如何正确设计从生物样品中分离纯化生物大分子
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结构测定:
多糖一级结构测定:多糖的一级结构分析,主要是分 析组成多糖的单糖类型、数目、连接方式及苷建构型. 常 用化学法和仪器分析法。 多糖高级结构测定:目前研究多糖的二级结构常用的 手段是NMR 技术。近年来,以精确三维结构知识为基础揭 示重要生命活动的规律已达到前所未有的深度和广度。
4. 蛋白质的分离纯化 蛋白质的分离纯化
2.脂质的分离纯化: 2.脂质的分离纯化: 脂质的分离纯化
I.
注意:组织破碎的方法会影响提取的脂质的浓度,因此分析的时候
必须将各种破碎方法进行比较。 II. 操作方法:按照Folch method法进行操作: 先配制氯仿/甲醇=2/1(v/v),取组织按1:20的量和氯仿/ 甲醇一起组织均浆,分层后在室温下在摇床中摇动15-20分钟。 均浆通过滤纸过滤或者离心获得液体。 在离心获得的液体中加入0.2倍体积的水或者0.9%的生理盐 水,涡旋几秒钟混均,然后2000rpm离心得到两相溶液,如果需要 的话用甲醇/水(1/1)的将两相界面洗一到两次,洗的过程不要 让甲醇/水与下层混合。 通过离心和虹吸去掉上层后,下层氯仿相含有脂质,如果体 积在2-3ml以下则通过真空旋转蒸发器或在氮气下浓缩。 二氯甲烷可以替代氯仿,结果表明二氯甲烷/甲百度文库能够取代 氯仿/甲醇,因此能够避免氯仿带来的健康、安全和管理问题。
6.生物大分子纯度的检测 6.生物大分子纯度的检测
根据提纯的生物大分子种类不同,选用相应的 检测方式进行检测。
7.产物的浓缩、 7.产物的浓缩、干燥与保存 产物的浓缩
常用的检测方法
物理、化学方法: 物理、化学方法:
比色法、气相/液相色谱法、 光谱法(紫外/可见、红 外和荧光等分光光度法) 、 电泳法、以及核磁共振等。 但应注意,如果实验对精确性要求较高则必须同时采用 2-3 种不同的纯度鉴定法才能确定。
4. 生物材料的破碎和处理
需要分离的生物大分子往往贮存在生物体内,而根据生物种 类的不同,如微生物、动物、植物等,有不同的生物材料处 理方式,而处理方式的得当与否,往往也决定着最终的提取 率的高低甚至实验的可行性。
5.分离纯化方案的选择和探索 5.分离纯化方案的选择和探索
同样的一类物质往往有很多种方案可以进行分离提纯,但如 何根据所需生物大分子的种类、它所处的生物环境、客观因 素等种种条件来选择最好的一种分离纯化方式,是整个实验 最为困难的步骤。而在一些尖端领域,甚至需要研究人员自 行探索新的方案,这无疑又大大加大了这一步的难度。所以 可以说,这一步是整个实验过程中最为困难的一步,也应是 投入精力最多、选择最仔细的一步。
d. 多糖的分析鉴定: 多糖的分析鉴定: 的分析鉴定
含量的测定:测定方法:硫酸-苯酚法、硫酸-蒽酮法、 比色定量法、分光光度法、纸色谱法、离子交换色谱法、 yaphe 法、薄层色谱法、酶法、原子吸收法、HPLC 法、凝 胶电泳法、亲和电泳法、连续流动分析法检测法、次亚碘 酸盐定量法、蒽酮-硫酸法(总糖)、DNS 法( 还原法)、 磷钼比色法、邻钾苯胺比色法等. 每种方法只对某些多糖 的测量效果好. 比色法、分光光度法、离子交换色谱法、 酶法和电泳法等可同时用于多糖的定性定量分析。
生物学的测定法: 生物学的测定法:
酶活测定、蛋白质含量测定、免疫化学方法、放射性同 位素示踪法等;
实验需要了解的理化性质
在水和各种有机溶剂中的溶解性。 在不同温度、pH 值和各种缓冲液中生物大分子的稳定性。 固态时和冻干时的稳定性。 物理性质: 分子的大小、穿膜的能力、带电的情况、在电 场中的行为、 离心沉降的表现、在各种凝胶、树脂等填料 中的分配系数等。 化学性质: 对各种蛋白酶、水解酶的稳定性和对各种化学 试剂的稳定性。 对其他生物分子的特殊亲和力等。
蛋白质、核酸和多糖是3类主要的生物大分子,它们在分子结 构和生理功能上差别很大,然而,在以下几个方面又显出共 性: 在活细胞内,生物大分子和相应的生物小分子之间 的互变,通常通过脱水缩合,或加水分解。 蛋白质链(或称肽链)、核酸链和糖链都有方向性, 尽管方向性的体现各不相同。 蛋白质、核酸和多糖分子都有各具特征的高级结构, 正确的高级结构是生物大分子执行其生物功能的必要 前提。 在活细胞中,生物大分子互相密切配合,共同参与 生命过程,甚至很多情况下形成生命活动必不可少的 复合大分子,如核蛋白、糖蛋白。
通用的技术路线设计方案
1. 确定要分离提纯的生物大分子的目的和要求
不论是学生学习简单的分离提纯方法,还是科 研人员进行研究、开发或者探索新物质,一个 明确的目的和要求都是必不可少的。本课题要 求对生物大分子进行分离提纯,也即在了解生 物大分子(即蛋白质、核酸、脂质、糖类)的 前提下,进行尽可能完善的提纯,同时也应注 意满足现实设备情况。
(2) 前处理:
定义:把蛋白质从原来的组织或细胞中以溶解的状态释放出 来,并保持原来的 天然状态,不丢失生物活性。 选择适当的方法,破碎组织和细胞: 动物组织和细胞:用电动捣碎机或匀浆器破碎或用 超声波处理法破碎; 植物组织和细胞:使用石英砂和适当的提取液一起 研磨的方法破碎或 用纤维素酶处理。 细菌细胞:常用方法有超声波振荡,与砂研磨、高 压挤压或溶菌酶处理等。 如果蛋白质主要集中在某一亚细胞, 例如细胞核、 染色体、核糖体或可溶性的细胞浆等。用差速离心方法分 离, 收集亚细胞组分材料。 如果蛋白质是与细胞膜或膜质细胞器结合, 必须用 超声波或去污剂使膜结构解聚。
浓缩:常用沉淀的方法。其好处是:改变核酸的溶解缓冲液;重
新调整核酸的浓度;去除溶液中某些盐离子与杂质。常用方法如下: 盐溶液沉淀:如MgCl2;NaAc;KAc等。 有机溶剂沉淀:如乙醇;异丙醇;聚乙二醇(PEG);精胺等。 低温长时间沉淀,易导致盐与DNA共沉淀,影响以后的实验。 一般使用0℃冰水,10-15min, DNA样品足可达到实验要求。 测定:一般选用紫外分光光度法或溴乙锭荧光法测定核酸的含量。 保存:对DNA和RNA有不同的保存方式: 对DNA:DNA样品溶于pH8.0的TE,4 ℃或-20 ℃保存;长期保 存样品中可加入1滴氯仿。 对RNA:RNA样品溶于0.3 mol/L NaAc (pH5.2)或双蒸灭菌水中, -70 ℃保存;长期保存可以沉淀形式贮于乙醇中;在RNA溶液中, 加1滴0.2 mol/L氧钒核糖核苷复合物冻贮于-70℃,可保存数年。
除杂:
除蛋白质:沙维积法(Sevag法);三氟三氯乙烷法;三氯醋酸 法;酶解法;盐酸法;其它方法(如加入5%ZnSO4溶液和饱和Ba (OH)2溶液,振荡后离心去蛋白,但此方法不够彻底)。 除色素:活性炭除色素;弱碱性树脂DEAE纤维素或DuoliteA-7 来吸附色素(针对植物色素);氧化脱色(糖和色素时结合,易被 DEAE纤维素吸附,不能被水洗脱的);依次用丙酮、无水乙醚和无 水乙醇洗涤多糖;用4:1的氯仿-正丁醇除色素 除低聚糖等小分子杂质:逆向流水透析法。
2. 建立相应可靠的分析测定方法
分离提纯最为重要的就是最终的“纯度”,所以 一套完善可靠地分析测定方法就是进行工作的前 提条件。没有这双“眼睛”,将无法得到最终的 实验结果。
3. 查阅文献调研和预备性实验
要进行分离提纯就必须掌握四种生物大分子的一 般理化性质以及需要提纯的产物的一些特殊理化 性质,只有这样才能进行分离提纯的工作。
3.糖类 3.糖类的分离纯化 糖类的分离纯化
a.
单、双糖:常见的单、双糖一
般采用合成的方式。制备如下: 脱脂→去杂→浓缩→再次去杂→ 脱色 →浓缩 →冷却 →结晶(→ 进一步纯化)。
b. 多糖的分离纯化:
脱脂:由于多糖被脂质包
围,通常用醇或醚回流脱脂。
提取:
热水浸提法 微波辅助提取法 超声辅助法 索氏提取法 醇提法 其它方法(如稀碱液 浸提法、稀酸液浸提法、 酶法等)
各种生物大分子进行分离提纯的技术路线要点
1.核酸 核酸的分离纯化 1.核酸的分离纯化
① 分离纯化原则:
保持核酸分子一级结构的完整性
意义:遗传信息全部储存在一级结构之中,核酸的—级结构还 决定其高级结构的形式以及和其他生物大分子结合的方式。 具体原则:温度不要过高;控制pH值范围(pH值5-9); 保持一 定离子强度; 减少物理因素对核酸的机械剪切力。 防止核酸生物降解 DNA酶抑制剂:金属离子螯合剂;阴离子型表面活性剂 RNA酶抑制剂:皂土;DEPC(二乙基焦碳酸盐);肝素;复合硅 酸盐;RNase阻抑蛋白;氧钒核糖核苷复合物
10级临床七年二班 10级临床七年二班 第五组
背景介绍: 背景介绍:生物大分子
生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分 生物大分子 的各种分子量达到上万或更多的有机分子。常见的 生物大分子包括蛋白质、核酸、脂类、糖类。实际 上生物大分子的特点在于其表现出的各种生物活性 和在生物新陈代谢中的作用。 生物大分子大多数是由简单的组成结构聚合而 生物大分子 成的,例如蛋白质的组成单位是氨基酸,核酸的组 成单位是核苷酸等。
②
分离纯化的步骤: 分离纯化的步骤: 步骤
取材:核酸在细胞内部,所以需要破碎细胞才能取得核酸,常用 取材 方法如下:高速组织捣碎机捣碎;玻璃匀浆器匀浆;超声波处理法; 液氮研磨法;化学处理法(SDS、LDS,吐温80等);生化法(溶菌酶、 纤维素酶等)
除杂:
肝糖元、淀粉及粘多糖:取材前尽量减少组织中多糖的含 量,如先使动物饥饿数天然后杀死;加入淀粉酶;在浓磷酸 盐存在下,以2-甲氧基乙醇抽提核酸提取液;以钙盐沉淀DNA, 再以草酸钾处理,使之形成DNA钾盐回收,然后用离子交换法 吸附DNA。 蛋白质的除去:加入去污剂如SDS;氯仿-戊醇或辛醇对提 取液摇荡抽提;苯酚水溶液抽提;加入浓盐溶液如NaCl。 不同类型核酸的分离:(1)从DNA中除去RNA:核糖核酸 酸酶选择地破坏RNA;钙盐分步沉淀;活性炭吸附。(2)从 RNA中除去DNA:苯酚水溶液抽提;加入脱氧核糖核酸酶处理。 同类核酸的分离:(1)RNA混合物的分离:多应用柱层析、 梯度离心及逆流分溶等方法。(2)DNA混合物的分离:常用 磷酸钙、ECTEOLA-纤维素、DEAE-纤维素和甲基化白蛋白柱层 析,逆流分溶,梯度离心等方法。
(1)基本原理:一是利用混合物中几个组分分配系数的差异,
把它们分配到两个或几个相中, 如盐析、有机溶剂沉淀、 层析和结晶等;二是将混合物置于某一物相(大多数是液相) 中,通过物理力场的作用,使各组分分配于不同的区域, 从而达到分离的目的, 如电泳、离心、超滤等。关键技术 是电泳、层析和高速与超速离心。纯化蛋白质大分子涉及纯 度和产率 实际中两者不能兼得,视目的而取舍。
纯化:
分部沉淀法 盐析法 季铵盐沉淀法 柱层析 制备性区域电泳 膜分离法 金属络合物法 其它方法(如超过滤法、活性炭柱色谱、LKB柱色谱系统等)
c. 黏多糖(酸性黏多糖)的分离纯化: 黏多糖(酸性黏多糖)
定义:粘多糖是一类广泛存在于动物体内的含糖醛酸和氨基糖
残基的复合多糖 提取:黏多糖大多与蛋白质共价结合,首先常用酶降解部分蛋 白或用碱使多糖-蛋白质间的键断裂,促进提取时的溶解。然后用普 通蛋白沉淀法沉淀蛋白。 分离:采用有机溶剂分离法、季铵化合物沉淀法或离子交换层 析法即可。
纯度鉴定:多糖是高分子化合物,其纯品微观上是不均一的,
通常所说的多糖纯品实质上是一定分子量范围的均一组分. 多糖纯 度鉴定的常用方法:超离心、高压电泳、凝胶层析、HLPC 法等. 现在应用较多的是HLPC 法,旋光度测定也是纯度测定的一种方法。 分子量的测定:多糖分子量的测定是研究多糖性质的一项重要 工作. 常用方法:渗透压法、蒸气压渗透剂法、端基法、粘度法、 光散射法、凝胶色谱法、超过率法、沉淀法、凝胶电泳法、HPLC 法、超离心分析法、分子筛色谱法、GPC 法、MALDI-TOF-MS 法.
粗分级: (3)粗分级:
定义:选用一套适当方法,把蛋白质混合物提取液中,所要的
蛋白质与其他杂蛋白质分离开来。 方法:盐析、等电点沉淀和有机溶剂分级分离等方法。
细分级: (4)细分级:
定义:样品的进一步提纯。 方法: 层析法:凝胶过滤,离子交换层析,吸附层析以及