彗星实验要点
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1、凋亡细胞的观察:看过国外此法作出的凋亡细胞彗星图像,很漂亮,用CASP软件分析后,其曲线呈典型的双峰,而正常细胞为单峰。我的一些教训:观察凋亡细胞最好把电压、电流、和电泳时间均调低,否则,凋亡细胞中的DNA片断跑的太块,荧光下根本看不到凋亡细胞的尾巴。注:我用的是中性条件,20V,200mA,20min, 凋亡细胞观察宜选用10V,100mA,10min。朋友们如果有异议,请不吝赐教,也对我有所帮助。
2、
解旋20分钟应该没问题,但是我认为您的电泳时间过长,当然我不知道您的电泳条件(电压、电流、),我认为20分钟足够了,时间长了一是浪费时间,二是彗星图像不好,不利于分析。您的裂解时间有点短了,文献报道,最好不要少于1.5小时
3、一般100ul0.5%低熔点胶中含400个细胞就足够了
4、本版【图片仓库】子版有我做的彗星图像,感兴趣可以看看
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5、注意,CASP只读.tif扩展名的图像,如果你的相机拍摄的图像可以有.tif 格式,就更好了,如果是.jpg格式,那还要在计算机中转换一下,不过很简单
6、首先,荧光染色的东西最好马上看,否则影响结果。
其次,您的染色液量我觉得多了点,我用2ug/ml,1ml注射器1滴就可以。第三,要忠于实验结果,图象内容不能更改,可以用ACDSEE或PHOTOSHOP 转换图象格式或大小,所以,作出来的实验图象质量要好
7、。背景的选择问题,如果图片质量好的话,背景大小不同,对结果影响不是很大,如果图片背景乱七八糟,那背景框的选择肯定对结果产生很大影响。我的建议:背景框不要太大,参考我贴的那个图。注意,背景框可以在细胞的上面或下面,如果背景框在上面时,分析后的图像(分析后出现一个头、尾分明的图像,是基本重合在细胞上的)质量很差,很不规则,那再把背景框调到下面试试,如果还是不好,那只能说你的结果质量不好了。背景框的选择关键在于分析同一批细胞,背景框要相同,才能保持资料的可比性。
结果的保存,记得好像使用说明里提到了,如果没有提到,那就是我原创的!!!呵呵,先卖个关子。FILE菜单下有一个EXPORT RESULTS(输出结果)的按钮,点击以后,默认是.TXT文本文件,好了,给你的输出文件起个名字,选择保存位置,点击确定就OK了,回到你保存的输出结果文件,发现它是一个不可识别的文件,那就直接把它的扩展名改成.TXT,打开它,看看你的结果,包括13个指标,很好,这个.TXT的结果文件可以被SPSS统计软件直接识别,不是很方便吗??(如果你愿意把数据一个一个地输入统计软件,我也没意见,呵呵)。这里还有一个小窍门,在用SPSS读取之前,最好把你的结果文件调整一下,这也是我发现的。把所有的指标都排列到第一行,下面的结果要和指标一一对应,每个数据之间留空格(默认的),行与行之间不要用回车,就是不要有空行,其实调整起来很简单,主要是调节.TXT文本文件阅读框的宽度。调好后,SPSS软件直接识别,很方便,为你节省很大工作量,不信就试试。
8、我用双层铺胶法,自制微电泳槽,第一层:0.75%正常熔点胶,100μl,第二层:0.75%低熔点胶,75μl+25μl淋巴细胞悬液,用枪直接把凝胶吹到
自制的微电泳槽中,铺平即可。第二层以相同的方法铺到第一层上面,不必担心脱胶的问题。
9、盖玻片用普通的就可以了,但是可以自做的,普通的盖玻片其实有点小了,如果胶很多的话,第二层胶非常厚,这样不利于观察细胞,而且不利于电泳。3。染色后要用双蒸水冲洗,据我的经验,冲要冲的非常干净,否则背景太亮了,拍照后不容易分析。但是又不能使劲的冲,否则胶很容易掉下来。
4。电泳的时间一般是20分钟,电压各个细胞是不同的,你可以查查有关资料,自己做做预试验。一般情况下,对照组的细胞的tail DNA%应为10%左右,不超过20%,如果尾巴太短了,也不好。
5。分析要用荧光显微镜的,具体的染液,有不同的激发波长。casp软件在前面的帖子中就有。很好用的,在推荐一次哦。最好用显微镜自带的相机,如果你的技术好的话,可以在目镜照相,洗出来扫描后可以分析的。
6.把EB滴加在胶上就可以了。观察时要在暗室里。
我是用EB的,电泳后,直接在胶板上滴上一滴,然后用水冲洗,用滤纸吸去多余水分,荧光显微镜观察
10、SCGE技术的原理:
细胞核中的DNA为负超螺旋结构,而且很致密,通常DNA双链以组蛋白为核心,盘旋而形成核小体。一般情况下,偶然的DNA单链断裂对核酸分子双股结构的连续性影响不大,而且不易释放出来,但是,如果用去污剂破坏细胞膜和核膜,用高浓度盐提取组蛋白,DNA残留而形成类核。如果类核中的DNA有断裂,断裂点将引起DNA致密的超螺旋结构松散,在类核外形成一个DNA晕圈。将类核置于电场中电泳,DNA断片可从类核部位向阳极迁移,经荧光染色后,在阳极方向可见形似彗星的特征性图像,故称“彗星试验”。彗星尾部即为迁移出类核的DNA片段。此时彗星尾部有可能还与头部以单链或双链的形式相连。DNA损伤越严重,导致DNA超螺旋结构越松散,产生的断裂点越多,DNA片段越小,从而在彗星尾部出现的DNA断片越多,则慧尾的长度、面积和荧光强度越大。通过测量彗星尾部的长度、面积或荧光强度等指标,可以对DNA的损伤程度进行定量分析。
随着SCGE技术的发展,可测量的指标也越来越多,而且更准确。目前,用于S CGE分析的指标主要分为四类,包括形状指标、距离指标、强度指标和矩类指标。其中形状指标有彗星细胞率;距离指标包括彗星尾长、彗星全长、彗星头部半径、尾部半径;强度指标包括头部DNA百分含量、尾部DNA百分含量、头部面积、尾部面积等;矩类指标包括尾矩、Olive尾矩等。
11、H2O2是作为阳性对照的吧?它是标准的断裂剂。但是不同的细胞对它的敏感程度是不同的,我觉得前几个数据有必要删掉,30微摩尔以下的浓度应该是会造成断裂的。.PI染色我见过,染出来的效果也是很不错,是蓝色的。不一定用EB染色呀,毒性又大。
12、单细胞琼脂糖凝胶电泳(comet assay)
Single Cell Agarose Gel Electrophoresis (SCGE)
步骤: