第18章酵母双杂交系统83页PPT

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Gal4的DNA-BD可识别位于Gal4效应基因的 UAS,并可与之结合;
Gal4的AD则可与转录复合物中其他成分结合, 激活UAS下游报告基因LacZ的转录。
酵母转录因子(Gal 4)
与BD-fusion ---诱饵(bait)
与AD-fusion ---猎物或靶蛋白(prey or target protein)
材料构建cDNA文库,能分析不同亚细胞部位和功 能的蛋白质,适用于部分细胞质、细胞核及膜结合 蛋白。
四、酵母双杂交系统的应用现状
➢ 分析已知蛋白之间的相互作用 ➢ 对蛋白质功能域的分析,如可将待测蛋白质进行点 突变或缺失突变再进行双杂交。 ➢ 用已知功能蛋白质筛选双杂交cDNA文库,研究蛋 白质之间相互作用的传递途径,发现新基因。 ➢ 分析新基因的生物学功能。即以功能未知的新基因 去筛选文库,再根据筛的已知基因推测新基因功能。 ➢ 绘制蛋白质相互作用系统图谱 ➢ 在药物设计中的应用
报告基因(reporter gene)
---Lac Z(编码β-半乳糖苷酶)
(二)酵母双杂交系统的原理
X
DNA-BD
GAL4 UAS
Promoter
lacZ(or HIS) reporter gene
GAL4 UAS
Promoter
AD
Y
lacZ(or HIS) reporter gene
X
DNA-BD
三、酵母双杂交系统的优点
1. 高敏感性。 2. 原因:
3.
①采用高拷贝和强启动子的表达载体,使融
合蛋白过量表达;
4.
②激活结构域和结合结构域结合形成转录起
始复合物,之后又与启动子结合,此三元复合体
使融合蛋白各组分间结合更趋于稳定;
5.
③通过mRNA使信号放大;
6.
④检测的结果是基因表达产物的累积效应,
第一节 酵母双杂交系统简介
酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母 中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用, 对蛋白质之间微弱的、瞬间的作用也能通过 报告基因的表达产物敏感地检测得到。
它是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之 间关系的技术。
该技术既可用来研究哺乳动物基因组编码 的蛋白质之间的相互作用,也可用来研究高等 植物基因组编码的蛋白质之间的相互作用。
GAL4 UAS
AD
Y
Promoter
transcription
lacZ(or HIS) reporter gene
酵母双杂交动画演示 (英文)
报道株
经改造的、含报告基因的重组质粒的宿 主细胞。
酵母细胞作为报道株的酵母双杂交系统具有 许多优点:
❖ 易于转化、便于回收扩增质粒 ❖ 具有可直接进行选择的标记基因和特征性报告基因 ❖ 酵母的内源性蛋白不易同来源于哺乳动物的蛋白相
可检测存在于蛋白质间的微弱或暂时的相互作用。
三、酵母双杂交系统的优点
1. 高敏感性。 2. 真实性。检测在活细胞内进行,作用条件与ห้องสมุดไป่ตู้用力
无需模拟,在一定程度上代表细胞内的真实情况。 3. 简洁性。融合蛋白相互作用后,减少了制备抗体和
纯化蛋白质的繁琐步骤。 4. 广泛性。采用不同组织器官细胞类型和分化时期的
两个结构域中的DNA-BD由位于N-末端的 1~147位多肽构成,能识别位于Gal4基因的上 游激活序列(upstream activation sequence, UAS)。
此外,在其N-端还具有一段核定位序列。 AD由位于C-末端的768~881位多肽构成。
当Gal4的两个结构域位于不同肽链上,只要 它们在空间上充分接近,则能恢复Gal4作为转 录因子的活性。
一、酵母双杂交系统的建立和基本原理 (一)酵母双杂交系统的建立
经典文献出处
❖ Fields S, Song O. A novel genetic system to detect protein-protein interactions. Nature, 1989, 340(6230):245-246
1989年美国纽约州立大学的Fields和Song首先描述 了酵母双杂交系统(yeast two-hybrid system)。
该系统的建立是基于对真核生物调控转录起始过 程的认识。真核生物基因转录需要反式转录激活因子的 参与,真核生长转录因子含有两个不同的结构域:
转录激活因子
DNA结合结构域(BD) (DNA binding domain)
互结合
改造后的酵母细胞的特点:
❖ 基因组中GAL4基因是缺失型的 ❖ 基因组中引入额外的报告基因LEU、TRP、
HIS
通过功能互补和显色反应筛选到阳性菌落
二、酵母双杂交系统的基本策略
➢ 表达“诱饵”和“猎物”蛋白; ➢ 检验这两种蛋白表达后能否激活酵母中的报 告基因。
做法:首先构建能表达“诱饵”和“猎物” 蛋白的表达载体。该载体中可加入进行营养型 筛选的基因。
Fields和Song将两个融合蛋白分别构建在穿梭 质粒上,一个是将Gal4的DNA-BD与酵母蛋白 SNF1融合;另一个是将Gal4的AD和酵母蛋白 SNF4融合。
其中,SNF1是一种丝氨酸/苏氨酸的蛋白激 酶,SNF4是它的一个结合蛋白,这两种蛋白是 已知可以相互作用的。
当两种穿梭质粒共转化含有Gal4结合位点的报 告基因LacZ的酵母菌株后,通过SNFl与SNF4的 相互作用,Gal4的DNA-BD与Gal4的AD靠近, 形 成一个大的复合物Gal4BD-SNF1-SNF4-Gal4-AD。
蛋白质之间相互作用研究的重要性
蛋白质之间相互作用以及通过相互作用 而形成的蛋白复合物是细胞各种基本功能的 主要完成者。
几乎所有的重要生命活动,包括DNA的 复制与转录、蛋白质的合成与分泌、信号转 导和代谢等等,都离不开蛋白质之间的相互 作用。
研究蛋白质相互作用的常用方法
•酵母双杂交(yeast two hybridization) •亲和层析 •免疫共沉淀 •蛋白质交联 •基于GFP的细胞内蛋白质相互作用的研究方法 •噬菌体显示系统筛选
转录激活结构域(AD) (activation domain)
这两个结构域各具功能,互不影响, 单独存在时没有转录激活的功能,只有两 者通过共价或非共价键连接建立起来的空 间结构方可表现出一个完整的激活特定基 因表达的激活因子的功能。
Gal4为酵母半乳糖苷酶基因gal1的转录激活 因子,天然的Gal4分子是由一条由881个氨基 酸残基组成的多肽链。
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