最新生物化学笔记(汇总)
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1.1 蛋白质的分子组成
构成人体的20种氨基酸均属于L-α-氨基酸(除甘氨酸)
【氨基酸的分类、结构式、中文名和英文缩写】
含硫氨基酸:半胱氨酸、胱氨酸、甲硫氨酸(蛋氨酸)
脯氨酸和赖氨酸可被羟化为羟脯氨酸、羟赖氨酸
20种氨基酸的理化性质:等电点、紫外吸收(Tyr、Trp含共轭双键,A280)、茚三酮反应【谷胱甘肽的组成、结构特点、主要活性基团、作用】
1.2 蛋白质的分子结构
一级结构:氨基酸从N端到C端的排列顺序肽键、二硫键
二级结构:局部主链骨架原子(Cα、N、Co)构象氢键
{α−螺旋(3.6个残基上升一圈,螺距0.54nm),β−折叠(平行和反平行,5~8个残基)β−转角(转角处常有Pro),无规卷曲
超二级结构(αα、βαβ、ββ)模体
三级结构:全部氨基酸残基相对空间位置次级键
四级结构:亚基相对空间位置和连接处布局次级键肽单元(Cα1、C、O、N、H、Cα2)
1.3 蛋白质结构与功能的关系
尿素、β-巯基乙醇分别可以破坏肽链中的次级键、二硫键
【肌红蛋白与血红蛋白】
肌红蛋白(Mb)为单一肽链蛋白质,含有一个血红素辅基;
血红蛋白(Hb)四个亚基(2α、2β),每个亚基都有一个血红素辅基;
肌红蛋白与血红蛋白亚基的三级结构相似;
肌红蛋白的氧解离曲线为直角双曲线、血红蛋白为S形曲线;
血红蛋白有紧张态(T)和松弛态(R),R态为结合氧的状态。
蛋白质构想改变引起疾病:疯牛病、阿尔兹海默症、亨廷顿舞蹈病
1.4 蛋白质的理化性质
两性电离、胶体性质(水化膜和电荷效应维持稳定)、双缩脲反应(检测蛋白质水解程度)
1.5 蛋白质的分离、纯化与结构分析
透析、超滤法可去除蛋白质溶液中的小分子化合物。
丙酮沉淀、盐析、免疫沉淀是常用的蛋白质浓缩方法
既可以分离蛋白质又可以测定其分子量的方法是超速离心
*简答题或论述题:
1、简述α-螺旋结构的主要特征
要点:右手螺旋、螺距和上升一圈的残基数、侧链位于外侧、氢键维持稳定
2、简述谷胱甘肽的结构特点和生物学功能?
要点:非α肽键、巯基、体内重要还原剂
3、蛋白质变性后有什么改变?
(1)生物活性丧失(2)空间结构被破坏、肽键完好(3)溶解度降低
(4)黏度增加(5)不易结晶、易沉淀(6)易被蛋白酶水解
2.1 核算的化学组成和一级结构
糖苷键:核糖的C-1’原子和嘌呤的N-9原子或嘧啶的N-1原子形成的共价键。
核酸的一级结构:5’-3’的核苷酸或脱氧核苷酸排列顺序。
2.2 DNA的空间结构与功能
DNA双螺旋结构模型的要点:
(1)反向平行多聚核苷酸链(2)右手螺旋及其参数(3)维持稳定的因素
一些参数:直径2.37nm螺距3.4nm 两个相邻碱基旋转角36°
【核小体的组成】人端粒的重复序列:TTAGGG
2.3 RNA的结构与功能
一、mRNA(丰度最小,占细胞总RNA的2%-5%)
结构要点:5’帽(m7Gppp)、3’尾(poly A)、开放阅读框(ORF)和非翻译区
帽子结构和多聚尾的作用:
(1)mRNA核内向胞质的转位(2)mRNA的稳定性维系(3)翻译起始的调控
二、tRNA(占细胞总RNA的15%)
结构要点:稀有碱基、茎环结构、3’端接纳臂(CCA)、反密码子
tRNA二级结构:三叶草形三级结构:倒“L”形
三、rRNA(占细胞总RNA的80%以上)【核糖体的组成】
四:其它非编码RNA
小干扰RNA(siRNA):降解外源入侵基因表达的mRNA
核酶:有酶活性的RNA,催化特定RNA降解,剪接修饰中有重要作用
核仁小RNA(snoRNA):参与rRNA的加工和修饰
2.4 核酸的理化性质
1、紫外吸收(A260)A260/A280:纯DNA为1.8,RNA为2.0
2、等电点
3、变性与复性
*思考题
3、简述tRNA二级结构的特点?
4、DNA与RNA的结构和功能有何异同?
同:都是线性多聚核苷酸生物信息大分子;都可以作为遗传信息的载体;
基本结构单位(碱基+戊糖+磷酸)相同。
异:戊糖类型;碱基类型;常见结构。
5、DNA变性后理化性质的改变。
(1)粘度下降(2)生物活性丧失(3)增色效应
(4)比旋度下降(5)浮力密度升高(6)滴定曲线改变
第三章 酶
3.1 酶的分子结构与功能
概念:单体酶、多聚酶、多酶复合物、多功能酶 单纯酶、结合酶=酶蛋白+辅助因子(辅酶、辅基)
辅酶:与蛋白质结合疏松,可用透析或超滤除去。在酶促反映中作为底物接受质子或基团后离开酶蛋白。辅基:与蛋白质结合紧密,不能用透析或超滤除去。酶促反应中不离开酶蛋白。 【金属离子作为辅助因子的主要作用】
(1)组成活性中心,参加催化反应 (2)连接酶与底物的桥梁 (3)中和阴离子,降低静电斥力 (4)稳定酶的空间构象 必需基团{
活性中心内:结合基团,与底物相结合;催化基团,催化底物变成产物。
活性中心外:维持酶活性中心应有的空间构象所必需
乳酸脱氢酶(LDH )是含Zn 的四聚体酶,由骨骼肌型(M 型)和心肌型(H 型)组成。 H4(LDH1)、H3M (LDH2,血清中“最多”)、H2M2、HM3、M4(LDH5,肝中“最多”)
3.2 酶的工作原理
1、高效性
2、专一性(相对、绝对)
3、可调节性
4、不稳定性 催化机理:诱导契合假说、邻近效应与定向排列、表面效应
3.3 酶促反应动力学 米-曼式方程:v =
Vmax 【S 】Km+【S 】
Km 是特征性常数。
酶的抑制剂【定义】{
不可逆性(共价结合){有机磷农药→胆碱酯酶,解毒剂:解磷定路易士气→巯基酶,解毒剂:二巯基丙醇可逆性(非共价结合){竞争性:与底物竞争结合酶的活性中心 非竞争性:结合酶活性中心之外的调节位点反竞争性:仅结合酶−底物复合物
3.4 酶的调节
酶活性调节是快速调节:别构调节(正协同效应→S 曲线)、共价修饰(主要是磷酸化) 酶含量调节是缓慢调节。
酶原是无活性的酶前体;酶原的激活实质是活性中心的暴露。
*思考题
1、试述三种竞争性抑制剂作用的区别和动力学特点。
2、酶与一般催化剂相比有何异同?
同: 反应前后量不变;不改变平衡常数;只催化热力学允许的反应;机理都是降低活化能 异: 酶具有高效、有特异性、可调节性、不稳定性。 3、金属离子作为酶的辅助因子的作用有哪些?