酵母遗传
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(2)酵母附加体质粒载体(YEp)
3. 酵母菌复制载体 4.酵母着丝粒载体 5.酵母的人工染色体(YAC)
载体首先被BamHI和SnaBI酶 切将分子切成三块,BamHI 片段被去掉,剩下两个臂, 每一臂都已TEL作为末端,另 一端是SnaBI位点。克隆的 DNA必须是平端(SnaBI也是 一个平端酶,识别序列是 TACGTA)被连接在两个臂的 中间就产生了人工染色体。 利用原生质转化法将人工染 色体引入酵母。受体酵母是 利用一个双营养缺陷体trp1ura3,载体上含有互补基因 作为选择标记。转化后于基 本培养基上培养,只有含有 人工染色体的细胞可以正常 生长。含有两个左臂或者两 个右臂的染色体都不能正常 生长,因为其中一个选择标 记基因丢失,插入片段的鉴 定可以通过SUP4基因的插入 失活,白色的克隆是重组子, 红色的不是。
分类:L-dsRNA:编码自身和M型的蛋白外壳和RNA聚合酶 M-dsRNA:编码杀伤毒素蛋白,分泌到细胞外。
第四节 酵母基因表达的调控*
真核基因调控分两类: 1、瞬间调控(可逆性控制) 2、发育调控(不可逆性控制)
一. 酵母基因的启动子元件 所有启动子都包括3个基本的DNA序列元 件(顺式作用元件): 1)上游激活序列(UAS) 2)TATA元件 3)转录起始位点,有些酵母基因的启动子 还含有沉默子。
2. 嗜杀现象 1963年,Bevan和Makower发现酿酒酵母中某些 菌株可产生毒素而杀死其他酵母的现象。 嗜杀株(killer):产生毒素的菌株 敏感株:对毒素敏感的菌株 中性株:既不产毒素又不敏感的菌株 该特性由两种具有自我复制能力的细胞遗传因 子----双链线状RNA(dsRNA)决定的,它们通常以蛋 白质外壳包裹着的粒子状态存在于细胞之中,不具 有体外侵染的特性。也称为类病毒颗粒(viruslike particle).
在二倍体中 α2 蛋白 仍可合成,其功能 是: ① 阻遏 a- 交 配型特异基因群的 表达; ② 和 a1 相 互合作来阻遏 α1 的 及 hsg 的表达。 α1 不能合成就无法诱 导 α- 交配型特异基 因群的表达。 hsg 基因的阻遏就不能 合成阻遏减数分裂 和孢子形成的蛋白, 使二倍体特异基因 群得到表达,从而 可以进行减数分裂 及孢子形成。
来自百度文库
线粒体是真核细胞重要的代谢中心之一。 其DNA(mtDNA)编码自身所需的rRNA、 tRNA以一些蛋白质如细胞色素和ATP酶等。 1. 呼吸缺陷突变株-三类: 分离性小菌落:染色体上基因发生了突变 中性小菌落:完全丢失了线粒体DNA 抑制性小菌落:丢失了部分线粒体DNA
2. 酵母线粒体基因组的物理图谱及其特性
酵母菌遗传学
酵母菌概况
酵母菌是一类单细胞真菌,并非系统演化分类 的单元。 目前已知有1000多种酵母,根据酵母菌产生孢 子(子囊孢子和担孢子)的能力,可将酵母分成三类: 形成孢子的株系属于子囊菌和担子菌;不形成孢子 但主要通过芽殖来繁殖的称为不完全真菌,或者叫 “假酵母”。 目前已知大部分酵母被分类到子囊菌门。酵母 菌主要的生长环境是潮湿或液态环境,有些酵母菌 也会生存在生物体内。 1996年完成了酿酒酵母的全基因组测序,是真 核生物中第一个被测序的生物。
(1)酵母接合 型基因的转换
(1)酵母接合型基因的转换
酵母交配型转换的暗箱模型( cassette model ),提出 MAT 是活性暗盒( active cassette ),可以是 α 型,也可以是 a 型。 HML 和 HMR 是沉默暗盒( silent cassettes ),都不能表达。通常 HML 带 有 α 暗盒,而 HMR 带有 a 暗盒,所有的 暗盒都带有编码交配型的信息,但只有 MAT 可以表达。当活性暗盒信息被沉默 暗盒信息所取代时就发生了交配型转换。
MATa 和 MATα 基因编码调节蛋白
α 细胞含有很多的“ α- 特异性蛋白”, 而 a 细胞含有一套“ a- 特异性蛋白”。 MAT 座位的基本功能是控制外激素和受 体基因以及其他和交配有关基因的表达, 每种类型的座位编码一些调节蛋白。 MATα 编码两种调节蛋白: α1 和 α2 MATa 只编码一种调节蛋白 a1 。
(2)ARS-结合蛋白:可能起始酿酒酵母的复制。 起始识别复合物(ORC):与A、B区结合,可 能使复制起始蛋白。Abf1p与蛋白结合可提高 复制效率。 (3)ARS启动染色体复制的活性 有些ARS在原染色体上无自主复制活性,而克 隆到质粒中则具有活性?正在研究中。
第二节酵母线粒体基因组及其遗传
沉默暗盒和活性暗盒的结构
SIR基因产物关闭HML α和HMR a基因
原推则 HMLα 和 MHRa 之所以“沉默”是由于它们缺乏启动子, 但其实不然,因为 MATα 和 MATa 特异性 mRNA 的转录是在 Y 片段的内部起始的,而沉默暗盒和 MAT 暗盒中的 Y 序列是相同 的,必定具有相同的启动子。差不多在同一时期遗传学家们发现 了 4 个不连锁的沉默信息调节基因 SIR ( silent information regulator ) 1 、 2 、 3 和 4 ,这些基因产物共同起反式作用(它 们并不在同一条的染色体上)来阻止沉默暗盒中的基因表达。若 这 4 个 SIR 基因中任何一个基因失去作用的话,那么 HMLα 和 HMRa 基因同样可转录。为了寻找 SIR 产物的作用位点,首先通 过体外诱变在 HMRa 和 HMRα 中产生缺失,然后利用 DNA 转化 的方法将缺失的 DNAs 插入合适的酵母菌株中看看是否能表达, 从而确定 SIR 蛋白结合位点。
(2)接合型转换机理
转换过程中受体位点( MAT )被转变成 供体型的序列( HML 和 HMR )。 MAT 的突变可阻止交配型转换鉴别出转换所 需的位点。通过 HML 或 HMR 中的缺失 突变发现了这个转变过程具有单向性的 特点。
第六节 酵母菌的载体系统
1. 克隆载体 (1)酵母整合型载体 (2)酵母附加体质粒载体(YEp)
YAC载体的使用:
一些哺乳动物的基因大于100kb超过了大肠杆菌载 体系统的承受范围,但正好在YAC载体的范围之内。 研究发现,在某些情况下,YACs可以在哺乳动物中表 达,因此可以在基因存在的生物中研究基因的功能。 YACs在构建基因文库中非常重要,最高容量的大 肠杆菌质粒可以插入300kb的片断,对于人的基因文库 需要30000个克隆,而YACs可以克隆600kb的片段,一 些类型可以携带1400kb片段,可以使人类基因文库的 克隆数降至6500个。虽然,”mega-YACs”存在着不稳 定性,克隆的DNA片段可以被重新排列。但是,YACs 在大规模的测序中是非常有用的。
二.酵母菌的染色体
1.核小体:DNA和组蛋白(H2A、H2B、H3和H4) 酿酒酵母中无H1(有丝分裂中维持染色质的高度超螺旋) 2.着丝粒(centromere):点着丝粒和区域着丝粒 3.端粒(telomere):末端重复序列和蛋白质 4.复制起点:控制DNA复制起始的一段DNA序列—ARS ARS若克隆到质粒中,可使质粒DNA在酵母中自主复制。 1)ARS的结构 A:ACS在所有的ARS都完全相同或相似 ARS B:ACS的3’末端 C:ACS的5’末端,富含AT,C之间无同源性,无共有序列
主要内容
一、酵母菌的基因组和染色体 二、酵母线粒体基因组及其遗传 三、酵母菌中的质粒 四、酵母基因表达的调控 五、接合型基因及其基因型转换 六、酵母菌的载体系统
第一节酵母菌的基因组和染色体
一.酵母菌的基因组 酵母中编码RNA或蛋白质的大约2600个基因。 通过对酿酒酵母的完整基因组测序,发现在 12068kb的全基因组序列中有5885个编码专一性蛋白 质的开放阅读框(ORF)。这意味着在酵母基因组中 平均每隔2kb就存在一个编码蛋白质的基因,即整个 基因组有72%的核苷酸顺序由开放阅读框组成。 这说明酵母基因比其它高等真核生物基因排列紧 密。
接合子基因营救:野生型 细胞能为缺陷的小菌落基 因组提供有功能的蛋白翻 译系统,那么它们杂交产 生的接合子就能够表达该 小菌落基因组携带的基因。 特点: 1)大多数mtDNA(线粒体 DNA)中无重复核苷酸序 列—重要特点 2)半自主性
图7-7
第三节 酵母菌中的质粒
1. 2μm质粒:双链、环状DNA、50-100个拷 贝,不赋予宿主细胞遗传表型,属于隐蔽质 粒。 最显著的特点:两个反向重复顺序(IR ), 其上有FRT(专一性重组位点),它们被一 个较大的单一区(约2.7kb)和一个较小的单 一区(约2.3kb)隔开。FRT重组产生两种构 型的质粒,即A型和B型。
3 . E L 和 E R 位点缺失突变分析表明在各个 HML 和 HMR 的上游具有阻遏它们表达的位点, 此靶位点有时称为 E 沉默子和 I 沉默子,或 E L ( near HML )和 E R ( near HMR )。控制 位点具有 2 个特点: ① 它们具有负的增强子 的作用,它们能对远隔 2 ~ 5Kb 的启动子发挥 作用,而且没有方向性,所以它们被称为沉默 子( silencers ); ② 它们和可能具有复制起点 作用的 ASR 序列相联 。
2. 酿酒酵母细胞分裂的遗传调 控
减数分裂 有丝分裂
(1)a和α 单倍体细胞
(2)接合信息素信号的传递
(3)接合型基因MAT在接合过 程中的调控
3. 接合型基因的转换
某些酵母有转换交配型的能力,即从 a 型变成 为 α 型,或从 α 型转变为 a 型。这些品系带 有显性等位基因 HO 并频繁地改变它们的交配 型(常常每代改变一次),带有隐性等位基因 ho 的品系有一个稳定的交配型,其交配型改 变的频率仅约 10 -6 。转换的存在表明所有的细 胞都含有 MATa 和 MAT α 型的潜在信息, MATα 和 MATa 同在一条染色体上, 。
酵母作为模式生物的作用
酵母作为高等真核生物特别是人类基因组研究 的模式生物,其最直接的作用体现在生物信息学 领域。 当人们发现了一个功能未知的人类新基因时, 可以迅速地到任何一个酵母基因组数据库中检索 与之同源的功能已知的酵母基因,并获得其功能 方面的相关信息,从而加快对该人类基因的功能 研究。 研究发现,有许多涉及遗传性疾病的基因均与 酵母基因具有很高的同源性,研究这些基因编码 的蛋白质的生理功能以及它们与其它蛋白质之间 的相互作用将有助于加深对这些遗传性疾病的了 解。
二、酵母的表达载体 三、酵母的分泌载体
2.酵母的转录调控因子 (1)TATA区结合蛋白 成环假说 (2)GAL4转录因子和gal基因的表达调控
(3)GCN4转录调控因子 (4)HAP1、HAP2和HAP3 (5)α1、α2和a1调节蛋白
第五节 接合型基因及其基因型转换
1. 酿酒酵母 的生活史
酵母的同宗配合和异宗配合