛋白储存液。蛋白储存液一般用20mM