珠磨法提取酵母基因组

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利用海砂提取酵母基因组

1、挑GS115单菌落接种于50mL三角瓶6mLYPD培养基中,摇两瓶。将30℃,200r/min,培养过夜(16~18h)的酵母细胞分别吸取1.5mL菌液放在1.5mL EP 管中,共8管,12000r/min,5min,离心收集细胞;

2、用无菌水将细胞悬浮(借助10uL枪头),洗细胞,12000r/min,5min,离心;再次用无菌水洗细胞,只洗表面,去上清;

3、加入200uL(0.275g)海砂,200uL裂解液,200uL酚氯仿(25:24),将细胞悬浮(借助10uL枪头),然后涡旋震荡1min,放在冰上1min,重复四次;

4、12000r/min,5min,离心,吸取上清液(260uL),两管合一管,共4管,每管520uL,加入等体积的酚氯仿(酚265uL,氯仿255uL),颠倒混匀,去蛋白,12000r/min,5min,离心;

5、吸取上清液(500uL),加入等体积的酚氯仿(酚255uL,氯仿245uL),颠倒混匀,去蛋白,12000r/min,5min,离心;

6、吸取上清液(480uL),加入等体积的酚氯仿(酚245uL,氯仿235uL),颠倒混匀,去蛋白,12000r/min,5min,离心;

7、吸取上清液(460uL),加入2倍体积(920uL)的无水乙醇,放在—80℃,30min;

8、12000r/min,5min,离心,去上清,加入400uL体积的70%乙醇,用手弹起沉淀,洗涤,12000r/min,5min,离心,去上清,再次加入400uL体积的70%乙醇,只洗表面,去上清,将DNA自然晾干;

9、用20uL的超纯水溶解DNA,加入1uLRNaseA,37℃,消化30min;

10、取5uLDNA溶液,用1%琼脂糖凝胶跑电泳。

试剂配方:

1、1M Tris-Hcl(pH 8.0):配50mL

Tris碱:6.06g

水:50mL

用浓盐酸约2.1mL调pH至8.0,

2、0.5M EDTA(pH 8.0):配50mL

EDTA二钠盐:9.306g

水:50mL

用NaOH(分子量40g/mol)约1g,调pH至8.0

注意:EDTA难溶,需调到pH8.0才能溶解,溶解时超声并加热3、TE缓冲液(pH 8.0):配制500mL

1M Tris-Hcl(pH 8.0):5mL

0.5M EDTA(pH 8.0):1mL

水:494mL,

调pH至8.0

4、提取基因组裂解液配方

Triton X-100:2%

SDS(W/V):1%

Nacl:100mM

Tris.Hcl(pH:8.0):10mM

配100mL裂解液:

Triton X-100:2mL

SDS:1g

Nacl(分子量58.44g/mol):0.5844g

Tris.Hcl(pH:8.0):1M Tris.Hcl(pH:8.0)1mL

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