1-4酶分类和命名.

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④ 在每个小类中,包括若干个具体的酶;
⑤ 在可能与蛋白类酶混淆的情况下,表明R酶,以 示区别。
分子内催化的R酶
指催化本身RNA分子进行反应的一类核酸类酶, 该大类酶均为RNA前体。 根据催化的反应类型可分为: 1)自我剪切酶(进行剪切反应) 2)自我剪接酶(同时进行剪切和连接反应):可 分为 含Ⅰ型IVS的R酶和含Ⅱ型IVS的R酶等。
OH OH
连接酶
连接酶,又称为合成酶,能够催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成反应。这类反应必须与ATP分解 反应相互偶联。
A+B+ATP=AB+ADP (or AMP) +Pi 系统名:在两个底物的名称后面加上“连接酶”; 推荐名:合成产物名称之后加上“合成酶”。
例如,谷氨酸:氨连接酶 L-谷氨酸+氨+ ATP = L-谷氨酰胺+ ADP + Pi
天冬氨酸合成酶
L-天冬氨酸+氨+ ATP = L-天门冬酰胺+ AMP + PPi
二、核酸类酶的分类与命名
(一)对R酶的分类原则
① 根据酶作用的底物是其本身RNA还是其他分子, 分为内催化R酶和分子间R酶;
② 每一大类中,根据酶的催化类型不同,又分为若 干亚类,如剪切酶、剪接酶和多功能酶。
③ 在每个亚类中,根据酶的结构特点和催化特性不 同,分为若干小类;
推荐名=底物名称+催化反应的类型
系统名:包括酶的作用底物、酶的作用基 团及催化反应类型。
(三)国际系统分类法及酶的编号
① 根据酶所催化反应类型,把酶分为6大类,即氧化还原酶类、 转移酶类、水解酶类、裂合酶类、异构酶类和连接酶类。分 别用1、2、3、4、5、6来表示。
② 根据酶作用的底物、基团或键的不同将每一大类分为若干个 亚类,每一个亚类又按顺序编成1、2、3、4……等数字。
(二)国际系统命名法
国际系统命名法原则是以酶的整体反应为
基础的,规定每种酶的名称应当明确标明酶的底 物及催化反应的性质。如果一种酶催化两个底物 起反应,应在它们系统名称中包括两个底物的名 称,并以“:”号将它们隔开。若底物之一是水 时,可将水略去不写。
1961年,国际酶学委员会提出并逐步完善 了酶的命名原则,建议每一种具体的酶都 有其推荐名和系统命名。
分子间催化的R酶
是催化其他分子进行反应的核酸类酶 根据作用的底物分子的不同,可分为若干亚类: 1)作用于其他RNA分子的R酶;
RNA剪切酶(能催化其他RNA进行剪切反应) 多功能 R 酶(能催化其他RNA进行百度文库种反应) 2)作用于DNA的R酶; 3)作用于多糖的R酶; 4)作用于氨基酸酯的R酶。
③ 每一个亚类再分为若干个小类,仍用1、2、3、4……编号。
④ 每一个小类中包含若干个具体的酶。
⑤ 每一个酶的分类编号由4个数字组成,数字间由“·”隔开, 编号之前冠以EC(Enzyme Commission)。
[EC1.1.3.4] 表示: 该酶是氧化还原酶类的第一亚类的第三小类中的第四个酶
(四)蛋白类酶系统分类的6大类
系统名:供体:受体某基团转移酶
例如, 谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。
CH3CHCOOH HOOCCH2CH2CCOOH
NH2
O
CH3CCOOH HOOCCH2CH2CHCOOH
O
NH2
水解酶
水解酶催化底物的加水分解反应。 AB+H2O=AOH+BH 系统名:底物名称+水解作用的化学键位置+水解酶 推荐名: 底物名称+酶 主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。 例如,脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反应:
系统名:(氢或电子)供体+受体+氧化还原酶; 推荐名: 某供体脱氢酶 or 某受体还原酶 or 某受 体氧化酶(氧作氢受体时)。
如,乳酸(Lactate)脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。
CH3CHCOOH NAD+ OH
CH3CCOOH NADH H+ O
转移酶类
转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分 子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。 AB+C=A+BC
异构酶
催化分子内部基团或构相的转化的酶,即底物分子 内基团或原子的重排过程。A=B
按异构化类型不同,可分为6个亚类:异构酶、消 旋酶、变位酶、表异构酶、顺反异构酶等。
命名:底物名称后面加上具体异构酶型。
例如,6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。
CH2OH O OH
OH OH
OH
CH2OH
CH2OH
O OH
R COOCH2CH3 H2O RCOOH CH3CH2OH
裂合酶
裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原子形 成双键的反应及其逆反应。主要包括醛缩酶、水 化酶及脱氨酶等。AB=A+B 系统命名:底物-裂解的基团-裂合酶 例如, 延胡索酸水合酶催化的反应。
HOOCCH=CHCOOH H2O
HOOCCH2CHCOOH OH
一、蛋白类酶的分类与命名
(一)习惯命名法
1961年以前使用的酶的名称都是习惯沿用的,称为习 惯名。主要依据两个原则:
1. 根据酶作用的底物命名; 2. 根据酶催化反应的性质及类型命名;有的酶 结合上述两个原则来命名。
习惯命名比较简单,应用历史较长,尽管缺乏系 统性,但现在还被人们使用,然常出现一名多酶或 一酶多名现象。
第四节 酶的分类和命名
按酶的化学组成不同,酶可分为蛋白类酶 (P酶)和核酸类酶(R酶)。
由于两大类酶具有不同的结构和催化功能, 所以又有各自不同的分类和命名原则。
绝大多数酶是蛋白质,根据酶的化学组成, 可把酶分成如下两类:
根据酶蛋白分子的特点分为: 单体酶、寡聚酶、多酶复合体;
根据酶的存在状态分为:胞内酶、胞外酶
氧化还原酶类(Oxidoreductases) 转移酶类(Transferases) 水解酶类(Hydrolases) 裂合酶类(Lyases) 异构酶类(Isomerases) 连接酶类(Ligases)
氧化还原酶
氧化还原酶催化氧化-还原反应。 AH2+B=A+BH2
主要包括脱氢酶(dehydrogenase)和氧化酶 (Oxidase)。
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