基因工程载体
基因工程载体
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基因诊断
利用基因工程载体携带特定的检测基因或标记物, 对疾病相关基因进行快速、灵敏的检测和诊断。
应用领域与前景
农业生产
通过基因工程载体将优良性状基因导入农作物或家畜家禽的 基因组中,改良品种性状,提高产量和品质。
前景
随着科学技术的不断进步和创新,基因工程载体的研究和应 用将更加深入和广泛。未来,基因工程载体有望在个性化医 疗、精准农业、生物安全等领域发挥更大的作用,为人类健 康和生活质量的提高做出更大的贡献。
人工染色体载体
概念
人工染色体载体是一种基于天然染色体结构设计的基因工程载体,可模拟天然染色体的功 能和特性。
优点
人工染色体载体具有较大的容量,可容纳多个外源基因和调控元件。此外,人工染色体载 体还具有稳定的遗传特性和较低的免疫原性,可实现外源基因的长期稳定表达和遗传。
缺点
人工染色体载体的构建和操作相对复杂,技术难度较大,且成本较高。目前主要应用于基 础研究和临床试验阶段。
潜在生态风险分析
基因污染
基因工程载体可能通过水平基因转移等方式,将外源基因 导入非目标生物体内,造成基因污染。
生态平衡破坏
外源基因的导入可能对目标生物及其相关生物种群的生态 平衡产生不良影响,如改变种间竞争关系、影响食物链等。
生物多样性减少
基因工程载体的广泛应用可能导致生物多样性减少,特别 是对一些濒危物种和生态系统的影响更为显著。
人类健康影响评估
食品安全问题
基因工程载体在食品生产中的应用,如转基因作物,可能对人体健 康产生潜在风险,如引发过敏反应、产生毒素等。
医药安全问题
基因治疗等医疗手段的应用,可能存在潜在的安全隐患,如基因编 辑的脱靶效应、基因治疗的副作用等。
基因工程第四章载体
(4) 插入失活型质粒载体
载体的克隆位点位于其某一个选择性 标记基因内部。
如pDF41、pDF42、pBR329。
外源DNA
抗菌素抗性
无抗菌素抗性
(5)正选择的质粒载体 Direct selection vectors
直接选择转化后的细胞。
只有带有选择标记基因的转化菌细胞才 能在选择培养基上生长。
如pUR2、pTR262等。
目前通用的绝大部分质粒载体都是正 选择载体。
(6) 表达型质粒载体
主要用来使外源基因表达出蛋白质产物。
注意启动子的性质,终止子、起始 密码、终止密码的阅读正确。
如果在大肠杆菌里表达,必须把所克隆的 真核生物的基因置于大肠杆菌的转录—翻 译信号控制之下。
表达载体的结构
1)普通载体元件
b)细菌抗性原理 Ampr基因编码-内酰胺酶,特异地 切割氨苄青霉素的-内酰胺环。
ii)氯霉素(chloramphenicol,Cml)
a)抑菌原理 通过与50S核糖体亚基结合,干扰细胞 蛋白质的合成并阻止肽键的形成。杀死 生长的细菌。
b)细菌抗性原理
Cmlr 编码乙酰转移酶,特异地使氯霉 素乙酰化而失活。
(2)长度 6.3 kb。
(3)选择标记
大肠杆菌素(colicin)E1和对E1免疫 的基因(immE1)
① colicin E1基因的结构
cea 结构基因
imm
kil
免疫基因 溶菌基因
② 杀死不含有ColE1细菌的原因 cea + kil基因产物
③ 不被其他细菌的colicin E1所杀死的原因 imm基因
① 双抗菌素抗性选择标记 插入失活,分两次先后选择: 没有获得载体的寄主细胞 在Amp或Tet中都死亡。
第三章基因工程载体
大肠杆菌的β-半乳糖苷酶基因lacZ系统
i
PO
lacZ
调控蛋白P
β-半乳糖苷酶 分解半乳糖
17
β-半乳糖苷酶基因lacZ突变体M15
a-互补显色反应(蓝白斑筛选)
i
PO
lacZ -
调控蛋白P
诱导剂IPTG α-肽段
β-半乳糖苷酶-
分解半乳糖
分解X-gal
产物呈现蓝色
18
互补显色反应
19
(四)带有尽可能多的单一限制性酶切位点 单一的限制性酶切位点可供外源DNA定点插入; 较多不同的单一限制酿酶切位点,可有选择地供
6
单链切割 连接
线性DNA (L型)
开环DNA
(oc型)
单链切割 连接
共价闭合环形DNA (SC型)
环形双链的质粒DNA分子具有三种不同构型
7
(三)质粒DNA的理化性质 质数DNA具有一般核酸分子的理化特性。
能溶于水,不溶于乙醇等有机溶剂, 在一定pH下可解离而带电荷 能吸收紫外线,可嵌入某些染料,如溴化乙锭。 比较能抗切割和抗变性。
9
(6)传递性:有些质粒在细菌间能够传递,具有传递性的 质粒带有一套与传递有关的基因。
(7)消除性:存在于宿主细胞中的质粒,可用某些办法将 其去除。
(8)复制类型:严紧型质粒的复制受到宿主细胞蛋白质合 成的严格控制,松弛型质粒的复制不受宿主细胞蛋白质 合成的严格控制。
(9)表现型:不同的质粒有不同的表型。如对抗生素的抗 性等。
个细菌细胞中所含有的质粒DNA分子的数目。
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根据宿主细胞所含的拷贝数多少,可将质粒分成:
严紧型
低拷贝数的质粒,每个宿主细胞中仅含有 1-3份的拷贝,称这类质粒为“严紧型”复 制控制的质粒(stringent plasmid);
基因工程中常用载体及其主要特点
基因工程中常用载体及其主要特点基因工程这一话题,听起来就像科幻小说里的情节,其实离我们并不遥远。
今天咱们就聊聊基因工程中的一些常用载体,简单明了,让你听得懂,明白得了!准备好了吗?那就跟我一起走进这奇妙的基因世界吧!1. 什么是载体?首先,得先搞清楚,什么是载体。
简单来说,载体就是那些能“背负”外来基因的“快递小哥”。
它们把我们想要的基因装上,然后送到目标细胞里。
这就像是你点了一份外卖,外卖小哥把美味的食物送到你家。
没有它们,我们的基因工程可就没法开展了。
想象一下,如果没有这些小哥,基因可怎么进得了细胞的大门呢?1.1 质粒载体说到载体,质粒可算是老前辈了。
质粒就像是细菌的“USB闪存”,它能自我复制,携带外来基因,简直就是基因工程的明星。
质粒的特点是操作简单、成本低,而且它们在细菌中可以很稳定地传递下去。
想想看,若是你把一张重要的文件放在闪存里,不仅可以在一台电脑上使用,还能借给朋友,这种“共享经济”在基因界也在不断上演。
质粒载体就是这样的存在,方便又实用,真是个好帮手!1.2 噬菌体载体再说说噬菌体载体。
这个名字听起来就有点威风,实际上它就是一种能感染细菌的病毒。
噬菌体载体像个特种部队,能精准地将目标基因送到细菌里。
它的特点是能在细菌中以极高的效率进行复制。
想象一下,像忍者一样悄无声息地完成任务,真是酷毙了!当然,它的使用相对复杂,需要一定的技术支持,不过一旦掌握,可是非常厉害的工具。
2. 常见的真核载体讲完细菌的载体,咱们再来看真核细胞的载体,这可得好好聊聊了。
2.1 真核表达载体真核表达载体,是为了在真核细胞中表达外来基因而设计的。
这就像是在高档餐厅里,得有专业的厨师才能把菜做好。
真核表达载体通常含有强大的启动子、终止子和选择标记。
它们能够确保外来基因在真核细胞中顺利表达。
举个例子,就像你去商场买了新衣服,得先试穿才知道合不合适,对吧?这载体也得确保外来基因在细胞中能够“穿”得合适,才能发挥作用。
基因工程第五章-载体
cccDNA在较高高的温度和PH值条件下才会变性,(较线 性和开放环结构的DNA),如果变性,由于团在一起,条 件恢复后,会很快复性,形成cccDNA,线性和环状的变 性后,复性会形成杂乱的大分子团状结构,从而从体系中 沉淀下来。
3. 质粒DNA的分子量和拷贝数:
按质粒的分子量大小,可分为量大类: 3――7kb,拷贝数多; 70-150kb,含有与质粒功能有关的更多基因,可自我传 递(可编码一套控制质粒DNA转移的基因,所以可从一 个细胞转到另一个细胞),如果一个细胞含有这种质粒, 他可以带动小质粒进行传递转移。这种质粒的拷贝数低。
质粒的拷贝数:分子的多与寡是决定产量的重要因素。
pBR322 拷贝数大于25个 ColE1 15个 产量0.23ug/ml 0.11 ug/ml
基因克隆尽量选择松弛型质粒,如果是严紧型要进行质粒 复制子改造。
质粒的大小:通常质粒越大,拷贝数也越少,所以我们 在进行基因重组时,首先要选择分子量小的质粒,其次 质粒分子量大的要使外源基因的片断长度合适,不要过 大。
பைடு நூலகம் 2、pUC质粒载体:
pUC质粒载体:是由美国加利福尼亚大学的专家构建 的。是在pBR322质粒载体的基础上,组入了一个带 有多克隆位点的LacZ’基因,而发展成为具有双功能 检测特性的质粒载体。
最常用的克隆载体,优点: 具有更小的相对分子量和更高的拷贝数。 在构建pUC质粒载体时仅留下pBR322的复制起始起 始位点和AMP抗性基因,分子大大减小,他的拷贝数 可以达到500-700个/个细胞。 适合组织化学法检测重组子。有利于检测 具有多克隆位点,便于片断的插入。
沉淀出来。
第一步:(1)在5m1含相应抗生素的LB培养基中接种 一单菌落,于37℃剧烈振荡培养过夜。(2)将1.5m1 培养物倒入Eppendorf管中,用微量离心机于4℃以 12000rpm离心30秒。 (3)吸去培养液,使细菌沉淀 尽可能干燥。(4)将细菌沉淀重悬于100μl用冰预冷的 溶液I中(溶液Ⅰ:50mmol/L 葡萄糖, 25mmol/L Tris· (pH 8.0), 10mmol/L CI EDTA(pH 8.0,溶菌酶4-5mg,酶作用环境由缓冲 液提供)。剧烈振荡。须使细菌沉淀在溶液Ⅰ中完全分 散,将两个微量离心管的管底部互相接触,室温静止5 -30min,细胞壁降解。
基因工程的载体
常用抗生素的作用方式及抗性机理
抗生素名称 氨苄青霉素 (Amp) 氯霉素 (Cm) 卡那霉素 (Kan) 链霉素 (Sm) 四环素 (Tet) 作用方式 抗性机理 一种青霉素的衍生物,通过干扰 bla抗性基因编码的一种周质酶,即β-内 细菌胞壁合成之末端反应,而杀 酰胺酶,可特异的切割amp的β-内酰胺 死生长细胞。 环,从而失去杀菌效力。 一种抑菌剂,通过同核糖体50S 亚基的结合作用,干扰细胞蛋白 质的合成,并阻止肽键的形成。 cat抗性基因编码乙酰转移酶,特异地使 氯霉素乙酰化而失活
λ噬菌体载体
结构特点: ①线性双链DNA分子 ②具非必需区(约1/3长度) ③两端具12个核苷酸单链互补粘性末端 ④可在E.coli中大量繁殖 ⑤可克隆15Kb左右的外源DNA
(2)质粒的基本特性
1) 2) 3) 4) 5) 自主复制性 不相容性 可扩增性 可转移性 携带遗传标记 野生型的质粒DNA上往往携带一个或多个遗传 标记基因,这使得寄主生物产生正常生长非必需 的附加性状,包括:抗生素、抗抗生素、抗重金 属、产生细菌毒素等。对DNA重组分子的筛选具有 重要意义。
(3)质粒DNA的转移
质粒自主转移
导入
+
自主转移
+
无DNA转移
donor
H H
H
+
辅助转移
H
+
质粒的辅助转移
H
H
+
Notransfer
质粒的重组转移
R-重组DNA分子
重组
+
DNA 转移
R
+ R
(4)质粒的命名
人工组建的质粒 第一个字母是质粒的英文名字(Plasmid)的第一 个字符p, 用小写。后面有两个字母是大写,代表质 粒的发现者和实验室名称,再后面是质粒的编号。
基因工程常用的三种载体
基因工程常用的三种载体
基因工程常用的三种载体
基因工程是一种用于改变和改造生物体遗传基因的技术,它是利用分子生物学技术提高生物性状的一种新技术。
在基因工程中,需要使用一种材料将外源基因投入细胞中,这种材料就是载体。
基因工程中常用的载体有以下三种:
1. 质粒载体. 质粒载体是一种比较常见的基因工程载体,具有较强的稳定性,它是一种质粒DNA,也称为质粒DNA,不是单链DNA,它是由细菌质粒的DNA结合其它分子,形成质粒DNA的结构,具有可复制性能,可以在细菌或动物细胞中复制,具有较强的稳定性。
2. 杆状病毒载体. 杆状病毒载体是一种比较常见的基因工程载体,它由病毒的全基因组和其它分子形成,用来转移外源基因到细胞中,可以把外源基因转移到细胞核或任何其它的地方,可以实现基因工程的目的。
3. 化合物载体. 化合物载体是一种新型的载体,它是由多种不同的分子组成的,可以将外源基因转移到细胞核或其它位置,并且可以把这些基因在细胞中表达出来,从而实现基因工程的目的。
4基因工程-载体
4.质粒是基因工程的常用载体,下列关于它的说法正确的是( D )
A.具有环状结构的染色体,能够携带目的基因 DNA B.含蛋白质,从而能完成生命活动 C.是 RNA,能够指导蛋白质的合成 D.能够自我复制,从而保持连续性
—CTTAAG—
—G —CTTAA
EcoR I切点
AATTC— G—
碱基互补配对
(2)DNA 连接酶是基因操作的“分子缝合针”,其作用是把基于________
能力而黏合在一起但存在的切口封闭,进而才可能形成有意义的__重__组__D_N_A。 (某些)病毒
(3)逆转录酶也常被用于基因工程,其存在于________(生物)中,催化以
___m_R_N_A__为模板合成 DNA 的过程。
某些生化表型基因
在质粒作为载体时其上必须有至少一个标记基因存在。 即:限制酶切割位点不能破坏全部标记基因
a,b,c为酶切位点, a,c为限制酶Ⅰ切割位点;b为限制酶Ⅱ切割位点, (限制酶Ⅰ能切开限制酶Ⅱ的序列,限制酶Ⅱ不能切
开限制酶Ⅰ的序列) 选限制酶Ⅱ
则应选那种限制酶? 含有该质粒的细胞将来在什么培养基上能存活? 在什么培养基不能存活?
B.①④⑥
C.①③⑥⑦
D.②③⑥⑦
类型二 质粒结构和功能 例 2►目前基因工程所用的质粒载体主要是以天然细菌质粒的各种元件为基 础重新组建的人工质粒,pBR322 质粒是较早构建的质粒载体,其主要结构如下 图所示。
(1)构建人工质粒时要有抗性基因,以便于_筛___选__(_鉴__别___)目___的__基___因__是_______ _____________________________________否__导___入__受__体___细__胞__________。
基因工程基因工程的载体
2020/4/4
苏州科技学院生物系
叶亚新
第三章 基因工程的载体
作为基因工程载体的基本功能
1. 运送外源基因高效转入受体细胞 2. 为外源基因提供复制能力或整合能力 3. 为外源基因的扩增或表达提供条件
2020/4/4
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叶亚新
第三章 基因工程的载体
作为基因工程载体必须具备的基本条件
1)标记基因与宿主细胞 2)标记基因产物的作用机制: Apr 3)标记基因的结构与适用范围: 基因启动子, 翻译起始
序列, 密码子偏爱性
4)标记基因的结构变化对功能的影响: LacZ, GUS
4. 常用的遗传标记基因
1) 四环素抗性基因(Tcr)
Tetracycline 可结合在核糖体30s亚基中的一种蛋白 质分子上,抑制核糖体的转位过程。四环素抗性基因编码 一种399 AAs蛋白质,与细菌细胞膜结合,阻止四环素分 子进入细菌细胞。
第三章 基因工程的载体
载体:携带外源基因进入受体细胞的工具 用于基因工程的载体
•细菌质粒载体 •噬菌体λ衍生载体 •Cosmid载体 •Phagemid载体
•酵母质粒载体 •真核病毒载体 •Bacmid载体 •YAC载体
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发展概况
1. 第一阶段(1977年前):天然质粒和重组质粒的利用,
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2) 氨苄青霉素抗性基因(Apr)
Ampicillin可抑制细菌细胞膜上参与细胞壁合成酶类的活性。Apr 抗性基因编码一种分泌到细菌细胞周间质的酶,催化β—内酰胺环的 水解,使氨苄青霉素失活。
3) 氯霉素抗性基因(Cmr)
基因工程第三章基因工程的载体
基因工程载体的种类
质粒载体
质粒是一种裸露的、独立于细菌 拟核DNA之外的DNA分子,具有 自我复制能力,可携带外源DNA 片段。
病毒载体
病毒载体是指能够将外源DNA片 段插入到病毒基因组中,并利用 病毒的复制机制将外源DNA片段 导入到受体细胞中的媒介。
基因工程载体的作用
基因转移
基因工程载体能够将外源DNA片 段导入到受体细胞中,实现基因 的转移和表达。
通过优化载体结构,提高其在宿主细胞内的稳定性,降低丢失和突变 的风险。
开发NA的载体,提高基因工 程的效率和安全性。
拓展载体功能
通过基因工程技术对载体进行改造,赋予其新的功能,如表达调控、 靶向输送等。
智能化载体
利用合成生物学和纳米技术,开发具有智能响应能力的基因工程载体, 实现基因治疗的精准化和个性化。
利用基因工程载体生产食品添加剂、 酶制剂等,提高生产效率和产品质量。
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此外,噬菌体载体还可以用于疫苗研 发和生物治疗等领域。
04 人工染色体载体
人工染色体的概念与特性
人工染色体是一种通过基因工程技术 构建的染色体,具有与天然染色体相 似的结构和功能。
人工染色体具有高容量、可定制和可 调控等特性,能够承载和表达大量的 外源基因,为基因治疗、生物制药等 领域提供了新的工具。
质粒载体的应用
总结词
质粒载体在基因工程中广泛应用于基因克隆、表达和基因治疗等领域。
详细描述
质粒载体此外,质粒载体还可以用于基因治疗和疫苗研制等领域, 为疾病治疗和预防提供了新的手段。
03 噬菌体载体
噬菌体的生物学特性
基因克隆
基因工程载体可作为基因克隆的 工具,将外源DNA片段插入到载 体中,通过复制和扩增实现基因 克隆。
基因工程载体
第三章基因工程载体体外获得的任一DNA片段,必须插入到可以自我复制的载体内,再转入宿主细胞,才能得到复制和进行表达。
基因工程载体(Vectors)就是携带外源基因进入受体细胞进行繁殖和表达的一种工具。
载体的功能运送外源基因高效转入受体细胞为外源基因提供复制能力或整合能力为外源基因的扩增或表达提供必要的条件基因工程中3种主要类型的载体:1.质粒载体2.噬菌体载体3.柯斯质粒(cosmid)载体基因工程对载体的要求(1)在宿主细胞内能独立复制。
(2)有选择性标记。
(3)有一段多克隆位点。
外源DNA插入其中不影响载体的复制。
(4)分子量小,拷贝数多。
(5)容易从宿主细胞中分离纯化。
第一节质粒(plasmid)载体质粒是一种独立于染色体外的双链闭环的DNA分子,具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。
质粒的复制和转录要依赖于宿主细胞编码的某些酶和蛋白质,如离开宿主细胞则不能存活,而宿主即使没有它们也可以正常存活。
(一)质粒的构形环形双链的质粒DNA在提取过程中通常出现三种不同的构型:①共价闭合环形DNA(cccDNA)②开环DNA(open circular,ocDNA)③线形DNA(linear,lDNA)(二)质粒的转移性指质粒从一个细胞转移到另一个细胞的特性。
接合型质粒:除了带有自我复制所必需的遗传信息外,还带有一套控制细菌配对和质粒接合转移的基因。
如:F质粒(性质粒或F因子)甚至能使寄主染色体上的基因随其一道转移到原先不存在该质粒的受体菌中。
不符合基因工程的安全要求。
非接合型质粒:带有自我复制所必需的遗传信息,但失去了控制细菌配对和质粒接合转移的基因,因而不能从一个细胞转移到另一个细胞。
如R质粒(抗性质粒)、Col质粒(细菌素质粒)。
符合基因工程的安全要求。
R质粒:带有一种或数种抗生素抗性基因,使寄主获得同样的抗生素抗性性状(resistance)。
Col质粒:细菌素通过与敏感细菌细胞壁的结合作用,抑制一种或数种细胞生命过程。
基因工程载体
基因工程载体是指用于携带外源基因,并在细胞内进行复制和表达的分子。 它们是改造生物的基础。
基因工程载体的类型
质粒
常用于细菌表达,包括原核生物和真核生物的质粒。
病毒载体
包括腺病毒、逆转录病毒等,常用于转导和转化细胞。
工具基因
可直接或间接编码外源蛋白质,还可辅助其他载体用于目的基因的快速识别与筛选。
用于表达重组蛋白等药物,开 发快速且经济有效的制剂工艺。
基因工程载体可用于生物药物及生产技术的研发,是生物医药领域的重要组成部分。
基因工程载体的设计和构建
1
槽式开阔系统
通过个性化定制载体的结构、比例、含量和形态,提升载体的反应性和扩散性。
2
基因簇筛选
可通过对质粒载体进行簇分析和筛选,去除异质体和残留DNA等,提升载体质 量。
3
切割与黏合
运用限制性内切酶、酶切ligase、PCR反应等技术,制备并放大载体。
基因工程载体的后续研究和发展
1 功能扩展
以基因载体为核心,引导基因工程技术的快速发展。
2 多样性构建
以创新设计为核心,开发绿色化、精简化、标准化、差异化、低耗能的基因载体构建平 台。
3 质量控制
研究基因工程质量控制的理论、方法及其结构化的过程,以期提升载体质量,并引导其 向更广泛领域扩展。
常见的基因工程载体
1
慢病毒
2
常用于生物学研究中的基因修饰技术,
有望成为治疗人类遗传病的一种有效工
3
具。
大肠杆菌BL21
用于重组表达外源蛋白,是最常用的质 粒载体。
转座子
可用于转移基因,可以使植物和动物的 产生长期、稳定、准确的基因转移。基因工程载体的特点和优势
基因工程的操作单元——载体
云南大学
The catabolic plasmids that complete sequence has been determined
Plasmid Substrates Strain Size (bp) Catabolic genes References
云南大学
基因工程的操作单元——载体
1.
2.
3.
4.
一个理想的载体至少包括4个方面的条件: 具有对受体细胞的可转移性,提高载体进入受体细 胞的效率; 具有与特定受体细胞相互适应的复制位点或整合位 点,使得外源基因在宿主细胞中稳定遗传; 具有多种的单一核酸内切酶识别切割位点,有利于 外源基因的拼接插入; 具有合适的选择性标记,便于重组DNA分子的检测; 其中前两点即载体的可转移性与可复制性取决于它 与宿主细胞之间严格的亲缘关系,不同受体细胞只 能使用与之匹配的载体。
pOAD2
Nylon Flavobacterium K172 45519 nylA Microbiology oligomers nylBC 1995,141:2585 pNL1 Biphenyl,naphthalene Sphingomonas 184457 pbh, xyl, J. Bacteriol. m-xylene, p-cresol aromaticivorans F199 nah, pch 1999,181:1585 pADP-1 Atrazine Pseudomonas ADP 108845 atzA,atzB J. Bacteriol. atzC,atzDEF 2001,183:5684 pWWO Xylene,Toluene P. putida mt-2 116580 xyl Envi.. Microbiol. 2002,4:856 pAO1 Nicotine Arthrobacter 165137 ndh, 6hlno J. Bacteriol. nicotinovorans kdh, dhph 2003,185:1976 pCAR1 Carbazole P. resinovorans CA10 199035 carABCDEF J. Mol. Biol. antABC 2003,326:21 pBD2 Isopropylbenzene Rhodococcus 210205 ipbA1A2A3A4 J. Bacteriol. Erythropolis BD2 2003,185:5269 pUO1 Haloacetates Delfitia 67066 dehH1, dehH2 J. Bacteriol. Acidovorans B 2003,185:6741 pJP4 2,4-D Ralstonia 87688 tfdA, tfdB Envi..Microbiol. 3-chlorobenzoate eutropha JMP134 tfdCDEF 2004,6:655 pND6-1 naphthalene Pseudomonas ND6 101858 nah Gene 2004,336:231 pDTG1 naphthalene P. putida 83042 nah J. Mol. Biol. NCIB 9816-4 2004,341:753
第三章 基因工程载体
表达载体与克隆载体的区别
Hale Waihona Puke 强启动子,一个可诱导的强启动子可使外源基因 有效的转录 在启动子下游区和ATG(起始密码子)上游区有 一个好的核糖体结合位点序列(SD序列),促进 蛋白质翻译 在外源基因插入序列的下游区要有一个强转录终 止序列,保证外源基因的有效转录和mRNA的稳 定性
表达型载体(expression vector)
Apr TcS为重组子 Apr Tcr为原载体 ApS Tcr为重组子 即为非重组子
pUC系列的质粒载体
pBR322质粒的复制起点 Amp抗性基因,但核苷酸序列不含有原来限制 性核酸内切酶的单一酶切位点 大肠杆菌β-半乳糖酶基因(lacZ)的启动子及其 编码α-肽链的DNA序列,此结构特称为lacZ‘基 因 位于lacZ'基因中的靠近5”端的一段多克隆位点 (MCS ,multiple cloning sites)区,但它 并不破坏该基因的功能
4、
去除两 个PstI
pBR318 (6.3Kb)
酶切 体外重组 酶切
pBR313
EcoRII片 断去掉
pBR322 (4.3Kb)
pBR320 (2.8Kb)
四、常用质粒载体类型
1、克隆质粒载体
2、表达质粒载体
3、多功能质粒载体
4、穿梭质粒载体
1、克隆质粒载体
克隆质粒载体是指专用于基因或DNA片断无性繁
pBR322插入失活效应
筛 选 重 组 子 的 示 意 图
Amp r
1)限制酶切 2)DNA重组 无DNA插入
Tc
有DNA插入
Amp r Tcr
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二、噬菌体载体 (一)、λ噬菌体载体
1、λ噬菌体载体的特征
λ噬菌体颗粒中DNA为线状双链DNA分子,全长48502bp, 两端各有一段长度为12个核苷酸的互补单链(粘端),称 为cos位点。λ 噬菌体有61个基因,其中有1/3的区域是其 裂解性生长的非必需区,这一区段的缺失,或在此区段中 插入外源DNA,并不影响噬菌体的增殖,这就是λ 噬菌体 可作为基因载体的依据 。
第一节
微生物基因工程载体
克隆载体(cloning vecto载体(expression vector):能使目的基因在宿 主细胞中表达的一类载体。这类载体既有复制子, 更要有强启动子; 穿梭载体(shuttle vector):这类载体可以在原核细 胞中复制,也可在真核细胞中扩增和表达。
四、酵母菌载体
多数酵母中含有一种能独立复制的环状双链DNA,称为 2μ 质粒,长约6.3kb,有单一的复制起始点和一个自主 复制功能区域(ARS片段)。 根据质粒的复制方式不同将它们分为:整合型、复制型、 附加型和稳定型等类型。
共同的特点:
①含有E.coli质粒的复制起始序列,这样在外源基因转到酵 母细胞前可先在大肠杆菌中扩增。
外源基因的插入:
PstI Amp r Tet r Amp s Tet r
重组体的筛选
. .. . . . . .
涂布有Tet的培养基
.. .. . .
涂布有Amp的培养基
3、pUC系列质粒载体
(1)特点 具有更小的分子 量(2686bp)和 更高的拷贝数。 具有多克隆位点
可用组化方法鉴别:
含有一个来自于大肠杆菌的经过加工的LacZ基因 (LacZ′),它编码β -半乳糖苷酶氨基端146个氨基酸 , 可以和β -半乳糖苷酶缺陷型的大肠杆菌实现基因内互补, 即α —互补 ,恢复分解乳糖的能力。 X-gal也是β -半乳糖苷酶的一种底物,经降解后可生成溴 氯吲哚,使大肠杆菌菌落呈蓝色。当无β -半乳糖苷酶时, X-gal不被分解,菌落呈白色。 当外源基因插入到pUC质 粒的LacZ′基因内部,则LacZ′基因受到破坏,便不能 再和缺陷型受体菌中生成有活性的β -半乳糖苷酶,因此, 菌落呈白色。 反之,非重组体为蓝色菌落。 可通过插入失活法进行筛选
共同区
2、毒性Vir 区, Vir区大约35kb,包含6个互补群,A、B、C、D、E、G。 VirA、B、D和G为致瘤性,它们的突变型为非致病性。 VirA、C、D编码专一核酸内切酶蛋白,与VirB共同 作用,与T-DNA迁移直接有关。 VirC部分决定寄主范围 VirE与菌体感染过程有关 3、代谢区 Tra,T-DNA转移功能;
3. 质粒的不相容性和不亲和群
质粒的不相容性:一般地,不同质粒不能共处在一个细 胞中,这种特性称质粒的不相容性,当它们处在一起时, 便有生存竞争,结果一种质粒繁殖,另一种逐渐被排斥, 数目变少。 不亲和群:彼此不相容的质粒组成一个不亲合群。
(二)、质粒的命名
1、人工组建的质粒
人工组建的质粒的第一个字母是质粒英文名字 (plasmid)的第一个字符p,用小写。p后有2个字母是大 写,表示质粒的作者和实验室名称,再其后为质粒的编号。 例:pXYp109;pSC101等 2、天然载体质粒 天然载体质粒的第一个字母大写,且质粒符号用括号 括起来。 如(C01E1)。农杆菌质粒用p加Ti(Tumer inducing)或 At(Agrobacterium tumefacions)表示,如pTiC58。
1. 严紧型和松驰型质粒 严紧型质粒:在宿主细胞中的拷贝数较少,一 般只有1~3个 松驰型质粒:其拷贝数较多,一般20~60个,多 的可达200~300个
2、转移型和非转移型质粒
转移型,结合型(conjugative plasmid)是指一些质粒在不 同的菌株中可以相互转移。 非转移型质粒(non-conjugative plasmid)则只能在一种寄主 中生存
②含有酵母的筛选标记,这样当重组质粒转入相应的酵母 细胞后,可用来筛选重组体。
③具有合适的供外源基因插入的限制酶切割位点。
整合型:含有酵母的筛选标记ura3,但不具有酵母的复制 起始点该质粒DNA以单拷贝形式稳定遗传,缺点是转化率 较低(1~10转化子/μ g DNA) 复制型:是酵母DNA片段插入到大肠杆菌质粒中构成的, 插入片段含有酵母的筛选标记ura3和2uDNA片段,一般以 低拷贝数维持在酵母染色体之外。复制型载体对酶母的转 化率极高(102~103转化子/μ g DNA),但是转化子不稳 定,容易丢失。 附加型:是在pBR322中插入酵母筛选标记和2uDNA的 ARS序列构建成的。这种质粒以附加体的形式存在于真核 细胞中。附加型型载体对酵母具有很高的转化活性 (102~103转化子/μ g DNA),且与复制型相比,稳定性 高,拷贝数也较高(25~100分子/ 细胞)。
(二)、Ti质粒及T-DNA的结构与功能
Ti质粒是农杆菌非染色体的环状双链DNA分子, 分子量为90×106~150×106道尔顿,有16~240kb。 致病菌株 治愈菌株
37℃培养
治愈菌株 (Ti质粒被消除)
致病菌株(重新获得Ti质粒)
与致病菌株接合
1、T-DNA区 胭脂碱型质粒T区大小约23kb,单一序列插入植物核DNA。
第四章 基因工程载体
Vesctors for Genetic Engineering
载体:这种能与目的基因结合,且有完整的复制和转录功能 的DNA大分子称之为载体(vector)。
作为一个理想的载体,应具备以下条件:
(1)能够在宿主细胞中存在并繁殖,有功能良好的复制 子和启动子,使插入基因复制和表达; (2)具有多个限制性内切酶的切点,且切点是单一的, 这样可将多个外源DNA片段插入其中; (3)具有容易检测的筛选标记; (4)载体DNA的分子量适当,可容纳较大的外源DNA片 段,又可在受体细胞内扩增较多的拷贝; (5)在细胞内稳定性高,这样可以使重组体可以稳定传 代而不易丢失。
(三)、常用质粒载体
1. pSC101
图
2. pBR322
(1)组成 它由三部分组成:
来自pSCl01的四环素 抗性基因Tetr
来自ColEl的衍生物 pMBl的松弛复制起 点ori 来自RSF2124的氨苄 青霉素抗性基因Ampr。
(2)特点
具有多个单一的限制性内切酶位点。 Tetr中有BamH1切点(G↓GATCC)和SalⅠ切点(G↓AATTC), Ampr中有PstⅠ切点(CTGCA↓G)。 利用ColEl的复制子,所以在细胞中是多拷贝的,可通过氯霉素使质粒 拷贝数进一步扩增。 (3)重组克隆的 “插入失活”筛选方法 pBR322—→插入在Tetr中,基因型为Tets 、Ampr——→在含有氨 卞青霉素培养基上可生长,在在含有四环素培养基上不生长; pBR322—→插入在Ampr中,基因型为Tetr 、Amps、——→在含 有氨卞青霉素培养基上不生长,在在含有四环素培养基可不生长; 而在两种抗生素培养基上都生长的是非重组型。这种在一个 基因位点中插入外源DNA片段,从而使该基因活性丧失的现象叫 插入失活。
含Ampr抗性基因,可通过插入失活和颜色反应进行双重筛选。
完整的β -半乳糖苷酶
N端 C端
lacZ’
lacZ’
缺陷型大肠杆菌
(四)大肠杆菌中的表达载体 表达载体应含有:
(1)强启动子 (2)在启动子下游区和ATG上游区有一个好的SD序列。 (3)在外源基因插入序列下游区要有一个强的转录终止序 列,保证外源基因有效转录和质粒的稳定性。
λ噬菌体的改造
⑴ 切去非必须区段,在切去的同时,加载目的基因(2.5kb或更大); ⑵ 去处太多的酶位点,每种酶只留1-2个切口; ⑶ 增加标记基因(remarke gene)。
(4) 引入无义突变.
3. λ噬菌体的主要类型 (1)插入型载体 只有1~2种限制性核酸内切酶的单一切割位点
免疫功能失活
一、质粒载体
细菌质粒 (plasmid) 载体是基因工程 中最常 用的载体, 它必须包括三种组成部分: 复制必须 区,选择标记基因和限制性核酸内切酶的酶切位 点(克隆位点,MCS). 质粒DNA分子具有三种构型: Closed circle DNA, ccDNA; supercoil; SC构型 Open circle DNA, OC构型; Liner DNA, IDNA; L构型.
+
+ RF型DNA
复制约 200copy
+ + -
+ -
+ 单链结合蛋白
+
+
以-链DNA为模 板合成+链DNA
+
+
+
+
-
三、噬菌粒载体(科斯质粒
1、构建
cosmid )
由质粒和λ噬菌体的粘性末端构建而成的。借用cos-(粘性 尾巴)作字头,质粒的-mid作字尾,故称Cosmid,也叫粘 粒载体。 2、特点 (1) 有λ噬菌体的高效感染能力。 ⑵ 有质粒的高效复制特性。 ⑶ 有更广泛寄主。 ⑷ 有较大的容量。 3.主要用途:用于DNA 序列分析
稳定型:在附加型载体中再插入酵母着丝粒的一个DNA 片段(CEN)。
第二节
植物基因工程载体
一、根癌农杆菌及Ti质粒
(一)、根癌农杆菌与冠瘿瘤
根癌农杆菌属根瘤菌科农杆菌属,通过伤口可感染双子叶 植物,并在创伤部位使组织恶性增生而形成植物肿瘤,叫 冠瘿瘤(crown galltumor)。 章鱼碱 冠瘿碱 胭脂碱 农杆碱 类植物激素
大肠杆菌β -半乳糖苷酶失活
(2)替换型载体
在其中央部位有一个可以被外源插入的DNA分子取代的 DNA片段的克隆载体 。这是由于构建此载体时,安排 在中央可取代片段两侧的多克隆位点是反向重复序列, 因此,当外源DNA插入时,一对克隆位点之间的DNA 片段便会被置换掉,从而有效提高了克隆外源DNA片段 的能力。