第七章 细菌的分类命名

种(Species)

凡是于典型培养菌紧密相同的其 他培养菌同统一起来，区分为细菌的一个种 （Species），即是以某个“典型菌株”为代表、 十分类似的菌株的总称。1987年，国际细菌分类 委员会颁布，DNA同源≧ 70%，而且其Tm≦5oC 的菌群为一个种 亚种（Subspecies) 在种内，有些菌株在遗传学 上关系密切，而且在表型上仅存在较小的某些差 异，在种内分成2个或2个以上的分类单位，即为 亚种
微生物的分类技术水平



微生物分类中使用的技术水平 细胞形态水平 细胞组分水平 蛋白质水平 基因组水平
《伯杰氏系统细菌学手册》

Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) second edition 2001 以 生理生化、G + C mol%、系统发育地位等 为主——体现了现代分子生物学的研究成 果 尚未出齐
二、微 生 物 的 命 名

微生物的命名按国际命名法命名，即Linna所创 立的“双名法” 每一种微生物都用属与种命名， 由2个拉丁词或希腊词或拉丁化了的其他文字组成。 属名和种名用斜体表达 属名在前，用拉丁名词 表示微生物的构造、形态、某科学家名字等，描 述微生物的主要特征。第一字母大写 种名在后， 第一字母小写。用拉丁形容词表示，描述微生物 的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的 名字等等 在种名后，附上命名者的姓和命名年 份
细菌的分类
一、细菌在生物中分类地位
目前公认“四界分类系统”
动物界 植物界 原核生物：细菌、放线菌、螺旋体、 生物 原生生物界 霉形体、立克次氏体、衣原体
真核生物：真菌、藻类、原虫
Fra Baidu bibliotek
病毒界：病毒
二、细菌分类的特征 1 ．形态学特性：形状、大小，排列、结构、染色 特性，有无细胞壁 2．培养特性：培养基上的表现，菌落特征 3．生活方式：自主生活，共生，寄生 4 ．生理生化特征：化学组成，营养类型，营养需 要，繁殖方式，生长条件，代谢途径，代谢产物。 5．抗原构造：O、K、H 6．对噬菌体的敏感性 7．对抗生素及其他化学物质的敏感性 8．病原性
第二节 原核微生物分类系统

一、原核微生物伯杰氏分类系统 《伯杰氏细菌鉴定手册》 《伯杰氏系统细菌学手册》
细菌分类系统

最有代表性和最有影响的细菌分类系统 《伯杰氏细菌鉴定手册》（Bergey’s Manual of DeterminativeBacteriology) 1923年, 1925年, 1930年, 1934年, 1939年, 1948年, 1957年, 1974年分别出版了第一至 第八版，1994年出了第九版 以形态、生理 生化、G + C mol%、生态分布等特征为主
第三节 细菌的命名
采用林奈氏双名法：
1．将一个细菌定一个学名，用属名和种名表示，属名在前， 用拉丁文或拉丁化的名词表示，且第一个字母要大写，种名 在后，用拉丁文或拉丁化的形容词或名词所有格表示，第一 个字母小写。中文译名与此相反，种名在前，属名在后。 2．在种名之后附以命名人的姓氏及命名年代。
3．转属：一种生物原为某人定为某属，后来又被旁 人改为别属，这时将原命名人的姓氏置于括弧之 内放在学名之后，再在括弧之后，附以改定人的 姓氏和年代。 Salmonella cholerae—suis (Smith) Weldin, 1927 沙氏菌 猪霍乱 （猪）(原命名人) (新命名人 ) 年代 （属名） （种名） 翻译：猪霍乱沙门氏菌。


界（Kingdom） 门（Phylum or Division） 纲（Class） 目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species） 种是最基本的分类单位。 但分类单元之间科加入 亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以 下又可分为亚种、变种、型、菌株等
微生物种与亚种的概念
分类学的任务
分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘 关系，将一个有机体放在一个单元中 命名（Nomenclature）：是按照国际命名法规 给予有机体一个科学的名称 鉴定（Identification）：是指确定一个新分离物 是否归属于某个已命名的分类单元的过程。
一、微生物的分类单位
9．遗传学特征
①转化和转导试验。与细菌之间亲缘关系密切相关， 发生在亲缘关系相近的细菌种类 ② G+C% 。 G+C 含量对一个种一般是恒定的，但 G+C相同并不一定是同一种。
③DNA-DNA杂合试验。将待检菌的DNA变性，其 双链解为单链，而后与标记的参考菌株单链DNA或 rRNA杂交，形成杂交DNA-DNA或DNA-rRNA， 两种细菌DNA中共同的核苷酸序列愈多，杂交互补 区间愈多，二者同源性愈高，亲缘关系就愈近。
微生物亚种以下的变型分类
亚种以下 生物变型——表示特殊的生化或生理特征 血清变型——表示抗原结构不同 致病变型——表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型——表示对噬菌体的特异性反应 形态变型——表示特殊的形态特征
微生物的菌株



菌株(Strain)或称品系 是指同种微生物不同来 源的纯培养物即单个分离物的纯培养后代，常以 数字、字母、人命或地名等表示 分离物是指已分离得到但为经鉴定的纯培养物的 后代即为分离物 群(Group) 为工作方便而将近似的种或介于 种间的菌株按其形态或结合生理生化、生态特征 归为若干类群。如放线菌中的链霉菌属内的种归 为1
微生物分类鉴定目的
分类是人类认识微生物，进而利用和 改造微生物的一种手段，微生物工作者只 有在掌握了分类学知识的基础上，才能对 纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解 其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用 微生物资源提供依据
第一节 微 生 物 分 类 学
微生物分类学(Taxonomy)是一门按微生物类群的 亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元 或分类群（Taxon）的科学