分子克隆基本流程及技术原理
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分子克隆主要技术:
(1)限制性内切酶酶切与连接
基因克隆也叫DNA分子克隆,即在体外重组DNA分子,而实现该技术的关键是一种被称作限制性核酸内切酶的工具酶。每一种限制性核酸内切酶可以识别DNA分子上特定的碱基序列,切断DNA分子。依据碱基互补的原理,在DNA连接酶的作用下可以把切开的DNA片段连接起来,因此可以把目的片段连接到合适的载体上形成重组子。
(2)转化与转染
作为表达载体,必须具有复制起始序列、多克隆位点及选择标记,可以在宿主细胞中进行自我复制或整合到宿主基因组中进行复制。作为宿主的工程菌或细胞在某些化学条件或物理刺激下会改变其细胞膜的通透性,从而易于将细胞表面附着的外源基因吸收到胞内,这一过程即转化(工程菌)或转染(细胞)。
利用选择标记可以很容易鉴别成功导入目的基因的工程菌或细胞,比如抗生素抗性筛选—凡是成功导入重组载体的工程菌或细胞均获得某种抗生素抗性,而未导入的工程菌或细胞则不能在含该抗生素的培养基中生长。
(3)聚合酶链式反应
聚合酶链式反应,即PCR。PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至94℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃(具体退火温度根据引物的Tm值确定)左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链,重复循环变性--退火--延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。
整个分子克隆从设计引物开始,根据需要拿到的目的蛋白相应地核酸序列,设计出含有酶切位点及所需Tag的特异性引物,至于设计引物的原则,可以从网上、书上查到,这里不再赘述。以下框架图给出了分子克隆的基本流程: