实验一、DNA提取
实验细菌基因组DNA的提取
原
因
1. 材料不新鲜或反复冻
融
2. 未很好克制内源核酸 酶旳活性
3. 提取过程操作过于剧
对 策
烈,DNA被机械打断
4. 外源核酸酶污染
5. 反复冻融
1. 尽量取新鲜材料,低温保存材料防 止反复冻融
2. 液氮研磨或匀浆组织后,应在解冻 前加入裂解缓冲液
3. 在提取内源核酸酶含量丰富旳材料 旳DNA时,可增长裂解液中螯合剂 旳含量
如:苯酚、氯仿、盐酸胍、DEPC
核酸制备中常用旳酶
DNase RNase 蛋白酶K 溶菌酶
核酸提取旳一般过程 1)破碎细胞(预防核酸酶旳作用)
微生物:溶菌酶、SDS裂解。 高等植物:捣碎器破碎、液氮研磨。
酶法:蛋白酶,如胰蛋白酶, 冰冻法:反复冻融或液氮冻后组织捣碎。 动物:液氮处理后用匀浆器破碎。 细胞器DNA:首先纯化细胞器。
一、试验原理
2、核酸制备旳一般原则
分离纯化核酸总旳原则: ①应确保核酸一级构造旳完整性; ②排除其他分子旳污染。
核酸纯化应到达旳要求: ①核酸样品中不应存在对酶有克制作用旳有机溶剂和过高 浓度旳金属离子; ②其他生物大分子旳污染应降低到最低程度; ③排除其他核酸分子旳污染。
一、试验原理
3、核酸制备旳一般原则
一、试验原理
4、核酸制备旳一般措施和原理
核酸酶旳克制和克制剂 降低温度,变化pH及盐旳浓度,都利于对核酸酶
活性旳克制,但均不如利用核酸酶克制剂更有利,当 然,几种条件并用更加好。
对于DNA,克制DNase活力很轻易,但预防机械 张力拉断则更主要。
对于RNA,因分子较小,不易被机械张力拉断, 但克制RNase活力较难,故在RNA提取中设法克制 RNase更主要。
植物dna提取实验报告(一)
植物dna提取实验报告(一)植物DNA提取实验报告简介•DNA提取是分子生物学中常用的实验技术之一•本实验的目的是从植物组织中提取纯净的DNA•DNA提取技术的应用广泛,可用于基因测序、基因分型等研究实验步骤1.样品准备–选择新鲜的植物叶片或根部组织作为样品–将样品冷冻在液氮中,研磨成粉末状2.细胞破碎–加入适量的提取缓冲液,研磨样品使细胞破碎–通过高速离心将碎细胞沉淀3.蛋白质去除–加入蛋白酶,去除蛋白质,并通过离心去除残留的碎细胞和蛋白质4.DNA沉淀–加入盐和酒精,使DNA从溶液中沉淀–通过离心收集DNA沉淀物5.DNA纯化–使用乙酸溶解DNA沉淀物–通过离心去除残留的盐和溶液6.DNA浓缩–加入适量的去离子水,使DNA溶解并浓缩结果分析•提取得到的DNA质量和纯度可通过分光光度计测定•纯净的DNA可用于后续实验,如PCR扩增、酶切等实验注意事项•使用无菌操作,避免DNA样品被污染•严格控制实验中的时间和温度,以避免DNA降解•质量好的试剂和实验器材对提取纯净的DNA至关重要结论•通过本实验,成功从植物组织中提取了纯净的DNA•DNA提取技术对于分子生物学研究具有重要意义•进一步研究和应用可拓展DNA提取技术的潜力注意:本实验报告为虚构文章,仅供参考实验结果与讨论本实验成功从植物组织中提取到了纯净的DNA。
经过分光光度计测定,确认提取得到的DNA具有良好的质量和纯度,可以用于后续的实验。
在实验过程中,我们注意到了一些现象和问题,需要进行进一步的讨论。
首先,样品的选择对DNA提取的结果至关重要。
我们在实验中选择了新鲜的植物叶片或根部组织作为样品,这些组织中含有丰富的细胞核,并且相对较容易破碎,有利于DNA的提取。
值得注意的是,样品的存储和处理过程中要避免DNA的降解,所以在样品准备过程中使用液氮对样品进行冷冻,并且将其研磨成粉末状,有助于细胞破碎和DNA的释放。
其次,细胞破碎是DNA提取的关键步骤之一。
基因组dna提取实验报告
基因组dna提取实验报告基因组 DNA 提取实验报告一、实验目的本次实验的主要目的是从不同的生物样本中提取高质量的基因组DNA,以便进行后续的分子生物学实验,如 PCR 扩增、基因测序等。
通过本次实验,掌握基因组 DNA 提取的基本原理和操作方法,了解影响 DNA 提取质量的因素,并对提取的 DNA 进行质量检测和分析。
二、实验原理基因组DNA 提取的基本原理是利用细胞裂解液破坏细胞膜和核膜,使细胞内的物质释放出来,然后通过蛋白酶 K 消化蛋白质,去除 RNA 等杂质,再利用酚/氯仿等有机溶剂抽提,将蛋白质、多糖等杂质去除,最后通过乙醇沉淀或异丙醇沉淀得到纯净的基因组 DNA。
三、实验材料与试剂(一)实验材料1、新鲜的动物组织(如肝脏、肌肉等)2、植物叶片3、细菌培养物(二)实验试剂1、细胞裂解液(含 TrisHCl、EDTA、NaCl、SDS 等)2、蛋白酶 K3、酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)4、无水乙醇5、 70%乙醇6、 RNA 酶 A7、 3M 醋酸钠(pH 52)8、 TE 缓冲液(10 mM TrisHCl,1 mM EDTA,pH 80)(三)实验仪器1、离心机2、移液器3、恒温水浴锅4、紫外分光光度计5、电泳仪及电泳槽四、实验步骤(一)动物组织基因组 DNA 提取1、取约 01g 新鲜的动物组织,放入 15ml 离心管中,加入 1ml 细胞裂解液,用剪刀将组织剪碎,然后在冰上放置 10min。
2、向离心管中加入20μl 蛋白酶 K(20mg/ml),充分混匀,在 55℃水浴锅中孵育过夜,直至组织完全消化。
3、加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),轻轻颠倒离心管10min,使溶液充分混匀。
4、 12000rpm 离心 10min,将上清液转移到新的离心管中。
5、重复步骤 3 和 4 一次。
6、向上清液中加入 1/10 体积的 3M 醋酸钠(pH 52)和 2 倍体积的无水乙醇,轻轻颠倒离心管,可见白色的 DNA 沉淀出现。
实验一 DNA提取
实验一DNA的小量制备小量法提取植物基因组DNA(CTAB法)1 实验目的:随着基因工程等分子生物学技术的迅速发展及广泛应用,人们经常需要提取高分子量的植物DNA,用于构建基因文库、基因组southern 分析、酶切及克隆等,这是研究基因结构和功能的重要步骤。
本实验目的是学习从植物材料中提取和测定DNA 的原理并掌握CTAB 提取DNA 的方法,进一步了解DNA 的性质。
2 实验原理细胞中的DNA 绝大多数以DNA-蛋白复合物(DNP)的形式存在于细胞核内。
提取DNA 时,一般先破碎细胞释放出DNP,再用含少量异戊醇的氯仿除去蛋白质,最后用乙醇把DNA 从抽提液中沉淀出来。
DNP 与核糖核蛋白(RNP)在不同浓度的电解质溶液中溶解度差别很大,利用这一特性可将二者分离。
以NaCl 溶液为例:RNP 在0.14mol/L NaCl中溶解度很大,而DNP 在其中的溶解度仅为纯水中的1%。
当NaCl 浓度逐渐增大时,RNP的溶解度变化不大,而DNP 的溶解则随之不断增加。
当NaCl 浓度大于1mol/L 时,DNP的溶解度最大,为纯水中溶解度的2 倍,因此通常可用1.4mol/L NaCl 提取DNA。
为了得到纯的DNA 制品,可用适量的RNase 处理提取液,以降解DNA 中搀杂的RNA。
关于植物总DNA 的提取主要有两种方法:1.CTAB 法:CTAB(十六烷基三甲基溴化铵,hexadecyltrimethylammonium bromide, 简称CTAB):是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/LNaCl)是可溶的,当降低溶液盐的浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB 与核酸的复合物同蛋白、多糖类物质分开,然后将CTAB 与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液中,再加入乙醇使核酸沉淀,CTAB 能溶解于乙醇中。
dna提取及测定实验报告
dna提取及测定实验报告DNA 提取及测定实验报告一、实验目的本次实验的主要目的是掌握从生物样本中提取 DNA 的方法,并对提取的 DNA 进行浓度和纯度的测定,以了解样本中 DNA 的质量和数量。
二、实验原理DNA 是遗传信息的携带者,存在于细胞核和线粒体等细胞器中。
在提取 DNA 的过程中,需要破碎细胞,使 DNA 释放出来,然后通过一系列的化学和物理方法去除蛋白质、RNA 等杂质,从而获得纯净的DNA 。
DNA 在 260nm 处有特征性的吸收峰,其吸收值与 DNA 的浓度成正比。
同时,通过测定 260nm 和 280nm 处的吸光度比值(A260/A280),可以评估 DNA 的纯度。
纯 DNA 的 A260/A280 比值约为 18。
三、实验材料和仪器1、实验材料新鲜的动物肝脏组织裂解液(包含 TrisHCl、EDTA、NaCl 等)蛋白酶 K无水乙醇氯仿:异戊醇(24:1)RNA 酶TE 缓冲液(TrisHCl、EDTA)2、实验仪器高速冷冻离心机移液器恒温水浴锅紫外分光光度计微量移液器离心管玻璃棒四、实验步骤1、样本处理称取约 05g 新鲜的动物肝脏组织,用剪刀剪碎后放入匀浆器中,加入适量的裂解液,充分匀浆。
2、消化蛋白质将匀浆液转移至离心管中,加入蛋白酶 K 至终浓度为100μg/ml,在 55℃水浴锅中孵育 1-2 小时,期间不时轻轻搅拌,以充分消化蛋白质。
3、去除蛋白质和 RNA加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),轻轻颠倒离心管充分混匀,然后在 4℃下以 12000rpm 离心 15 分钟。
吸取上清液至新的离心管中,加入 2 倍体积的无水乙醇,轻轻颠倒离心管,可见白色的 DNA 沉淀出现。
4、洗涤 DNA将沉淀用 70%的乙醇洗涤 2 次,每次在 4℃下以 12000rpm 离心 5 分钟,去除上清液。
5、溶解 DNA待乙醇挥发干净后,加入适量的 TE 缓冲液溶解 DNA ,置于 4℃冰箱保存备用。
dna提取实验报告分析
dna提取实验报告分析DNA 提取实验报告分析一、实验背景DNA 作为生物体内的遗传物质,携带着生物体生长、发育、繁殖等重要的遗传信息。
对 DNA 的提取和分析在生物学、医学、法医学等领域都具有极其重要的意义。
通过提取DNA,我们可以进行基因测序、疾病诊断、亲缘关系鉴定等一系列研究和应用。
二、实验目的本次实验的主要目的是从给定的生物样本中提取高质量的 DNA,并对提取的结果进行分析和评估,以确定提取方法的有效性和所提取DNA 的纯度、浓度等指标。
三、实验材料与方法(一)实验材料1、新鲜的植物叶片(如菠菜叶)或动物组织(如鸡血)。
2、提取试剂盒(包含裂解液、蛋白酶、缓冲液、吸附柱等)。
3、无水乙醇、异丙醇等有机溶剂。
4、移液器、离心机、涡旋振荡器等实验仪器。
(二)实验方法1、样本处理植物样本:取适量新鲜的植物叶片,洗净擦干,剪碎后放入研钵中,加入液氮迅速研磨成粉末状。
动物样本:取适量新鲜的动物组织,用生理盐水洗净,剪碎后放入匀浆器中,加入适量裂解液匀浆。
2、细胞裂解将处理好的样本转移至离心管中,加入适量的裂解液和蛋白酶,充分混匀,在一定温度下孵育一段时间,使细胞充分裂解,释放出DNA。
3、 DNA 分离与纯化向裂解液中加入适量的缓冲液,调整溶液的盐浓度和 pH 值,使DNA 与蛋白质等杂质分离。
将溶液转移至吸附柱中,离心使 DNA 吸附在吸附柱的膜上,而杂质则被离心去除。
用洗涤液对吸附柱进行多次洗涤,去除残留的杂质。
4、 DNA 洗脱向吸附柱中加入适量的洗脱液,离心使DNA 从吸附柱上洗脱下来,收集洗脱液即为提取的 DNA 溶液。
四、实验结果与分析(一)DNA 浓度测定使用紫外分光光度计测定提取的 DNA 溶液在 260nm 和 280nm 处的吸光度值(A260 和 A280)。
根据公式:DNA 浓度(μg/μL)= A260× 50 ×稀释倍数,计算出 DNA 的浓度。
通常,A260/A280 的比值在 18 20 之间表示 DNA 的纯度较高。
DNA实验流程范文
DNA实验流程范文一、DNA提取1.收集样品:选择需要提取DNA的样品,如细菌、动物或植物组织等。
2.细胞破碎:将样品研磨或切碎,使细胞破碎释放DNA。
3.细胞溶解:将破碎的样品加入溶解液,溶解细胞膜和细胞器膜。
4.蛋白酶处理:加入蛋白酶,消化细胞蛋白质,释放DNA。
5.DNA沉淀:加入盐溶液,将DNA沉淀到溶液底部。
6.洗涤:反复用酒精洗涤DNA沉淀,去除杂质。
7.DNA溶解:用适量的缓冲溶液溶解DNA。
二、DNA纯化1. 加入酶:加入RNase(核糖核酸酶)酶,消化DNA上的RNA。
2.加入盐溶液:加入盐溶液,使DNA释放出来形成沉淀。
3.洗涤:用酒精洗涤DNA沉淀,去除杂质。
4.脱水:将洗涤后的DNA沉淀在常温下干燥。
三、DNA扩增(PCR)1.反应混合物制备:将待扩增的DNA样品与引物(特异性序列)和PCR反应缓冲液混合。
2.反应条件设定:设置PCR反应的温度和时间条件。
3.PCR反应:在PCR仪中进行循环反应,包括依次升温、降温、保温等步骤,在每个循环中让DNA的两条链分离,并在合适的温度下进行DNA 合成。
4.PCR产物检测:将PCR产物进行电泳分析,观察是否得到了目标DNA片段。
四、测序1.测序混合物制备:将PCR产物与引物和测序反应缓冲液混合。
2. 测序反应:将测序混合物放入测序仪中,通过荧光标记的 ddNTP (二氧异链苷酸)与待测序的DNA链末端的碱基进行连接。
3. 信号检测:测序仪会记录下每个ddNTP的荧光信号,并将其转化为序列。
五、序列分析1.序列校对:将测序仪测得的荧光信号转化为序列,并与参考序列进行比对,校对测序的准确性。
2.序列剪切:去除测序前后的引物序列。
3.序列分析:将测得的序列进行进一步的分析,如比对数据库相似序列、预测蛋白质编码区域等。
六、结果解读和报告1.分析结果:结合序列分析结果,解读DNA的特征和功能。
2.结果报告:将实验结果整理成报告,包括序列数据、分析结果和结论。
提取和分析DNA实验报告
提取和分析DNA实验报告DNA提取是生物学实验中的重要步骤,有助于从各种生物组织中分离出DNA并进行后续分析。
本实验旨在提取DNA样本,并通过凝胶电泳等方法对提取得到的DNA进行分析,以验证提取的DNA质量和纯度。
1. 实验材料与仪器实验所需材料包括DNA提取试剂盒、离心管、显微管、琼脂糖凝胶、电泳槽等。
实验仪器包括显微镜、电泳仪等。
2. 实验步骤(1)样本处理:将待检测样本加入DNA提取试剂盒中,根据试剂盒说明书进行细胞破碎、蛋白酶处理等步骤,将DNA溶解于缓冲液中。
(2)DNA沉淀与收集:通过离心加速DNA沉淀的过程,最终在离心管底部形成DNA沉淀。
(3)洗涤与溶解:分离DNA沉淀后,进行多次洗涤,并最终将DNA溶解于适量缓冲液中。
(4)凝胶电泳分析:在琼脂糖凝胶中进行凝胶电泳,通过电场作用使DNA在凝胶中移动,根据DNA条带特征分析样本DNA的大小和纯度。
3. 实验结果与分析通过凝胶电泳结果可以清晰地观察到不同大小的DNA条带,根据标准DNA分子量Marker的位置,可以估算待测DNA片段的大小。
如果实验操作正确,提取得到的DNA应具有良好的纯度和完整性,且无附加杂质。
若实验存在操作失误或污染等问题,则可能导致DNA提取不完整或DNA受损,影响到后续结果的准确性。
4. 实验总结与展望DNA提取与分析是生物学研究中不可或缺的重要环节,有效的DNA提取和分析技术能够为后续实验提供可靠的数据基础。
在今后的实验中,我们将进一步完善实验操作技巧,提高DNA提取的效率和准确性,以应对更复杂的研究需求。
通过本次实验,我们成功实现DNA的提取与分析,验证了实验设计的有效性,并积累了丰富的操作经验,为今后的生物学研究工作奠定了基础。
DNA提取实验的重要性在于为科研和临床诊断提供了坚实的理论支持和实验数据,为生命科学领域的发展和进步发挥着重要作用。
DNA提取与分析实验的成功展示了科学实验的严谨性和方法的重要性,同时也提醒我们在实验操作中应保持谨慎与耐心,以获得准确可靠的实验结果。
dna的粗提取实验报告
dna的粗提取实验报告DNA的粗提取实验报告引言DNA(脱氧核糖核酸)是生物体中负责遗传信息传递的分子,它的提取是进行分子生物学实验的基础步骤之一。
本实验旨在通过简单的方法提取DNA,并观察提取效果。
材料与方法材料:- 植物组织(如洋葱、豆芽等)- 高渗盐溶液(含有盐分的溶液,如食盐溶液)- 咖啡过滤纸- 酒精(酒精浓度为70%)- 水方法:1. 将植物组织切碎,使细胞破裂,释放DNA。
2. 将切碎的植物组织放入一个容器中,加入高渗盐溶液,搅拌均匀。
3. 将搅拌后的溶液过滤,使细胞碎片和其他杂质被滤掉,得到澄清的液体。
4. 将澄清的液体倒入一个试管中,加入等量的酒精,并缓慢倾斜试管,使酒精与液体缓慢混合。
5. 观察酒精与液体的交界面,可以看到白色的DNA沉淀。
6. 使用酒精漂浮在DNA沉淀上方的方法,将DNA转移到另一个容器中。
7. 加入适量的水,溶解DNA。
结果与讨论通过上述方法,我们成功地从植物组织中提取到了DNA。
观察到的白色沉淀物就是DNA,其形状呈线状或颗粒状。
实验过程中,我们注意到以下几个现象:1. 细胞破裂:切碎植物组织的过程中,细胞膜被破坏,使DNA从细胞内释放出来。
这一步骤的重要性在于提供了DNA的来源。
2. 高渗盐溶液:高渗盐溶液的作用是破坏细胞膜和核膜,使DNA从细胞内释放出来。
高渗盐溶液中含有盐分,可以改变细胞内外的渗透压,进而破坏细胞膜和核膜。
3. 过滤:通过过滤,我们可以去除细胞碎片和其他杂质,得到澄清的液体。
这一步骤的目的是减少后续操作中DNA沉淀的杂质。
4. 酒精沉淀:加入酒精后,DNA会从溶液中沉淀出来。
酒精与溶液的混合过程中,DNA会聚集在交界面上形成白色沉淀物。
这是因为DNA在酒精中不溶,而且比较重,所以会沉淀下来。
5. DNA的溶解:将DNA从酒精中转移到水中后,加入适量的水,使DNA溶解。
DNA在水中溶解后,呈现出透明的溶液。
本实验采用的是粗提取方法,所得到的DNA并不纯净。
质粒DNA提取+电泳+质粒酶切实验报告
实验一:质粒DNA提取+琼脂糖凝胶电泳*实验目的:1.掌握质粒DNA提取的基本原理和方法2.掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法*实验原理:1.DNA提取原理1)DNA提取要求:①保证DNA一级结构的完整性;②排除其他分子的污染,使其纯度尽可能提高。
2)DNA样品来源:①培养细胞;②组织样本;③血液样本。
3)主要试剂和材料及仪器:试剂和材料:RNA酶A、细胞悬浮液(Buffer P1)、细菌裂解液(Buffer P2)、中和液(Buffer P3)、漂洗液PW1、漂洗液PW2、洗脱液、质粒DNA吸附柱、滤液收集管仪器:微量移液器、台式微量高速离心机、电泳仪、水平电泳槽、紫外透射仪或凝胶成像系统。
2.电泳原理:1)概念:电泳是指带电粒子在电场中向电势降低的方向移动的现象,移动速度与粒子大小及所带电荷多少有关。
在一定pH条件下,核酸及蛋白质等生物分子呈带电状态,可以进行电泳分析。
2)迁移方向:DNA由负极向正极迁移3)影响目标物迁移速率的因素:分子大小、构象、凝胶浓度、琼脂糖种类、电泳缓冲液、嵌入染料的存在和使用电压等。
4)荧光强度(得率):荧光的强度是同DNA片段的大小或数量成正比的。
5)琼脂糖凝胶电泳原理:(1)关于电泳技术:电泳常用于分离和纯化那些分子大小电荷性状或分个构象有所不同的生物大分子一尤其是蛋白质和核酸。
正因为如此,电泳已成为生物化学和分子生物学中应用最为广泛的技术之一,其中在分子生物学实验中最为常用的是琼脂糖凝胶电泳。
琼脂糖是一种海藻多糖,琼脂糖胶分离范围很大,但其分辨率却相对较低。
通过改变琼脂糖凝胶的浓度,应用标准的电泳技术可以分离200到50,000 bp大小的DNA片断。
一般琼脂糖胶浓度在0.5%到4%之间,琼脂糖凝胶浓度越大,凝胶就越硬。
较高浓度的琼脂糖胶有利于较小的DNA片断分离,而较低浓度的琼脂糖胶则可以分离较大的DNA片断。
(2)琼脂糖凝胶电泳条带的观察:通过观察示踪染料的迁移距离可以判断DNA的迁移距离。
实验一碱变性法抽提质粒DNA
03 实验步骤
准备实验材料
实验器材
离心管、离心机、移液器、磁力搅拌器、恒温水 浴锅等。
试剂
细胞培养基、细胞裂解液、质粒DNA洗涤液、TE 缓冲液等。
质粒DNA标准品
用于定量和验证实验结果。
细胞培养与收集
选择适当的细胞系进 行培养,确保细胞生 长旺盛。
将收集的细胞转移到 离心管中,离心去除 上清液,得到细胞沉 淀。
03
靠的结果。
实验注意事项
01
02
03
04
在操作过程中,要保持低温环 境,以防止DNA降解。
在加入试剂时,要保证试剂的 浓度和纯度,以避免对实验结
果的影响。
在操作过程中,要避免气泡的 产生,以免影响实验结果。
在操作过程中,要注意安全, 避免试剂溅出对皮肤和眼睛的
伤害。
实验总结与思考
01
通过实验,我们成功地使用碱变性法抽提了质粒 DNA,得到了较为纯净的质粒DNA。
质粒DNA的质量评估
总结词质量可靠
详细描述:通过质量评估,质粒DNA的质量可靠,可用于后续的PCR扩增和克隆实验。
05 注意事项与实验总结
实验注意事项
01
实验前确保所有仪器和器具已经消毒,并处于良好的工作状态。
02
在操作过程中,要避免DNA污染,尤其是来自细菌和PCR产物
的污染。
在加入试剂和操作步骤时,要保证准确性和一致性,以获得可
将裂解液转移到一个新的离心管中,加入等体积的酚-氯仿混合液,充分混合后离心, 取上层水相。
将水相转移到一个新的离心管中,加入适量的乙醇和盐溶液,充分混合后离心,去 除上清液。
用洗涤液洗涤沉淀,去除残留的盐离子和酚。
DNA提取实验报告
DNA提取实验报告实验报告:DNA提取实验一、引言DNA提取是生物学实验中常见且重要的步骤,可以从细胞或组织中分离出DNA分子,并将其用于后续的分子生物学研究。
DNA提取可以用于基因组测序、PCR、限制性酶切、基因重组等实验。
本实验旨在通过一系列步骤,从土壤样品中提取纯度较高的DNA。
二、材料与方法材料:1.细菌培养基和试管2.无菌吸管和无菌离心管3.无菌培养皿和微量移液器4.DNA提取试剂盒(包括溶液、溶剂和酶等)5.离心机和冷冻干燥机方法:1.准备土壤样品,将其称取0.5克加入细菌培养基中。
2.震荡培养皿,使土壤样品均匀悬浮在细菌培养基中。
3.将培养皿放入震荡器中,在37°C恒温下震荡培养24小时。
4. 从培养液中取出2ml用无菌离心管离心2分钟,根据菌落情况可调整离心时间。
5. 倒出上清液后,加入0.5ml TE溶液进行洗涤。
6. 离心2分钟后,倒出上清液,加入0.5ml溶胀液进行洗涤。
7. 在离心后,倒出上清液,加入0.5ml各种试剂进行洗涤和裂解。
8.将洗涤和裂解好的液体转移到另一个无菌离心管中,用冷冻干燥机中15分钟。
9.用无菌离心管接着进行DNA纯化、酶切和PCR等实验。
三、结果与讨论本实验成功从土壤样品中提取到了较高纯度的DNA,提取的DNA量为300ng/ul。
通过电泳检测,可以看到DNA条带较为清晰,没有明显的降解。
这说明提取步骤中的洗涤和裂解等操作都较为有效,成功地去除了样品中的杂质和抑制物,使得提取的DNA纯度较高。
此外,实验中使用的试剂盒也起到了很好的作用,提供了高效的DNA提取试剂和相关酶。
DNA提取实验中有几个关键的步骤,包括洗涤、裂解和纯化。
洗涤过程中,TE溶液可以有效去除土壤样品中的盐类和细胞残渣,溶胀液可以去除蛋白质和脂类等杂质。
裂解过程中,酶的作用可以有效裂解细胞壁和细胞膜,释放DNA分子。
纯化过程中,通过离心和冷冻干燥等操作,可以将DNA分子重积到离心管底部,并去除杂质。
实验报告DNA提取与纯化
实验报告DNA提取与纯化一、实验目的本次实验的主要目的是从给定的生物样本中提取并纯化 DNA,以获取高纯度、高质量的 DNA 样品,为后续的分子生物学实验,如 PCR 扩增、基因测序等提供可靠的材料。
二、实验原理DNA 存在于细胞核内,与蛋白质等物质结合形成染色质。
在提取过程中,需要通过细胞裂解、去除蛋白质和其他杂质等步骤来分离DNA。
细胞裂解可以使用物理方法(如研磨、超声破碎)或化学方法(如使用裂解液)。
去除蛋白质常用的方法有蛋白酶 K 消化和酚/氯仿抽提。
DNA 在一定浓度的盐溶液中可溶解,而在乙醇中会沉淀,利用这一特性可对其进行纯化。
三、实验材料与试剂(一)实验材料新鲜的动物组织(如肝脏、肌肉)或植物叶片。
(二)实验试剂1、细胞裂解液:包含 TrisHCl、EDTA、SDS 等成分,用于破坏细胞膜和核膜,释放 DNA。
2、蛋白酶 K:能分解与 DNA 结合的蛋白质。
3、酚/氯仿/异戊醇混合液:用于去除蛋白质。
4、无水乙醇、70%乙醇:用于沉淀和洗涤 DNA。
5、 NaCl 溶液:提供适当的离子强度。
6、 TE 缓冲液(TrisEDTA 缓冲液):用于保存 DNA。
(三)实验仪器1、离心机2、移液器3、恒温水浴锅4、涡旋振荡器5、冰箱6、紫外分光光度计四、实验步骤(一)样本处理1、动物组织:将新鲜的动物组织剪碎,放入匀浆器中,加入适量的裂解液,匀浆至组织完全破碎。
2、植物叶片:取适量新鲜叶片,液氮研磨成粉末,加入裂解液。
(二)细胞裂解1、将处理好的样本转移至离心管中,在 55℃水浴中孵育 1 2 小时,期间每隔一段时间轻轻涡旋振荡,以促进细胞裂解。
(三)去除蛋白质1、加入蛋白酶 K,使其终浓度达到一定值,在 55℃继续孵育 1 2小时。
2、冷却至室温后,加入等体积的酚/氯仿/异戊醇混合液,充分混匀,然后在离心机中以一定的转速离心一定时间。
3、吸取上清液至新的离心管中,重复酚/氯仿抽提步骤 1 2 次,直至中间层无白色蛋白质沉淀。
分子生物学实验一二报告
分子生物学实验一二报告实验一:DNA提取引言:DNA提取是分子生物学实验中的基础实验,通过提取DNA我们可以进一步进行分子生物学上的一系列实验。
DNA提取的目的是从细胞中分离出DNA,常用于构建基因库、PCR扩增等实验。
材料与方法:1.取一定数量的细胞样本,如细菌、植物、动物组织等。
2.加入细胞裂解缓冲液,将细胞破裂释放DNA。
3.加入蛋白酶K以降解蛋白质。
4.加入酒精使DNA沉淀,并用无菌纯水洗涤DNA沉淀。
5. 用Tris-EDTA缓冲液溶解DNA。
6.用紫外可见光谱仪检测DNA浓度和纯度。
结果与讨论:通过以上步骤,我们成功地从细胞中提取出了DNA。
观察到DNA溶液呈现典型的黄绿色,说明DNA浓度较高。
利用紫外可见光谱仪检测DNA的浓度和纯度,结果显示DNA浓度为2μg/μL,纯度(A260/A280)为1.8,表明提取的DNA质量良好。
实验二:PCR扩增引言:PCR全称聚合酶链式反应,是一种快速、特异性并且高灵敏度的DNA扩增技术。
PCR可以扩增出目标DNA的大量复制品,常用于基因克隆、基因突变分析等实验。
材料与方法:1.准备PCR反应体系,包括目标DNA,引物,聚合酶、缓冲液及dNTPs。
2.将反应体系加入PCR仪中,设置好反应条件(温度、时间)。
3.进行PCR扩增反应。
4.用琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。
结果与讨论:通过PCR扩增反应,我们成功得到了目标DNA的扩增产物。
在琼脂糖凝胶电泳中观察到明显的目标DNA条带,且相对应的分子量与预期一致。
这表明PCR扩增反应成功地复制出了目标DNA,并得到纯净的PCR产物。
结论:通过DNA提取实验,我们成功地从细胞中提取出了DNA,并通过PCR扩增技术得到了目标DNA的扩增产物。
这些结果验证了我们实验的有效性,并为后续的分子生物学研究奠定了基础。
附注:以上报告仅为示例,实际报告应根据具体实验结果和实验目的进行撰写。
实验报告DNA提取实验步骤及结果分析
实验报告DNA提取实验步骤及结果分析实验报告:DNA提取实验步骤及结果分析一、引言DNA提取是分子生物学研究中的关键步骤之一,能够从样本中纯化出DNA,用于后续的分析和实验。
本实验旨在探究DNA提取的步骤和方法,并对提取结果进行分析和评估。
二、实验步骤1. 样本准备:选择合适的样本进行DNA提取,如植物组织、动物组织或微生物培养物。
样本应储存于-80℃的冰箱中,以防止DNA降解。
2. 细胞破碎:将样本取出,加入细胞破碎缓冲液,使用均质机或研钵等方法将细胞破碎,使细胞膜被破坏,释放DNA。
3. 蛋白酶处理:加入蛋白酶,将样本中的蛋白质降解,以去除蛋白质的干扰。
4. 酚/氯仿提取:加入等体积的酚/氯仿混合液,混匀后离心,使混合液分为上下两层,上层为DNA上清液。
5. DNA沉淀:将DNA上清液转移至新离心管中,加入等体积的冷异丙醇,轻轻颠倒混匀,待DNA逐渐沉淀出来。
6. 洗涤:使用70%的乙醇洗涤DNA沉淀物,以去除异丙醇和其他杂质。
7. 重溶:将洗涤后的DNA沉淀物用适量的TE缓冲液重溶,使其溶解。
8. 定量和纯化:使用紫外可见分光光度计测定DNA的浓度,并使用凝胶电泳验证DNA的纯度和完整性。
三、结果分析通过以上步骤,我们成功提取了DNA,并进行了初步的纯化。
下面是对实验结果进行分析和评估:1. DNA提取效果评估:- 可见分光光度计测定DNA浓度:根据光度计读数,我们可以计算出DNA的浓度。
通常,越高的读数代表着更高的DNA浓度。
- 凝胶电泳:通过凝胶电泳,我们可以观察到DNA在琼脂糖凝胶上的迁移情况。
理想情况下,DNA应该呈现出清晰的条带,并且没有明显的降解现象。
2. 实验结果评价:- DNA浓度:根据光度计读数,我们可以评估DNA提取的效果。
如果浓度较高,说明提取效果较好;如果浓度较低,说明可能存在提取效果不佳或DNA被降解的情况。
- DNA完整性:通过观察凝胶电泳结果,我们可以评估提取的DNA是否完整。
dna提取实验报告
dna提取实验报告DNA提取实验报告。
实验目的,通过本实验,掌握DNA提取的基本原理和方法,了解DNA在生物学研究中的重要性。
实验材料和仪器,鸡蛋白、盐酸、乙醇、玻璃棒、试管、离心机、恒温水浴。
实验步骤:1. 取一只鸡蛋,打破蛋壳,将鸡蛋白倒入试管中。
2. 加入少量盐酸,轻轻摇匀,使鸡蛋白变得透明。
3. 将试管放入恒温水浴中,加热至60摄氏度,恒温10分钟。
4. 取出试管,用玻璃棒搅拌均匀,使蛋白凝固。
5. 加入同体积的乙醇,轻轻摇匀,观察到白色絮状物沉淀于试管底部。
6. 将试管放入离心机,离心5分钟,离心后可见白色DNA沉淀于试管底部。
实验结果与分析:通过以上实验步骤,成功从鸡蛋中提取出了DNA。
实验中,盐酸的作用是使蛋白质变得透明,加热则是使蛋白质凝固,乙醇的加入则有利于DNA的沉淀。
离心机的使用则能够使DNA更好地沉淀于试管底部。
通过本实验,我们不仅了解了DNA提取的基本原理和方法,也对DNA在生物学研究中的重要性有了更深刻的认识。
实验总结:DNA提取实验是生物学实验中的基础实验,通过本实验的操作,我们深入理解了DNA提取的原理和方法,也对DNA在生物学研究中的应用有了更直观的认识。
在今后的学习和科研中,我们将进一步深入研究DNA的结构和功能,探索更多关于DNA的奥秘。
实验注意事项:1. 实验中应注意个人安全,避免盐酸和乙醇的直接接触。
2. 恒温水浴的温度应控制在60摄氏度,避免过高温度损坏DNA。
3. 实验操作时应轻柔,避免对DNA的损伤。
通过本次实验,我们对DNA提取有了更深入的了解,也为今后的生物学研究打下了坚实的基础。
DNA作为生命的密码,其重要性不言而喻,希望通过我们的努力,能够揭开更多关于DNA的奥秘,为人类的生命科学研究做出更大的贡献。
实验一`植物DNA的提取及凝胶电泳分析
实验一、植物DNA的提取及凝胶电泳分析一、植物DNA的提取原理利用基因组DNA较长的特性,可以将其于细胞器或质粒等小分子DNA分离。
当加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团漂浮其中,可用玻璃棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,从而达到分离提取的目的。
分离基因组DNA应尽量在温和的条件下操作。
二、实验试剂CTAB 氯仿乙戊醇乙醇异丙醇酚NaAc Tris碱EDTA RnaseANaCl等三、操作步骤(一)简易提取1.在50ml带盖离心管(放在-20度预冷)中加入20ml提取缓冲液I,60℃水浴预热。
2.水稻幼苗或叶子5~10g,剪碎,在研钵中加液氮磨成粉状后立即倒入预热的离心管中,剧烈摇动混匀,60℃水浴保温30~60分钟(时间长,DNA产量高),不时摇动。
3.加入20ml氯仿/戊醇/乙醇溶液,颠倒混匀(需带手套,防止损伤皮肤),室温下静止5~10分钟,使水相和有机相分层(必要时可重新混匀)。
4.室温下5000rpm离心5分钟。
5.仔细移取上清液至另一50ml离心管,加入一倍体积异丙醇,混匀,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。
6.在1.5ml eppendorf 管中加入1ml TE。
用钩状玻璃棒捞出DNA絮团,在干净吸水纸上吸干,转入含TE的离心管中,DNA很快溶解于TE。
7.如DNA不形成絮状沉淀,则可用5000rpm离心5分钟,再将沉淀移入TE管中。
这样收集的沉淀,往往难溶解于TE,可在60℃水浴放置15分钟以上,以帮助溶解。
8.将DNA溶液3000rpm离心5分钟,上清液倒入干净的5ml离心管。
9.加入5μlRNaseA(10μg/μl),37℃10分钟,除去RNA(RNA对DNA的操作、分析一般无影响,可省略该步骤)。
10.加入1/10体积的3mol/L NaAc 及2×体积的冰乙醇,混匀,-20℃放置20分钟左右,使DNA形成絮状沉淀。
实验一---DNA提取
天然状态的DNA 是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存在于细胞核 中。要从细胞中提取DNA时,先把DNP抽提出来,再把蛋白质 和糖去除,同时除去RNA及无机离子等,从中分离DNA 。
提取植物 DNA 的方法主要采用 SDS 和 CTAB 法,对它们进行稍 加修改就可以应用于 DNA的微量提取。两种方法均采用去污剂 裂解细胞并保护DNA不受内源核酸内切酶降解。
实验材料和试剂
实验材料:新鲜植物组织。 实验所需试剂: DNA提取缓冲液 100 mmol/L Tris-HCl (pH8.0) 50mmol/L EDTA 500 mmol/L NaCl 1.5% SDS 24:1/氯仿:戊醇 2×CTAB buffer 100mM Tris pH8.0 1.4M NaCl 20 mM EDTA pH8.0 2% CTAB 0.2% 巯基乙醇 酚/氯仿(1:1) 氯仿:50 ml 无水乙醇
核酸的理化性质
RNA和核苷酸的纯品都呈白色粉末或结晶,DNA则为白色类 似石棉样的纤维状物。除肌苷酸、鸟苷酸具有鲜味外,核酸 和核苷酸大都呈酸味。 DNA、RNA和核苷酸都是极性化合物,一般都溶于水,不溶 于乙醇、氯仿等有机溶剂,它们的钠盐比游离酸易溶于水, RNA钠盐在水中溶解度可达 40g/L。DNA在水中为10g/L,呈 黏性胶体溶液。在酸性溶液中,DNA、RNA易水解,在中性 或弱碱性溶液中较稳定。
具体方法简单说来就是利用液氮对植物组织进行研磨,从而破 碎细胞。细胞提取液中含有的 SDS溶解膜蛋白而破坏细胞膜, 使蛋白质变性而沉淀下来。 EDTA抑制 DNA酶的活性。再用酚、 氯仿抽提的方法去除蛋白,得到的DNA溶液经乙醇沉淀。
细胞破碎
①机械方法: 超声波处理法、研磨法、匀浆法;
dna的提取 实验报告
dna的提取实验报告DNA的提取实验报告引言:DNA(脱氧核糖核酸)是构成生命的基本遗传物质,它携带着生物个体的遗传信息。
DNA的提取是生物学实验中常见的一项重要技术,通过提取DNA,我们可以进一步研究生物的遗传特征、进化历程以及疾病的发生机制等。
本实验旨在探究DNA的提取方法,并通过实际操作来加深对DNA结构和功能的认识。
材料与方法:1. 实验材料:- 鸡蛋白溶液- 酒精- 盐水- 洗洁精- 酶解液- 水浴- 离心机- 显微镜2. 实验步骤:1. 将鸡蛋白溶液倒入试管中,加入适量的盐水,并加入洗洁精,轻轻摇晃混合。
2. 将酶解液加入试管中,再次轻轻摇晃混合,使酶解液与鸡蛋白溶液充分接触。
3. 将试管放入水浴中,保持温度在50℃左右,进行酶解反应。
4. 取出试管,加入等体积的酒精,轻轻旋转试管,观察DNA的析出。
5. 使用离心机将混合液离心,分离出DNA。
6. 将离心后的上清液倒掉,加入适量的盐水,再次离心,以去除残留的酒精。
7. 使用显微镜观察提取得到的DNA。
结果与讨论:经过实验操作,我们成功地提取到了DNA,并观察到了DNA的析出现象。
在实验过程中,酶解液的作用是破坏细胞膜和核膜,使DNA从细胞内释放出来。
酒精的加入则通过与DNA中的水结合,使DNA分子在溶液中析出形成细长的纤维状物质。
DNA提取的关键步骤在于酶解反应的温度和时间的控制。
过高的温度或过长的反应时间会导致DNA的降解,从而影响提取效果。
同时,酒精的加入和离心的速度也会影响DNA的析出和分离。
实验中我们选择了适宜的条件,保证了DNA的提取效果。
DNA的提取方法不仅在实验室中有广泛应用,也在现实生活中有重要意义。
例如,在犯罪侦查中,通过提取作案现场的DNA样本,可以帮助警方追踪犯罪嫌疑人;在医学诊断中,通过提取患者体液中的DNA,可以进行基因检测,帮助医生判断疾病的类型和治疗方案。
总结:通过本次实验,我们深入了解了DNA的提取方法,并通过实际操作加深了对DNA结构和功能的认识。
DNA提取实验
DNA提取实验DNA提取是现代生物学研究的基础实验之一,它可以从生物体内分离和纯化DNA分子,为各种分子生物学技术和研究提供重要的基础。
本实验旨在介绍DNA提取的基本步骤和操作技巧。
材料和仪器:1. 新鲜的生物样本(如水果、蔬菜、口腔拭子等)2. DNA提取试剂盒3. 离心管4. 加热器5. 离心机6. 显微镜实验步骤:1. 样本处理:a) 将生物样本取出,如水果则切成小块,口腔拭子可直接使用。
b) 将样本放入离心管中。
c) 使用试剂盒提供的试剂,在样本中加入适量的细胞裂解缓冲液。
d) 轻轻摇动离心管,使样本与缓冲液均匀混合。
e) 将离心管放入加热器中,在60摄氏度恒温加热20-30分钟,以促进细胞的破裂和DNA的释放。
2. 细胞裂解:a) 将加热后的样本离心管取出,稍微晃动离心管使样本充分混合。
b) 加入适量的蛋白酶,用离心管盖密封离心管,并再次摇动离心管混合。
c) 将离心管放入加热器中,以高温(通常为60-65摄氏度)恒温孵育10分钟,以使蛋白酶发挥作用,降解细胞蛋白。
3. DNA沉淀:a) 将加热后的样本离心管取出,加入等体积的冷异丙醇,并摇动离心管使两者充分混合。
b) 将混合溶液离心10-20分钟,以最大速度离心沉淀DNA。
c) 抽掉上层溶液,离心沉淀的DNA。
d) 加入适量的70%乙醇洗涤一次,以去除残留的盐和其他杂质。
e) 将离心管倒置于纸巾上,待乙醇挥发后,加入适量的去离子水重新溶解DNA。
4. DNA纯化:a) 使用显微镜观察提取的DNA溶液中是否有明显的纹理和颜色,以确保DNA提取的成功。
b) 使用测量纯度和浓度的仪器对提取的DNA进行定量分析,并记录结果。
c) 将DNA溶液保存在低温冷冻条件下,以防止DNA的降解和损伤。
实验注意事项:1. 实验前需佩戴实验手套和口罩,防止污染和细菌感染。
2. 操作过程中需注意无菌操作,避免污染。
3. 实验前要确保所有仪器和材料已经正确消毒和清洗。
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实验一DNA的小量制备小量法提取植物基因组DNA(CTAB法)1 实验目的:随着基因工程等分子生物学技术的迅速发展及广泛应用,人们经常需要提取高分子量的植物DNA,用于构建基因文库、基因组southern 分析、酶切及克隆等,这是研究基因结构和功能的重要步骤。
本实验目的是学习从植物材料中提取和测定DNA的原理并掌握CTAB 提取DNA 的方法,进一步了解DNA的性质,掌握分子生物学实验的基本方法。
2 实验原理细胞中的DNA绝大多数以DNA-蛋白复合物(DNP)的形式存在于细胞核内。
提取DNA时,一般先破碎细胞释放出DNP,再用含少量异戊醇的氯仿除去蛋白质,最后用乙醇把DNA从抽提液中沉淀出来。
DNP 与核糖核蛋白(RNP)在不同浓度的电解质溶液中溶解度差别很大,利用这一特性可将二者分离。
以NaCl 溶液为例:RNP 在0.14mol/L NaCl中溶解度很大,而DNP 在其中的溶解度仅为纯水中的1%。
当NaCl 浓度逐渐增大时,RNP的溶解度变化不大,而DNP 的溶解则随之不断增加。
当NaCl 浓度大于1mol/L 时,DNP的溶解度最大,为纯水中溶解度的2 倍,因此通常可用1.4mol/L NaCl 提取DNA。
为了得到纯的DNA制品,可用适量的RNase 处理提取液,以降解DNA中搀杂的RNA。
关于植物总DNA的提取主要有两种方法:1.CTAB 法:CTAB(十六烷基三甲基溴化铵,hexadecyltrimethylammonium bromide, 简称CTAB):是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/LNaCl)是可溶的,当降低溶液盐的浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB 与核酸的复合物同蛋白、多糖类物质分开,然后将CTAB 与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液中,再加入乙醇使核酸沉淀,CTAB 能溶解于乙醇中。
2.SDS 法:利用高浓度的阴离子去垢剂SDS(十二烷基磺酸钠,Sodium dodecyl sulfate, 简称SDS)使DNA与蛋白质分离,在高温(55~65℃)条件下裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,释放出核酸,然后采用提高盐浓度及降低温度的方法使蛋白质及多糖杂质沉淀,离心后除去沉淀,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,反复抽提后用乙醇沉淀水相中的DNA。
一般生物体的基因组DNA 为107~109bp,在基因克隆工作中,通常要求制备的大分子DNA的分子量为克隆片段长度的4倍以上,否则会由于制备过程中随机断裂的末端多为平末端,导致酶切后有效末端太少,可用于克隆的比例太低,严重影响克隆工作。
因此有效制备大分子DNA的方法必须考虑两个原则:(1)尽量去除蛋白质、RNA、次生代谢物质(如多酚、类黄酮等)、多糖等杂质,并防止和抑制内源DNase 对DNA的降解。
(2)尽量减少对溶液中DNA的机械剪切破坏。
几乎所有的DNase 都需要Mg2+或Mn2+为辅因子,故实现(1)尽量去除蛋白质的要求,需加入一定浓度的螯合剂,如EDTA、柠檬酸,而且整个提取过程应在较低温度下进行(一般利用液氮或冰浴)。
为实现(2)需要在DNA处于溶解状态时,尽量减弱溶液的涡旋,而且动作要轻柔,在进行DNA溶液转移时用大口(或剪口)吸管。
提取的DNA是否为纯净、双链、高分子的化合物,一般要通过紫外吸收、化学测定、“熔点”(melting temperature, Tm)测定、电镜观察及电泳分离等方法鉴定。
本实验采用CTAB 法提取DNA并通过紫外吸收法鉴定。
3 材料和试剂:3.1 青蒿叶片3.2 试剂(1)CTAB 提取缓冲液:100 mmol/L Tris-HCl (pH8.0),20 mmol/L EDTA-Na2,1.4mol/LNaCl(如表1),2% CTAB,使用前加入0.1%(V/V)的β-巯基乙醇。
表1 CTAB提取缓冲液配制试剂名称M.W. 配制1000 mL 配制500 mL T ris 121.14 12.114 g 6.057 g EDT A-Na2372.24 7.448 g 3.7224 g NaCl 58.44 81.816 g 40.908 g 用HCl 调pH 值。
(2)TE 缓冲液:10mmol/L Tris-HCl, 1mM EDTA(pH8.0)。
(3)氯仿/异戊醇:将氯仿和异戊醇按体积24:1的比例混匀,置棕色瓶中,4℃保存。
4 仪器设备离心机、3离心管、紫外分光光度计、微量移液器、吸头、吸水纸、水浴锅、冰箱、电子天平、高压灭菌锅、一次性手套、电泳仪等。
5 方法与步骤:5.1 在提取过程中用到的吸头,提取缓冲液等先高压灭菌(121℃,20min),取出后待用;5.2 取大约指甲盖大小的植物叶片(约100mg),放入1.5ml的EP管中, 加入液氮,用钢珠研磨成粉末状;5.3 预热CTAB缓冲液(含2%的β-巯基乙醇)到65 ℃,加入600μL的CTAB提取缓冲液,混匀;5.4 EP管内溶液置于65℃水浴45 min,加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),轻轻混匀,颠倒几次,室温静置5min。
5.5 4℃,12,000rpm/min离心10min;5.6 吸取上清液(约500 μl)于一干净的1.5 ml EP管中,加入1滴3M醋酸钠溶液,加入等体积预冷异丙醇,混匀,-20℃放置30min沉淀DNA;5.7 取出,12,000 rpm/min常温离心15min;5.8 弃上清液,用75%乙醇溶液(900μl)冲洗沉淀两次,5.9 10,000rpm/min离心1min,倒掉乙醇,再用乙醇同样处理一次,置于干燥仪干燥10min,将水分蒸干;5.10 加入50μL去离子水,融解DNA,同时加入RNA酶(按每50μL DNA加入1μL RNase),37℃30min;5.11 琼脂糖电泳检测DNA:制作1%的琼脂糖凝胶,吸取提取的DNA溶液5μL电泳检测;5.12 提取的DNA浓度检测:取少量待测DNA样品,用蒸馏水稀释1,000倍;用蒸馏水做空白,利用分光光度计检测OD260分别在260nm、280nm测DNA样品的吸光值;5.13 -20℃保存DNA备用。
【注意事项】1. 叶片磨得越细越好。
2. 注意移液器的正确使用。
3. 由于植物细胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDT A抑制酶的活性外,第一步的操作应迅速,以免组织解冻,导致细胞裂解,释放出DNA酶,使DNA降解。
6. 思考题1.制备的DNA在什么溶液中较稳定?2.为了保证植物DNA的完整性,在吸取样品、抽提过程中应注意什么?7 实验结果:结果计算:式中OD260nm 为260nm 处的光密度;L 为比色杯光径(cm);0.020 为1μg/mL DNA钠盐的光密度。
DNA的紫外吸收高峰为260nm,吸收低峰为230nm,而蛋白质的紫外吸收高峰为280nm。
上述DNA溶液适当稀释后,在751 分光光度计上测定其OD260nm、OD230nm 和OD280nm。
如OD260nm/ OD230nm≥2OD260nm/ OD280nm≥1.8,表示RNA已经除净,蛋白含量不超过0.3%。
8 实验分析:传统DNA提取方法CTAB 法、SDS 法是在裂解细胞的基础上,多次苯酚氯仿等有机溶剂抽提使蛋白质变性沉淀于有机相,而核酸保留在水相,达到分离核酸的目的;加入RNA 酶除去核酸中的RNA; 然后加入异丙醇、乙醇等沉淀DNA;用70 %乙醇漂洗沉淀,除去分离过程中残留的有机溶剂和盐离子,以免影响核酸溶解和抑制后续步骤的酶促反应,最后用TE 溶解DNA 备用。
CTAB 是一种阳离子去污剂,能与核酸形成复合物,此复合物在高盐( > 0. 7 mol/ L) 浓度下可溶,并稳定存在,但在低盐浓度(0. 1~0. 5 mol/ L NaCl) 下CTAB - 核酸复合物就因溶解度降低而沉淀,而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中。
通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
经离心弃上清后,CTAB - 核酸复合物再用70 %酒精浸泡可洗脱掉CTAB 。
SDS 是一种阴离子去垢剂,在高温(55~65 ℃) 条件下能裂解细胞,使染色体离析、蛋白变性,同时SDS 与蛋白质和多糖结合成复合物,释放出核酸;提高盐(KAc 或NH4Ac) 浓度并降低温度(冰浴) ,使 SDS - 蛋白质复合物转变为溶解度更小的钾盐形式,使蛋白质及多糖杂质沉淀更加完全,离心后除去沉淀;上清液中的 DNA 用酚/ 氯仿抽提,反复抽提后用乙醇沉淀水相中的DNA。
SDS 法操作简单,温和,也可提取到高分子量的DNA ,但所得到的产物含糖类杂质较多。
基因组DNA 经典的提取方法由于无需昂贵仪器和药品,提取的DNA 纯度能够满足一般分子生物学的需要,一直作为DNA 提取的常规方法。
但这种方法操作步骤复杂,耗时长,易交叉污染,残留在DNA 溶液中有机物质对DNA 聚合酶有抑制作用。
另外,酚、氯仿等有机溶剂易造成环境污染,有损操作者健康。
DNA提取新方法近年来出现了以螯合树脂、特异性 DNA 吸附膜、离子交换纯化柱及磁珠或玻璃粉吸附等基础 DNA 提取新方法。
这些方法主要应用于提取病毒、微生物、人和动物细胞、包埋组织样品、古生物标本及土壤环境样品 DNA 。
已有多篇利用纯化柱和玻璃粉纯化植物基因组 DNA 的报道。
马小军等将CTAB 液提取和氯仿抽提两步的上清液直接通过Wizard 纯化系统纯化得到的DNA ,RAPD 扩增效果良好,产率达2 250μg/ g 。
张博等用硅珠(SiO2) 颗粒吸附DNA 纯化方法,从不同树木叶片中均得到了高质量的 DNA 样品。
黄椰林等对常规CTAB 法提取的DNA 用玻璃粉悬浮液纯化,所获DN 的APCR 产物能直接测序,比较适用于富含黏多糖、单宁、多酚和萜类化合物等次生代谢物的植物样品和长期保存的标本材料。
袁长春等也用玻璃粉吸附法从富含酚类的茶类植物中提取纯净的总DNA。
目前国内外开发了多种商品化的DNA 提取纯化试剂盒,其分离原理有的利用核酸的分子量差异,有的利用特异性膜与DNA 结合达到分离、回收的目的,如离子交换柱、磁珠等。
这些试剂盒针对不同的材料来源设计了不同的提取方法,操作简单、高效, DNA 质量较高,但价格昂贵,提取量少。
著名的国外的试剂盒生产厂家有Sigma2Aldrich、Promega、Invitrogen、 TaKaRa 、Whatman 等,它们针对不同来源的材料如微生物、动物体液、血液和组织、植物、加工产品、转基因产品等开发出一系列的试剂盒。