高级动物生物化学:第五章 蛋白质结构与功能的关系

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4、蛋白质变性的利用与预防 、
蛋白质变性有许多实际应用。 蛋白质变性有许多实际应用。如在医疗上利用高温 高压消毒手术器械、用紫外线照射手术室、 高压消毒手术器械、用紫外线照射手术室、用70%酒精 酒精 消毒手术部位的皮肤。这些变性因素都可使细菌、 消毒手术部位的皮肤。这些变性因素都可使细菌、病毒 的蛋白质发生变性,从而失去致病作用,防止伤口感染; 的蛋白质发生变性,从而失去致病作用,防止伤口感染; 另外,在蛋白质、酶的分离纯化过程中, 另外,在蛋白质、酶的分离纯化过程中,为了防止蛋白 质变性,必须保持低温,防止强酸、强碱、重金属盐、 质变性,必须保持低温,防止强酸、强碱、重金属盐、 剧烈震荡等变性因素的影响。 剧烈震荡等变性因素的影响。
(四) 蛋白质变性与复性 1、蛋白质的变性与变性因素 、
在变性因素的作用下,蛋白质的空间结构被破坏, 在变性因素的作用下,蛋白质的空间结构被破坏, 从而引起蛋白质生物学功能的丧失和理化性质的改变, 从而引起蛋白质生物学功能的丧失和理化性质的改变,这 种现象被称为变性( )。变性后的蛋白质 种现象被称为变性(denaturation)。变性后的蛋白质 )。 称变性蛋白质;没有变性的称天然蛋白质。 称变性蛋白质;没有变性的称天然蛋白质。 引起天然蛋白质变性的因素很多。 引起天然蛋白质变性的因素很多。 变性的因素很多 物理因素包括热、紫外线、 射线 超声波、高压、 射线、 物理因素包括热、紫外线、X-射线、超声波、高压、 包括热 表面张力,以及剧烈的振荡、研磨、搅拌等; 表面张力,以及剧烈的振荡、研磨、搅拌等; 化学因素(又称变性剂)包括酸、 化学因素(又称变性剂)包括酸、碱、有机溶剂(如 变性剂 有机溶剂( 乙醇、丙酮等)、尿素、盐酸胍、重金属盐、三氯醋酸、 )、尿素 乙醇、丙酮等)、尿素、盐酸胍、重金属盐、三氯醋酸、 苦味酸、磷钨酸以及去污剂等。 苦味酸、磷钨酸以及去污剂等。 加入巯基试剂如β-巯基乙醇、二硫苏糖醇( 加入巯基试剂如 巯基乙醇、二硫苏糖醇( DTT)使二 巯基乙醇 ) 硫键还原。 硫键还原。
肌红蛋白和血红蛋白的β-亚基的三级结构 肌红蛋白和血红蛋白的 亚基的三级结构
血红蛋白和肌红蛋白与氧结合时表现出不同 的结合模式。血红蛋白的氧结合曲线是S形曲线 的结合模式。血红蛋白的氧结合曲线是 形曲线 );而肌红蛋白的氧结合曲 (sigmoidal curve);而肌红蛋白的氧结合曲 ); 线是双曲线。 线是双曲线。 S曲线说明在血红蛋白分子与氧结合的过程中, 曲线说明在血红蛋白分子与氧结合的过程中, 曲线说明在血红蛋白分子与氧结合的过程中 其亚基之间存在相互作用。 其亚基之间存在相互作用。血红蛋白四聚体在开 始与氧结合时,其氧亲和力很低, 始与氧结合时,其氧亲和力很低,即与氧结合的 能力很小。一旦其中一个亚基与氧结合, 能力很小。一旦其中一个亚基与氧结合,亚基的 三级结构发生变化, 三级结构发生变化,并逐步引起其余亚基三级结 构的改变,从而提高其余亚基与氧的亲和力; 构的改变,从而提高其余亚基与氧的亲和力;同 样道理,当一个氧与血红蛋白亚基分离后, 样道理,当一个氧与血红蛋白亚基分离后,能降 低其余亚基与氧的亲和力,有助于氧的释放。 低其余亚基与氧的亲和力,有助于氧的释放。经 实验测定, 实验测定,第四个亚基与氧的亲和力比第一个亚 基大200~300倍。 基大 倍
二、蛋白质空间结构与功能的关系
空间结构决定其功能
(一)肌红蛋白和血红蛋白的结构
(二)血红蛋白的构象变化与结合氧 协同效应:一个亚基与其配体( 中的 协同效应:一个亚基与其配体(Hb中的 配体为O 结合后, 配体为 2)结合后,能影响此寡聚体中 另一亚基与配体的结合能力。 另一亚基与配体的结合能力。如果是促进 作用则称为正协同效应( 作用则称为正协同效应(positive cooperativity);反之则为负协同效应 );反之则为负协同效应 ); (negative cooperativity)。 )。
血红蛋白与氧结合并发生构象的改变是变构效应。 血红蛋白与氧结合并发生构象的改变是变构效应。 变构效应是指在寡聚蛋白分子中, 所谓变构效应是指在寡聚蛋白分子中 所谓变构效应是指在寡聚蛋白分子中,一个亚基由于 与其他分子结合而发生构象变化, 与其他分子结合而发生构象变化,并引起相邻其他亚 基的构象和功能的改变。 基的构象和功能的改变。变构效应也存在于其他寡聚 蛋白( 变构酶)分子中, 蛋白(如变构酶)分子中,是机体调节蛋白质或酶生 物活性的一种方式。当某个小分子, 变构剂与蛋白 物活性的一种方式。当某个小分子,称变构剂与蛋白 质结合时,可调节蛋白质的生物活性,这类蛋白称变 质结合时,可调节蛋白质的生物活性,这类蛋白称变 构蛋白。变构蛋白除了具有发挥功能的活性位点外, 构蛋白。变构蛋白除了具有发挥功能的活性位点外, 还有用于调节的结合位点。 还有用于调节的结合位点。变构剂可增加或降低变构 蛋白的活性, 蛋白的活性,这种变构调节能引起蛋白天然构象的变 变构抑制剂能使蛋白迅速从活性状态( 化。变构抑制剂能使蛋白迅速从活性状态(称R态) 态 变为非活性状态( 变构激活剂则相反。 变为非活性状态(称T态);变构激活剂则相反。血红 态);变构激活剂则相反 蛋白的脱氧构象是T态 可阻止氧的结合。 蛋白的脱氧构象是 态,可阻止氧的结合。
3、蛋白质的复性 、
有些蛋白质,尤其是小分子蛋白质,变性后在适 有些蛋白质,尤其是小分子蛋白质, 当条件下可以恢复折叠状态,并恢复全部的生物活性, 当条件下可以恢复折叠状态,并恢复全部的生物活性, 这种现象称为复性( )。热变性后的蛋 这种现象称为复性(renaturation)。热变性后的蛋 )。 白通常很难复性。 白通常很难复性。
牛 核 糖 核 酸 酶 一 级 结 构 与 空 间 结 构 的 关 系
(二)一级结构与功能的关系
1、一级结构相似的多肽或蛋白质,其空间 、一级结构相似的多肽或蛋白质, 构象以及功能也相似。 构象以及功能也相似。 2、一级结构的相似性,可以研究物种的亲 、一级结构的相似性, 缘关系。进化树, 缘关系。进化树,如Cyt C。细胞色素 的 。细胞色素c的
血红蛋白与氧结合的S型曲线具有重要的生理意义。 血红蛋白与氧结合的 型曲线具有重要的生理意义。 型曲线具有重要的生理意义 在肺部由于氧分压高, 在肺部由于氧分压高,脱氧血红蛋白与氧的结合接 近饱和;在肌肉中氧分压低, 近饱和;在肌肉中氧分压低,氧合血红蛋白与肌红 蛋白相比能释放更多的氧, 蛋白相比能释放更多的氧,以满足肌肉运动和代谢 对氧的需求。可见,血红蛋白比肌红蛋白更适合运 对氧的需求。可见, 输氧。 输氧。由于肌红蛋白与氧的亲和力总是高于血红蛋 它可接受氧合血红蛋白中的氧, 白,它可接受氧合血红蛋白中的氧,贮存在肌肉中 供利用。血红蛋白还可结合组织产生的二氧化碳, 供利用。血红蛋白还可结合组织产生的二氧化碳, 并在肺部通过气体交换将其排出体外。另外, 并在肺部通过气体交换将其排出体外。另外,血红 蛋白与CO有很高的亲和力,结合后无法运输氧而 有很高的亲和力, 蛋白与 有很高的亲和力 导致人或动物中毒。 导致人或动物中毒。
进化始于动植物分化之前。对80多种不同真核生物的细胞 进化始于动植物分化之前。 多种不同真核生物的细胞 色素c的一级结构比较发现 的一级结构比较发现, 亿多年的进化中, 色素 的一级结构比较发现,在15亿多年的进化中,有26个 亿多年的进化中 个 氨基酸始终不变。发现凡与人类亲缘关系越远的生物, 氨基酸始终不变。发现凡与人类亲缘关系越远的生物,其氨 基酸顺序与人的差异越大。利用细胞色素c的种属差异可以 基酸顺序与人的差异越大。利用细胞色素 的种属差异可以 绘制相关物种的系统进化树, 绘制相关物种的系统进化树,为生物进化提供分子水平的依 据
七、蛋白质的理化性质
(一) 蛋白质两性电离与等电点 蛋白质分子中有许多可解离的基团, 蛋白质分子中有许多可解离的基团,除了肽链末 端的α-氨基和 羧基以外,还有各种侧链基团,如 端的 氨基和α-羧基以外,还有各种侧链基团, 氨基和 羧基以胍基、 侧链的羧基、 氨基、 的胍基、 和 侧链的羧基 的 氨基 的胍基 His的咪唑基、Cys的巯基、Tyr的酚基。因此,蛋白 的咪唑基、 的巯基、 的酚基 因此, 的酚基。 的咪唑基 的巯基 质与氨基酸类似, 两性电解质。 质与氨基酸类似,是两性电解质。 蛋白质的解离取决于溶液的pH值 蛋白质的解离取决于溶液的 值。当溶液在某个 pH值时,蛋白质分子所带正电荷数与负电荷数恰好相 值时, 值时 净电荷为零,在电场中既不向阳极移动, 等,净电荷为零,在电场中既不向阳极移动,也不向 阴极移动,此时溶液的pH值就是该蛋白质的等电点。 值就是该蛋白质的等电点 阴极移动,此时溶液的 值就是该蛋白质的等电点。 等电点大小由蛋白质分子中可解离基团的种类和数量 决定。 决定。
2、变性表现与变性机理 、
变性蛋白质有下列各种表现: 变性蛋白质有下列各种表现: 生物活性丧失,如酶丧失催化活性; 生物活性丧失,如酶丧失催化活性;激素蛋白丧失生理调 节作用;抗体失去与抗原专一结合的能力。另外, 节作用;抗体失去与抗原专一结合的能力。另外,蛋白质的抗 原性也发生改变。 原性也发生改变。 物理性质发生改变, 溶解度降低,易沉淀, 物理性质发生改变,如溶解度降低,易沉淀,失去结晶能 电泳迁移率改变,黏度增加, 力,电泳迁移率改变,黏度增加,紫外光谱和荧光光谱发生改 变等。 变等。 化学性质发生改变,如容易被蛋白酶水解。 化学性质发生改变,如容易被蛋白酶水解。 天然蛋白质分子的构象主要是通过各种次级键来维持的。 天然蛋白质分子的构象主要是通过各种次级键来维持的。 变性因素破坏了蛋白质分子构象中的次级键, 变性因素破坏了蛋白质分子构象中的次级键,从而使蛋白质分 子从原来紧密有序的折叠构象(天然态) 子从原来紧密有序的折叠构象(天然态)变成了松散无序的伸 展构象(变性态)。 展构象(变性态)。
(七) 新生肽的折叠 细胞内新合成的蛋白质(即新生肽) 细胞内新合成的蛋白质(即新生肽)经过特定 的折叠过程才能变为具有特定空间结构和生物活性 的蛋白质。 的蛋白质。一些简单的蛋白质无需能量的输入或其 他蛋白质的帮助就能折叠成天然构象; 他蛋白质的帮助就能折叠成天然构象;但大多数情 况下, 况下,新合成的蛋白质需要其他蛋白质的帮助才能 形成正确的构象。 形成正确的构象。新生肽折叠成天然构象往往是在 被称为分子伴侣( 被称为分子伴侣(molecular chaperone)的一类 ) 蛋白帮助下完成的。 蛋白帮助下完成的。 细胞中有很多分子伴侣。当细胞处于应激状态时, 细胞中有很多分子伴侣。当细胞处于应激状态时, 其合成往往增加。 其合成往往增加。这种反应与分子伴侣参与变性蛋 白的复性有关。 白的复性有关。目前最了解的一类分子伴侣是热休 克蛋白( 克蛋白(heat shock protein,HSP)。 , )。
第四章 蛋白质结构与功能的关系
一、蛋白质一级结构与功能的关系 (一)一级结构是空间构象的基础 蛋白质特定的三级结构是以氨基酸顺序为 基础的。 世纪 年代, 世纪60年代 基础的。20世纪 年代 Anfinsen的 的 RNase实验证明 空间结构的信息存储在一 实验证明: 实验证明 级结构中,一级结构决定空间结构 一级结构决定空间结构。 级结构中 一级结构决定空间结构。
(三) 血红蛋白的变构作用与运输氧的功能
红细胞血红蛋白具有运氧功能。 红细胞血红蛋白具有运氧功能。 血红蛋白分子是 由两个α-亚基和两个 亚基构成的四聚体( 亚基和两个β-亚基构成的四聚体 由两个 亚基和两个 亚基构成的四聚体(α2β2)。 )。 血红素位于每个亚基的空穴中,血红素中央的Fe2+是氧 血红素位于每个亚基的空穴中,血红素中央的 是氧 结合部位,可以结合一个氧分子。 结合部位,可以结合一个氧分子。每个血红蛋白分子能 进行可逆结合。 与4个O2进行可逆结合。 个 进行可逆结合
细胞色素c 细胞色素c的一级结构与生物进化的关系
3、蛋白质分子中起关键作用的氨基酸残基缺失或被替 、 。 代,都会严重影响空间构象乃至生理功能,如分子病。 都会严重影响空间构象乃至生理功能, • 在镰刀状红细胞贫血患者中,由于基因突变导致血红蛋 在镰刀状红细胞贫血患者中, 链第六位氨基酸残基由谷氨酸改变为缬氨酸, 白 β- 链第六位氨基酸残基由谷氨酸改变为缬氨酸 , 血 红蛋白的亲水性明显下降,从而发生聚集, 红蛋白的亲水性明显下降,从而发生聚集,使红细胞变 为镰刀状,易破碎。 为镰刀状,易破碎。
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