酵母双杂交文库筛选与蛋白互作验证服务
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45 Os04g54240 wound induced protein, putative, expressed
99.30%
38 Os05g11320 metallothionein-like protein 3B,
putative, expressed 99.14%
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图1 酵母双杂交技术原理图(引自MATCHMAKER GAL4 Two-Hybrid System
3&Libraries User Manual). 公司选用的是美国Clontech公司(现为Takara公
司收购)的MatchMaker系列酵母双杂交系统,所用的 AH109,Y187酵母
菌株,是通过基因工程的方法突变了内源Gal4转录因子的工程菌株,并
在GAL4
UASs和启动子的下游构建了3个报道基因--ADE2,HIS3,
MEL1(或LacZ),因此可以通过营养缺陷和显色报告基因的表达来筛选
或验证两个蛋白之间是否存在相互作用。菌株信息如图2所示。
所用表达载体信息如下
酵母双杂交技术优点: ①高效:转化方法简单,转化效率高,便于操作。②灵敏:可检测蛋白质 之间的微弱作用。③真实:酵母细胞是真核细胞,融合蛋白之间的相互作 用是在真核细胞核内进行的,蛋白质经过翻译后的修饰,多数可以保持蛋 白质的天然空间构象和折叠状态,接近其真实的生理状态,一定程度上可 代表其在细胞内真实情况。④简捷:只需要构建诱饵表达载体,可以省略 蛋白质抽提纯化或抗体制备的繁琐步骤。
酵母双杂交技术是研究蛋白质-蛋白质相互作用的一种蛋白组学方法, 是基于对真核生物的转录因子调控转录起始过程的认识而发明的技术。
其基本原理是利用真核生物酵母的转录激活因子Gal4可分为结构上分开 并且功能独立的两个结构域:N端1-147aaDNA结合结构域 (DNAbindingdomain,BD)和C端768-881aa转录激活结构域(Activation Domain,AD),Gal4的N端和C端可以分开构建表达质粒,将N端和诱饵蛋 白(研究的目标蛋白A)融合表达,C端和细胞cDNA或者猎物蛋白X融合 表达,如果cDNA编码的蛋白x能和A互相作用,就能把Gal4的C端和N端 联系在一起,形成转录因子,激活UAS下游的基因表达,原理如图1所 示。
百度文库
克隆编号相似序列登录号蛋白功能描述相似百分比 56 Os02g50240 glutamine synthetase, catalytic domain containing protein,expressed 96.89%
67 Os06g40640 fructose-bisphospatealdolaseisozyme, putative,
酵母双杂交服务内容介绍: 1.酵母双杂交cDNA文库构建: 服务内容: 总RNA提取、纯化―mRNA分离―cDNA制备―cDNA连接AD载体-连接产 物转化大肠杆菌-cDNA文库效价测定-cDNA文库扩增-cDNA文库扩增 后的质粒DNA纯化-纯化后cDNA文库质量的鉴定(如PCR和酶切鉴定等 方法)等 合作方式: 为客户构建指定的酵母双杂交基因文库。由客户提供cDNA或组织、细 胞等。 服务完成时提供详细的实验报告以及文库 2.酵母双杂交技术从cDNA文库中筛选相互作用蛋白: 服务内容: l 诱饵质粒的构建及自激活作用和蛋白毒性检测 l 组织cDNA文库的构建(或客户提供) l酵母接合效率的计算及接合后初步阳性克隆筛选的统计 l 阳性克隆文库质粒的提取,转化酵母后自激活作用检测 l 酵母双杂交筛选结果的质粒回转验证结果 l 阳性克隆文库质粒的提取,转化细菌,测序及登陆NCBI等网站进行序 列比对,公布最终筛选结果 合作方式: 为客户对指定的基因文库进行酵母双杂交筛选,筛选完成后向客户提供 详细的筛选报告和阳性克隆实物,客户需要提供诱饵基因信息。 3.酵母双杂交技术检测指定蛋白对之间的相互作用:技术服务内容: l 诱饵蛋白表达载体与猎物蛋白表达载体的构建 l 表达载体转化酵母的验证及自激活活性,毒性检测 l 诱饵蛋白质粒与猎物蛋白质粒共转化酵母的验证以及相互作用的检测 报告 l 无相互作用时诱饵和猎物蛋白的表达情况的Western blotting检测 合作方式: 为客户对指定的2个或多个蛋白之间进行酵母双杂交实验,验证其相互 作用。由客户提供基因克隆,抗体,或从公司购买抗体。实验完成后向 客户提供详细的实验报告和相互作用阳性的酵母共转化菌株。 部分实验案例图示
expressed 99.76%
65 Os02g46520 hydrolase, putative,expressed 95.22%
22 Os05g40180 serine/threonine-protein kinase stt7, chloroplast
precursor, putative, expressed 77.27%