食品安全国家标准 食品中诺如病毒检测
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食品安全国家标准
食品微生物学检验食品中诺如病毒检测
1 范围
本标准本标准规定了食品中诺如病毒的测定方法。
本标准适用于食品中诺如病毒总数的测定。
2 术语和定义
2.1 实时荧光RT-PCR real-time fluorescence
在普通RT-PCR的基础上加了一条特殊性的荧光探针。该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接受到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。
2.2 C
值 cycle threshold
t
每个反应管内的荧光信号达到设定的域值时所经历的循环数。
3 设备和材料
除微生物实验室常规灭菌及培养设备外,其他设备和材料如下:
3.1无菌平皿,直径90mm;
3.2无菌手术剪;
3.3无菌镊子;
3.4无菌50ml离心管,耐氯仿,可高速离心;
3.5无菌85ml离心管,耐氯仿,可高速离心;
3.6无菌胶头滴管;
3.7无菌移液管,10ml;
3.8移液枪,1-1000ul;
3.9匀浆机;
3.10超净工作台;
3.11天平,精密度为0.01g;
3.12高速冷冻离心机,10000g;
3.13恒温摇床;
3.14荧光定量PCR仪。
4 试剂
4.1 含0.3mol/lNaCl的甘氨酸缓冲溶液,配制方法见A.1;
4.2 PEG8000,配制方法见A.2;
4.3 病毒RNA提取试剂盒;
4.4 Nuclisens裂解液;
4.5逆转录试剂盒;
4.6荧光PCR定量试剂盒;
4.7 缓冲液1×TAE,配制方法见A.3;
4.8溴化乙锭(EB)溶液10ug/uL,配制方法见A.4;
4.9琼脂糖凝胶,配制方法见A.5。
5 检验程序
6 操作步骤
6.1诺如病毒的富集
6.1.1在无菌平皿中进行无菌取样,取食品5g,加入25ml含0.3mol/lNaCl的甘氨酸缓冲溶液,匀浆3min,为避免匀浆过程产生的高温破坏病毒,分两次匀浆,中间停顿1min。
6.1.2将均质液转移到50ml离心管中,恒温摇床37℃孵育30min或室温震荡30min,4℃,10000g离心30min。
6.1.3取上清,转移到另外的离心管中,加入10ml氯仿,充分震荡,放置10min,中间震荡一次,4℃,10000g离心30min。
6.1.4取上清液25ml转移到85ml离心管中,加入等体积的PEG8000溶液(PEG的终浓度为8%),充分震荡混匀。
6.1.5在冰上放置至少1h,4℃,10000g离心5min,弃上清,加入2mlNuclisens裂解液溶解沉淀,如不马上进行检测,将沉淀用1ml无菌水重悬,-70℃保存,避免反复冻融。
6.2诺如病毒RNA提取
使用商品化的病毒RNA提取试剂盒提取和纯化,步骤参考说明书,提取完成后,为延长RNA保存时间可选择性加入RNase抑制剂,操作过程中应佩戴一次性橡胶或乳胶手套,并经常更换。
6.3实时荧光RT-PCR
以诺如病毒RNA作为阳性阳性对照,以不含诺如病毒的样品RNA作为阴性对照,以水代替模板作为空白对照,每个体系设置两个平行反应.可根据具体情况调整总体积。
6.3.1 实时荧光RT-PCR反应体系
实时荧光RT-PCR反应体系见表1
6.3.2实时荧光RT-PCR检测所用引物和探针
实时荧光RT-PCR检测所用引物和探针见表2
表2 实时荧光RT-PCR检测所用引物和探针