第二节酶的分类与命名
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一些酶的命名举例
编号 推荐名称
系统名称
催化的反应
EC1.4.1.3 谷氨酸 脱氢酶
EC2.6.1.1 天冬氨酸氨 基转移酶
EC3.5.3.1 精氨酸酶
EC4.1.2.13 果糖二磷酸 醛缩酶
EC5.3.1.9 磷酸葡萄糖 异构酶
EC6.3.1.2 谷氨酰胺 合成酶
L-谷氨酸:NAD+ 氧化还原酶
L-天冬氨酸:α-酮 戊二酸氨基转移酶
2A·2H+O2
2A+2H2O
A·2H+O2
例:
A+H2O2
邻苯二酚氧化酶(EC 1.10.3.1,邻苯二酚:氧氧化酶)
OH
O
OH 邻苯二酚氧化酶
2
+ O2
2
O + 2H2O
邻苯二酚
邻苯醌
2.转移酶类(transferases)
催化基团的转移
A R +B
A+ B R
例:谷丙转氨酶(GPT)(EC 2.6.1.2,L-丙氨酸: α-酮戊二酸氨基转移酶)
4.裂合酶类(lyases)
从底物移去一个基团或原子而形成双键或逆反应
AB
例:
A+B
醛缩酶 果糖1,6-二磷酸 磷酸二羟丙酮 甘油醛-3-磷酸
(5) 异构酶 Isomerase
催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内 基团或原子的重排过程
例如:
葡萄糖-6-磷酸己酮醇异构酶(EC5.3.1.9)6-磷酸葡萄糖异构酶
第二章 酶
第二节 酶的分类及命名
一、酶的分类
根据国际酶学委员会(Enzyme commission, EC)制定的“国际系统分 类法”,将酶按酶促反应性质分为六大 类
国际系统分类法
1. 氧化还原酶类 Oxidoreductases
2. 转移酶类
Transgerases
3. 水解酶类
Hydrolases
例:
A + B + ATP
AB + ADP + Pi AB + AMP + PPi
Байду номын сангаас
乙酸+CoA-SH+ATP
乙酰-S-CoA+AMP+PPi
CHO
CH2OH
H C OH
CO
HO C H
HO C H
H C OH
H C OH
H C OH CH2OPO32-
H C OH CH2OPO32-
葡萄糖-6-磷酸
果糖-6-磷酸
6.连接酶类(ligases, 也称synthetases合成酶类) 将两种物质合成一种物质的反应,通常需要ATP供能。
A + B + ATP
谷丙转氨酶
谷氨酸 丙酮酸
-酮戊二酸 丙氨酸
3 水解酶 hydrolase
催化底物的加水分解反应。 主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。 例如,亮氨酸氨基肽水解酶(EC3.4.1.1,习惯名为
亮氨酸氨肽酶)。 例如,脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反应:
R COOCH2CH3 H2O RCOOH CH3CH2OH
2、国际系统命名法
系统命名(system name)包括底物名称及催 化反应的性质,最后加一个酶字;若有两种 底物,则两种底物均需标明,并以“:”隔 开。
例如:
习惯名称:谷丙转氨酶 系统名称:丙氨酸:-酮戊二酸氨基转移酶 酶催化的反应: 谷氨酸 + 丙酮酸 -酮戊二酸 + 丙氨酸 若底物之一是水时,可将水略去不写,如乙酰辅酶 A水解酶(习惯名) 乙酰辅酶A:水解酶(系统名)
二、 酶的命名
1、习惯命名法(recommended name) (1)根据其催化底物:如淀粉酶,蛋白酶。 (2)根据所催化反应的性质:如水解酶,转氨
酶。 (3)结合上述两个原则:
如琥珀酸脱氢酶是催化琥珀酸脱氢反应的酶。 (4)上述原则再加上酶的来源或其它特点:
如胃蛋白酶及胰蛋白酶;碱性磷酸酯酶及 酸性磷酸酯酶等。
L-谷氨酸 + H2O + NAD+ α-酮戊二酸 + NH3 + NADH
L-天冬氨酸+α-酮戊二酸 草酰乙酸 +L-谷氨酸
L-精氨酸脒基水解酶
L-精氨酸 + H2O L-鸟氨酸+ 尿素
D-果糖1,6-二磷酸: D-果糖1,6-二磷酸 D-甘油醛3-磷酸裂合酶 磷酸二羟丙酮 + D-甘油醛3-磷酸
D-葡萄糖6-磷酸酮醇 异构酶
D-葡萄糖6-磷酸 D-果糖6-磷酸
L-谷氨酸:氨连接酶
ATP + L-谷氨酸 + NH3 ADP+磷酸 + L-谷氨酰胺
三、六大酶类的反应
1 氧化-还原酶 Oxido-reductase
催化氧化-还原反应 主要包括脱氢酶(dehydrogenase)和氧化酶
(Oxidase)
(1)脱氢酶类:直接催化底物脱氢
A·2H + B
A + B·2H
例:乳酸脱氢酶(EC 1.1.1.27,L-乳酸:NAD+氧化还原酶)
COOH
乳酸脱氢酶
H O C H + NAD+
COOH C O + NADH + H+
CH3
乳酸
CH3
丙酮酸
(2)氧化酶类:催化底物脱氢,并氧化生成H2O或H2O2 。
4. 裂合酶类
Lyases
5. 异构酶类
Isomerases
6. 合成酶类
Synthetases
Synthases
国际系统分类法及编号
每一种酶有一个编号, EC+4个数字
如乙醇脱氢酶
EC 1.
大类
1. 亚类
1. 亚亚类
27 序号
氧还原酶 供体CHOH 受体NAD+ NADP+ 亚亚类中的位置