第五章讲义核酸的分离纯化

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浓度鉴定
紫外分光光度法:测定DNA在A260nm的光吸收值。 如计算DNA浓度
A260×稀释倍数×50= μg/ml
(A值等于1时,相当于50μg/ml双链DNA, 40μg/ml单链DNA或RNA, 20 μg/ml单链寡核苷酸)
紫外分光光度法只用于测定浓度大于0.25ug/ml的核酸 溶液。
三、核酸的鉴定与保存
二、技术路线的设计
(一)核酸的释放 (二)核酸的分离与纯化 (三)核酸的浓缩、沉淀与洗涤
二、技术路线的设计
(一)核酸的释放
DNA和RNA均位于细胞内(病毒除外),因 此核酸分离与纯化的第一步即是裂解细胞、释 放核酸。
表5-1 各种组织细胞破碎方法
Ⅰ机械法 Ⅱ物理法 Ⅲ化学法
细胞破碎方法
1匀浆法 2捣碎法 3研磨法 1超声法 2反复冻融法 3冷热交替法 4低渗裂解 1有机溶剂 2去垢剂 3酶解法
三、核酸的鉴定与保存
• 一般而言,28S(23S)RNA的荧光强度约为18S (16S)RNA的2倍,否则提示有RNA的降解。若 在点样孔附近有着色条带,则说明存在DNA 的污染。
三、核酸的鉴定与保存
总RNA电泳图谱
正常时,28S RNA的荧光强度 约为18S RNA的 2倍,否则提示 RNA的降解
以EB为示踪剂的核酸凝胶电泳结果可 判定核酸制品的完整性。基因组DNA片段 的分子量很大,在电场中泳动很慢,如果 发生降解,电泳图呈拖尾状。
三、核酸的鉴定与保存
DNA片段的降解
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
三、核酸的鉴定与保存
• 完整或降解很少的总RNA电泳图谱中,三条带荧 光强度积分应呈特定的比值,沉降系数大的核 酸区带,电泳迁移低,荧光强度积分高;反之, 分子量小,电泳迁移率高,荧光强度积分低。
第五章 核酸的分离纯化
第一节 核酸分离纯化的设计及原则 第二节 基因组DNA的分离纯化 第三节 质粒DNA的提取与纯化 第四节 RNA的分离纯化
第一节 核酸分离纯化的设计及原则
第一节 核酸分离纯化的设计及原则
一、材料与方法的选择 二、技术路线的设计 三、核酸的鉴定与保存
一、材料与方法的选择
(一) 材料与方法的选择 (二) 选择原则
精品
第五章核酸的分离纯化
第五章 核酸的分离纯化
核酸的结构与功能是分子水平生命活动的基础; 内源基因的突变、表达及调控的异常和外源致病 基因的侵入是人类疾病发生、发展的根源。
第五章 核酸的分离纯化
DNA、RNA是生物体中最重要的核酸分子,是分 子生物学和分子诊断的研究对象。 DNA、RNA的分离纯化是分子生物学研究及对疾 病进行分子诊断的最基础工作。
在TE缓冲液中,纯DNA的A260/A280为1.8 纯RNA的A260/A280比值为2.0
三、核酸的鉴定与保存
1. DNA或RNA的定量 OD260=1.0相当于 50μg/ml双链DNA 40μg/ml单链DNA(或RNA) 20μg/ml寡核苷酸
2.判断核酸样品的纯度 DNA纯品: OD260/OD280 = 1.8 RNA纯品: OD260/OD280 = 2.0
氯化钾及氯化镁 • 常用的有机溶剂则为乙醇、异丙醇和聚乙二醇 • 核酸沉淀常常含有少量共沉淀的盐,需用70%~75%
的乙醇洗涤去除
三、核酸的鉴定与保存
(一)核酸的鉴定 (二)核酸的保存
三、核酸的鉴定与保存
(一)核酸的鉴定 1、浓度鉴定 2、纯度鉴定 3、完整性鉴定
三、核酸的鉴定与保存
1、浓度鉴定 ⑴ 紫外分光光度法:该法是基于核酸分子 中的碱基具有共轭双键结构因而可以吸收 紫外线,其最大吸收波长为260nm。
第五章 核酸的分离纯化
核酸分离纯化的原则 一、 保持核酸一级结构的完整性 二 、尽可能提高核酸制品的纯度
提取DNA总的原则
1 保证核酸一级结构的完整性; 2 其他生物大分子如蛋白质、多糖和脂类 分子
的污染应降低到最低程度; 3 核酸样品中不应存在对酶有抑制作用的有机溶
剂和过高浓度的金属离子; 4 其他核酸分子,如RNA,也应尽量去除。
一、材料与方法的选择
(一) 材料与方法的选择
不同的研究目的对核酸的完整性、纯度、产量及浓 度可能有不同的要求 • 需考虑制备核酸所需的时间与成本 • 应选择安全的试剂与制备方案
一、材料与方法的选择
(二) 选择原则 1、保持核酸碱基序列的完整性 2、尽量清除其它分子的污染,保证核酸纯度 3、保持核酸的完整性 应尽量简化分离纯化步骤,缩短提取时间 尽量避免各种有害因素对核酸的破坏
应用
机体软组织 动物韧性组织 细菌、酵母 细胞混悬液 培养细胞 细菌、病毒 红细胞 细菌、酵母 组织、培养细胞 细菌、酵母
核酸分子抽提的技术设计
核酸的释放:
破裂细胞
释放核酸
机械法与非机械法(非机械法中溶胞法是应 用最广泛的方法)
核酸的分离与纯化:
将含有核酸分子复杂复合物中,将核酸与其
他物质分离
非核酸的大分子污染物(蛋白质、多糖和脂
三、核酸的鉴定与保存
各种碱基的紫外吸收光谱
三、核酸的鉴定与保存
⑵ 荧光光度法:核酸的荧光染料溴化乙锭嵌 入碱基平面后,本身无荧光的核酸在UV激 发下发出红色荧光,且荧光强度的积分与 溶液中核酸的含量呈正比。
EB与DNA的结合
三、核酸的鉴定与保存
2、纯度鉴定
⑴ 紫外分光光度法:该法主要通过A260与A280 的比值来判定有无蛋白质的污染,比值升高与 降低均提示不纯。
类分子)、非需要的核酸分子、试剂和溶液
二、技术路线的设计
(二)核酸的分离与纯化 应该清除的杂质主要包括三部分 1、非核酸的大分子污染物:蛋白质、多糖及脂类
物质等 2、非需要的核酸分子:分离某一特定的核酸分子
时,其它的核酸分子皆为杂质 3、加入的有机溶剂和某些金属离子
二、技术路线的设计
(三)核酸的浓缩、沉淀与洗涤 • 沉淀是浓缩核酸的最常用的方法 • 常用的盐类有醋酸钠、醋酸钾、醋酸铵、氯化钠、
⑵荧光光度法:用EB等荧光染料示踪的核酸电 泳结果可判定核酸制品的纯度。DNA分子较 RNA大得多,电泳迁移率低。
荧光光度法 荧光染料溴化乙锭,可嵌入到碱基平面,而
发出荧光,且荧光强度与核酸含量呈正比。 适用于低浓度核酸溶液的定量分析。(1-5ng)
三、核酸的鉴定与保存
3、完整性鉴定 ⑴ 琼脂糖凝胶电泳法:
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