优选第六章个体遗传评定选择指数法
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优选第六章个体遗传评定选择 指数法
✓ 相 对 育 种 值(relative breeding value, RBV): 个体
育种值相对于所在群体均值的百分数R。BV 通 常 以 100 为
标 准 ， 超 过 100 者
RBV Aˆ 100% RBV (1 Aˆ ) 100%
P
P
育种值高于群体均 值 ； 低 于 100 者 一 般不留做种用。
➢ 偏回归系数的求解
✓建立正规方程组：
1
p12
r21
r12
1 p22
r13 r23
1
r31
r32
p32
rm1
rm 2
rm3
pi:各类亲属到被估个体
育种值的通径系数；
rij:各亲属彼此间的亲缘
相关；
bi:偏回归系数；
r1m
riX:提供信息亲属与被估 个体间的亲缘系数。
rwk.baidu.com m
b1 b2
通过育种值对表型值的多元回归来估计，即
Aˆ b1(P1 P1) b2(P2 P2) ......bn(Pn Pn)
bi Xi b'x
式中，Xi —以离均差形式表示的第 i 种亲属的表 型信息；
bi —被估个体育种值对 Xi 的偏回归系数； x —为信息的表型值向量； b′—为偏回归系数向量。
选择时，利用多元统计方法所得到的利用了多种遗传
信息（个体、祖先、同胞、后裔）的个体育种值。
育种值有关概念小结
育种值
估计值
单信息
个体育种值
单
估计育种值
个体育种值
性
估计育种 值的一半
复合育种值 多信息
状
估计传递力
多
综合育种值
性
状
第二节 单性状育种值估计
个体育种值估计的信息来源
后裔
全同胞 同胞
半同胞
种用价值
✓系谱信息
• 包括父母及祖先的表型信息 • 主要利用父母的信息，然后是祖父母 • 更远的祖先提供信息价值有限，一般少用 • 单亲信息的bAP只有个体本身信息的一半，rA=
0.5 • 早期选择：个体性状未表现之前
个体出生前，根据系谱记录的亲本成绩预 测后代育种值
个体出生后，亲本信息作为个体选择的辅 助信息，提高育种值估计的准确度
多个同类个体单次度量时，rP rA*h2
rA* 提供信息的同类个体间的亲缘系数。
不同信息估计育种值的回归系数
➢ 育种值估计的准确度 ✓ 定义：估计育种值
P* :信息表型标准差
与真实
2 P*
1
(n n
1)rP
2 P
育种值 A 间的相关系数
A :性状的加性遗传
标准差
2 P
:性状的表型方差
✓ 计算公式：
✓ 估计育种值的准确度取决于：被估个体与 提供信息个体间的亲缘关系（rA）、性状的 遗传力(h2)、可利用的信息数量(n)及表型信 息间的相关（ rP ）等
➢ 利用不同信息来源估计育种值
✓ 个体本身信息 • 通过个体性能测定获得，利用个体本身信 息估计育种值 • 包括单次度量值、多次度量值两种情况
阈性状选择（产羔数）
✓ 后裔信息估计育种值的特点
• 育种值估计准确度高，但延长了世代间隔 • 主要针对影响较大且不能进行个体测定的种畜，
如乳用种公牛的选择 • 测定数量相等时，半同胞后裔测定的效率较全同
胞后裔测定高
✓后裔信息估计育种值注意事项
• 消除与配母畜效应的影响：随机交配、统计方法 • 控制后裔所处的环境：不同种公畜的比较，应在
✓ 同胞信息
• 包括全同胞信息和半同胞信息 • 全同胞：同父同母的子女间，无近交情况时
亲缘系数为0.5。 • 半同胞：同父异母或同母异父的子女间，无
近交情况时为0.25。
✓ 同胞信息估计育种值的特点
• 同胞数目较多，可提高育种值估计的准确度 • 性状度量需屠宰后才能得到（如眼肌面积） • 可作早期选择、限性性状选择（产奶量）、
单次度量值：回归系数即性状的遗传力 多次度量值：提高了育种值估计的准确度， 消除部分特殊环境效应对个体的影响
bAP 取决于度量次数k和性状重复力re ：k越多， bAP 相对越大； re 越高，单次度量值的代表性
越强，多次度量提高的效率变低
✓ 个体本身信息估计育种值的特点
• 育种值估计准确度取决于性状遗传力大小 • 高遗传力性状通常采用个体测定 • 非限性性状应充分利用这一信息：如体重等
r1X r2 X
r3m
b3
r3
X
1
bm
rmX
pm2
C
b =r
其中，C为系数矩阵：其对角线元素为各类亲属到 被估个体育种值通径系数（path coefficient）平方 的倒数；非对角线元素为各亲属彼此间的亲缘相关；
bAP — 育种值对提供信息亲属表型值的回归
系数；
P* — 提供信息亲属的表型值；
P —提供信息亲属所在群体的平均表型值。
bAP
rAnh2 1 (n 1)rP
n 个体本身的度量次数或同类亲属个体数； rA 个体与提供信息亲属间的亲缘相关；
rP 多个表型值间的相关。
一个个体多次度量时，rP re ；
祖先
祖父 父
祖母
本身性能
外祖父 母
外祖母
估计育种值的基本原理
✓ 育种值不能直接度量，只能用表型值估计。 ✓ 估计原理：线性回归。通用的回归方程为：
yˆ byx (x x) y
其中：x为自变量，y为因变量，byx为y对x的回归 系数。 ✓ 设表型值P为自变量，育种值A为因变量，则育 种值对表型值的回归方程为：
✓ 综合育种值(total breeding value, TBV): 多性状选择
时，根据各个性状的经济重要性对各单性状育种值进
行加权的加权育种值。是一个以货币为单位的指数。
n
H wiai 1
wi: 第 i 个性状的经济重要性 ai: 第 i 个性状的育种值
✓复合育种值 (complex breeding value, CBV): 单性状
Aˆ bAP (P P) A ✓ 在大群中，各种偏差正负抵消，故： P A
Aˆ bAP (P P) P
单一亲属信息育种值估计
➢ 基本原理
通过育种值对表型值的回归来估计，即：
EBV
A
bAP(P
P)
EBV表示为与群体均值 的离差形式，这在育种
值估计中非常必要。
式中：A— 个体的估计育种值；
相同或相似的环境条件下饲养它们的女儿 • 保证一定的测定数量
Accuracy of predicting breeding values from progeny records depends on heritability and number of progeny
多种亲属信息育种值估计
➢ 基本原理
✓ 相 对 育 种 值(relative breeding value, RBV): 个体
育种值相对于所在群体均值的百分数R。BV 通 常 以 100 为
标 准 ， 超 过 100 者
RBV Aˆ 100% RBV (1 Aˆ ) 100%
P
P
育种值高于群体均 值 ； 低 于 100 者 一 般不留做种用。
➢ 偏回归系数的求解
✓建立正规方程组：
1
p12
r21
r12
1 p22
r13 r23
1
r31
r32
p32
rm1
rm 2
rm3
pi:各类亲属到被估个体
育种值的通径系数；
rij:各亲属彼此间的亲缘
相关；
bi:偏回归系数；
r1m
riX:提供信息亲属与被估 个体间的亲缘系数。
rwk.baidu.com m
b1 b2
通过育种值对表型值的多元回归来估计，即
Aˆ b1(P1 P1) b2(P2 P2) ......bn(Pn Pn)
bi Xi b'x
式中，Xi —以离均差形式表示的第 i 种亲属的表 型信息；
bi —被估个体育种值对 Xi 的偏回归系数； x —为信息的表型值向量； b′—为偏回归系数向量。
选择时，利用多元统计方法所得到的利用了多种遗传
信息（个体、祖先、同胞、后裔）的个体育种值。
育种值有关概念小结
育种值
估计值
单信息
个体育种值
单
估计育种值
个体育种值
性
估计育种 值的一半
复合育种值 多信息
状
估计传递力
多
综合育种值
性
状
第二节 单性状育种值估计
个体育种值估计的信息来源
后裔
全同胞 同胞
半同胞
种用价值
✓系谱信息
• 包括父母及祖先的表型信息 • 主要利用父母的信息，然后是祖父母 • 更远的祖先提供信息价值有限，一般少用 • 单亲信息的bAP只有个体本身信息的一半，rA=
0.5 • 早期选择：个体性状未表现之前
个体出生前，根据系谱记录的亲本成绩预 测后代育种值
个体出生后，亲本信息作为个体选择的辅 助信息，提高育种值估计的准确度
多个同类个体单次度量时，rP rA*h2
rA* 提供信息的同类个体间的亲缘系数。
不同信息估计育种值的回归系数
➢ 育种值估计的准确度 ✓ 定义：估计育种值
P* :信息表型标准差
与真实
2 P*
1
(n n
1)rP
2 P
育种值 A 间的相关系数
A :性状的加性遗传
标准差
2 P
:性状的表型方差
✓ 计算公式：
✓ 估计育种值的准确度取决于：被估个体与 提供信息个体间的亲缘关系（rA）、性状的 遗传力(h2)、可利用的信息数量(n)及表型信 息间的相关（ rP ）等
➢ 利用不同信息来源估计育种值
✓ 个体本身信息 • 通过个体性能测定获得，利用个体本身信 息估计育种值 • 包括单次度量值、多次度量值两种情况
阈性状选择（产羔数）
✓ 后裔信息估计育种值的特点
• 育种值估计准确度高，但延长了世代间隔 • 主要针对影响较大且不能进行个体测定的种畜，
如乳用种公牛的选择 • 测定数量相等时，半同胞后裔测定的效率较全同
胞后裔测定高
✓后裔信息估计育种值注意事项
• 消除与配母畜效应的影响：随机交配、统计方法 • 控制后裔所处的环境：不同种公畜的比较，应在
✓ 同胞信息
• 包括全同胞信息和半同胞信息 • 全同胞：同父同母的子女间，无近交情况时
亲缘系数为0.5。 • 半同胞：同父异母或同母异父的子女间，无
近交情况时为0.25。
✓ 同胞信息估计育种值的特点
• 同胞数目较多，可提高育种值估计的准确度 • 性状度量需屠宰后才能得到（如眼肌面积） • 可作早期选择、限性性状选择（产奶量）、
单次度量值：回归系数即性状的遗传力 多次度量值：提高了育种值估计的准确度， 消除部分特殊环境效应对个体的影响
bAP 取决于度量次数k和性状重复力re ：k越多， bAP 相对越大； re 越高，单次度量值的代表性
越强，多次度量提高的效率变低
✓ 个体本身信息估计育种值的特点
• 育种值估计准确度取决于性状遗传力大小 • 高遗传力性状通常采用个体测定 • 非限性性状应充分利用这一信息：如体重等
r1X r2 X
r3m
b3
r3
X
1
bm
rmX
pm2
C
b =r
其中，C为系数矩阵：其对角线元素为各类亲属到 被估个体育种值通径系数（path coefficient）平方 的倒数；非对角线元素为各亲属彼此间的亲缘相关；
bAP — 育种值对提供信息亲属表型值的回归
系数；
P* — 提供信息亲属的表型值；
P —提供信息亲属所在群体的平均表型值。
bAP
rAnh2 1 (n 1)rP
n 个体本身的度量次数或同类亲属个体数； rA 个体与提供信息亲属间的亲缘相关；
rP 多个表型值间的相关。
一个个体多次度量时，rP re ；
祖先
祖父 父
祖母
本身性能
外祖父 母
外祖母
估计育种值的基本原理
✓ 育种值不能直接度量，只能用表型值估计。 ✓ 估计原理：线性回归。通用的回归方程为：
yˆ byx (x x) y
其中：x为自变量，y为因变量，byx为y对x的回归 系数。 ✓ 设表型值P为自变量，育种值A为因变量，则育 种值对表型值的回归方程为：
✓ 综合育种值(total breeding value, TBV): 多性状选择
时，根据各个性状的经济重要性对各单性状育种值进
行加权的加权育种值。是一个以货币为单位的指数。
n
H wiai 1
wi: 第 i 个性状的经济重要性 ai: 第 i 个性状的育种值
✓复合育种值 (complex breeding value, CBV): 单性状
Aˆ bAP (P P) A ✓ 在大群中，各种偏差正负抵消，故： P A
Aˆ bAP (P P) P
单一亲属信息育种值估计
➢ 基本原理
通过育种值对表型值的回归来估计，即：
EBV
A
bAP(P
P)
EBV表示为与群体均值 的离差形式，这在育种
值估计中非常必要。
式中：A— 个体的估计育种值；
相同或相似的环境条件下饲养它们的女儿 • 保证一定的测定数量
Accuracy of predicting breeding values from progeny records depends on heritability and number of progeny
多种亲属信息育种值估计
➢ 基本原理