酵母菌DNA的提取

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酵母DNA提取方法

方法一:

石英砂法

1、5000rpm×5min 收集过夜培养的菌体(5ml左右),于200μL 裂解液(50 mmol/ L Tris-HCl pH 8.0 , 180 mmol/ LEDTA pH 8.0 , 1 % SDS , 现配)中,加入3/10 总体积石英砂在涡流混合器上振荡13min,每隔4min 将离心管取出用力甩几下,然后65℃水浴10min。

2、加入200μL 5mol/L KAc,冰浴8min;

3、12000rpm×5min 转移上清至新的离心管中;

4、加入 3 mol/L NaAc 35μl,加入异丙醇200μL混匀后冰浴8min,12000rpm×5min收集沉淀;

5、200μL TE 溶解,加入RNase10μL,65℃水浴10min;

6、加入200μL 氯仿-异戊醇(24:1),抽提;

7、温柔地取上清150μL ,加入20μL 3 mol/L NaAc及375μL 无水乙醇,混匀后

12000rpm×8min 收集DNA;

8、70% 乙醇洗涤沉淀,吹干后TE 溶解,-20℃保藏。

方法二:

蜗牛酶法

1. 接种于5 ml的YEPD培养基中在25℃-28℃振荡培养12-16 h。

2. 3500 rpm离心5min沉淀细胞,用1ml 的无菌水洗涤一次,再加0.5ml solution Ⅰ(1M 山梨醇,0.1M EDTA, pH=7.5)重悬。

3. 转移细胞至1.5 ml 的离心管中,加入0.1蜗牛酶(30mg/ml)溶液,37℃保温30-60min, 以获得原生质体。

4. 最大转速离心1min以沉淀细胞,用500ulsolutionⅡ(50mMTris-HCl, 20mM EDTA,pH=7.4)溶液悬浮,然后加入50μl 10% SDS, 混合65℃保温30min。

5. 加入200μl 5M 醋酸钾,放于冰上30 min。

6. 最大转速离心15min,转移上清液至新的离心管中,用等体积的异丙醇沉淀DNA。

7. 室温下放置5min,离心10min,用70%的乙醇洗涤一次,真空干燥,用50ul pH=7.4 TE溶液溶解。

方法三:

蜗牛酶过夜处理法

将酵母接种到YPD培养基中30℃过夜培养16~18h,离心收集1.5mL,用灭菌水洗涤两次;加入600μL裂解液,35μL蜗牛酶,37℃消化过夜;加入饱和酚450μL,氯仿-异戊醇(体积比24:1)150μL,轻轻颠倒混匀使溶液成为乳状,并保持10min,3000r/min离心10min;吸取上清液,用氯仿-异戊醇(体积比24:1)450μL再抽提1次,10000r/min离心5min;取上清加入异丙醇800μL,-20℃静置30min;10000r/min离心5min,沉淀物用70%乙醇洗两次,自然干燥后溶于30μL TE缓冲液;加入0.5μL10mg/mL的RNaseA,37℃温浴30min,自然冷却后保存。

方法四:

蜗牛酶反复冻融法

收集过夜培养16~18h的菌体1.5mL,加入500μLPBS溶液重悬菌体,12000r/min离心2min,用PBS重洗一次;将沉淀溶于35μL的蜗牛酶溶液中,加入65μL的PBS,45℃作用2h,加100μL裂解液,-20℃冷冻,然后室温振荡溶解,反复3次;向悬浮液中加入150μL 5mol/L KAc(pH8.9)轻轻混匀,然后10000r/min离心5min;取上清液,加入两倍体积的无水乙醇,轻轻混匀,室温放置5min;12000r/min离心10min,将沉淀溶解在100μL TE中;加入等体积的酚-氯仿-异戊醇(体积比25:24:1),轻柔颠倒混匀,12000r/min离心5min,重复抽提1次;加1/10体积的3mol/L醋酸钠(pH5.2),2.5倍体积的无水乙醇,-20℃放置30min;10000r/min离心5min,弃上清液,用70%乙醇溶液洗涤沉淀两次,室温干燥后用20μL TE溶解;加入0.5μL 10mg/mL的RNaseA,37℃温浴30min,自然冷却后保存。

方法五:

溶解在100μL TE中;加入等体积的酚-氯仿-异戊醇(体积比25:24:1),轻柔颠倒混匀,12000r/min离心5min,重复抽提1次;加1/10体积的3mol/L醋酸钠(pH5.2),2.5倍体积的无水乙醇,-20℃放置30min;10000r/min离心5min,弃上清液,用70%乙醇溶液洗涤沉淀两次,室温干燥后用20μL TE溶解;加入0.5μL 10mg/mL的RNaseA,37℃温浴30min,自然冷却后保存。

方法六:

1、配一个破菌缓冲液:

Triton X-100 2%(v/v)SDS 1%(w/v)

NaCl 100mM Tris-HCl(pH 8.0)10mM

2、把酵母细胞离心收集,加200ul的石英砂或玻璃珠,加入200μl的破菌液再加200μl的酚氯仿,涡旋一分钟,放在冰上一分钟,一共反复4次

3、加入500μl的ddH2O,涡旋,离心,抽上清和等体积的酚氯仿混合

4、涡旋,离心,抽上清和等体积的酚氯仿混合,重复4直到离心后两层之间没有蛋白出现

5、抽上清加1ml的无水乙醇,放在-20度30min

6、离心,抽上清,再用70%乙醇洗一次,真空干燥,用TE或ddH20溶解

方法七:

接种酵母到2.5ml 酵母试管培养基中(YPD培养基),30℃,培养16~18h;取1.5ml 酵母培养液,室温下,1500 × g 离心5~10min 收集菌体;菌体用灭菌水洗1 次,1500 ×g 离心5min;菌体用200μl SCED(1mol/L 山梨醇、10mmol/L 柠檬酸钠、10mmol/LEDTA、10mmol/L DTT 二硫苏糖醇)溶液重悬,加入3 0μl 10mg/ml 溶菌酶(Lysozyme)37℃温浴1h;加入100μl 2%SDS 混匀,-20℃冰冻,然后室温震荡溶解,反复3 次;向悬浮液中加入150μl 5mol/L KAc(pH 8.9)轻轻混匀,然后10000r/min 离心5min;将上清转移到一新的1.5ml 离心管中,加入 2 倍体积的乙醇,轻轻混匀,室温放置5min 后12000r/min 离心10min;除去上清,将沉淀溶解在300μl TE(10mmol/L Tris-HCl,pH7.4,1mmol/L EDTA,pH8.0) 中,加入6μl RNase (10mg/ml),37℃温浴30min;加入饱和酚和氯仿各150μl 充分混匀,然后10000r/min 离心5min;转移上清到新的1.5ml 离心管中,加入1/2体积的7.5mol/L NH4Ac(pH7.5)和等体积的异丙醇,-20℃放置20min 后12000r/min 离心10min;除去上清,加入300μl 70% 乙醇漂洗沉淀一次,10000r/min离心5min;风干除去乙醇,用2 0μl TE 溶解酵母DNA。

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