蛋白质定量研究技术方法及差异表达蛋白质作用通路分析(1)
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MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
Ion trap
• 灵敏度高，采集频率高， • 缺陷：1/3 rule
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
MALDI)
• 根据质量分析器：
MALDI
MALDI
• 需要经过铺基质、点靶板等步骤，通量较低 • 一般只产生+1价离子
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
质谱基本构造
质谱基本构造
最早的质谱（复制品）
质荷比的测定原理
小结
• 质谱仪的功能是测定离子的质荷比。
• 质谱仪一般包括三个主要部分：离子源、 质量分析器和检测器。
• 下一部分：质谱的类型
质谱的分类
• 质谱可以根据其离子源和质量分析器的类 型进行分类
• 根据离子源：电喷雾质谱，MALDI质谱等
TOF
TOF
• 肽段分子量1000 Da，MALDI离子化成+1 价离子，静止时施以15 kV电压，飞行距离 1.5 m，飞行时间是？
• 时间很短，因此测量相对误差容易较大
MALDI-TOF
MALDI-TOF
MALDI-TOF
• 单个样品准备时间短，采集速率较快， 分辨率适中（50 ppm）
蛋白质定量研究技术方法及 差异表达蛋白质作用通路分析
10/24/2011
内容纲要
• 质谱（Mass spectrometer）工作原理及蛋 白质组学中常用质谱类型
• 目前常用定量蛋白组学研究手段 • 差异表达蛋白的生物信息学分析
质谱工作原理
• 质谱的工作原理 • 质谱的分类 • 蛋白质组学中常用质谱类型及各自特点
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
FTICR
• 根据磁场中的离子回旋频率来测量离子质荷比 • 分辨率很高，采集频率低
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
Quadropule
Quadropule
Quadropule
• 三重四级杆，用于SRM定量
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
FTICR) • Orbitrap
ESI
ESI
ESI
• 直接从溶液中将生成离子化喷雾 • 同一肽段可以产生带有不同电荷的一系列离子 （2+~7+）
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
• 根据质量分析器：飞行时间质谱、离子阱 质谱等
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
Ion trap
• 灵敏度高，采集频率高， • 缺陷：1/3 rule
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
MALDI)
• 根据质量分析器：
MALDI
MALDI
• 需要经过铺基质、点靶板等步骤，通量较低 • 一般只产生+1价离子
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
质谱基本构造
质谱基本构造
最早的质谱（复制品）
质荷比的测定原理
小结
• 质谱仪的功能是测定离子的质荷比。
• 质谱仪一般包括三个主要部分：离子源、 质量分析器和检测器。
• 下一部分：质谱的类型
质谱的分类
• 质谱可以根据其离子源和质量分析器的类 型进行分类
• 根据离子源：电喷雾质谱，MALDI质谱等
TOF
TOF
• 肽段分子量1000 Da，MALDI离子化成+1 价离子，静止时施以15 kV电压，飞行距离 1.5 m，飞行时间是？
• 时间很短，因此测量相对误差容易较大
MALDI-TOF
MALDI-TOF
MALDI-TOF
• 单个样品准备时间短，采集速率较快， 分辨率适中（50 ppm）
蛋白质定量研究技术方法及 差异表达蛋白质作用通路分析
10/24/2011
内容纲要
• 质谱（Mass spectrometer）工作原理及蛋 白质组学中常用质谱类型
• 目前常用定量蛋白组学研究手段 • 差异表达蛋白的生物信息学分析
质谱工作原理
• 质谱的工作原理 • 质谱的分类 • 蛋白质组学中常用质谱类型及各自特点
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
FTICR
• 根据磁场中的离子回旋频率来测量离子质荷比 • 分辨率很高，采集频率低
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
Quadropule
Quadropule
Quadropule
• 三重四级杆，用于SRM定量
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
FTICR) • Orbitrap
ESI
ESI
ESI
• 直接从溶液中将生成离子化喷雾 • 同一肽段可以产生带有不同电荷的一系列离子 （2+~7+）
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
• 根据质量分析器：飞行时间质谱、离子阱 质谱等
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,
FTICR) • Orbitrap
质谱的分类
• 根据离子源：
• 电喷雾(electrospray ionization, ESI) • 基质辅助激光解吸(matrix-assisted laser desorption/ionization,
MALDI)
• 根据质量分析器：
• 飞行时间 (time of flight, TOF) • 四级杆(quadruople， Q) • 离子阱(ion trap, IT) • 傅里叶离子共回旋(Fourier Transform ion cyclotron resonance,