生化-第3章-酶(已看)
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影响酶促反应速率的因素
底物浓度
酶浓度
pH 温度 抑制剂
研究某一因素时,其他因素均固定不变。
一、底物浓度对酶促反应速率的影响
(一)酶促反应速率对底物浓度作图呈矩形双曲线
[S]较低时,V与[S]成 正比; [S] 逐渐增加,反应速 率不再成正比例加速; 当[S]增加到一定程度时, 反应速率不再增加,达到 最大反应速率。
什么是酶?
酶是一类由活细胞产生,对其特 异性底物具有高效催化作用的蛋白质。
酶的生物学意义
●
●
●
生命活动离不开酶 酶对体内的代谢发挥着巧妙的调节作用 人体的许多疾病与酶的异常密切相关
第一节 酶的分子结构
一、酶的分子组成
单纯酶 (simple enzyme) 结合酶 (conjugated enzyme)
四、温度对酶促反应速率的影晌
酶 活 性
2 1.5 1 0.5 0 0 10 20 30 40 50 60
温度
最适温度(optimum temperature) 酶促反应速率最大时 的反应系统温度,称为 酶促反应的最适温度。
图3-8 温度对唾液淀粉酶活性的影响
恒温动物组织中,酶 的最适温度一般在 37~40℃
(二)酶的活性中心 (active center)的概念 必需基团在一级结构上可能相隔甚远, 但在空间结构上十分接近,构成特定的与 酶催化活性密切相关的区域,即能与底物 结合并催化底物转化为产物的空间结构,
称为酶的活性中心(active center)或活
性部位(active site)。
活性中心内的必需基团 结合基团 (binding group) 催化基团
蛋白质部分:酶蛋白(apoenzyme) 全酶 (holoenzyme) 辅因子 小分子有机化合物
(cofactor)
金属离子
(一)金属离子作为辅因子
金属酶
金属离子 结合紧密,不易丢失 金属活化酶 结合疏松,但是酶活性所必须 金属离子的作用 • 稳定酶蛋白的构象。
•
• •
参与催化反应,传递电子。
酶和底物之间发挥桥梁作用。 中和负电荷,降低静电斥力。
(Maximum velocity)。
Km:米氏常数(Michaelis
constant)。
2. 米氏常数( Km)的意义
1) Km值是酶的特征性常数
与酶结构、底物种类、外界环境有关;
与酶浓度无关。
己糖激酶 葡萄糖激酶
G G
G-6-P G-6-P
Km=0.4 × 10-3
Km =12 × 10-3
五、抑制剂对酶促反应速率的影晌
酶的抑制剂(inhibitor,I)
与酶结合使酶催化活性降低或丧失,而 不引起酶蛋白变性的一类化合物。
抑制作用的类型 不可逆性抑制 (irreversible inhibition) 可逆性抑制(reversible inhibition)
(一) 不可逆性抑制(irreversible inhibition)
N
N N NH2
FAD
许多氧化还原酶的辅基。起着氢的传递体作用
维生素PP 尼可酸(nicotinic acid ), 尼可酰胺(nicotinamide ),
COOH N
CONH2 N
活性形式 NAD+ (尼可酰胺-腺嘌呤二核苷酸,又称为辅酶I) 和NADP+(尼 可酰胺-腺嘌呤二核苷酸磷酸,又称为辅酶II )
3)Km值反映了酶对底物亲和力的大小
Km
亲和力愈大;
Km
亲和力愈小
G
己糖激酶 葡萄糖激酶
G-6-P G-6-P
Km=0.4 × 10-3 Km =12 × 10-3
G
二、酶浓度对酶促反应速率的影晌
在酶促反应体系中,底物的浓度又足够大,
酶全部被底物饱和时,则反应速率与酶浓度
成正比 。
初 速 率
酶浓度
抑制剂与酶非共价疏松结合而引起酶活性 降低或丧失,称为可逆性抑制。
特点
a. 结合可逆,除去抑制剂,酶活性可以恢复 ; b. 酶活性降低而非丧失。
类型
根据I与E结合的方式不同,可以分为四种 : 竞争性抑制 (competitive inhibition ) 反竞争性抑制 (uncompetitive inhibition) 非竞争性抑制 (non-competitive inhibition) 混合性抑制 (mixed inhibition )
二、高度特异性 1)定义
一种酶只作用于一种或一类化合物,
进行一种类型的化学反应,以得到一
定结构的产物,这种现象称为酶的特
异性(specificity)。
2) 分类
三种类型: 立体异构特异性(stereo spcificity)
结构特异性(structure specificity)
绝对特异性(absolute specificity) 相对特异性(relative specificity)
第 三 章
酶
(Chapter 3 Enzyme)
本章主要内容
第一节 第二节 第三节 第四节 第五节 第六节 第七节 第八节 第九节 酶的分子结构 酶促反应的特点 酶促反应机制 酶促反应的动力学 酶活性调节 酶活性的测定(自学) 酶的命名和分类(自学) 其他具有催化作用的生物大分子 酶与医学的关系(自学)
0.8
0.6
1/v
0.4
-1/km
无抑制剂
0.2
0.0 -4 -2 0 2 4
-1
6
8
10
1/[S](1/mmol.L )
3. 反竟争性抑制
此类抑制剂只能与酶与作用物的复合体 结合,当ES与I结合后,酶活性被抑制。 动力学特征为Km值变小,最大反应速度 降低。
三种可逆性抑制作用的比较
无抑制 剂 竞争性抑 非竞争性 反竞争性 制剂 抑制剂 抑制剂 E E、ES 不变 降低 ES 减小 降低
一种酶可以催化一类底物(结构相似的物质 或一种化学键)。
磷脂酶A2催化取代基X不同的磷脂水解相同的2-位酯酰键
第三节
酶促反应的机制
一、酶-底物复合物形成和诱导契合学说
酶与底物分子结合时,酶与底物的结构 相互诱导、相互形变、相互适应,使酶活性 中心与底物密切结合,这就是诱导契合 (induced-fit)学说 。
立体异构特异性(stereo spcificity)
一种酶只能作用于立体异构体中的一种。
LDH NAD+ NADH+H+
L - 乳酸
丙酮酸
绝对专一性(absolute specificity) 一种酶只对一种化合物有催化活性。
脲酶
尿素
NH3 + CO2
相对特异性(relative specificity)
作用特点
I的结合部位 酶促动力 学特点
表观Km
Km Vmax
增大 不变
Vmax
第五节 酶活性的调节
调节酶(regulatory enzyme)
因环境因素的作用表现出催化活性变 化,进而调整代谢途径反应速率的酶,统 称为调节酶。
别构酶
酶原 同工酶
一、别构酶(allosteric enzyme) 定义
研究意义
为研究酶结构和功能的关系提供实验 依据;探索酶催化的有利条件,有利于了 解酶在物质代谢中的作用和了解部分药物 的作用机制。
反应速率(Velocity, V )
单位时间内产物的增加量或反应物的减少量。
反应初速率(Initial velocity)
反应刚开始时的反应速率。
下述所提及的反应速率均为反应初速率。
维生素B2 核黄素(Riboflavin)
OHOHOH N N N C O
O OH
CH2CHCHCHCH2OPOH H CH3 CH3 C O NH
活性形式 FAD(黄素-腺嘌呤二核苷酸) FMN(黄素单核苷酸)
OH OHOHOH N N N C O FMN O
OH
CH2CHCHCHCH2OPOCH2 O CH3 CH3 C O NH OH N
细胞内有些酶活性中心以外的某个 部位可与一些代谢物分子可逆结合,引起 酶的空间构象发生改变,进而影响酶的催
化活性。这些通过构象改变而影响其活性
的酶称为别构酶。
2. 别构效应剂
引起别构效应的物质称为别构效 应剂。使酶活性升高的物质称为别构 激活剂,使酶活性下降的物质称为别 构抑制剂。
定义
羟基酶
抑制剂与酶的必需基团以共价键结合而引 起酶活力丧失,不能用物理方法除去抑制剂而 使酶复活,称为不可逆性抑制。
I:敌敌畏、美曲膦酯等农药 有机磷化合物
O RO P
E:蛋白酶、 酯酶(胆碱酯酶) O
X + HO 丝 酶 RO P OR O 酶 + HX
OR
(二)可逆性抑制(Reversible Inhibition) 概念:
三、pH对酶促反应速率的影晌
酶 的 相 对 活 性
胃 蛋 白 酶
胰 蛋 白 酶
碱 性 磷 酸 酶
来自百度文库
酶的最适pH(optimum pH)
2
4
6
8
1 0
pH
在某一pH环境下,使各必需 基团的解离情况得到统筹兼顾, 相互协调,使酶可以发挥最大 活性。这种酶催化活性最高时 反应系统的pH称为酶的最适pH。
图3-7 pH对三种不同酶活性的 影响
2)Km值表示反应速率为最大反应 速率一半时的[S]。
初 速 率
Vmax
Vmax =
max [S] V V Km+[S]
Vmax [S] Km+ [S]
1/2Vmax
2
Km
∴ Km=[S],即Km表示反应速率
底物浓度
为最大反应速率一半时的[S]。 其单位为 mmol/L。
图3 - 4 底物浓度对酶促反应速度的影响
NH2 CONH2 O O N
+ -
N N
N
O
CH2OPOPOCH2 N O O O OH OH
OH
OH(OPO3H2)
许多不需氧脱氢酶的辅酶。起着氢的传递体作用
二、酶的活性中心
(一)必需基团 酶分子中与酶活性密切相关的化学基团。 常见的必需基团:
Ser —— OH Cys —— SH His —— 咪唑基 Asp ——β - COOH
(二)米氏方程
1913年,Michaelis and Menten 提出V与[S]关系的数学方程式。
即著名的Michaelis-Menten 方 程(米氏方程)。
1. Michaelis-Menten 方程
[S]:底物浓度。
V:不同底物浓度下的反应速
V=
Vmax [S] Km + [S]
率。
Vmax:最大反应速率
(catalytic group)
催化底物转变为产物
与底物结合
活性中心外的必需基团
位于活性中心以外,维持酶活性应 有的空间构象所必需。
举例:己糖激酶催化G生成G-6-P的过程
己糖激酶 或葡萄糖激酶(肝)
G + ATP
G-6-P + ADP
第二节
酶促反应特点
一、 高效性 降低活化能
> 105~1017倍
1. 竟争性抑制
某些抑制剂的化学结构与作用物相似,因 而能与作用物竟争并与酶活性中心结合。 使有活性的酶的数量减少,酶促反应被抑 制了。 竟争性抑制通常可以通过增大作用物浓度 ,即提高作用物的竞争能力来消除。
竟 争 性 抑 制
* 举例
丙二酸与琥珀酸竞争琥珀酸脱氢酶
琥珀酸
琥珀酸脱氢酶
延胡索酸
S S S S S
enzyme
products
S
enzyme
enzyme
enzyme
图3-3
酶与底物的诱导契合模型
二、邻近效应和定向排列
三、酸碱催化 四、表面效应
第四节
酶促反应的动力学
(Kinetics of Enzyme-catalyzed Reaction)
概 述
酶动力学
研究酶促反应速率及影响因素的科学。
2. 非竟争性抑制
酶可同时与作用物及抑制剂结合,引 起酶分子构象变化,并导至酶活性下 降。由于这类物质并不是与作用物竞 争并与活性中心结合,因此称为非竞 争性抑制剂。
非 竟 争 性 抑 制
非竞争性抑制作用的动力学特征
加入非竞 争性抑制 剂后,Km 虽然不变 ,但Vmax 减小。
1.0
非竞争性抑制剂
FAD
FADH2
COOH CH2 CH2 COOH
COOH CH2 COOH 丙二酸
琥珀酸
竞争性抑制作用的动力学特征
加入竞争 性抑制剂 后,Km 变 大,最大 反应速度 不变
1.0
0.8
0.6
1/v
竞争性抑制剂
1/Vmax
0.4
0.2
无抑制剂
0 2 4
-1
0.0 -4 -2 6 8 10 1/[S](1/mmol.L )
(二)小分子有机化合物作为辅因子
B族维生素、血红素等。
小分子有机化合物的作用
载体的作用,传递电子、质子及其他基团。
(三) 辅因子的分类
(按其与酶蛋白结合的紧密程度不同)
辅酶(coenzyme)
与酶蛋白结合疏松,可以用透析或超滤的方法除去。
辅基(prosthetic group)
与酶蛋白结合紧密,不能用透析或超滤的方法除去。