阪崎肠杆菌研究进展
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– 克罗诺杆菌（Cronobacter spp.） 属名、种名词源学
– 属及其各个种的生物学特性、代表 性种
阪崎肠杆菌分类学及命名的发展历史
• 阪崎肠杆菌的发现及其命名历史
– 1929年Pangalos报道的一种引起婴儿败血症的产 黄色素的大肠菌，称为“黄色大肠菌、黄色肠杆 菌”;
– 1961年Urmenyi和Franklin根据1958年发生在英国 奥尔本的两例新生儿死亡病理研究，在报道中描 述了其病因源于一种少见的产黄色素的阴沟肠杆 菌菌群，并取日本细菌学家Riichi Sakazaki的名 字作为该菌的名称;有人称之为：“Urmenyi和 Franklin杆菌”；
脑膜炎
小肠结肠炎
菌血症
我国对阪崎肠杆菌方面的管理规定
• 《关于对进口乳制品进行阪崎肠杆菌检测的通知》(国质 检食函[2005]690号)；
• 《关于加强进口乳制品检验检疫监督管理工作的通知》 国质检食函[2007]298号）；
• 《婴幼儿配方乳粉生产许可证审查细则》(2006、2008 版)
阪崎肠杆菌对配方粉的污染点、存活时间和传播线路
– 1965年Joker等分析了发生在丹麦的一个相同病例， 并报道该种菌可导致新生儿脑膜炎并产生神经损 伤，根据两起报道首次明确了该种病原菌为“非 典型的产黄色素的阴沟肠杆菌”.
– 直到1980年，Farmer等发表了题为 “Enterobacter sakazakii, new species of Enterobacteriaceae isolated from clinical specimens.”的文章，该菌才被统一命名并定义， 该篇文章是对阪崎肠杆菌研究的阶段性成果总结。
细菌分类方面的问题
• 种是生物分类中基本分类单位，是具有高 度特征相似性的菌株群，该菌株群与其它 类群的菌株有很明显的区别；
• 细菌学家和分类学家存在一定分歧； • DNA杂交同源性在60-70%以上，或
16SrRNA序列同源性达到97%以上的菌株， 被认为是同一种。
阪崎肠杆菌的分类学变化
• 16SrRNA序列同源性在 细菌分类学上的重要作用
“系统与进化微生物学国际期刊（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSB）”
记录新细菌类群包括分类、命名、鉴定和系统发育的官方杂志
克罗诺杆菌属（Cronobacter spp.）
包括5个新种,（其中Cronobacter sakazakii称为新组合）、1个克罗诺 杆菌基因种（genomospeciese）和三个新亚种.
• 建议将阪崎肠杆菌重新分类命名，成为肠杆菌科1个新属，即克罗 诺杆菌属（Cronobacter spp.）包括5个新种（其中Cronobacter sakazakii称为新组合）、1个克罗诺杆菌基因种 （genomospeciese）和三个新亚种，在该杂志通知清单上 （2008年，58卷，第6部分）1个新属、5个新种和三个新亚种已 公布。
阴沟肠杆菌 阪崎肠杆菌
• 阪崎肠杆菌为新种的分类 依据
– 统一了该菌的名称；
– 确证了“产黄色素的阴沟肠 杆菌”是一个新种，而不是 阴沟肠杆菌的一个生物群。
依据什么？
DNA相关性 产黄色素 生化试验 抗生素易感性
细菌不同株属于同一种水平 DNA的相关性通常应在70% 或更高
DNA相关性实验
DNA相关性：同种70%；其它70%；支持克罗诺杆菌应由不 同种组成的说法
克罗诺杆菌及相近种细菌的16SrRNA基因进化树
克罗诺杆菌属（Cronobacter spp.）
Cronobacter sakazakii，仍以日本细菌学家名字命名，中文应为阪崎克罗诺 杆菌；
Cronobacter malonaticus，“malonaticus”意为可利用丙二酸盐，中文应为 丙二酸盐阳性克罗诺杆菌；
阪崎肠杆菌重新分类的依据及结果
• 重新分类的依据：
– 的扩增片段长度多态性分析（Amplified fragment length polymorphismas, AFLP）
– 16S rRNA全序列比较 – DNA- DNA杂交实验结果。
• 2008年Iversen等在记录新细菌类群包括分类、命名、鉴定和系统 发育的官方杂志“国际期刊系统与进化微生物学（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSB）” 上发表文章。
阪崎肠杆菌的重视程度
• 《CODE OF HYGIENIC PRACTICE FOR POWDERED FORMULAE FOR INFANTS AND YOUNG CHILDREN》 CAC/RCP 66 - 2008替代 CAC/RCP 21-1979 – 由争论到定论 – 给出了制定阪崎肠杆菌监控计划的指南
ATCC29544
阴沟肠杆菌
差异柠檬酸杆菌
51% 51%
生化试验
• 不利用山梨醇 • 36C下培养7d，DNA酶为阳性
Farmer实验结论
• 阪崎肠杆菌与阴沟肠杆菌不是同一个种； • 阪崎肠杆菌生化反应与肠杆菌属细菌更
为相近； • 阪崎肠杆菌应作为一个独立种，归属于
肠杆菌属，鉴于所分离出的阪崎肠杆菌 之间也有差异，被分成15个生物型或群。
Cronobacter turicensis，“turicensis”是瑞士苏黎世的拉丁文名字，中文应为 苏黎世克罗诺杆菌；
Cronobacter muytjensii，“muytjensii”即Muytjens，是荷兰著名微生物学家， 早期从事过大量阪崎肠杆菌方面的研究工作，中文穆汀斯克罗诺杆菌；
• 监控时间：2005.4—2006.3 • 分离出阪崎肠杆菌：80株 • 中间产品和终产品的阳性检出率：2.5% • 阳性样品检出点占全部取样点的比例：31%
第一部分：阪崎肠杆菌的分类学变化
• 阪崎肠杆菌分类学及命名的发展 历史
– 阪崎肠杆菌的发现及其命名历史 – 阪崎肠杆菌为新种的分类依据
• 克罗诺杆菌分类学、词源学及其 属和ຫໍສະໝຸດ Baidu生物学特性
– 属及其各个种的生物学特性、代表 性种
阪崎肠杆菌分类学及命名的发展历史
• 阪崎肠杆菌的发现及其命名历史
– 1929年Pangalos报道的一种引起婴儿败血症的产 黄色素的大肠菌，称为“黄色大肠菌、黄色肠杆 菌”;
– 1961年Urmenyi和Franklin根据1958年发生在英国 奥尔本的两例新生儿死亡病理研究，在报道中描 述了其病因源于一种少见的产黄色素的阴沟肠杆 菌菌群，并取日本细菌学家Riichi Sakazaki的名 字作为该菌的名称;有人称之为：“Urmenyi和 Franklin杆菌”；
脑膜炎
小肠结肠炎
菌血症
我国对阪崎肠杆菌方面的管理规定
• 《关于对进口乳制品进行阪崎肠杆菌检测的通知》(国质 检食函[2005]690号)；
• 《关于加强进口乳制品检验检疫监督管理工作的通知》 国质检食函[2007]298号）；
• 《婴幼儿配方乳粉生产许可证审查细则》(2006、2008 版)
阪崎肠杆菌对配方粉的污染点、存活时间和传播线路
– 1965年Joker等分析了发生在丹麦的一个相同病例， 并报道该种菌可导致新生儿脑膜炎并产生神经损 伤，根据两起报道首次明确了该种病原菌为“非 典型的产黄色素的阴沟肠杆菌”.
– 直到1980年，Farmer等发表了题为 “Enterobacter sakazakii, new species of Enterobacteriaceae isolated from clinical specimens.”的文章，该菌才被统一命名并定义， 该篇文章是对阪崎肠杆菌研究的阶段性成果总结。
细菌分类方面的问题
• 种是生物分类中基本分类单位，是具有高 度特征相似性的菌株群，该菌株群与其它 类群的菌株有很明显的区别；
• 细菌学家和分类学家存在一定分歧； • DNA杂交同源性在60-70%以上，或
16SrRNA序列同源性达到97%以上的菌株， 被认为是同一种。
阪崎肠杆菌的分类学变化
• 16SrRNA序列同源性在 细菌分类学上的重要作用
“系统与进化微生物学国际期刊（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSB）”
记录新细菌类群包括分类、命名、鉴定和系统发育的官方杂志
克罗诺杆菌属（Cronobacter spp.）
包括5个新种,（其中Cronobacter sakazakii称为新组合）、1个克罗诺 杆菌基因种（genomospeciese）和三个新亚种.
• 建议将阪崎肠杆菌重新分类命名，成为肠杆菌科1个新属，即克罗 诺杆菌属（Cronobacter spp.）包括5个新种（其中Cronobacter sakazakii称为新组合）、1个克罗诺杆菌基因种 （genomospeciese）和三个新亚种，在该杂志通知清单上 （2008年，58卷，第6部分）1个新属、5个新种和三个新亚种已 公布。
阴沟肠杆菌 阪崎肠杆菌
• 阪崎肠杆菌为新种的分类 依据
– 统一了该菌的名称；
– 确证了“产黄色素的阴沟肠 杆菌”是一个新种，而不是 阴沟肠杆菌的一个生物群。
依据什么？
DNA相关性 产黄色素 生化试验 抗生素易感性
细菌不同株属于同一种水平 DNA的相关性通常应在70% 或更高
DNA相关性实验
DNA相关性：同种70%；其它70%；支持克罗诺杆菌应由不 同种组成的说法
克罗诺杆菌及相近种细菌的16SrRNA基因进化树
克罗诺杆菌属（Cronobacter spp.）
Cronobacter sakazakii，仍以日本细菌学家名字命名，中文应为阪崎克罗诺 杆菌；
Cronobacter malonaticus，“malonaticus”意为可利用丙二酸盐，中文应为 丙二酸盐阳性克罗诺杆菌；
阪崎肠杆菌重新分类的依据及结果
• 重新分类的依据：
– 的扩增片段长度多态性分析（Amplified fragment length polymorphismas, AFLP）
– 16S rRNA全序列比较 – DNA- DNA杂交实验结果。
• 2008年Iversen等在记录新细菌类群包括分类、命名、鉴定和系统 发育的官方杂志“国际期刊系统与进化微生物学（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSB）” 上发表文章。
阪崎肠杆菌的重视程度
• 《CODE OF HYGIENIC PRACTICE FOR POWDERED FORMULAE FOR INFANTS AND YOUNG CHILDREN》 CAC/RCP 66 - 2008替代 CAC/RCP 21-1979 – 由争论到定论 – 给出了制定阪崎肠杆菌监控计划的指南
ATCC29544
阴沟肠杆菌
差异柠檬酸杆菌
51% 51%
生化试验
• 不利用山梨醇 • 36C下培养7d，DNA酶为阳性
Farmer实验结论
• 阪崎肠杆菌与阴沟肠杆菌不是同一个种； • 阪崎肠杆菌生化反应与肠杆菌属细菌更
为相近； • 阪崎肠杆菌应作为一个独立种，归属于
肠杆菌属，鉴于所分离出的阪崎肠杆菌 之间也有差异，被分成15个生物型或群。
Cronobacter turicensis，“turicensis”是瑞士苏黎世的拉丁文名字，中文应为 苏黎世克罗诺杆菌；
Cronobacter muytjensii，“muytjensii”即Muytjens，是荷兰著名微生物学家， 早期从事过大量阪崎肠杆菌方面的研究工作，中文穆汀斯克罗诺杆菌；
• 监控时间：2005.4—2006.3 • 分离出阪崎肠杆菌：80株 • 中间产品和终产品的阳性检出率：2.5% • 阳性样品检出点占全部取样点的比例：31%
第一部分：阪崎肠杆菌的分类学变化
• 阪崎肠杆菌分类学及命名的发展 历史
– 阪崎肠杆菌的发现及其命名历史 – 阪崎肠杆菌为新种的分类依据
• 克罗诺杆菌分类学、词源学及其 属和ຫໍສະໝຸດ Baidu生物学特性